Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GKB0

Protein Details
Accession C5GKB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-398LRTKEHPSKDGGHREKRHKHRGFKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-397EHPSKDGGHREKRHKHRGFKP
Subcellular Location(s) mito 9.5, nucl 8, cyto_mito 7.666, cyto_nucl 7.333, cyto 4.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MASPSQYRLLHQTSQSSLSLPPGSYIYSLCQSGIDALAAISSDNSLRRFDRETLNVLPDGVFADIHPGQDGGGVTCVCEVDPASVEGKNIVATSGRDGTVKLWDVRGKRRDAVLTVTVDKSAPITALTCSLEPCTIVAGTELVSSQSSVIFWDIRSPGQPRLQYVESHNDDITELQFHPTRRNVLLSGSTDGLVNIYDTTISDEDEALLQVFNHGSIHRAGFFGEHAIYALSHDEVFSVHPLNNPDENAVEPAPIQFGDLRPVLQNDYVAQVLDGRGGMFVVSGKTSEQRLDFTPLVCSPKFDFDLANTWRLPGAHGEELVRSVFLDNNSKSIFTCGEDGHVRSWKLDEGDQQQGEDFPSKPFTKRTAPENVLRTKEHPSKDGGHREKRHKHRGFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.35
4 0.31
5 0.3
6 0.29
7 0.23
8 0.21
9 0.19
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.11
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.07
30 0.1
31 0.12
32 0.15
33 0.17
34 0.21
35 0.26
36 0.29
37 0.35
38 0.36
39 0.4
40 0.41
41 0.43
42 0.39
43 0.35
44 0.31
45 0.23
46 0.2
47 0.15
48 0.1
49 0.07
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.14
57 0.14
58 0.09
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.19
87 0.21
88 0.19
89 0.2
90 0.24
91 0.29
92 0.38
93 0.44
94 0.43
95 0.43
96 0.45
97 0.44
98 0.41
99 0.41
100 0.36
101 0.33
102 0.31
103 0.29
104 0.26
105 0.23
106 0.21
107 0.16
108 0.12
109 0.09
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.17
144 0.21
145 0.25
146 0.27
147 0.24
148 0.29
149 0.3
150 0.29
151 0.3
152 0.34
153 0.31
154 0.31
155 0.29
156 0.24
157 0.23
158 0.21
159 0.18
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.13
165 0.17
166 0.18
167 0.21
168 0.2
169 0.22
170 0.2
171 0.19
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.07
181 0.06
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.1
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.13
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.17
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.24
282 0.24
283 0.28
284 0.26
285 0.26
286 0.22
287 0.26
288 0.28
289 0.25
290 0.23
291 0.2
292 0.29
293 0.28
294 0.3
295 0.25
296 0.23
297 0.24
298 0.23
299 0.22
300 0.17
301 0.2
302 0.18
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.19
308 0.15
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.13
313 0.2
314 0.2
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.24
320 0.23
321 0.17
322 0.19
323 0.15
324 0.19
325 0.22
326 0.24
327 0.26
328 0.3
329 0.28
330 0.26
331 0.28
332 0.27
333 0.26
334 0.28
335 0.3
336 0.3
337 0.39
338 0.38
339 0.37
340 0.34
341 0.32
342 0.31
343 0.27
344 0.22
345 0.16
346 0.23
347 0.25
348 0.28
349 0.32
350 0.36
351 0.42
352 0.46
353 0.5
354 0.54
355 0.57
356 0.61
357 0.65
358 0.67
359 0.62
360 0.6
361 0.57
362 0.56
363 0.58
364 0.55
365 0.49
366 0.47
367 0.51
368 0.57
369 0.65
370 0.66
371 0.68
372 0.74
373 0.82
374 0.87
375 0.89
376 0.91
377 0.89
378 0.89