Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6H8V2

Protein Details
Accession B6H8V2    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-104AGGPKKRKRAPVDPNAPKRABasic
225-253SPSPVKEKTPPRSTTKRRRSENKAKEAETHydrophilic
270-291STPAVKTPAENKRRSKKRKSEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-96AKSEAGGPKKRKRAPV
231-289EKTPPRSTTKRRRSENKAKEAETPAKSPVKRGRKAAEPVSTPAVKTPAENKRRSKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12.833, mito 11, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pcs:Pc16g09240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLASFICKKERRIPTISLPPELRSIVMRLMEVQSYIADLGKAYVQHVNNITEGRDATIDLPAGPSGFMGHDVPFRAGSPGAKSEAGGPKKRKRAPVDPNAPKRALTPYFLYMQHNRSKIADDLGGDARPKDVADEGTRRWQSMEDTQKEVWKKMYAANYDQYKRDMAAYKAGGKVDEDHDPAANQLQQDFAGAEPEAEAEPEAEAEAGPEESADESTESSDESQSPSPVKEKTPPRSTTKRRRSENKAKEAETPAKSPVKRGRKAAEPVSTPAVKTPAENKRRSKKRKSEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.71
3 0.69
4 0.66
5 0.58
6 0.53
7 0.5
8 0.44
9 0.36
10 0.27
11 0.25
12 0.22
13 0.21
14 0.2
15 0.18
16 0.2
17 0.19
18 0.17
19 0.16
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.09
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.16
31 0.16
32 0.2
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.25
37 0.24
38 0.19
39 0.19
40 0.16
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.21
71 0.28
72 0.33
73 0.38
74 0.44
75 0.5
76 0.6
77 0.65
78 0.67
79 0.67
80 0.71
81 0.74
82 0.76
83 0.79
84 0.79
85 0.83
86 0.79
87 0.72
88 0.62
89 0.53
90 0.49
91 0.4
92 0.32
93 0.27
94 0.24
95 0.26
96 0.27
97 0.3
98 0.27
99 0.3
100 0.33
101 0.32
102 0.3
103 0.28
104 0.29
105 0.25
106 0.23
107 0.19
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.08
120 0.11
121 0.14
122 0.16
123 0.23
124 0.24
125 0.23
126 0.23
127 0.22
128 0.21
129 0.25
130 0.33
131 0.27
132 0.31
133 0.31
134 0.35
135 0.35
136 0.34
137 0.28
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.24
142 0.23
143 0.25
144 0.3
145 0.34
146 0.35
147 0.34
148 0.32
149 0.26
150 0.24
151 0.24
152 0.21
153 0.16
154 0.2
155 0.21
156 0.22
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.18
161 0.19
162 0.15
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.11
210 0.13
211 0.14
212 0.16
213 0.17
214 0.2
215 0.21
216 0.24
217 0.29
218 0.38
219 0.45
220 0.53
221 0.57
222 0.62
223 0.71
224 0.78
225 0.81
226 0.82
227 0.83
228 0.83
229 0.87
230 0.9
231 0.9
232 0.9
233 0.89
234 0.86
235 0.79
236 0.76
237 0.74
238 0.72
239 0.64
240 0.56
241 0.52
242 0.52
243 0.5
244 0.51
245 0.54
246 0.56
247 0.58
248 0.64
249 0.64
250 0.65
251 0.73
252 0.72
253 0.7
254 0.63
255 0.61
256 0.6
257 0.55
258 0.46
259 0.41
260 0.36
261 0.28
262 0.28
263 0.33
264 0.37
265 0.45
266 0.54
267 0.61
268 0.68
269 0.79
270 0.87
271 0.88