FuNGI

B6HJ83

Protein Details

Accession

B6HJ83

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-105	GEPPKPVLKHKPKAVGRRSKQERDEI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
82-104	PPKPVLKHKPKAVGRRSKQERDE
112-164	RHNERLKEAAAIQRGRGGTARRAGFRGRGGPMAMGMSGFGGRGGKRGRGGFGG
279-279	K

Subcellular Location(s)

mito 17, cyto_nucl 5.5, nucl 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	pcs:Pc21g01870 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAASRGSARGGAANRGARSDTTTPTPAGGGAAQNAPTATGAPGPASRASVQRLQSLNKRTPSGSIPPSSRPPSVLGGEPPKPVLKHKPKAVGRRSKQERDEIERLEQERHNERLKEAAAIQRGRGGTARRAGFRGRGGPMAMGMSGFGGRGGKRGRGGFGGGGGGGGGGGGYGGGSGGAGSGYNRSGLTGANRGRAYDSSDDEENELRVSIDHINLDSDEEDWDTPKDIKGKQPSRSRGGLRPVRLERHEHEERVVSVNMESSTSRTADLRKKAEKEKAAKDVGRTPTKVKTEPQDDDTTMPDAIPHADDDDFLPEHNVRVRSAQSMSPTKRSTTELRSTQITPEPEILDPRSLLHTKEEIDEYDRHMEDLAIIRDLLVPKDSKKANTEAETAEGATESKPAAVEGQEDNQTNEEKEEEKEDENPLHGQMFLMQFPPMTPYLRVAGSAQDNQHQATAATAPPQNEIKREAGDDVEILDNTKPVESKDNSVITAGQPWTLPTGRVGKLNVHESGRVTLDWGGISMELDRGAPVGFVQEAVILSKAPPEPEEDTAKHVWSMGQLSGKFTVTPNWDEML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.41
3	0.39
4	0.37
5	0.34
6	0.35
7	0.3
8	0.34
9	0.33
10	0.31
11	0.31
12	0.33
13	0.32
14	0.31
15	0.3
16	0.24
17	0.21
18	0.19
19	0.14
20	0.14
21	0.16
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.14
26	0.13
27	0.12
28	0.11
29	0.1
30	0.1
31	0.11
32	0.12
33	0.14
34	0.15
35	0.17
36	0.18
37	0.21
38	0.25
39	0.29
40	0.31
41	0.36
42	0.39
43	0.42
44	0.48
45	0.53
46	0.56
47	0.55
48	0.56
49	0.49
50	0.49
51	0.49
52	0.49
53	0.47
54	0.46
55	0.45
56	0.47
57	0.54
58	0.55
59	0.51
60	0.44
61	0.41
62	0.39
63	0.38
64	0.35
65	0.34
66	0.36
67	0.38
68	0.37
69	0.37
70	0.36
71	0.34
72	0.37
73	0.42
74	0.46
75	0.51
76	0.58
77	0.66
78	0.7
79	0.79
80	0.84
81	0.84
82	0.8
83	0.83
84	0.84
85	0.83
86	0.8
87	0.79
88	0.76
89	0.74
90	0.74
91	0.66
92	0.62
93	0.58
94	0.55
95	0.51
96	0.46
97	0.43
98	0.42
99	0.44
100	0.46
101	0.41
102	0.4
103	0.41
104	0.39
105	0.36
106	0.32
107	0.33
108	0.33
109	0.33
110	0.32
111	0.31
112	0.3
113	0.28
114	0.29
115	0.26
116	0.25
117	0.31
118	0.34
119	0.32
120	0.34
121	0.36
122	0.36
123	0.37
124	0.37
125	0.32
126	0.3
127	0.28
128	0.26
129	0.24
130	0.2
131	0.16
132	0.1
133	0.08
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.06
140	0.12
141	0.14
142	0.17
143	0.21
144	0.22
145	0.24
146	0.23
147	0.25
148	0.2
149	0.19
150	0.16
151	0.12
152	0.1
153	0.08
154	0.06
155	0.04
156	0.03
157	0.02
158	0.02
159	0.01
160	0.01
161	0.01
162	0.01
163	0.02
164	0.02
165	0.02
166	0.02
167	0.02
168	0.02
169	0.02
170	0.03
171	0.04
172	0.05
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.1
179	0.17
180	0.19
181	0.24
182	0.24
183	0.24
184	0.25
185	0.25
186	0.26
187	0.22
188	0.23
189	0.2
190	0.21
191	0.21
192	0.2
193	0.2
194	0.16
195	0.13
196	0.11
197	0.08
198	0.07
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.11
217	0.15
218	0.17
219	0.23
220	0.33
221	0.4
222	0.47
223	0.55
224	0.59
225	0.6
226	0.64
227	0.62
228	0.57
229	0.6
230	0.57
231	0.51
232	0.53
233	0.52
234	0.5
235	0.48
236	0.47
237	0.4
238	0.42
239	0.43
240	0.35
241	0.33
242	0.29
243	0.28
244	0.27
245	0.24
246	0.16
247	0.12
248	0.13
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.09
257	0.15
258	0.21
259	0.27
260	0.32
261	0.37
262	0.41
263	0.47
264	0.53
265	0.54
266	0.55
267	0.54
268	0.54
269	0.54
270	0.5
271	0.46
272	0.46
273	0.46
274	0.43
275	0.38
276	0.34
277	0.36
278	0.38
279	0.38
280	0.33
281	0.33
282	0.36
283	0.36
284	0.38
285	0.35
286	0.32
287	0.31
288	0.29
289	0.24
290	0.18
291	0.15
292	0.11
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.13
308	0.13
309	0.11
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.18
314	0.19
315	0.2
316	0.27
317	0.29
318	0.34
319	0.34
320	0.32
321	0.33
322	0.35
323	0.35
324	0.33
325	0.39
326	0.36
327	0.37
328	0.39
329	0.38
330	0.36
331	0.36
332	0.3
333	0.24
334	0.22
335	0.21
336	0.19
337	0.2
338	0.19
339	0.15
340	0.14
341	0.14
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.16
346	0.17
347	0.17
348	0.18
349	0.19
350	0.15
351	0.18
352	0.18
353	0.19
354	0.21
355	0.2
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.14
360	0.17
361	0.15
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.12
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.11
370	0.12
371	0.19
372	0.21
373	0.21
374	0.24
375	0.29
376	0.32
377	0.34
378	0.35
379	0.29
380	0.3
381	0.27
382	0.24
383	0.19
384	0.14
385	0.11
386	0.08
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.09
395	0.1
396	0.13
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.19
401	0.19
402	0.17
403	0.16
404	0.15
405	0.12
406	0.13
407	0.16
408	0.17
409	0.17
410	0.19
411	0.22
412	0.21
413	0.21
414	0.21
415	0.18
416	0.16
417	0.14
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.12
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.14
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.14
431	0.16
432	0.16
433	0.17
434	0.15
435	0.18
436	0.2
437	0.23
438	0.23
439	0.25
440	0.26
441	0.25
442	0.25
443	0.21
444	0.17
445	0.14
446	0.14
447	0.11
448	0.14
449	0.16
450	0.16
451	0.18
452	0.24
453	0.25
454	0.26
455	0.29
456	0.27
457	0.27
458	0.28
459	0.26
460	0.22
461	0.21
462	0.18
463	0.16
464	0.15
465	0.13
466	0.13
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.19
474	0.2
475	0.25
476	0.31
477	0.33
478	0.32
479	0.32
480	0.32
481	0.24
482	0.28
483	0.24
484	0.18
485	0.16
486	0.16
487	0.2
488	0.19
489	0.19
490	0.17
491	0.24
492	0.25
493	0.28
494	0.3
495	0.31
496	0.35
497	0.39
498	0.39
499	0.34
500	0.35
501	0.33
502	0.34
503	0.3
504	0.24
505	0.22
506	0.19
507	0.18
508	0.16
509	0.14
510	0.11
511	0.1
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.07
516	0.08
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.1
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.14
533	0.15
534	0.15
535	0.16
536	0.2
537	0.24
538	0.28
539	0.35
540	0.31
541	0.35
542	0.37
543	0.37
544	0.32
545	0.29
546	0.25
547	0.21
548	0.23
549	0.21
550	0.25
551	0.25
552	0.28
553	0.3
554	0.3
555	0.27
556	0.25
557	0.28
558	0.26
559	0.29

B6HJ83

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer