Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HWM0

Protein Details
Accession B6HWM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-487EKEVSDLRAKNEKKKQKRTRSIRTIVHKGDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
473-483KNEKKKQKRTR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pcs:Pc24g00610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF05225  HTH_psq  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MPPIRSQSSRNSIEKEGRILLAIQAFKNQKISSIRELARHYKIPRSTLQDRLNGHXSRAISRANSHKLTEIKEESLKKWILSIDRHRAAPRPSIVREMANLLLKKRGTTPVISVSENWVTNYMKRRPLLSSRFSKRYNYERAKCEDPKVIREWFDLVQKTILQFRIDPDDIYNFDKTGFTIGLTATAKVITRSEYYGRRALLXPRNREWVTIIECTNATSXALPPCVIFKGKVFIKSXFDSLPEDWRFEVSPNGWTSDEIRLRXLKKLFIPTTSSRTKGAYRLLILDGHGSHLTPRFDKICEENKIIPIYIPPHSSYLLXPLDIGCFTVLKRSYSRIVKIKMRNGVNYIDKLDFLEVYPLARIKAFKLETIKNSFRSTDLIPFIPEIVISKLNIRLRTPTPPSSRGSDXGSKNALELYLVIKAASSIKALLRIRSRSPPSPLNSAINQVLKAYQITMQSAALLEKEVSDLRAKNEKKKQKRTRSIRTIVHKGDLSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.57
3 0.5
4 0.43
5 0.38
6 0.34
7 0.3
8 0.28
9 0.27
10 0.23
11 0.28
12 0.3
13 0.3
14 0.35
15 0.32
16 0.33
17 0.36
18 0.42
19 0.42
20 0.48
21 0.5
22 0.5
23 0.57
24 0.58
25 0.58
26 0.6
27 0.56
28 0.55
29 0.57
30 0.56
31 0.56
32 0.57
33 0.57
34 0.59
35 0.62
36 0.6
37 0.59
38 0.61
39 0.62
40 0.54
41 0.49
42 0.44
43 0.39
44 0.38
45 0.39
46 0.35
47 0.33
48 0.41
49 0.48
50 0.46
51 0.45
52 0.46
53 0.45
54 0.46
55 0.48
56 0.43
57 0.4
58 0.44
59 0.47
60 0.42
61 0.45
62 0.43
63 0.35
64 0.34
65 0.33
66 0.32
67 0.37
68 0.45
69 0.47
70 0.5
71 0.53
72 0.53
73 0.55
74 0.53
75 0.52
76 0.49
77 0.46
78 0.44
79 0.47
80 0.47
81 0.42
82 0.39
83 0.35
84 0.32
85 0.31
86 0.3
87 0.26
88 0.29
89 0.28
90 0.28
91 0.28
92 0.3
93 0.27
94 0.28
95 0.3
96 0.34
97 0.36
98 0.36
99 0.33
100 0.32
101 0.33
102 0.31
103 0.27
104 0.22
105 0.2
106 0.23
107 0.31
108 0.33
109 0.36
110 0.36
111 0.38
112 0.41
113 0.49
114 0.52
115 0.52
116 0.56
117 0.58
118 0.64
119 0.64
120 0.64
121 0.61
122 0.62
123 0.65
124 0.65
125 0.65
126 0.63
127 0.66
128 0.69
129 0.66
130 0.62
131 0.59
132 0.52
133 0.5
134 0.48
135 0.45
136 0.39
137 0.36
138 0.35
139 0.29
140 0.32
141 0.28
142 0.25
143 0.23
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.22
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.23
152 0.23
153 0.22
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.23
158 0.21
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.16
180 0.2
181 0.24
182 0.27
183 0.27
184 0.29
185 0.31
186 0.36
187 0.39
188 0.4
189 0.4
190 0.43
191 0.44
192 0.4
193 0.38
194 0.34
195 0.3
196 0.27
197 0.24
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.12
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.16
215 0.17
216 0.23
217 0.24
218 0.24
219 0.27
220 0.28
221 0.27
222 0.23
223 0.25
224 0.19
225 0.21
226 0.22
227 0.2
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.13
232 0.15
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.23
244 0.23
245 0.25
246 0.27
247 0.27
248 0.23
249 0.27
250 0.3
251 0.27
252 0.32
253 0.33
254 0.37
255 0.38
256 0.36
257 0.32
258 0.29
259 0.3
260 0.27
261 0.28
262 0.24
263 0.22
264 0.23
265 0.22
266 0.2
267 0.19
268 0.16
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.23
282 0.27
283 0.3
284 0.33
285 0.33
286 0.35
287 0.35
288 0.33
289 0.27
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.06
308 0.06
309 0.12
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.26
315 0.31
316 0.38
317 0.4
318 0.45
319 0.52
320 0.58
321 0.61
322 0.62
323 0.6
324 0.56
325 0.51
326 0.5
327 0.45
328 0.4
329 0.36
330 0.28
331 0.25
332 0.23
333 0.21
334 0.16
335 0.12
336 0.12
337 0.09
338 0.09
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.19
346 0.19
347 0.22
348 0.28
349 0.33
350 0.38
351 0.45
352 0.48
353 0.44
354 0.45
355 0.42
356 0.37
357 0.35
358 0.31
359 0.29
360 0.28
361 0.25
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.19
366 0.16
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.11
371 0.13
372 0.19
373 0.24
374 0.26
375 0.26
376 0.29
377 0.31
378 0.39
379 0.44
380 0.46
381 0.49
382 0.51
383 0.53
384 0.52
385 0.53
386 0.48
387 0.48
388 0.46
389 0.43
390 0.44
391 0.42
392 0.37
393 0.34
394 0.3
395 0.23
396 0.17
397 0.15
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.2
409 0.22
410 0.28
411 0.33
412 0.37
413 0.42
414 0.49
415 0.55
416 0.53
417 0.59
418 0.6
419 0.58
420 0.6
421 0.59
422 0.55
423 0.5
424 0.48
425 0.47
426 0.41
427 0.37
428 0.3
429 0.27
430 0.22
431 0.21
432 0.18
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.17
438 0.16
439 0.16
440 0.16
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.17
449 0.19
450 0.24
451 0.34
452 0.38
453 0.46
454 0.56
455 0.65
456 0.71
457 0.8
458 0.86
459 0.87
460 0.94
461 0.95
462 0.95
463 0.95
464 0.94
465 0.92
466 0.91
467 0.89
468 0.83
469 0.78