Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HDN8

Protein Details
Accession B6HDN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-39SCEPRTYRSLRIPYRPNQRFHHydrophilic
397-420LKYASTRKVPEPKQAKREEKPAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024461  CCDC90-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
KEGG pcs:Pc20g12520  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07798  CCDC90-like  
Amino Acid Sequences MATPRLPFLYPNLMRAVRSCEPRTYRSLRIPYRPNQRFHTSQQRERDSYQRRYGPAVEPNTTPSLRPKKDSDDQVKEVPDDQSAKNEAVNVSGQEEGSAEESQSEPPPQEAGQDTADVASSEAPALDQQNEAKTKGDNPPTDREPHEEQAKDIDGAEQEQASAPSSTPSERPSEESTDTSSFTAQTPFDDVLHMPSPSVYLAPTGEPSSDKRPPHLSPGPYVHPFDTYSLVQDLSKGGYSQEQSTTIMKAVRAILQNNLSLARESLTSKSDVENEEYLFKAACSELQSSLQTARNSEIQHQRSSRTQLQHETDIISQRLSQELAGMKDDIKGMFNDHKMTTREQQRSIDTSVQELNYKITVSLNSDGKSEIEGLRWILTRRAALTIAICAFMIIVFLKYASTRKVPEPKQAKREEKPAVAKETVTETRVVQDGGIETIVPSAEAHLGESLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.41
4 0.36
5 0.43
6 0.44
7 0.46
8 0.5
9 0.54
10 0.61
11 0.59
12 0.6
13 0.62
14 0.68
15 0.68
16 0.71
17 0.76
18 0.76
19 0.81
20 0.81
21 0.77
22 0.74
23 0.73
24 0.7
25 0.7
26 0.72
27 0.7
28 0.71
29 0.75
30 0.76
31 0.73
32 0.71
33 0.73
34 0.71
35 0.71
36 0.72
37 0.68
38 0.62
39 0.62
40 0.62
41 0.58
42 0.58
43 0.54
44 0.48
45 0.42
46 0.44
47 0.44
48 0.4
49 0.35
50 0.36
51 0.41
52 0.42
53 0.46
54 0.47
55 0.5
56 0.58
57 0.67
58 0.67
59 0.65
60 0.66
61 0.66
62 0.63
63 0.56
64 0.5
65 0.4
66 0.34
67 0.29
68 0.25
69 0.25
70 0.26
71 0.25
72 0.23
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.19
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.13
91 0.14
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.16
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.22
122 0.28
123 0.35
124 0.35
125 0.37
126 0.44
127 0.46
128 0.49
129 0.46
130 0.44
131 0.43
132 0.43
133 0.45
134 0.38
135 0.36
136 0.35
137 0.34
138 0.29
139 0.23
140 0.19
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.2
159 0.22
160 0.26
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.26
165 0.26
166 0.22
167 0.19
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.17
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.3
200 0.3
201 0.37
202 0.41
203 0.36
204 0.34
205 0.38
206 0.39
207 0.36
208 0.36
209 0.28
210 0.24
211 0.23
212 0.19
213 0.18
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.17
245 0.17
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.12
266 0.11
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.22
278 0.19
279 0.19
280 0.19
281 0.22
282 0.22
283 0.28
284 0.34
285 0.32
286 0.38
287 0.39
288 0.4
289 0.41
290 0.47
291 0.47
292 0.44
293 0.45
294 0.46
295 0.48
296 0.48
297 0.44
298 0.4
299 0.35
300 0.33
301 0.29
302 0.22
303 0.19
304 0.16
305 0.16
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.17
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.13
320 0.18
321 0.2
322 0.22
323 0.22
324 0.27
325 0.28
326 0.32
327 0.37
328 0.41
329 0.45
330 0.47
331 0.5
332 0.49
333 0.51
334 0.5
335 0.47
336 0.38
337 0.35
338 0.33
339 0.3
340 0.27
341 0.24
342 0.21
343 0.17
344 0.17
345 0.14
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.2
350 0.22
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.21
355 0.21
356 0.19
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.19
365 0.21
366 0.21
367 0.21
368 0.23
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.18
374 0.17
375 0.15
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.12
387 0.15
388 0.19
389 0.22
390 0.31
391 0.42
392 0.45
393 0.54
394 0.62
395 0.68
396 0.73
397 0.8
398 0.81
399 0.78
400 0.83
401 0.81
402 0.79
403 0.79
404 0.75
405 0.71
406 0.63
407 0.57
408 0.49
409 0.49
410 0.43
411 0.35
412 0.3
413 0.24
414 0.25
415 0.27
416 0.25
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.14
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.1
430 0.1
431 0.11