Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HIY5

Protein Details
Accession B6HIY5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MQNAPKKHFDGKRKKAKVDKNNKSSGHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-18KKHFDGKRKKAKV
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR030391  MeTrfase_TrmA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
KEGG pcs:Pc21g06420  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01938  TRAM  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
PS01231  TRMA_2  
Amino Acid Sequences MQNAPKKHFDGKRKKAKVDKNNKSSGHDEVLLCDINRLLKCNETEQSETNGDSEPFSLPEKFTEIDVKISELSSTGDGLALAENGKYVYVVPFTVPGDTVRVKLVKHFESLSYSLTDFVKVIEPGPQRNDALIGCKYFGECSGCQLQMMSYDDQLAHKRRIVEKAYANFSGLIPELVPTIGETFASPMQYGYRTKLTPHFAHGGAGKGSKKDGEEPSQPQVPPIGFTYKNRRLDMDIEDCPLGTDIVRRGLTSERKRVAENIRSYKRGATLLMRESTARIPKDAAPTADGEAPTVGGIAATPNADTGDVIRIERENYIEEKRCVTDNNATSFEYVDDYIFSNKAGAFFQNNNSILSGFTEYIRSQAIPAGNDKDAKPIKYLLDAYSGSGLFTITLSPLFKSSLGVDIGGDSIVSARENARANKLPNTGFAAADAATLFKDVPYPPDQTLLVIDPPRKGCSEDFLRQMLDFKPRRVVYVSCNVHTQARDVAVMVQGDEKQNVRYEIESVRGFDFFPQTGHVEGVAILNRTSFPQAETV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.88
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.91
7 0.89
8 0.89
9 0.83
10 0.78
11 0.71
12 0.66
13 0.59
14 0.53
15 0.44
16 0.37
17 0.37
18 0.33
19 0.3
20 0.25
21 0.2
22 0.21
23 0.22
24 0.24
25 0.22
26 0.25
27 0.28
28 0.33
29 0.36
30 0.35
31 0.39
32 0.38
33 0.42
34 0.38
35 0.36
36 0.31
37 0.3
38 0.25
39 0.21
40 0.19
41 0.15
42 0.14
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.17
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.24
51 0.22
52 0.24
53 0.24
54 0.24
55 0.21
56 0.21
57 0.19
58 0.14
59 0.14
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.2
89 0.19
90 0.24
91 0.31
92 0.28
93 0.3
94 0.3
95 0.28
96 0.31
97 0.32
98 0.28
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.18
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.12
108 0.13
109 0.18
110 0.2
111 0.24
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.27
116 0.28
117 0.21
118 0.24
119 0.22
120 0.19
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.17
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.17
135 0.2
136 0.17
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.22
142 0.23
143 0.22
144 0.24
145 0.29
146 0.32
147 0.39
148 0.41
149 0.42
150 0.45
151 0.48
152 0.5
153 0.45
154 0.42
155 0.35
156 0.31
157 0.25
158 0.18
159 0.13
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.26
183 0.31
184 0.29
185 0.32
186 0.33
187 0.29
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.2
192 0.22
193 0.18
194 0.15
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.19
199 0.22
200 0.25
201 0.29
202 0.32
203 0.36
204 0.39
205 0.38
206 0.32
207 0.3
208 0.25
209 0.2
210 0.18
211 0.2
212 0.16
213 0.2
214 0.3
215 0.36
216 0.43
217 0.42
218 0.41
219 0.39
220 0.4
221 0.42
222 0.37
223 0.29
224 0.25
225 0.24
226 0.22
227 0.2
228 0.17
229 0.11
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.13
237 0.18
238 0.27
239 0.31
240 0.38
241 0.37
242 0.38
243 0.39
244 0.44
245 0.46
246 0.44
247 0.46
248 0.48
249 0.48
250 0.49
251 0.49
252 0.45
253 0.39
254 0.32
255 0.26
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.2
264 0.22
265 0.18
266 0.16
267 0.17
268 0.19
269 0.24
270 0.24
271 0.21
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.16
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.18
305 0.21
306 0.21
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.26
313 0.26
314 0.29
315 0.29
316 0.28
317 0.27
318 0.27
319 0.23
320 0.17
321 0.13
322 0.09
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.12
334 0.14
335 0.17
336 0.22
337 0.23
338 0.22
339 0.22
340 0.21
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.12
353 0.14
354 0.13
355 0.16
356 0.18
357 0.19
358 0.21
359 0.21
360 0.27
361 0.28
362 0.28
363 0.27
364 0.27
365 0.26
366 0.28
367 0.3
368 0.22
369 0.24
370 0.23
371 0.22
372 0.21
373 0.2
374 0.15
375 0.14
376 0.12
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.08
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.11
404 0.16
405 0.19
406 0.25
407 0.31
408 0.33
409 0.39
410 0.44
411 0.4
412 0.38
413 0.42
414 0.36
415 0.3
416 0.28
417 0.22
418 0.17
419 0.16
420 0.14
421 0.08
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.05
426 0.08
427 0.08
428 0.13
429 0.17
430 0.2
431 0.21
432 0.24
433 0.24
434 0.22
435 0.24
436 0.21
437 0.22
438 0.23
439 0.24
440 0.26
441 0.29
442 0.3
443 0.29
444 0.3
445 0.26
446 0.3
447 0.36
448 0.38
449 0.4
450 0.4
451 0.4
452 0.37
453 0.39
454 0.34
455 0.36
456 0.34
457 0.33
458 0.4
459 0.39
460 0.42
461 0.42
462 0.42
463 0.39
464 0.45
465 0.48
466 0.4
467 0.42
468 0.41
469 0.42
470 0.39
471 0.34
472 0.28
473 0.24
474 0.23
475 0.21
476 0.21
477 0.19
478 0.19
479 0.17
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.23
487 0.24
488 0.24
489 0.22
490 0.24
491 0.24
492 0.29
493 0.29
494 0.27
495 0.26
496 0.25
497 0.24
498 0.24
499 0.25
500 0.2
501 0.19
502 0.2
503 0.2
504 0.21
505 0.21
506 0.18
507 0.14
508 0.14
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.14
513 0.14
514 0.15
515 0.16
516 0.19
517 0.16