FuNGI

C5G730

Protein Details

Accession

C5G730

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-43	MAVEKKDKKRKAAIVSAQTTADPPSKKSKKSTSKPAKVQEDVP	Hydrophilic
114-139	KSSAAEKPSKKKSKKAAEVPRPSVPS	Hydrophilic
224-247	AIPDAKQMKRKLRKMKKNTTEAEE	Hydrophilic
447-496	DAETTPKKAKKEKEKKDTPPVKEAKRTGEVEKKKKEGKSTPKKEKAVVDT	Basic
511-530	ATAGKSEKKGGKSKGKKSKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-12	KDKKRKA
24-51	PSKKSKKSTSKPAKVQEDVPKPILKKPK
97-143	EKSKKKSVTSSPAAAKSKSSAAEKPSKKKSKKAAEVPRPSVPSAAKK
230-240	QMKRKLRKMKK
452-530	PKKAKKEKEKKDTPPVKEAKRTGEVEKKKKEGKSTPKKEKAVVDTPEKPAKGREGKASPATAGKSEKKGGKSKGKKSKA

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.999, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MAVEKKDKKRKAAIVSAQTTADPPSKKSKKSTSKPAKVQEDVPKPILKKPKAAEATNSDLPKSVPVKVTSEPARQIRPRKRAADFLSDDEAEEGDREKSKKKSVTSSPAAAKSKSSAAEKPSKKKSKKAAEVPRPSVPSAAKKTATKADSGKESLSASKSSKESKDVTEASKEISRQIAEDENEGSEGEGDDDQTTALIQGFESSGDEDISGDEGFEPGKGVPAIPDAKQMKRKLRKMKKNTTEAEEPGTIYVGRVPHGFYEHEMRAYFSQFGPITQLRLSRNRTTGRSKHFAFIEFASDSVARVVADTMDNYLMFGHILKCKYVPKERVHPELWKGANKRFKRTPWNVIERRRMDAGKTRQQWSKKIEQEEVRRAARAEKMKVLGYEFEMPALKGVDEVPVAVAGEGEQGAIDGVEKEPSADKQEQPAAIEAPTKDTDKPNGHVADAETTPKKAKKEKEKKDTPPVKEAKRTGEVEKKKKEGKSTPKKEKAVVDTPEKPAKGREGKASPATAGKSEKKGGKSKGKKSKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.77
3	0.71
4	0.61
5	0.53
6	0.44
7	0.37
8	0.34
9	0.25
10	0.25
11	0.34
12	0.42
13	0.47
14	0.55
15	0.63
16	0.68
17	0.76
18	0.83
19	0.84
20	0.86
21	0.9
22	0.91
23	0.89
24	0.81
25	0.8
26	0.79
27	0.76
28	0.71
29	0.66
30	0.61
31	0.54
32	0.58
33	0.6
34	0.53
35	0.53
36	0.51
37	0.57
38	0.58
39	0.59
40	0.59
41	0.55
42	0.59
43	0.57
44	0.55
45	0.44
46	0.38
47	0.36
48	0.36
49	0.31
50	0.28
51	0.26
52	0.28
53	0.32
54	0.33
55	0.4
56	0.4
57	0.43
58	0.46
59	0.46
60	0.52
61	0.56
62	0.64
63	0.67
64	0.7
65	0.73
66	0.74
67	0.73
68	0.74
69	0.71
70	0.71
71	0.64
72	0.59
73	0.55
74	0.47
75	0.43
76	0.34
77	0.29
78	0.19
79	0.15
80	0.12
81	0.1
82	0.14
83	0.16
84	0.22
85	0.28
86	0.36
87	0.42
88	0.46
89	0.53
90	0.58
91	0.66
92	0.66
93	0.67
94	0.65
95	0.67
96	0.65
97	0.56
98	0.48
99	0.4
100	0.38
101	0.34
102	0.32
103	0.28
104	0.32
105	0.42
106	0.48
107	0.55
108	0.62
109	0.69
110	0.7
111	0.75
112	0.79
113	0.8
114	0.82
115	0.83
116	0.84
117	0.84
118	0.88
119	0.85
120	0.81
121	0.72
122	0.63
123	0.56
124	0.48
125	0.46
126	0.43
127	0.43
128	0.4
129	0.39
130	0.43
131	0.46
132	0.44
133	0.39
134	0.36
135	0.34
136	0.36
137	0.36
138	0.32
139	0.26
140	0.27
141	0.25
142	0.24
143	0.23
144	0.19
145	0.21
146	0.24
147	0.27
148	0.28
149	0.3
150	0.31
151	0.3
152	0.36
153	0.35
154	0.34
155	0.33
156	0.31
157	0.29
158	0.29
159	0.27
160	0.21
161	0.21
162	0.18
163	0.15
164	0.17
165	0.19
166	0.17
167	0.18
168	0.17
169	0.15
170	0.15
171	0.14
172	0.12
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.1
211	0.12
212	0.11
213	0.19
214	0.21
215	0.25
216	0.33
217	0.38
218	0.45
219	0.52
220	0.61
221	0.64
222	0.72
223	0.79
224	0.82
225	0.87
226	0.86
227	0.86
228	0.81
229	0.75
230	0.69
231	0.59
232	0.52
233	0.41
234	0.32
235	0.23
236	0.2
237	0.14
238	0.09
239	0.1
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.14
249	0.14
250	0.15
251	0.15
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.1
257	0.14
258	0.12
259	0.12
260	0.15
261	0.15
262	0.15
263	0.15
264	0.19
265	0.18
266	0.25
267	0.3
268	0.29
269	0.35
270	0.37
271	0.41
272	0.46
273	0.5
274	0.5
275	0.52
276	0.5
277	0.48
278	0.45
279	0.42
280	0.35
281	0.29
282	0.25
283	0.18
284	0.17
285	0.14
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.09
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.07
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.14
309	0.18
310	0.24
311	0.32
312	0.37
313	0.39
314	0.49
315	0.54
316	0.59
317	0.58
318	0.56
319	0.51
320	0.51
321	0.48
322	0.45
323	0.43
324	0.44
325	0.5
326	0.49
327	0.53
328	0.52
329	0.56
330	0.6
331	0.64
332	0.67
333	0.67
334	0.75
335	0.75
336	0.76
337	0.79
338	0.71
339	0.67
340	0.61
341	0.52
342	0.45
343	0.46
344	0.47
345	0.47
346	0.5
347	0.51
348	0.54
349	0.57
350	0.62
351	0.58
352	0.59
353	0.56
354	0.56
355	0.58
356	0.6
357	0.64
358	0.65
359	0.65
360	0.57
361	0.51
362	0.47
363	0.43
364	0.42
365	0.4
366	0.35
367	0.33
368	0.35
369	0.35
370	0.36
371	0.33
372	0.28
373	0.24
374	0.25
375	0.2
376	0.19
377	0.17
378	0.16
379	0.16
380	0.15
381	0.12
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.09
407	0.11
408	0.17
409	0.2
410	0.21
411	0.27
412	0.31
413	0.32
414	0.31
415	0.32
416	0.27
417	0.23
418	0.26
419	0.2
420	0.2
421	0.21
422	0.22
423	0.23
424	0.25
425	0.32
426	0.33
427	0.36
428	0.39
429	0.38
430	0.36
431	0.35
432	0.33
433	0.3
434	0.26
435	0.29
436	0.23
437	0.23
438	0.29
439	0.31
440	0.36
441	0.4
442	0.49
443	0.55
444	0.64
445	0.73
446	0.79
447	0.85
448	0.89
449	0.92
450	0.91
451	0.86
452	0.85
453	0.84
454	0.81
455	0.79
456	0.74
457	0.71
458	0.69
459	0.66
460	0.64
461	0.65
462	0.67
463	0.68
464	0.72
465	0.73
466	0.73
467	0.74
468	0.76
469	0.76
470	0.77
471	0.78
472	0.81
473	0.84
474	0.86
475	0.86
476	0.82
477	0.8
478	0.77
479	0.75
480	0.7
481	0.68
482	0.64
483	0.66
484	0.67
485	0.6
486	0.53
487	0.48
488	0.51
489	0.51
490	0.5
491	0.52
492	0.51
493	0.57
494	0.61
495	0.59
496	0.51
497	0.48
498	0.45
499	0.4
500	0.42
501	0.41
502	0.42
503	0.47
504	0.51
505	0.54
506	0.6
507	0.66
508	0.69
509	0.74
510	0.78

C5G730

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer