Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HHB5

Protein Details
Accession B6HHB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-116SPDPTYRPPTRRKGPLYTRTHKVHydrophilic
621-652NMSDEQRREYNKERRKKKRRRLAIERNMREEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
627-642RREYNKERRKKKRRRL
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 5, cyto 3, plas 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG pcs:Pc20g14290  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSRRALVLDGLWYCLCPSFTTLSLSRSTPIPKPTGRNPRLYPLPSISSPSSGSRRCYNTSGGDGYKVPYNATYHNDRSEAREPRENEYRDAHLSPDPTYRPPTRRKGPLYTRTHKVQDDLLGKTNEGLESRLQYAMDNKPNIRHITQILRLLIRDRHVQPNARHYKALILANTDNERGSPQLVRGLLEEMENNGITADSGTLHGALQVLAVHPDYLLRQEILNKLRDRWLTLSPAGWHFVVAGLLRENQIELALEHVALMERKDISVENWLHSIIVYTLCDHRELDEVYNVMRARVDQGHNMTHRLWMHVLTEAGKQGHYPMAHYAWRRMVELGYMHPLVEVCDDVLKMAANAGDTDMASSVFRYLRESGIPLERTQYERLVETHVAAGDLPAAFEALCTMHEAQIPLADSSTERILAHMVQSKVDRREAWQILKRLKNAKRAIPIDSVRVIADLCEHDAHDDPSVVDDGVGFYKELYTLCPEGADVRVYNALIRMCRTARNRESGMFLVKEMASLGVVPNGVTFESIILMCLDAGNFRSGFMYFQDLMKRDARLSPETQVEIREICAGSVDEFAMRLQYHPFIRDDVRKLDEELQQKQKEKEANEKAGRHPVPPAVRRLNMSDEQRREYNKERRKKKRRRLAIERNMREEGWDEWEAGGTGNGSTKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.14
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.24
8 0.25
9 0.26
10 0.29
11 0.29
12 0.27
13 0.28
14 0.31
15 0.31
16 0.35
17 0.4
18 0.43
19 0.49
20 0.58
21 0.65
22 0.66
23 0.7
24 0.68
25 0.69
26 0.72
27 0.68
28 0.63
29 0.57
30 0.58
31 0.5
32 0.51
33 0.44
34 0.37
35 0.37
36 0.37
37 0.4
38 0.38
39 0.41
40 0.43
41 0.47
42 0.49
43 0.5
44 0.49
45 0.46
46 0.47
47 0.48
48 0.42
49 0.39
50 0.35
51 0.33
52 0.33
53 0.28
54 0.24
55 0.21
56 0.23
57 0.24
58 0.28
59 0.34
60 0.34
61 0.37
62 0.39
63 0.37
64 0.42
65 0.47
66 0.5
67 0.48
68 0.52
69 0.51
70 0.55
71 0.64
72 0.59
73 0.53
74 0.49
75 0.48
76 0.45
77 0.43
78 0.38
79 0.32
80 0.31
81 0.3
82 0.32
83 0.3
84 0.3
85 0.36
86 0.41
87 0.46
88 0.53
89 0.61
90 0.64
91 0.71
92 0.74
93 0.78
94 0.81
95 0.83
96 0.84
97 0.81
98 0.78
99 0.75
100 0.74
101 0.65
102 0.56
103 0.5
104 0.47
105 0.45
106 0.42
107 0.41
108 0.36
109 0.34
110 0.32
111 0.3
112 0.23
113 0.19
114 0.17
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.21
122 0.27
123 0.32
124 0.34
125 0.33
126 0.37
127 0.42
128 0.45
129 0.41
130 0.36
131 0.34
132 0.37
133 0.4
134 0.41
135 0.39
136 0.36
137 0.35
138 0.36
139 0.34
140 0.3
141 0.32
142 0.31
143 0.37
144 0.41
145 0.48
146 0.49
147 0.56
148 0.62
149 0.57
150 0.54
151 0.45
152 0.45
153 0.43
154 0.43
155 0.33
156 0.29
157 0.28
158 0.31
159 0.32
160 0.28
161 0.22
162 0.18
163 0.18
164 0.14
165 0.15
166 0.12
167 0.11
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.12
207 0.18
208 0.22
209 0.28
210 0.28
211 0.29
212 0.34
213 0.34
214 0.34
215 0.32
216 0.31
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.25
221 0.25
222 0.23
223 0.2
224 0.16
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.15
283 0.17
284 0.16
285 0.19
286 0.24
287 0.25
288 0.26
289 0.24
290 0.23
291 0.22
292 0.2
293 0.18
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.13
310 0.16
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.18
358 0.19
359 0.16
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.21
364 0.21
365 0.16
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.04
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.19
410 0.23
411 0.25
412 0.27
413 0.25
414 0.23
415 0.32
416 0.34
417 0.39
418 0.4
419 0.44
420 0.5
421 0.54
422 0.56
423 0.56
424 0.58
425 0.6
426 0.59
427 0.6
428 0.6
429 0.58
430 0.57
431 0.54
432 0.5
433 0.44
434 0.39
435 0.34
436 0.25
437 0.23
438 0.18
439 0.11
440 0.12
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.13
472 0.13
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.13
479 0.14
480 0.13
481 0.15
482 0.17
483 0.17
484 0.25
485 0.29
486 0.37
487 0.4
488 0.46
489 0.47
490 0.45
491 0.48
492 0.43
493 0.43
494 0.33
495 0.28
496 0.24
497 0.21
498 0.19
499 0.15
500 0.12
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.07
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.16
531 0.14
532 0.17
533 0.23
534 0.23
535 0.27
536 0.29
537 0.29
538 0.25
539 0.28
540 0.3
541 0.3
542 0.31
543 0.32
544 0.33
545 0.34
546 0.33
547 0.31
548 0.28
549 0.23
550 0.22
551 0.21
552 0.17
553 0.14
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.12
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.17
567 0.19
568 0.21
569 0.23
570 0.24
571 0.3
572 0.36
573 0.39
574 0.4
575 0.41
576 0.4
577 0.42
578 0.45
579 0.45
580 0.45
581 0.48
582 0.52
583 0.55
584 0.59
585 0.58
586 0.58
587 0.58
588 0.56
589 0.59
590 0.58
591 0.62
592 0.64
593 0.67
594 0.65
595 0.69
596 0.66
597 0.57
598 0.51
599 0.48
600 0.5
601 0.5
602 0.55
603 0.52
604 0.54
605 0.55
606 0.55
607 0.55
608 0.52
609 0.56
610 0.56
611 0.54
612 0.57
613 0.59
614 0.6
615 0.6
616 0.63
617 0.65
618 0.65
619 0.7
620 0.76
621 0.81
622 0.88
623 0.92
624 0.93
625 0.94
626 0.95
627 0.96
628 0.96
629 0.96
630 0.96
631 0.96
632 0.92
633 0.88
634 0.8
635 0.68
636 0.59
637 0.5
638 0.41
639 0.36
640 0.29
641 0.23
642 0.2
643 0.21
644 0.2
645 0.17
646 0.15
647 0.09
648 0.09
649 0.12