Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6GXX1

Protein Details
Accession B6GXX1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
428-447RGLKSASKRTQRDEYFRKKEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 7.333, cyto 7, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG pcs:Pc12g04480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MNPLIAVVGATGTGKSKLAVDLASRFNGEIINGDAMQMYRGLPIITNQIPIEERNGIPHHLLSCIDLDAEAWRVGLFKREALRIIEDIRARGKVPIIVGGTHYYTQAVLFKEQLVGEGVDDESEREQLTEFSSTSKKWPILDSSPEVLLEKLREVDPVMAARWHPRDGRKIRRSLEIYFQTGRRASDIYKEQFSQKRKAMDQEEGLLRFENTLVFWVHAEKEVLNARLDARVDDMVKQGLMTEAEKMSDYLREKASQGIEVDQTRGVWVSIGFKELAPYFKAIRDGEASEKEIEDLKRNSLELIRIATRQYGTSQVKWIRNKLWKALTEAGETRRLYLLDSSNVSDWSKCIAGPSEEIVQLMQQNKPTPDPKSLSQLAAAEFGAKEAQAQKREQTDPIGRCYTCDVCQKTMATEDQWHIHLNSHQHKRGLKSASKRTQRDEYFRKKELEAKGIQALETEPGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.16
7 0.18
8 0.22
9 0.26
10 0.27
11 0.26
12 0.25
13 0.23
14 0.22
15 0.18
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.12
25 0.1
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.1
31 0.17
32 0.18
33 0.2
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.23
38 0.25
39 0.22
40 0.21
41 0.24
42 0.26
43 0.26
44 0.26
45 0.27
46 0.24
47 0.22
48 0.22
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.16
63 0.16
64 0.18
65 0.22
66 0.25
67 0.27
68 0.29
69 0.32
70 0.28
71 0.29
72 0.3
73 0.28
74 0.28
75 0.28
76 0.26
77 0.24
78 0.23
79 0.22
80 0.19
81 0.18
82 0.21
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.13
119 0.15
120 0.16
121 0.19
122 0.24
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.29
127 0.31
128 0.36
129 0.36
130 0.33
131 0.32
132 0.3
133 0.28
134 0.22
135 0.19
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.23
152 0.26
153 0.36
154 0.44
155 0.55
156 0.58
157 0.63
158 0.62
159 0.67
160 0.66
161 0.58
162 0.58
163 0.51
164 0.47
165 0.42
166 0.4
167 0.35
168 0.33
169 0.3
170 0.22
171 0.2
172 0.16
173 0.2
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.28
178 0.33
179 0.38
180 0.42
181 0.42
182 0.39
183 0.42
184 0.41
185 0.47
186 0.44
187 0.42
188 0.39
189 0.36
190 0.35
191 0.3
192 0.29
193 0.22
194 0.18
195 0.14
196 0.13
197 0.08
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.07
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.19
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.18
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.2
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.21
287 0.19
288 0.19
289 0.15
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.21
299 0.23
300 0.23
301 0.3
302 0.35
303 0.42
304 0.46
305 0.5
306 0.49
307 0.54
308 0.56
309 0.55
310 0.55
311 0.5
312 0.52
313 0.54
314 0.48
315 0.43
316 0.43
317 0.39
318 0.38
319 0.36
320 0.31
321 0.26
322 0.24
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.19
327 0.21
328 0.21
329 0.2
330 0.22
331 0.21
332 0.17
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.18
343 0.18
344 0.18
345 0.16
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.22
352 0.24
353 0.29
354 0.33
355 0.33
356 0.38
357 0.41
358 0.4
359 0.44
360 0.45
361 0.4
362 0.38
363 0.36
364 0.3
365 0.27
366 0.24
367 0.17
368 0.14
369 0.14
370 0.11
371 0.09
372 0.1
373 0.15
374 0.22
375 0.25
376 0.28
377 0.32
378 0.39
379 0.42
380 0.42
381 0.43
382 0.46
383 0.45
384 0.49
385 0.5
386 0.43
387 0.42
388 0.45
389 0.41
390 0.38
391 0.43
392 0.41
393 0.37
394 0.42
395 0.42
396 0.38
397 0.39
398 0.36
399 0.3
400 0.31
401 0.31
402 0.3
403 0.3
404 0.31
405 0.27
406 0.28
407 0.29
408 0.33
409 0.4
410 0.46
411 0.5
412 0.54
413 0.58
414 0.6
415 0.64
416 0.64
417 0.62
418 0.62
419 0.68
420 0.73
421 0.78
422 0.79
423 0.77
424 0.79
425 0.79
426 0.8
427 0.79
428 0.8
429 0.79
430 0.79
431 0.76
432 0.69
433 0.69
434 0.66
435 0.64
436 0.56
437 0.52
438 0.52
439 0.49
440 0.45
441 0.38
442 0.31