Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6HIQ7

Protein Details
Accession B6HIQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-295GEPSGAGTEKKKKEKKRVIRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-295EKKKKEKKRVIRA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
IPR022938  SRP19_arc-type  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG pcs:Pc21g23450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSRHAQIEEVSDSDPEEIAPSYDSDDDLPRNAIISPVNIPTKAAPQPQQQMPMPSMPSMPAPEPQREIPRHFSCLYPVYFDKSRSRAEGRKVGAELAVENPLARDIVDAVQMLGLNAGLEPEKLHPKDWANPGRVRVQVKNEDGQLANPKIKNKHHLYILVAQYLKANPTTEKSPYRLRIRGLPMPEKLPAAPAAPRGWKIGKILPIHSPAYSGGGVSDNPLKDAMAEMQGMQGMEGMPNMSEMMSQMGGMGGLSNMLGGLGGLGGMGGMGGMGGEPSGAGTEKKKKEKKRVIRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.19
16 0.16
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.19
24 0.22
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.27
29 0.3
30 0.33
31 0.33
32 0.38
33 0.46
34 0.49
35 0.54
36 0.5
37 0.48
38 0.45
39 0.43
40 0.37
41 0.3
42 0.27
43 0.21
44 0.2
45 0.19
46 0.19
47 0.2
48 0.22
49 0.25
50 0.28
51 0.31
52 0.38
53 0.4
54 0.44
55 0.48
56 0.48
57 0.5
58 0.47
59 0.43
60 0.38
61 0.39
62 0.34
63 0.3
64 0.27
65 0.28
66 0.3
67 0.33
68 0.35
69 0.34
70 0.36
71 0.37
72 0.42
73 0.42
74 0.47
75 0.51
76 0.47
77 0.46
78 0.44
79 0.4
80 0.33
81 0.28
82 0.21
83 0.15
84 0.14
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.05
101 0.05
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.07
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.18
113 0.21
114 0.28
115 0.36
116 0.4
117 0.38
118 0.4
119 0.42
120 0.43
121 0.45
122 0.42
123 0.36
124 0.36
125 0.37
126 0.37
127 0.37
128 0.32
129 0.3
130 0.27
131 0.25
132 0.24
133 0.19
134 0.2
135 0.2
136 0.23
137 0.27
138 0.29
139 0.36
140 0.35
141 0.38
142 0.38
143 0.38
144 0.38
145 0.39
146 0.38
147 0.33
148 0.28
149 0.24
150 0.22
151 0.2
152 0.18
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.11
157 0.14
158 0.18
159 0.21
160 0.24
161 0.3
162 0.37
163 0.43
164 0.44
165 0.43
166 0.46
167 0.49
168 0.5
169 0.48
170 0.46
171 0.41
172 0.39
173 0.38
174 0.32
175 0.26
176 0.22
177 0.18
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.16
182 0.18
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.29
190 0.29
191 0.3
192 0.31
193 0.34
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.2
198 0.21
199 0.18
200 0.14
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.15
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.01
256 0.01
257 0.01
258 0.01
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.07
268 0.14
269 0.25
270 0.34
271 0.45
272 0.55
273 0.64
274 0.75
275 0.84