Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HC12

Protein Details
Accession B6HC12    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-130GTARDDRKSNKARDKLLRLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022018  GIT1_C  
IPR013724  GIT_SHD  
IPR039892  Spa2/Sph1  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
KEGG pcs:Pc18g05200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12205  GIT1_C  
PF08518  GIT_SHD  
Amino Acid Sequences MSPVSVDGSEWSGLNQYGKSDSPFSPTFPSSRPNLATPPTSGVPSAPLSPSGPPPSLSPSTRSGNPSPPSSVAARSSSGTLADGQRDGRRYRQMEEILGQHYGVLRRFLNGTARDDRKSNKARDKLLRLSPTQFHELSTDVYDELIRRQQASPPPGRPPRPDVPPYLPARNDFHEKRNHARQRLAALHHVRFRDLATDVFCELERRFPHFTSRDYRGRPPPNMGPPSARTSQSSRGPPSRMGRGYPSGGPPGSPFPPRSGSLGGPPSMNGDGPFPRSFQSNTMVPNKSTMVEDSDDMGPEDEDDARSDAFALDAVLSRRGTTTTLGDNERRLLQESQTQVSVLQDKIEKLEELVRSKDEELAHSSQDADSSGISHNERQEWDDLRHDLESKVSKAEDLNSSLQLELERVRNEHETMERDLRSQLNGSSRGVDDAGLQARYVDLETQHQNLQAELQQQKQVTDEVRREAAAFLMEMKTLSAESHSNWEREEQLSNEVHRLEADANEWKHRYAKVKAQLRHLRTSSGGFANSRPDASLVAKEHELVQADGVVKDIHVTKFQVSVDELLRVARFEESHVVLHQLKMVIGTVRHILQDVEYSPIPVDGSAALRAKLKGQVSTTANNMITATRNFASSSGLSPVSLLDAAASHLCTAIIDLIRAVKIQASPVDEMEDEDHEADVSQEQFPDYFDTSANQKRMSNNSVYSAISRPDDSQYPMQNGATNHLNHGWGHVQEDHEVLELKLYVEDQTDGMVQQIQALVASIRAEDNLHTVQTHVSAISNVVMNVVSATEQLIRERSGDIALRQTSEPVIAALDQCRGRLAATASEGEDTATPEQLRELTNKLPPIAFEIARQTKDLVQRLEATSVVADEEDDFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.15
4 0.18
5 0.2
6 0.23
7 0.25
8 0.24
9 0.29
10 0.3
11 0.31
12 0.34
13 0.34
14 0.35
15 0.33
16 0.37
17 0.35
18 0.41
19 0.41
20 0.39
21 0.42
22 0.43
23 0.43
24 0.41
25 0.43
26 0.37
27 0.34
28 0.31
29 0.25
30 0.24
31 0.23
32 0.23
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.22
37 0.28
38 0.29
39 0.28
40 0.27
41 0.28
42 0.33
43 0.38
44 0.37
45 0.35
46 0.35
47 0.39
48 0.43
49 0.47
50 0.45
51 0.48
52 0.5
53 0.5
54 0.49
55 0.45
56 0.43
57 0.4
58 0.39
59 0.33
60 0.32
61 0.3
62 0.26
63 0.26
64 0.23
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.2
71 0.22
72 0.26
73 0.3
74 0.32
75 0.36
76 0.42
77 0.43
78 0.44
79 0.5
80 0.48
81 0.47
82 0.48
83 0.45
84 0.38
85 0.35
86 0.31
87 0.23
88 0.23
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.21
95 0.23
96 0.28
97 0.28
98 0.33
99 0.38
100 0.43
101 0.43
102 0.46
103 0.47
104 0.5
105 0.55
106 0.59
107 0.6
108 0.63
109 0.7
110 0.76
111 0.8
112 0.79
113 0.78
114 0.75
115 0.69
116 0.66
117 0.62
118 0.57
119 0.54
120 0.46
121 0.38
122 0.33
123 0.3
124 0.27
125 0.23
126 0.19
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.2
136 0.26
137 0.33
138 0.41
139 0.46
140 0.46
141 0.55
142 0.61
143 0.66
144 0.65
145 0.65
146 0.64
147 0.65
148 0.64
149 0.6
150 0.58
151 0.6
152 0.61
153 0.6
154 0.54
155 0.49
156 0.49
157 0.47
158 0.49
159 0.45
160 0.47
161 0.49
162 0.53
163 0.58
164 0.65
165 0.69
166 0.66
167 0.68
168 0.65
169 0.64
170 0.65
171 0.6
172 0.58
173 0.56
174 0.55
175 0.55
176 0.51
177 0.43
178 0.37
179 0.34
180 0.28
181 0.22
182 0.19
183 0.17
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.2
191 0.2
192 0.23
193 0.27
194 0.27
195 0.36
196 0.37
197 0.42
198 0.42
199 0.48
200 0.51
201 0.51
202 0.58
203 0.6
204 0.64
205 0.62
206 0.62
207 0.62
208 0.64
209 0.63
210 0.57
211 0.51
212 0.47
213 0.49
214 0.46
215 0.39
216 0.33
217 0.34
218 0.39
219 0.42
220 0.45
221 0.45
222 0.48
223 0.49
224 0.53
225 0.52
226 0.54
227 0.49
228 0.44
229 0.43
230 0.41
231 0.41
232 0.38
233 0.35
234 0.3
235 0.28
236 0.26
237 0.23
238 0.23
239 0.23
240 0.24
241 0.22
242 0.22
243 0.26
244 0.27
245 0.28
246 0.27
247 0.25
248 0.28
249 0.3
250 0.27
251 0.23
252 0.22
253 0.21
254 0.19
255 0.18
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.17
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.19
266 0.22
267 0.2
268 0.24
269 0.31
270 0.32
271 0.3
272 0.31
273 0.29
274 0.26
275 0.24
276 0.2
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.07
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.06
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.17
312 0.2
313 0.22
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.21
318 0.21
319 0.19
320 0.17
321 0.21
322 0.22
323 0.22
324 0.2
325 0.2
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.11
337 0.16
338 0.17
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.2
343 0.2
344 0.23
345 0.19
346 0.17
347 0.2
348 0.2
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.07
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.16
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.16
388 0.15
389 0.15
390 0.12
391 0.11
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.19
403 0.23
404 0.21
405 0.2
406 0.22
407 0.21
408 0.19
409 0.17
410 0.16
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.15
417 0.15
418 0.12
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.05
429 0.05
430 0.08
431 0.1
432 0.12
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.16
440 0.16
441 0.17
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.19
446 0.19
447 0.16
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.19
452 0.19
453 0.18
454 0.16
455 0.15
456 0.1
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.13
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.17
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.14
478 0.16
479 0.18
480 0.18
481 0.19
482 0.17
483 0.15
484 0.14
485 0.14
486 0.1
487 0.08
488 0.1
489 0.14
490 0.15
491 0.18
492 0.19
493 0.18
494 0.2
495 0.23
496 0.27
497 0.25
498 0.33
499 0.39
500 0.47
501 0.5
502 0.58
503 0.63
504 0.62
505 0.64
506 0.57
507 0.49
508 0.42
509 0.4
510 0.33
511 0.26
512 0.23
513 0.17
514 0.17
515 0.2
516 0.19
517 0.17
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.17
523 0.14
524 0.15
525 0.15
526 0.15
527 0.16
528 0.16
529 0.16
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.08
537 0.07
538 0.08
539 0.11
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.12
544 0.15
545 0.15
546 0.15
547 0.14
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.14
552 0.11
553 0.12
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.12
560 0.12
561 0.13
562 0.14
563 0.17
564 0.16
565 0.16
566 0.16
567 0.13
568 0.12
569 0.11
570 0.11
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.1
579 0.09
580 0.11
581 0.1
582 0.12
583 0.11
584 0.12
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.08
589 0.08
590 0.06
591 0.07
592 0.1
593 0.11
594 0.12
595 0.14
596 0.14
597 0.16
598 0.2
599 0.2
600 0.19
601 0.2
602 0.26
603 0.27
604 0.29
605 0.29
606 0.29
607 0.27
608 0.25
609 0.23
610 0.17
611 0.17
612 0.15
613 0.18
614 0.13
615 0.14
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.14
620 0.15
621 0.14
622 0.14
623 0.13
624 0.13
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.08
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.06
639 0.08
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.11
650 0.13
651 0.15
652 0.16
653 0.16
654 0.18
655 0.16
656 0.16
657 0.16
658 0.14
659 0.12
660 0.11
661 0.11
662 0.09
663 0.09
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.09
668 0.08
669 0.09
670 0.09
671 0.1
672 0.13
673 0.13
674 0.13
675 0.12
676 0.14
677 0.2
678 0.27
679 0.29
680 0.27
681 0.29
682 0.33
683 0.39
684 0.43
685 0.42
686 0.37
687 0.38
688 0.38
689 0.35
690 0.33
691 0.29
692 0.26
693 0.22
694 0.22
695 0.2
696 0.21
697 0.23
698 0.25
699 0.29
700 0.31
701 0.33
702 0.33
703 0.32
704 0.32
705 0.3
706 0.3
707 0.3
708 0.26
709 0.25
710 0.24
711 0.25
712 0.21
713 0.24
714 0.23
715 0.17
716 0.2
717 0.2
718 0.19
719 0.19
720 0.2
721 0.17
722 0.15
723 0.15
724 0.12
725 0.11
726 0.11
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.1
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.09
743 0.08
744 0.09
745 0.08
746 0.07
747 0.08
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.13
754 0.13
755 0.14
756 0.13
757 0.14
758 0.14
759 0.15
760 0.15
761 0.11
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.12
766 0.12
767 0.1
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.08
772 0.08
773 0.06
774 0.05
775 0.07
776 0.09
777 0.1
778 0.12
779 0.15
780 0.15
781 0.16
782 0.17
783 0.17
784 0.18
785 0.2
786 0.2
787 0.25
788 0.25
789 0.27
790 0.26
791 0.26
792 0.24
793 0.21
794 0.2
795 0.13
796 0.12
797 0.11
798 0.12
799 0.13
800 0.18
801 0.18
802 0.18
803 0.19
804 0.18
805 0.17
806 0.19
807 0.2
808 0.19
809 0.21
810 0.23
811 0.22
812 0.23
813 0.22
814 0.19
815 0.17
816 0.16
817 0.14
818 0.16
819 0.15
820 0.15
821 0.16
822 0.18
823 0.19
824 0.2
825 0.23
826 0.24
827 0.3
828 0.33
829 0.34
830 0.32
831 0.3
832 0.33
833 0.35
834 0.3
835 0.28
836 0.34
837 0.39
838 0.4
839 0.4
840 0.36
841 0.36
842 0.44
843 0.48
844 0.41
845 0.38
846 0.42
847 0.43
848 0.43
849 0.37
850 0.3
851 0.23
852 0.2
853 0.17
854 0.12
855 0.1