FuNGI

C5GNB3

Protein Details

Accession

C5GNB3

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-44	DILSRLRTRQWKSRARSRHEVPNTQD	Hydrophilic
84-106	EDDPTKPPSKHRRLPTPPSNAAS	Hydrophilic
373-392	QLRFCEKHRKETARREWSRL	Hydrophilic
420-448	SGYRSRYKSVVHKKVRKHGRKILSRSILH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
431-440	HKKVRKHGRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009057 Homeobox-like_sf IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4
PROSITE	View protein in PROSITE PS50090 MYB_LIKE

Amino Acid Sequences

MHLMVVVEVPIIADCLKEDILSRLRTRQWKSRARSRHEVPNTQDCKLPGKPVQCVEDNTTMSDTSSSSAHSDDTDDNYHASSEEDDPTKPPSKHRRLPTPPSNAASRHPRFQIPRAAAAAGREGVKQEDSKVRATTAKDHYTTPPNTNHGLDTYTHSRHPIDDKTHHCPLPLLARGEAVMLSSTVAQVIFKMVTGCPMTTSDLMSETTAAADTERDYSERKVEDLDGKRHHWTREEDNCLMALKQDSFSWLEIEEQFLHRQLSSLRQRWYTKLQNTHASNPPTDKLRQEGKCRASAGELLPISKPPTPLKTSHHYPSGQPQPADDPATPNAKPRTPSPSSTVTAMCPVCNSVVEVEASSAFDATNNRMGVREQLRFCEKHRKETARREWSRLRYPIIAWDRLDDRLTQFHPRLRRILDDSGYRSRYKSVVHKKVRKHGRKILSRSILHSTGYYGLRGHEILSAHVMSHFKDAIDSLAGIDSVASKYGTVVYAQEVLVPELLEMLVQEDMGVDAKGARWILKESNKIGNLLNLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.11
6	0.17
7	0.23
8	0.29
9	0.32
10	0.36
11	0.44
12	0.53
13	0.59
14	0.62
15	0.66
16	0.7
17	0.76
18	0.8
19	0.82
20	0.82
21	0.85
22	0.82
23	0.82
24	0.82
25	0.81
26	0.78
27	0.78
28	0.73
29	0.64
30	0.62
31	0.52
32	0.5
33	0.44
34	0.45
35	0.4
36	0.41
37	0.46
38	0.48
39	0.51
40	0.49
41	0.5
42	0.48
43	0.49
44	0.44
45	0.4
46	0.36
47	0.31
48	0.27
49	0.24
50	0.18
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.14
59	0.15
60	0.19
61	0.2
62	0.2
63	0.2
64	0.2
65	0.19
66	0.16
67	0.15
68	0.13
69	0.13
70	0.16
71	0.17
72	0.18
73	0.19
74	0.25
75	0.32
76	0.31
77	0.38
78	0.45
79	0.54
80	0.62
81	0.7
82	0.75
83	0.77
84	0.86
85	0.86
86	0.85
87	0.8
88	0.75
89	0.7
90	0.61
91	0.58
92	0.58
93	0.53
94	0.49
95	0.46
96	0.49
97	0.5
98	0.54
99	0.57
100	0.5
101	0.5
102	0.46
103	0.44
104	0.38
105	0.33
106	0.29
107	0.21
108	0.19
109	0.14
110	0.13
111	0.14
112	0.15
113	0.15
114	0.17
115	0.23
116	0.24
117	0.28
118	0.28
119	0.28
120	0.3
121	0.32
122	0.36
123	0.36
124	0.4
125	0.38
126	0.4
127	0.42
128	0.46
129	0.47
130	0.44
131	0.41
132	0.39
133	0.4
134	0.38
135	0.35
136	0.28
137	0.26
138	0.22
139	0.22
140	0.25
141	0.24
142	0.24
143	0.25
144	0.25
145	0.26
146	0.3
147	0.3
148	0.32
149	0.37
150	0.43
151	0.48
152	0.54
153	0.51
154	0.46
155	0.41
156	0.36
157	0.36
158	0.35
159	0.29
160	0.23
161	0.23
162	0.23
163	0.22
164	0.19
165	0.12
166	0.07
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.1
204	0.11
205	0.15
206	0.15
207	0.15
208	0.15
209	0.16
210	0.24
211	0.27
212	0.33
213	0.33
214	0.35
215	0.4
216	0.42
217	0.41
218	0.38
219	0.37
220	0.39
221	0.44
222	0.48
223	0.43
224	0.4
225	0.39
226	0.34
227	0.3
228	0.21
229	0.14
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.09
240	0.11
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.09
247	0.1
248	0.09
249	0.17
250	0.24
251	0.29
252	0.31
253	0.36
254	0.37
255	0.4
256	0.47
257	0.47
258	0.45
259	0.47
260	0.48
261	0.51
262	0.52
263	0.54
264	0.53
265	0.46
266	0.41
267	0.35
268	0.33
269	0.28
270	0.27
271	0.23
272	0.21
273	0.28
274	0.32
275	0.38
276	0.44
277	0.44
278	0.46
279	0.46
280	0.42
281	0.34
282	0.32
283	0.25
284	0.23
285	0.2
286	0.17
287	0.16
288	0.16
289	0.17
290	0.16
291	0.18
292	0.15
293	0.2
294	0.22
295	0.25
296	0.3
297	0.35
298	0.38
299	0.4
300	0.43
301	0.39
302	0.37
303	0.42
304	0.47
305	0.43
306	0.37
307	0.34
308	0.32
309	0.34
310	0.35
311	0.26
312	0.2
313	0.2
314	0.24
315	0.23
316	0.25
317	0.27
318	0.26
319	0.28
320	0.28
321	0.33
322	0.33
323	0.35
324	0.35
325	0.37
326	0.36
327	0.36
328	0.34
329	0.27
330	0.28
331	0.26
332	0.21
333	0.15
334	0.15
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.09
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.15
355	0.16
356	0.21
357	0.26
358	0.3
359	0.26
360	0.31
361	0.36
362	0.37
363	0.41
364	0.45
365	0.42
366	0.45
367	0.54
368	0.59
369	0.63
370	0.72
371	0.79
372	0.79
373	0.81
374	0.79
375	0.78
376	0.76
377	0.76
378	0.7
379	0.63
380	0.54
381	0.51
382	0.53
383	0.49
384	0.46
385	0.37
386	0.35
387	0.33
388	0.32
389	0.33
390	0.24
391	0.21
392	0.22
393	0.24
394	0.28
395	0.3
396	0.33
397	0.4
398	0.43
399	0.46
400	0.43
401	0.46
402	0.45
403	0.48
404	0.47
405	0.45
406	0.47
407	0.49
408	0.5
409	0.45
410	0.41
411	0.37
412	0.35
413	0.34
414	0.39
415	0.42
416	0.5
417	0.6
418	0.67
419	0.73
420	0.81
421	0.87
422	0.87
423	0.85
424	0.84
425	0.84
426	0.86
427	0.85
428	0.86
429	0.84
430	0.76
431	0.7
432	0.67
433	0.58
434	0.49
435	0.41
436	0.32
437	0.28
438	0.27
439	0.23
440	0.17
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.17
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.17
449	0.16
450	0.14
451	0.17
452	0.17
453	0.15
454	0.18
455	0.18
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.14
460	0.14
461	0.13
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.15
484	0.14
485	0.11
486	0.1
487	0.1
488	0.07
489	0.06
490	0.07
491	0.06
492	0.05
493	0.06
494	0.05
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.14
505	0.18
506	0.27
507	0.34
508	0.41
509	0.43
510	0.51
511	0.51
512	0.52
513	0.49

C5GNB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer