Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GXU2

Protein Details
Accession C5GXU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-206RVSAIRKSQRPKKEAPVKKARGAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-209IRKSQRPKKEAPVKKARGAKARKA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 9.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR002672  Ribosomal_L28e  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MLASPKRKAVGLAAKSCKIIHTSEATSTTTKSLSQSRYSTASLQFLPHRSSRLDSPPAYIMSYAGRPNLSDDVVWEIARTQNSFMVKRAGVQFSRDPLNLVNKHSRKYAGFANSKAIGINATESGNIAVTTKKPAMGHRPASSTVTNTYSSTATSRKIYKGVANTAAKSGYRPDLRAEAVSRVSAIRKSQRPKKEAPVKKARGAKARKAAEESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.53
3 0.52
4 0.45
5 0.37
6 0.31
7 0.25
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.3
12 0.31
13 0.29
14 0.28
15 0.26
16 0.21
17 0.19
18 0.19
19 0.23
20 0.26
21 0.31
22 0.32
23 0.34
24 0.37
25 0.38
26 0.38
27 0.34
28 0.33
29 0.27
30 0.28
31 0.29
32 0.28
33 0.3
34 0.28
35 0.28
36 0.26
37 0.28
38 0.3
39 0.33
40 0.36
41 0.33
42 0.35
43 0.35
44 0.34
45 0.32
46 0.27
47 0.2
48 0.15
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.1
68 0.12
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.19
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.25
82 0.22
83 0.19
84 0.17
85 0.25
86 0.24
87 0.26
88 0.33
89 0.32
90 0.33
91 0.34
92 0.35
93 0.27
94 0.28
95 0.29
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.31
100 0.29
101 0.29
102 0.26
103 0.21
104 0.13
105 0.09
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.25
123 0.32
124 0.37
125 0.36
126 0.39
127 0.38
128 0.4
129 0.37
130 0.31
131 0.26
132 0.23
133 0.22
134 0.19
135 0.19
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.19
142 0.22
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.29
147 0.32
148 0.35
149 0.39
150 0.38
151 0.37
152 0.36
153 0.36
154 0.31
155 0.26
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.24
160 0.26
161 0.28
162 0.3
163 0.32
164 0.31
165 0.27
166 0.26
167 0.25
168 0.23
169 0.2
170 0.21
171 0.21
172 0.25
173 0.3
174 0.38
175 0.47
176 0.56
177 0.65
178 0.69
179 0.73
180 0.78
181 0.79
182 0.81
183 0.81
184 0.83
185 0.8
186 0.82
187 0.83
188 0.8
189 0.79
190 0.78
191 0.77
192 0.76
193 0.76
194 0.73