Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HJG3

Protein Details
Accession B6HJG3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
824-845DKPLMPTSSKHKRKMSPQSPLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG pcs:Pc21g15220  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFTFLCDLLTSLDDSRTAKASTAAKNDNPDIRTVAQWFSRHGRTIHNANTDRVALLSCMFPEKRTDRVYWLQATQLSRVIGRCLGLGSSRLSELNRWQRPGGSDLGGCVEIVMRQAENYIPAGQELSVEEIDRAMAMIASRCRFSGPHARRNRTAVDVEETLSKLYRRSSSRDAKWLTRMILKSYSPVVFPEKYTLKKFHFLLPQLLQLQNSFEGALEMLASDPINHFPPNPDPQTAKSLSAVALQHMRPRPGIKVGRPDYYKARSIKHCHQMANGRRMSIERKYDGEYCQIHVDLSNKYTPIQIFSKSGKDSTADKDKIIPVIEETLRTGFPDCKFAHRCILEGELLVWNDQNCDLMDFSKIRRFIPRSGIMIGVDNDSPPQPYEHLMIMFFDILLLDNDVCLAKPHRERRLLLQQVVKTIPGRAELAYQEVLDFNRPDSYHRLERSFEKAMTKHWEGYVLKASDEPYFPTYSTDTDHMCGRWIKLKKDYIPGLGDTLDLALVGASYNTRDAPDLGQIKGLKWTHFFVACLLNPDQVKERGGLPRFRIIDVINRHRMSIQNMQILNQIGEFHARQPENFEWFHIEYGHQALPPPTTLFKQPFIVEMLGSGFEKPSGARYFTLRFPRILKIHSDRTLEECTSFQGLQLSAEHARAVPADELEEREKWARRLEACSGLNLYVVRSPSPEATCSDTDEETHSPSSQVPQATTTSEESFMDARPLMEALQEDSKRKGSHDYPLSPLVYVDETMPPTQNDENPVVEKTVLVDNDNLSSRQHSSQKEGKIASQKSSGFLHPVQTSSFISTHEHFQQSHESQERLPDKPLMPTSSKHKRKMSPQSPLTTIPIWTPETSLGSFTLPKFDGKSNDDHEYCDLNEFVQCLCSDESASSLRQSNPYAASQGTGFGIVLFVPKATQLGKEMHRLAKTLSNFVHTGTSPLPSIGSIFFLGSSMLEHDLRPGDLRFCLRDMWTGIGRDHSYGCLSWNLSKHSDGISVGREQLRSDLDRRRYDMSKETPEHGGSGPRPPWIEITFDETAIAVLGEYSSIEPLVHVLYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.18
5 0.19
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.23
10 0.29
11 0.34
12 0.41
13 0.46
14 0.46
15 0.52
16 0.56
17 0.57
18 0.51
19 0.46
20 0.42
21 0.38
22 0.37
23 0.34
24 0.33
25 0.32
26 0.33
27 0.36
28 0.38
29 0.41
30 0.42
31 0.41
32 0.44
33 0.46
34 0.53
35 0.56
36 0.59
37 0.57
38 0.54
39 0.56
40 0.49
41 0.42
42 0.34
43 0.27
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.26
52 0.28
53 0.35
54 0.38
55 0.4
56 0.41
57 0.48
58 0.54
59 0.51
60 0.49
61 0.46
62 0.46
63 0.45
64 0.4
65 0.36
66 0.3
67 0.28
68 0.27
69 0.26
70 0.22
71 0.21
72 0.19
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.21
83 0.29
84 0.38
85 0.42
86 0.43
87 0.44
88 0.45
89 0.47
90 0.47
91 0.41
92 0.34
93 0.28
94 0.25
95 0.26
96 0.23
97 0.19
98 0.16
99 0.12
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.1
128 0.15
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.24
135 0.32
136 0.35
137 0.44
138 0.54
139 0.61
140 0.64
141 0.68
142 0.66
143 0.6
144 0.55
145 0.48
146 0.43
147 0.37
148 0.34
149 0.32
150 0.28
151 0.23
152 0.22
153 0.19
154 0.16
155 0.19
156 0.25
157 0.26
158 0.33
159 0.42
160 0.51
161 0.56
162 0.64
163 0.65
164 0.63
165 0.66
166 0.63
167 0.56
168 0.53
169 0.49
170 0.44
171 0.44
172 0.39
173 0.35
174 0.35
175 0.33
176 0.26
177 0.27
178 0.28
179 0.24
180 0.25
181 0.29
182 0.31
183 0.35
184 0.4
185 0.44
186 0.42
187 0.48
188 0.48
189 0.49
190 0.51
191 0.48
192 0.51
193 0.46
194 0.48
195 0.45
196 0.44
197 0.37
198 0.29
199 0.28
200 0.22
201 0.19
202 0.14
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.14
219 0.21
220 0.28
221 0.3
222 0.32
223 0.32
224 0.35
225 0.41
226 0.4
227 0.35
228 0.29
229 0.27
230 0.24
231 0.26
232 0.23
233 0.18
234 0.22
235 0.21
236 0.27
237 0.29
238 0.3
239 0.28
240 0.3
241 0.31
242 0.35
243 0.41
244 0.39
245 0.47
246 0.49
247 0.54
248 0.54
249 0.55
250 0.53
251 0.51
252 0.53
253 0.46
254 0.49
255 0.5
256 0.55
257 0.61
258 0.63
259 0.63
260 0.58
261 0.6
262 0.63
263 0.63
264 0.65
265 0.57
266 0.48
267 0.44
268 0.44
269 0.43
270 0.4
271 0.38
272 0.3
273 0.32
274 0.35
275 0.37
276 0.37
277 0.39
278 0.33
279 0.29
280 0.28
281 0.26
282 0.22
283 0.2
284 0.21
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.16
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.24
297 0.29
298 0.28
299 0.28
300 0.24
301 0.24
302 0.25
303 0.28
304 0.35
305 0.31
306 0.3
307 0.33
308 0.33
309 0.34
310 0.31
311 0.25
312 0.16
313 0.2
314 0.2
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.22
324 0.22
325 0.29
326 0.32
327 0.34
328 0.4
329 0.35
330 0.36
331 0.3
332 0.32
333 0.24
334 0.2
335 0.19
336 0.14
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.17
352 0.19
353 0.19
354 0.27
355 0.3
356 0.32
357 0.39
358 0.41
359 0.39
360 0.39
361 0.39
362 0.31
363 0.29
364 0.25
365 0.19
366 0.14
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.08
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.13
396 0.21
397 0.29
398 0.36
399 0.41
400 0.43
401 0.49
402 0.59
403 0.59
404 0.56
405 0.54
406 0.47
407 0.45
408 0.44
409 0.37
410 0.27
411 0.22
412 0.18
413 0.14
414 0.14
415 0.11
416 0.12
417 0.11
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.08
427 0.11
428 0.11
429 0.13
430 0.17
431 0.23
432 0.27
433 0.3
434 0.32
435 0.31
436 0.34
437 0.37
438 0.36
439 0.32
440 0.29
441 0.27
442 0.29
443 0.34
444 0.32
445 0.28
446 0.24
447 0.29
448 0.25
449 0.27
450 0.3
451 0.24
452 0.22
453 0.21
454 0.22
455 0.18
456 0.18
457 0.17
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.12
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.19
474 0.23
475 0.25
476 0.31
477 0.37
478 0.38
479 0.43
480 0.44
481 0.4
482 0.37
483 0.34
484 0.28
485 0.22
486 0.18
487 0.12
488 0.1
489 0.06
490 0.04
491 0.04
492 0.02
493 0.02
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.03
498 0.03
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.12
505 0.14
506 0.13
507 0.16
508 0.16
509 0.16
510 0.22
511 0.22
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.12
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.16
525 0.17
526 0.18
527 0.16
528 0.16
529 0.13
530 0.15
531 0.19
532 0.22
533 0.25
534 0.24
535 0.29
536 0.29
537 0.29
538 0.27
539 0.22
540 0.26
541 0.29
542 0.34
543 0.36
544 0.35
545 0.35
546 0.34
547 0.35
548 0.33
549 0.34
550 0.31
551 0.3
552 0.3
553 0.3
554 0.31
555 0.3
556 0.25
557 0.17
558 0.14
559 0.08
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.18
567 0.2
568 0.22
569 0.22
570 0.21
571 0.2
572 0.2
573 0.21
574 0.16
575 0.14
576 0.11
577 0.14
578 0.14
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.14
588 0.16
589 0.17
590 0.19
591 0.18
592 0.18
593 0.19
594 0.18
595 0.14
596 0.12
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.09
606 0.1
607 0.12
608 0.13
609 0.16
610 0.19
611 0.25
612 0.33
613 0.3
614 0.3
615 0.31
616 0.36
617 0.36
618 0.34
619 0.35
620 0.33
621 0.39
622 0.42
623 0.41
624 0.36
625 0.38
626 0.39
627 0.33
628 0.28
629 0.21
630 0.18
631 0.18
632 0.17
633 0.13
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.12
639 0.11
640 0.11
641 0.11
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.11
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.17
655 0.19
656 0.2
657 0.23
658 0.25
659 0.25
660 0.29
661 0.31
662 0.36
663 0.33
664 0.33
665 0.3
666 0.26
667 0.25
668 0.2
669 0.17
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.1
674 0.11
675 0.14
676 0.15
677 0.16
678 0.15
679 0.19
680 0.2
681 0.21
682 0.22
683 0.19
684 0.18
685 0.21
686 0.2
687 0.17
688 0.17
689 0.15
690 0.14
691 0.14
692 0.16
693 0.16
694 0.16
695 0.14
696 0.15
697 0.16
698 0.17
699 0.18
700 0.18
701 0.16
702 0.16
703 0.16
704 0.15
705 0.15
706 0.14
707 0.13
708 0.11
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.15
717 0.17
718 0.19
719 0.21
720 0.25
721 0.24
722 0.25
723 0.3
724 0.26
725 0.33
726 0.39
727 0.4
728 0.4
729 0.44
730 0.43
731 0.36
732 0.33
733 0.26
734 0.18
735 0.15
736 0.13
737 0.11
738 0.12
739 0.13
740 0.14
741 0.13
742 0.16
743 0.17
744 0.18
745 0.19
746 0.2
747 0.21
748 0.21
749 0.22
750 0.19
751 0.17
752 0.15
753 0.13
754 0.15
755 0.14
756 0.13
757 0.13
758 0.13
759 0.16
760 0.17
761 0.16
762 0.13
763 0.15
764 0.16
765 0.21
766 0.27
767 0.26
768 0.32
769 0.39
770 0.43
771 0.47
772 0.45
773 0.45
774 0.47
775 0.48
776 0.44
777 0.43
778 0.39
779 0.36
780 0.37
781 0.33
782 0.28
783 0.27
784 0.28
785 0.23
786 0.24
787 0.22
788 0.22
789 0.22
790 0.2
791 0.2
792 0.16
793 0.19
794 0.19
795 0.23
796 0.25
797 0.27
798 0.24
799 0.26
800 0.33
801 0.31
802 0.37
803 0.36
804 0.32
805 0.3
806 0.38
807 0.4
808 0.34
809 0.35
810 0.33
811 0.31
812 0.36
813 0.39
814 0.35
815 0.34
816 0.35
817 0.42
818 0.47
819 0.55
820 0.57
821 0.62
822 0.64
823 0.72
824 0.8
825 0.8
826 0.8
827 0.78
828 0.76
829 0.71
830 0.67
831 0.6
832 0.49
833 0.41
834 0.31
835 0.28
836 0.25
837 0.21
838 0.2
839 0.17
840 0.19
841 0.19
842 0.19
843 0.16
844 0.15
845 0.18
846 0.17
847 0.2
848 0.18
849 0.19
850 0.21
851 0.24
852 0.28
853 0.29
854 0.35
855 0.35
856 0.42
857 0.41
858 0.4
859 0.38
860 0.35
861 0.32
862 0.27
863 0.22
864 0.16
865 0.16
866 0.15
867 0.12
868 0.12
869 0.11
870 0.12
871 0.12
872 0.13
873 0.12
874 0.12
875 0.14
876 0.15
877 0.16
878 0.16
879 0.19
880 0.2
881 0.23
882 0.25
883 0.26
884 0.27
885 0.28
886 0.27
887 0.23
888 0.22
889 0.19
890 0.18
891 0.14
892 0.12
893 0.1
894 0.07
895 0.07
896 0.06
897 0.07
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.08
903 0.09
904 0.1
905 0.13
906 0.19
907 0.23
908 0.3
909 0.35
910 0.39
911 0.4
912 0.39
913 0.39
914 0.39
915 0.38
916 0.37
917 0.33
918 0.32
919 0.31
920 0.31
921 0.32
922 0.25
923 0.26
924 0.2
925 0.21
926 0.17
927 0.17
928 0.17
929 0.13
930 0.14
931 0.11
932 0.12
933 0.11
934 0.1
935 0.1
936 0.1
937 0.1
938 0.08
939 0.08
940 0.08
941 0.1
942 0.11
943 0.11
944 0.14
945 0.15
946 0.16
947 0.18
948 0.18
949 0.17
950 0.21
951 0.25
952 0.24
953 0.24
954 0.26
955 0.25
956 0.28
957 0.28
958 0.29
959 0.3
960 0.29
961 0.29
962 0.32
963 0.31
964 0.29
965 0.27
966 0.24
967 0.22
968 0.2
969 0.21
970 0.19
971 0.21
972 0.24
973 0.28
974 0.31
975 0.32
976 0.33
977 0.32
978 0.3
979 0.3
980 0.27
981 0.25
982 0.24
983 0.23
984 0.27
985 0.29
986 0.27
987 0.25
988 0.28
989 0.3
990 0.31
991 0.35
992 0.39
993 0.45
994 0.51
995 0.54
996 0.56
997 0.56
998 0.57
999 0.6
1000 0.59
1001 0.6
1002 0.58
1003 0.57
1004 0.56
1005 0.52
1006 0.49
1007 0.42
1008 0.4
1009 0.32
1010 0.38
1011 0.36
1012 0.36
1013 0.36
1014 0.35
1015 0.39
1016 0.33
1017 0.34
1018 0.27
1019 0.33
1020 0.3
1021 0.28
1022 0.27
1023 0.21
1024 0.2
1025 0.15
1026 0.13
1027 0.06
1028 0.04
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.05
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.08