Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GEC1

Protein Details
Accession C5GEC1    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-221VQKVGGKRVKKEDRKRPPTDEKYSBasic
321-345PKAIEGSKKTSKKRKSTGELQPMQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-214QKVGGKRVKKEDRKRP
328-336KKTSKKRKS
402-409KKKRKSVS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAVTSGVLTIKPTSGTPYQLNNDQVTRASSALLRHIKAEEEKKALESTKKDLLANNDDEDDDDAEDSADATPVWLVVTTKKHIVDKNRLKPGKIPVPHSLNTSPSLSVCLITADPQRAVKDVIADPQFPATLSSRITKVIGYTKLKTKYKSFESRRRLLSEHDVFLADDRIIMRLVETLGKIFYKSSKRPVPIRIAEVQKVGGKRVKKEDRKRPPTDEKYSAVASPAVVAKEIEKTLASVPVHLASAATTSVRVGSAKFTPEKLVENVEAVVQGMTEKFVSKGWRNIKALHLKGANTMAMPIWLASELWVDEGDVREDEDPKAIEGSKKTSKKRKSTGELQPMQSKKPKTAEKEEDDDAELIASRKAKLQAQKARALSDGDKVNGSKAAVATAPEGATTSSKKKRKSVSKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.25
3 0.27
4 0.33
5 0.37
6 0.42
7 0.46
8 0.44
9 0.42
10 0.39
11 0.36
12 0.32
13 0.29
14 0.23
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.27
19 0.31
20 0.29
21 0.3
22 0.3
23 0.33
24 0.39
25 0.44
26 0.41
27 0.4
28 0.4
29 0.4
30 0.43
31 0.43
32 0.42
33 0.39
34 0.38
35 0.41
36 0.43
37 0.42
38 0.42
39 0.45
40 0.46
41 0.45
42 0.41
43 0.35
44 0.32
45 0.31
46 0.29
47 0.22
48 0.15
49 0.12
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.07
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.11
64 0.16
65 0.19
66 0.23
67 0.26
68 0.32
69 0.36
70 0.44
71 0.51
72 0.57
73 0.64
74 0.7
75 0.7
76 0.66
77 0.67
78 0.68
79 0.66
80 0.6
81 0.56
82 0.54
83 0.58
84 0.58
85 0.57
86 0.49
87 0.42
88 0.39
89 0.35
90 0.28
91 0.21
92 0.23
93 0.17
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.13
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.16
116 0.17
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.15
125 0.15
126 0.2
127 0.25
128 0.28
129 0.3
130 0.36
131 0.44
132 0.48
133 0.49
134 0.48
135 0.48
136 0.53
137 0.6
138 0.62
139 0.64
140 0.69
141 0.73
142 0.72
143 0.68
144 0.61
145 0.54
146 0.54
147 0.48
148 0.41
149 0.34
150 0.3
151 0.26
152 0.25
153 0.22
154 0.12
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.13
171 0.19
172 0.22
173 0.3
174 0.35
175 0.4
176 0.44
177 0.49
178 0.52
179 0.48
180 0.49
181 0.47
182 0.44
183 0.41
184 0.37
185 0.33
186 0.27
187 0.24
188 0.23
189 0.2
190 0.19
191 0.21
192 0.31
193 0.39
194 0.47
195 0.56
196 0.65
197 0.73
198 0.8
199 0.83
200 0.81
201 0.82
202 0.81
203 0.78
204 0.72
205 0.63
206 0.56
207 0.51
208 0.42
209 0.32
210 0.24
211 0.16
212 0.12
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.08
243 0.1
244 0.13
245 0.15
246 0.15
247 0.17
248 0.19
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.18
253 0.17
254 0.17
255 0.14
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.14
268 0.17
269 0.26
270 0.32
271 0.4
272 0.42
273 0.44
274 0.5
275 0.54
276 0.52
277 0.5
278 0.46
279 0.38
280 0.38
281 0.37
282 0.3
283 0.2
284 0.19
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.12
306 0.14
307 0.13
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.25
314 0.32
315 0.4
316 0.49
317 0.57
318 0.66
319 0.72
320 0.79
321 0.82
322 0.82
323 0.84
324 0.85
325 0.86
326 0.83
327 0.78
328 0.77
329 0.69
330 0.67
331 0.64
332 0.56
333 0.52
334 0.54
335 0.57
336 0.56
337 0.64
338 0.68
339 0.67
340 0.7
341 0.65
342 0.59
343 0.53
344 0.45
345 0.34
346 0.24
347 0.19
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.12
352 0.17
353 0.21
354 0.26
355 0.33
356 0.43
357 0.51
358 0.56
359 0.63
360 0.61
361 0.59
362 0.55
363 0.52
364 0.43
365 0.4
366 0.38
367 0.31
368 0.32
369 0.3
370 0.3
371 0.27
372 0.26
373 0.22
374 0.17
375 0.18
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.18
386 0.27
387 0.34
388 0.41
389 0.48
390 0.56
391 0.66