Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HNV8

Protein Details
Accession B6HNV8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-302IPRFMIKKLQARNERRKTRGFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-166AEGRKRAGGRGRGRGRARGRGGRTGRS
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 12, nucl 3.5, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pcs:Pc21g18310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAVDALADSVAATTLTDKPNTNGATPSTQAADAAAASADEGRRLYIGNLAYATTEEELKEFFKAYTIETTSIPVNPRTNRPVGYAFVDIATAAEAAAAIEALSGKEILQRKVSVQLARKPEPAEAKEGAVSGGEGASGAEGRKRAGGRGRGRGRARGRGGRTGRSRAVCARTLSLLESTHIDTLKWMLTLQKAQDGQETTEAPVSETPLADTTNEKDTASKAGEARAARPQKQRGPPEDGIPSKTKVMVANLPYDLTEDKLKEIFAAYEPVSAKVALRPIPRFMIKKLQARNERRKTRGFGFVNLASEELQAKAVSEMNGKDIDGRVIAVKVAIDSPGKEDEDINAVAETEETAPASAPAPAAPAQENAAPAVTTQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.12
3 0.16
4 0.18
5 0.2
6 0.22
7 0.29
8 0.31
9 0.3
10 0.28
11 0.29
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.25
16 0.23
17 0.21
18 0.18
19 0.15
20 0.11
21 0.1
22 0.08
23 0.05
24 0.06
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.23
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.27
63 0.29
64 0.35
65 0.39
66 0.42
67 0.4
68 0.42
69 0.41
70 0.37
71 0.36
72 0.31
73 0.26
74 0.22
75 0.2
76 0.16
77 0.12
78 0.1
79 0.06
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.02
87 0.02
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.09
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.26
100 0.31
101 0.31
102 0.34
103 0.39
104 0.44
105 0.47
106 0.49
107 0.43
108 0.43
109 0.44
110 0.4
111 0.38
112 0.31
113 0.29
114 0.26
115 0.25
116 0.21
117 0.14
118 0.12
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.1
131 0.11
132 0.14
133 0.2
134 0.3
135 0.35
136 0.44
137 0.5
138 0.55
139 0.56
140 0.61
141 0.59
142 0.59
143 0.58
144 0.56
145 0.53
146 0.54
147 0.56
148 0.55
149 0.55
150 0.52
151 0.51
152 0.45
153 0.44
154 0.4
155 0.4
156 0.36
157 0.32
158 0.28
159 0.24
160 0.23
161 0.21
162 0.18
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.18
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.18
212 0.18
213 0.2
214 0.25
215 0.29
216 0.33
217 0.39
218 0.45
219 0.49
220 0.57
221 0.63
222 0.59
223 0.63
224 0.59
225 0.56
226 0.56
227 0.49
228 0.45
229 0.4
230 0.36
231 0.28
232 0.27
233 0.25
234 0.19
235 0.21
236 0.22
237 0.21
238 0.23
239 0.22
240 0.21
241 0.2
242 0.2
243 0.17
244 0.13
245 0.14
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.13
255 0.11
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.23
266 0.24
267 0.26
268 0.31
269 0.36
270 0.37
271 0.37
272 0.42
273 0.45
274 0.5
275 0.55
276 0.6
277 0.65
278 0.72
279 0.8
280 0.8
281 0.82
282 0.8
283 0.8
284 0.77
285 0.72
286 0.72
287 0.64
288 0.57
289 0.54
290 0.51
291 0.46
292 0.4
293 0.35
294 0.25
295 0.23
296 0.19
297 0.13
298 0.11
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.16
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.14
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.11
349 0.12
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.18
357 0.17
358 0.14