Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HTJ1

Protein Details
Accession B6HTJ1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-55FTDKDTKPGKIKVKKTSKASTKKKADGKAPRTCFHydrophilic
115-142HVRGCLKAKQEKARKKKEARDAANRLKABasic
188-214EDDGKESKKKKKKDEPKQKTAKPKGPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-50KPGKIKVKKTSKASTKKKADGKA
122-136AKQEKARKKKEARDA
166-212AKKSATKGTEDGNRKGKKRKADEDDGKESKKKKKKDEPKQKTAKPKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
KEGG pcs:Pc22g09040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MANNGDPGQGRGSLVDASGYTFTDKDTKPGKIKVKKTSKASTKKKADGKAPRTCFYRHAKDGPIDTSPTASPLPVLDSKVVAVFPTGKPREDDLLETVICKHCKRPTLKQTAAEHVRGCLKAKQEKARKKKEARDAANRLKAGDDRDDDGPDKADGDNPNMGQKSAKKSATKGTEDGNRKGKKRKADEDDGKESKKKKKKDEPKQKTAKPKGPVDVEKQCGVTLPNGAQCARSLTCKSHSMGAKRSVPGRTLPYDMLLQQYQKKNQARQQKAAIDANAPLQEDIENTGPIDSDEERDAVMAAIARSAPQPLIRHPVITTKSKYRYVRIKEQMSHAMGVRNGGGLFSNGDSQPLFGGILFSTVADDLESSVEDANGEPDVSAGGIDVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.1
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.13
10 0.2
11 0.2
12 0.26
13 0.31
14 0.38
15 0.43
16 0.52
17 0.61
18 0.63
19 0.71
20 0.75
21 0.8
22 0.8
23 0.82
24 0.84
25 0.84
26 0.85
27 0.87
28 0.87
29 0.86
30 0.86
31 0.86
32 0.83
33 0.82
34 0.82
35 0.81
36 0.81
37 0.77
38 0.74
39 0.7
40 0.65
41 0.63
42 0.61
43 0.61
44 0.58
45 0.57
46 0.57
47 0.58
48 0.6
49 0.55
50 0.48
51 0.41
52 0.34
53 0.31
54 0.25
55 0.23
56 0.19
57 0.16
58 0.13
59 0.11
60 0.16
61 0.15
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.23
73 0.24
74 0.25
75 0.27
76 0.3
77 0.33
78 0.3
79 0.31
80 0.24
81 0.26
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.25
87 0.23
88 0.26
89 0.27
90 0.36
91 0.42
92 0.51
93 0.56
94 0.64
95 0.69
96 0.72
97 0.71
98 0.73
99 0.7
100 0.63
101 0.52
102 0.44
103 0.42
104 0.35
105 0.33
106 0.27
107 0.29
108 0.32
109 0.39
110 0.47
111 0.53
112 0.62
113 0.7
114 0.78
115 0.81
116 0.84
117 0.86
118 0.86
119 0.86
120 0.84
121 0.84
122 0.83
123 0.82
124 0.79
125 0.7
126 0.6
127 0.51
128 0.45
129 0.37
130 0.32
131 0.24
132 0.2
133 0.21
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.19
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.14
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.16
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.2
151 0.24
152 0.28
153 0.33
154 0.3
155 0.33
156 0.4
157 0.44
158 0.43
159 0.38
160 0.36
161 0.39
162 0.43
163 0.46
164 0.47
165 0.45
166 0.47
167 0.54
168 0.54
169 0.55
170 0.58
171 0.62
172 0.61
173 0.66
174 0.71
175 0.7
176 0.74
177 0.68
178 0.62
179 0.57
180 0.55
181 0.54
182 0.53
183 0.53
184 0.55
185 0.63
186 0.72
187 0.79
188 0.85
189 0.86
190 0.89
191 0.91
192 0.87
193 0.87
194 0.85
195 0.81
196 0.76
197 0.7
198 0.65
199 0.61
200 0.59
201 0.54
202 0.52
203 0.47
204 0.42
205 0.38
206 0.32
207 0.26
208 0.23
209 0.17
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.18
222 0.21
223 0.24
224 0.25
225 0.28
226 0.31
227 0.33
228 0.37
229 0.41
230 0.42
231 0.41
232 0.44
233 0.4
234 0.37
235 0.35
236 0.34
237 0.3
238 0.28
239 0.26
240 0.23
241 0.23
242 0.22
243 0.22
244 0.18
245 0.19
246 0.23
247 0.28
248 0.31
249 0.39
250 0.44
251 0.48
252 0.53
253 0.61
254 0.61
255 0.62
256 0.66
257 0.61
258 0.61
259 0.57
260 0.52
261 0.42
262 0.36
263 0.32
264 0.25
265 0.21
266 0.16
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.12
296 0.15
297 0.18
298 0.26
299 0.26
300 0.27
301 0.27
302 0.34
303 0.35
304 0.4
305 0.41
306 0.43
307 0.49
308 0.56
309 0.59
310 0.59
311 0.64
312 0.65
313 0.71
314 0.71
315 0.73
316 0.7
317 0.72
318 0.71
319 0.64
320 0.58
321 0.48
322 0.43
323 0.35
324 0.31
325 0.25
326 0.18
327 0.16
328 0.14
329 0.12
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.14
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.07
342 0.09
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06