Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HDE9

Protein Details
Accession B6HDE9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-111EPDQKKPGEKEKPVYRPREDRBasic
812-839LLARHAFQHRKPLKKKYQPKTDTGKTVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
821-826RKPLKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pcs:Pc20g07430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAIYYVEQNSSESIAWHSAPEPDIPFYEHTASESSAPGCSSSEPSTPEHTAAKSAEPVKPSKLFKPFAPVERDELVEPLELGTDQPVEPVEPDQKKPGEKEKPVYRPREDRLNQKATKGNAQGLFLPDCCVFVGNLSVKVSPEKLEEDLTEMISAFGRCHVKIKLSQGLKKLPVGFVQFEDTKAANSALKQNGNLMLHNRVLRLESSKARRTANFGYLSDAPIKKSEVIDALKGRGSLETISIEHFVTPEGVNSTFGLVTFAYPDDYADALQHFQNNSVYYMTRSNMDPNNDNQLPQDYSPAGHRPSNQPPPNRGNQQRYNNGRRSYHRPWYSGSSNNSRGGFRNAPGPAPRHQNTPFANHGHSQSFNGQGHSPHGSFPQNYPGGNGFPQNFNQGYPNPNFNQNFPGNFHPNYQGNNFPNYPNQGFVAAGPFPNPPVVFNQMQMPEAPPPPYHAEYTAMPAPGFPVFVGNQPFQPANTLPPIVTQPQSVAGPVPGPAPGPVPGFRRKPPRPDCPLIVSSQPQFDTEHHRQLYYEPIPAEELNMQANWVGHPNACYVQPGYVQPDYNQPYPPNAYPRSRQSSMESQQTINSPPRANESESTLTQTKVQTPEIERGRPLVRPRHPNTDGSCDMTPVSAPTKTQSDPIPMQALEGSSEITNVGHATKSTEAQAEPAAPVDIESENKPTKPETELNPPQTESTCAAASDQKEEELVDETKPPYEIDTKDEESGGSSSEAGPKTPDTDESQESAKPQTPAKAASLESADTKTPDTVETLKPVDKGTPDKGKSREAVTPTPTKSSKRLEPAVPDNKHLLARHAFQHRKPLKKKYQPKTDTGKTVEQYTREINTQRASVDPDSRVPEHLLQEVIQELENERRDNIRKSQGLGPSDKSSVDSGVASKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.2
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.22
11 0.24
12 0.25
13 0.26
14 0.27
15 0.23
16 0.23
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.22
21 0.19
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.23
30 0.25
31 0.28
32 0.33
33 0.34
34 0.35
35 0.34
36 0.32
37 0.32
38 0.31
39 0.3
40 0.31
41 0.33
42 0.34
43 0.34
44 0.37
45 0.39
46 0.44
47 0.46
48 0.47
49 0.52
50 0.51
51 0.5
52 0.56
53 0.56
54 0.56
55 0.59
56 0.53
57 0.5
58 0.49
59 0.48
60 0.39
61 0.34
62 0.27
63 0.2
64 0.18
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.14
77 0.22
78 0.25
79 0.28
80 0.35
81 0.39
82 0.43
83 0.48
84 0.55
85 0.56
86 0.59
87 0.67
88 0.69
89 0.75
90 0.8
91 0.82
92 0.8
93 0.79
94 0.76
95 0.78
96 0.72
97 0.72
98 0.73
99 0.75
100 0.69
101 0.66
102 0.67
103 0.59
104 0.62
105 0.56
106 0.53
107 0.45
108 0.44
109 0.41
110 0.39
111 0.37
112 0.29
113 0.28
114 0.21
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.22
127 0.22
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.17
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.09
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.2
147 0.21
148 0.25
149 0.29
150 0.36
151 0.4
152 0.44
153 0.49
154 0.51
155 0.57
156 0.55
157 0.54
158 0.5
159 0.43
160 0.4
161 0.39
162 0.34
163 0.28
164 0.3
165 0.26
166 0.24
167 0.25
168 0.21
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.14
173 0.15
174 0.21
175 0.24
176 0.26
177 0.26
178 0.27
179 0.31
180 0.31
181 0.31
182 0.26
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.25
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.22
191 0.23
192 0.27
193 0.34
194 0.4
195 0.44
196 0.46
197 0.46
198 0.49
199 0.49
200 0.48
201 0.45
202 0.39
203 0.39
204 0.36
205 0.37
206 0.36
207 0.32
208 0.26
209 0.23
210 0.24
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.21
216 0.25
217 0.25
218 0.25
219 0.25
220 0.24
221 0.23
222 0.17
223 0.16
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.19
273 0.22
274 0.25
275 0.26
276 0.26
277 0.34
278 0.32
279 0.32
280 0.27
281 0.27
282 0.25
283 0.22
284 0.23
285 0.15
286 0.15
287 0.18
288 0.21
289 0.2
290 0.21
291 0.23
292 0.27
293 0.36
294 0.46
295 0.49
296 0.5
297 0.55
298 0.59
299 0.64
300 0.66
301 0.65
302 0.63
303 0.66
304 0.69
305 0.72
306 0.75
307 0.76
308 0.74
309 0.71
310 0.68
311 0.64
312 0.65
313 0.63
314 0.64
315 0.6
316 0.54
317 0.52
318 0.54
319 0.53
320 0.5
321 0.48
322 0.46
323 0.45
324 0.47
325 0.45
326 0.39
327 0.37
328 0.36
329 0.33
330 0.26
331 0.28
332 0.25
333 0.26
334 0.28
335 0.29
336 0.27
337 0.33
338 0.34
339 0.33
340 0.35
341 0.4
342 0.39
343 0.41
344 0.41
345 0.36
346 0.36
347 0.32
348 0.32
349 0.27
350 0.26
351 0.22
352 0.2
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.18
358 0.2
359 0.21
360 0.2
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.23
367 0.22
368 0.21
369 0.22
370 0.21
371 0.2
372 0.19
373 0.21
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.17
381 0.16
382 0.19
383 0.19
384 0.23
385 0.2
386 0.27
387 0.27
388 0.26
389 0.3
390 0.28
391 0.28
392 0.26
393 0.3
394 0.27
395 0.27
396 0.28
397 0.26
398 0.26
399 0.27
400 0.26
401 0.28
402 0.25
403 0.28
404 0.27
405 0.24
406 0.25
407 0.26
408 0.25
409 0.19
410 0.18
411 0.15
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.09
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.09
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.15
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.11
436 0.14
437 0.17
438 0.19
439 0.18
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.2
444 0.19
445 0.15
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.1
450 0.1
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.09
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.14
460 0.12
461 0.14
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.1
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.11
472 0.1
473 0.11
474 0.12
475 0.11
476 0.09
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.1
487 0.12
488 0.16
489 0.22
490 0.26
491 0.3
492 0.4
493 0.43
494 0.52
495 0.57
496 0.63
497 0.65
498 0.66
499 0.64
500 0.6
501 0.57
502 0.48
503 0.42
504 0.35
505 0.28
506 0.25
507 0.22
508 0.17
509 0.17
510 0.17
511 0.23
512 0.25
513 0.32
514 0.3
515 0.3
516 0.29
517 0.29
518 0.36
519 0.28
520 0.27
521 0.19
522 0.19
523 0.2
524 0.2
525 0.2
526 0.13
527 0.12
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.16
547 0.16
548 0.17
549 0.17
550 0.24
551 0.27
552 0.28
553 0.29
554 0.25
555 0.26
556 0.3
557 0.32
558 0.31
559 0.31
560 0.34
561 0.36
562 0.43
563 0.48
564 0.47
565 0.46
566 0.44
567 0.49
568 0.49
569 0.52
570 0.45
571 0.38
572 0.38
573 0.37
574 0.35
575 0.3
576 0.3
577 0.23
578 0.22
579 0.27
580 0.28
581 0.29
582 0.27
583 0.28
584 0.29
585 0.28
586 0.32
587 0.27
588 0.25
589 0.25
590 0.26
591 0.24
592 0.23
593 0.24
594 0.23
595 0.25
596 0.33
597 0.35
598 0.35
599 0.31
600 0.32
601 0.33
602 0.32
603 0.36
604 0.38
605 0.41
606 0.49
607 0.54
608 0.6
609 0.61
610 0.62
611 0.6
612 0.58
613 0.52
614 0.46
615 0.41
616 0.32
617 0.29
618 0.24
619 0.2
620 0.13
621 0.14
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.16
626 0.17
627 0.2
628 0.2
629 0.24
630 0.25
631 0.27
632 0.28
633 0.24
634 0.24
635 0.22
636 0.2
637 0.14
638 0.13
639 0.11
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.06
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.09
650 0.1
651 0.11
652 0.13
653 0.14
654 0.13
655 0.14
656 0.15
657 0.14
658 0.12
659 0.12
660 0.11
661 0.08
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.16
668 0.18
669 0.19
670 0.2
671 0.2
672 0.21
673 0.25
674 0.29
675 0.28
676 0.37
677 0.45
678 0.5
679 0.51
680 0.49
681 0.45
682 0.41
683 0.39
684 0.3
685 0.24
686 0.19
687 0.16
688 0.17
689 0.19
690 0.19
691 0.2
692 0.19
693 0.16
694 0.16
695 0.16
696 0.16
697 0.16
698 0.16
699 0.13
700 0.15
701 0.16
702 0.17
703 0.17
704 0.16
705 0.15
706 0.2
707 0.2
708 0.21
709 0.28
710 0.29
711 0.29
712 0.29
713 0.26
714 0.23
715 0.22
716 0.18
717 0.12
718 0.1
719 0.1
720 0.16
721 0.16
722 0.15
723 0.16
724 0.16
725 0.18
726 0.19
727 0.21
728 0.21
729 0.25
730 0.27
731 0.27
732 0.29
733 0.27
734 0.27
735 0.28
736 0.27
737 0.24
738 0.24
739 0.28
740 0.29
741 0.3
742 0.31
743 0.32
744 0.28
745 0.28
746 0.28
747 0.23
748 0.22
749 0.22
750 0.2
751 0.17
752 0.18
753 0.16
754 0.15
755 0.14
756 0.16
757 0.18
758 0.2
759 0.24
760 0.26
761 0.27
762 0.28
763 0.28
764 0.28
765 0.28
766 0.32
767 0.35
768 0.42
769 0.43
770 0.5
771 0.53
772 0.55
773 0.54
774 0.52
775 0.51
776 0.47
777 0.5
778 0.48
779 0.52
780 0.49
781 0.53
782 0.53
783 0.5
784 0.52
785 0.53
786 0.55
787 0.56
788 0.6
789 0.57
790 0.61
791 0.67
792 0.7
793 0.65
794 0.6
795 0.54
796 0.51
797 0.5
798 0.43
799 0.39
800 0.34
801 0.35
802 0.4
803 0.47
804 0.51
805 0.49
806 0.6
807 0.62
808 0.67
809 0.73
810 0.76
811 0.77
812 0.81
813 0.89
814 0.88
815 0.91
816 0.87
817 0.87
818 0.86
819 0.83
820 0.81
821 0.76
822 0.74
823 0.65
824 0.66
825 0.61
826 0.53
827 0.49
828 0.45
829 0.42
830 0.39
831 0.4
832 0.36
833 0.36
834 0.35
835 0.32
836 0.3
837 0.33
838 0.32
839 0.35
840 0.34
841 0.35
842 0.39
843 0.39
844 0.39
845 0.37
846 0.38
847 0.35
848 0.34
849 0.31
850 0.25
851 0.25
852 0.24
853 0.21
854 0.17
855 0.14
856 0.14
857 0.2
858 0.24
859 0.24
860 0.25
861 0.31
862 0.37
863 0.42
864 0.48
865 0.51
866 0.5
867 0.54
868 0.59
869 0.59
870 0.59
871 0.58
872 0.55
873 0.5
874 0.48
875 0.44
876 0.38
877 0.33
878 0.28
879 0.24
880 0.2