FuNGI

B6HRF9

Protein Details

Accession

B6HRF9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-105	RQAEGVRPPKRNRLNVRVREIFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	pcs:Pc22g07860 -
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MAPAATDTQWSVEYDTLRRENLFRNPPTDHTAYPSLAESIRPHIDSFNALFEDSKILEAGLRDIGTKTFLDGELETYEQKKARQAEGVRPPKRNRLNVRVREIFLEKPTLPPTNKYTTRNREIYPSECRERHATYRGKLRARLEYQVNNGDWMESVRELGNVPIMVRTNRCHLEKATPDELVRHKEESEELGGFYIVNGNEKLIRMLIVGKRNYPMSIIRGSFVKRGQTYTKFGVQIRSVRPDQTSQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKNEYLIPVMMILKALAETNDREIFEAIVGAASSKGMSNTFVTDRVELLLRTYHAYQKHSQYDCRSHLGKAFRPVLGVPADMPDEEVGTEFLRKVVLPHLGNENVTESQDWDKFKLITFMIRKLYSTVAGDCAPDNPDAVSNQEILLGGFLYGMILKERIEEWLRSFGPIARDWSIRNNGAKFTDEAFERDFLSKIVKRSNENIGNALEYFLSTGNLVSPTGLDLQQTSGYTVIAEKINFYRFISHFRMIHRGSFFAQLKTTTVRKLLPESWGFLCPVHTPDGSPCGLLNHLSHKCLIATDNLDVSHLPRTLVQLGVRSESSVALDESVVVQLDGRIIGYCSPKQAQRIADTIRYWKVEGKNNIPRELEVGYIPNSSGGQYPGVYMFSQSARMYRPVKYLALDKLDYVGPFEQPFMEIACVESDLIPGLSTHIEFTPTNILSIVANMTPFSDYNQSPRNMYQCQMSKQTMGTPGTSIAHRTDNKLYRIQTGQTPIVRPPLYNAYGLDNFPNGMNAVVAIISYTGYDMDDAMIINKSAHERGFGHGTVYKTKVVTLAENDSRRNKSKREVTKLFGFAPGDEIKDQVRNTIDEDGMPHLGARVKEGDKIAAWHNVRFDPASDSYVNVDGVTHYMKYKDAEEGYVDSIRIMGSESGNEPAQSLSIKYRIPRKPVIGDKFSSRHGQKGVLSQLWPAVDMPFSESGMQPDLIINPHAFPSRMTIAQMIESMAGKAGAMHGLPQDSTPFQFSEENTATDYFGEQLRKAGYNYYGNEPLYSGVTGREFSADIYMGLVYYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVNALTGQPVKGRAKGGGIRVGEMERDSLIAHGAAFLLQDRLMNCSDAQHTWICRCCGSFLSTQVAVSGSSRSRTAINPGAAAAAAKVAPNQQSANAHAGAAIGAVGGVNGFVRCRRCAREATFDDSRADVWEDGDGHRYVGGDDVTIVAVPGVLRYLDVELAAMGIRMKFLVNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.29
3	0.31
4	0.31
5	0.33
6	0.35
7	0.39
8	0.45
9	0.52
10	0.48
11	0.51
12	0.53
13	0.55
14	0.58
15	0.56
16	0.47
17	0.43
18	0.44
19	0.39
20	0.36
21	0.33
22	0.28
23	0.24
24	0.26
25	0.22
26	0.24
27	0.28
28	0.27
29	0.27
30	0.26
31	0.27
32	0.28
33	0.27
34	0.26
35	0.22
36	0.21
37	0.21
38	0.2
39	0.22
40	0.18
41	0.17
42	0.12
43	0.12
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.14
48	0.13
49	0.14
50	0.14
51	0.15
52	0.16
53	0.15
54	0.15
55	0.14
56	0.14
57	0.16
58	0.15
59	0.17
60	0.17
61	0.19
62	0.19
63	0.18
64	0.22
65	0.22
66	0.24
67	0.28
68	0.31
69	0.33
70	0.4
71	0.44
72	0.5
73	0.58
74	0.67
75	0.68
76	0.72
77	0.74
78	0.75
79	0.8
80	0.8
81	0.78
82	0.79
83	0.82
84	0.83
85	0.87
86	0.83
87	0.75
88	0.7
89	0.64
90	0.57
91	0.49
92	0.46
93	0.37
94	0.35
95	0.38
96	0.4
97	0.39
98	0.4
99	0.43
100	0.47
101	0.53
102	0.55
103	0.61
104	0.63
105	0.7
106	0.7
107	0.66
108	0.64
109	0.63
110	0.62
111	0.61
112	0.59
113	0.59
114	0.54
115	0.56
116	0.54
117	0.55
118	0.56
119	0.56
120	0.56
121	0.54
122	0.63
123	0.68
124	0.68
125	0.69
126	0.67
127	0.67
128	0.63
129	0.64
130	0.61
131	0.58
132	0.58
133	0.59
134	0.54
135	0.45
136	0.41
137	0.34
138	0.27
139	0.22
140	0.19
141	0.12
142	0.13
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.12
149	0.12
150	0.14
151	0.16
152	0.18
153	0.21
154	0.23
155	0.27
156	0.33
157	0.35
158	0.35
159	0.36
160	0.42
161	0.47
162	0.52
163	0.48
164	0.45
165	0.43
166	0.45
167	0.47
168	0.44
169	0.4
170	0.34
171	0.3
172	0.3
173	0.31
174	0.28
175	0.27
176	0.22
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.15
181	0.13
182	0.13
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.12
191	0.12
192	0.1
193	0.16
194	0.21
195	0.27
196	0.29
197	0.3
198	0.32
199	0.33
200	0.33
201	0.29
202	0.27
203	0.24
204	0.28
205	0.26
206	0.25
207	0.27
208	0.29
209	0.31
210	0.31
211	0.34
212	0.29
213	0.33
214	0.4
215	0.42
216	0.45
217	0.45
218	0.48
219	0.45
220	0.45
221	0.46
222	0.43
223	0.46
224	0.45
225	0.47
226	0.42
227	0.41
228	0.42
229	0.4
230	0.39
231	0.39
232	0.37
233	0.34
234	0.35
235	0.33
236	0.32
237	0.29
238	0.25
239	0.18
240	0.17
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.15
247	0.15
248	0.18
249	0.25
250	0.24
251	0.34
252	0.37
253	0.39
254	0.4
255	0.45
256	0.45
257	0.43
258	0.41
259	0.32
260	0.28
261	0.26
262	0.23
263	0.17
264	0.13
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.17
276	0.17
277	0.14
278	0.13
279	0.09
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.08
290	0.08
291	0.12
292	0.13
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.13
300	0.13
301	0.13
302	0.12
303	0.14
304	0.16
305	0.19
306	0.22
307	0.26
308	0.3
309	0.36
310	0.44
311	0.45
312	0.49
313	0.51
314	0.55
315	0.55
316	0.56
317	0.49
318	0.42
319	0.44
320	0.46
321	0.43
322	0.43
323	0.43
324	0.37
325	0.36
326	0.35
327	0.33
328	0.27
329	0.22
330	0.14
331	0.12
332	0.13
333	0.11
334	0.12
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.11
348	0.18
349	0.17
350	0.19
351	0.24
352	0.25
353	0.25
354	0.24
355	0.24
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.12
360	0.15
361	0.18
362	0.19
363	0.18
364	0.19
365	0.19
366	0.2
367	0.22
368	0.18
369	0.22
370	0.24
371	0.28
372	0.3
373	0.3
374	0.3
375	0.28
376	0.29
377	0.23
378	0.21
379	0.17
380	0.14
381	0.15
382	0.15
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.11
388	0.09
389	0.1
390	0.09
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.1
412	0.12
413	0.13
414	0.15
415	0.21
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.21
420	0.22
421	0.22
422	0.24
423	0.2
424	0.21
425	0.21
426	0.27
427	0.29
428	0.3
429	0.32
430	0.29
431	0.29
432	0.29
433	0.29
434	0.24
435	0.21
436	0.2
437	0.17
438	0.17
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.16
443	0.14
444	0.12
445	0.18
446	0.19
447	0.2
448	0.25
449	0.27
450	0.29
451	0.33
452	0.42
453	0.41
454	0.39
455	0.39
456	0.33
457	0.31
458	0.28
459	0.24
460	0.15
461	0.09
462	0.08
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.11
490	0.13
491	0.13
492	0.13
493	0.17
494	0.16
495	0.23
496	0.27
497	0.28
498	0.29
499	0.3
500	0.37
501	0.33
502	0.36
503	0.3
504	0.27
505	0.25
506	0.3
507	0.3
508	0.23
509	0.23
510	0.2
511	0.2
512	0.22
513	0.22
514	0.16
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.22
519	0.23
520	0.24
521	0.24
522	0.25
523	0.24
524	0.24
525	0.23
526	0.18
527	0.18
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.11
542	0.15
543	0.16
544	0.17
545	0.17
546	0.17
547	0.16
548	0.15
549	0.16
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.12
559	0.1
560	0.1
561	0.09
562	0.11
563	0.12
564	0.13
565	0.13
566	0.13
567	0.14
568	0.15
569	0.14
570	0.12
571	0.12
572	0.11
573	0.1
574	0.07
575	0.07
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.04
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.06
591	0.09
592	0.09
593	0.11
594	0.13
595	0.15
596	0.17
597	0.22
598	0.22
599	0.22
600	0.25
601	0.26
602	0.27
603	0.26
604	0.28
605	0.26
606	0.24
607	0.22
608	0.23
609	0.25
610	0.29
611	0.32
612	0.37
613	0.43
614	0.44
615	0.47
616	0.42
617	0.37
618	0.32
619	0.28
620	0.21
621	0.13
622	0.12
623	0.1
624	0.1
625	0.09
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.08
639	0.07
640	0.1
641	0.1
642	0.11
643	0.11
644	0.16
645	0.18
646	0.19
647	0.22
648	0.21
649	0.22
650	0.22
651	0.24
652	0.22
653	0.24
654	0.22
655	0.19
656	0.18
657	0.18
658	0.16
659	0.15
660	0.12
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.05
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.06
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.14
689	0.13
690	0.14
691	0.13
692	0.13
693	0.11
694	0.11
695	0.11
696	0.06
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.1
704	0.11
705	0.15
706	0.21
707	0.21
708	0.22
709	0.24
710	0.27
711	0.25
712	0.25
713	0.28
714	0.27
715	0.29
716	0.33
717	0.32
718	0.29
719	0.28
720	0.3
721	0.28
722	0.25
723	0.22
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.17
728	0.15
729	0.12
730	0.17
731	0.18
732	0.21
733	0.27
734	0.32
735	0.35
736	0.38
737	0.38
738	0.35
739	0.36
740	0.34
741	0.3
742	0.29
743	0.3
744	0.27
745	0.27
746	0.25
747	0.29
748	0.28
749	0.24
750	0.23
751	0.25
752	0.24
753	0.23
754	0.23
755	0.21
756	0.22
757	0.23
758	0.2
759	0.14
760	0.13
761	0.12
762	0.12
763	0.07
764	0.06
765	0.05
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.03
774	0.03
775	0.03
776	0.03
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.06
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.11
791	0.12
792	0.14
793	0.18
794	0.17
795	0.18
796	0.2
797	0.21
798	0.22
799	0.23
800	0.22
801	0.18
802	0.19
803	0.19
804	0.17
805	0.17
806	0.17
807	0.21
808	0.25
809	0.28
810	0.31
811	0.34
812	0.38
813	0.43
814	0.45
815	0.42
816	0.45
817	0.53
818	0.59
819	0.64
820	0.64
821	0.63
822	0.65
823	0.65
824	0.57
825	0.5
826	0.4
827	0.3
828	0.29
829	0.24
830	0.19
831	0.16
832	0.16
833	0.14
834	0.17
835	0.17
836	0.16
837	0.17
838	0.16
839	0.18
840	0.2
841	0.19
842	0.15
843	0.16
844	0.15
845	0.14
846	0.13
847	0.11
848	0.1
849	0.12
850	0.12
851	0.13
852	0.15
853	0.16
854	0.19
855	0.2
856	0.2
857	0.17
858	0.2
859	0.2
860	0.23
861	0.23
862	0.22
863	0.24
864	0.23
865	0.24
866	0.22
867	0.21
868	0.18
869	0.18
870	0.2
871	0.18
872	0.18
873	0.18
874	0.19
875	0.18
876	0.13
877	0.11
878	0.08
879	0.1
880	0.1
881	0.09
882	0.08
883	0.09
884	0.11
885	0.12
886	0.13
887	0.16
888	0.16
889	0.16
890	0.17
891	0.18
892	0.19
893	0.19
894	0.18
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.09
899	0.08
900	0.07
901	0.07
902	0.08
903	0.09
904	0.11
905	0.12
906	0.12
907	0.11
908	0.1
909	0.1
910	0.09
911	0.1
912	0.11
913	0.14
914	0.16
915	0.2
916	0.3
917	0.35
918	0.41
919	0.46
920	0.48
921	0.53
922	0.61
923	0.65
924	0.6
925	0.57
926	0.57
927	0.53
928	0.5
929	0.5
930	0.41
931	0.38
932	0.35
933	0.37
934	0.33
935	0.37
936	0.4
937	0.35
938	0.34
939	0.29
940	0.3
941	0.26
942	0.24
943	0.17
944	0.12
945	0.1
946	0.1
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.12
951	0.12
952	0.13
953	0.14
954	0.14
955	0.11
956	0.11
957	0.12
958	0.12
959	0.13
960	0.12
961	0.1
962	0.12
963	0.14
964	0.13
965	0.12
966	0.16
967	0.19
968	0.19
969	0.2
970	0.19
971	0.19
972	0.19
973	0.19
974	0.14
975	0.12
976	0.11
977	0.1
978	0.08
979	0.07
980	0.06
981	0.06
982	0.06
983	0.06
984	0.05
985	0.07
986	0.08
987	0.09
988	0.09
989	0.1
990	0.12
991	0.12
992	0.13
993	0.14
994	0.13
995	0.15
996	0.17
997	0.17
998	0.23
999	0.24
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.24
1003	0.22
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.12
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.18
1012	0.19
1013	0.2
1014	0.22
1015	0.23
1016	0.27
1017	0.3
1018	0.33
1019	0.35
1020	0.33
1021	0.33
1022	0.3
1023	0.26
1024	0.21
1025	0.19
1026	0.13
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.13
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.08
1042	0.07
1043	0.11
1044	0.12
1045	0.14
1046	0.16
1047	0.17
1048	0.25
1049	0.33
1050	0.39
1051	0.42
1052	0.5
1053	0.5
1054	0.5
1055	0.5
1056	0.48
1057	0.4
1058	0.38
1059	0.34
1060	0.3
1061	0.29
1062	0.28
1063	0.29
1064	0.26
1065	0.25
1066	0.24
1067	0.23
1068	0.19
1069	0.19
1070	0.25
1071	0.26
1072	0.28
1073	0.29
1074	0.27
1075	0.32
1076	0.35
1077	0.38
1078	0.38
1079	0.36
1080	0.33
1081	0.33
1082	0.32
1083	0.27
1084	0.23
1085	0.19
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.11
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.08
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.07
1095	0.06
1096	0.06
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.14
1106	0.17
1107	0.19
1108	0.18
1109	0.21
1110	0.23
1111	0.25
1112	0.29
1113	0.35
1114	0.33
1115	0.32
1116	0.32
1117	0.31
1118	0.29
1119	0.31
1120	0.29
1121	0.27
1122	0.31
1123	0.3
1124	0.29
1125	0.27
1126	0.25
1127	0.21
1128	0.17
1129	0.19
1130	0.15
1131	0.16
1132	0.17
1133	0.17
1134	0.19
1135	0.21
1136	0.28
1137	0.31
1138	0.3
1139	0.29
1140	0.29
1141	0.28
1142	0.26
1143	0.24
1144	0.16
1145	0.1
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.09
1149	0.12
1150	0.15
1151	0.17
1152	0.18
1153	0.21
1154	0.24
1155	0.27
1156	0.3
1157	0.27
1158	0.24
1159	0.21
1160	0.21
1161	0.16
1162	0.13
1163	0.09
1164	0.04
1165	0.04
1166	0.03
1167	0.03
1168	0.03
1169	0.03
1170	0.04
1171	0.04
1172	0.06
1173	0.1
1174	0.14
1175	0.19
1176	0.26
1177	0.32
1178	0.37
1179	0.45
1180	0.51
1181	0.57
1182	0.59
1183	0.62
1184	0.62
1185	0.58
1186	0.54
1187	0.46
1188	0.4
1189	0.32
1190	0.3
1191	0.22
1192	0.17
1193	0.18
1194	0.17
1195	0.18
1196	0.22
1197	0.19
1198	0.17
1199	0.17
1200	0.17
1201	0.14
1202	0.15
1203	0.14
1204	0.1
1205	0.1
1206	0.1
1207	0.1
1208	0.1
1209	0.09
1210	0.06
1211	0.06
1212	0.06
1213	0.06
1214	0.06
1215	0.06
1216	0.06
1217	0.07
1218	0.09
1219	0.09
1220	0.09
1221	0.09
1222	0.08
1223	0.08
1224	0.08
1225	0.08
1226	0.07
1227	0.07
1228	0.07
1229	0.08

B6HRF9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer