FuNGI

A0A5N5QQB6

Protein Details

Accession

A0A5N5QQB6

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
267-295	DDESSNESRKKKRRKKDKGKSSNNSNGGS	Hydrophilic
317-341	DSDSNTTASRKKKRRKEANSDSDAD	Hydrophilic
357-396	AKSDSDARFKKRKKSARSKSESRSKSRSKSRRTANSDSDS	Hydrophilic
410-447	SDSSGRGRNKSKSKKSAASKPKSKSKAKSGAKVKREVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-304	RKKKRRKKDKGKSSNNSNGGSTKRGKKRIR
326-332	RKKKRRK
364-388	RFKKRKKSARSKSESRSKSRSKSRR
415-444	RGRNKSKSKKSAASKPKSKSKAKSGAKVKR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSTLTPGELEVYEACSQAEDGMLRQKELEKRITIKGADMAAAVNGLLKKSLLKIMKDGKGILSYKAVDKADAKIVGLMDADESIVYKKIQEAKNEGIWTKHLKSTELHQSVITRVLKSLEKKGLIKSIKSHPTRKIYILANLQPSIEVSGGPWYNNSEFETEFVQTLCNACLNFIQKRSYPVQKSNSKLSPRALFPTSQSSRYPTAADVLNFLKQTNITDTPLEISHVESLLQVLIYDGSVEALPGSGIGGMPDLNGKDDNSDSDSDDESSNESRKKKRRKKDKGKSSNNSNGGSTKRGKKRIRDDSRSDSATSDDDSDSNTTASRKKKRRKEANSDSDADSDSDSDLDSGSADDDAKSDSDARFKKRKKSARSKSESRSKSRSKSRRTANSDSDSNSEPGSDPDSSSDSDSSGRGRNKSKSKKSAASKPKSKSKAKSGAKVKREVSPEEVQFDANAGRVYRAIRPERVAQGWTQSPCSVCPQFDFCHDDGPVNAQECQYYSTWLNAGVADAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.13
3	0.13
4	0.12
5	0.13
6	0.1
7	0.11
8	0.19
9	0.2
10	0.2
11	0.22
12	0.28
13	0.33
14	0.39
15	0.43
16	0.41
17	0.45
18	0.51
19	0.55
20	0.49
21	0.45
22	0.43
23	0.37
24	0.31
25	0.26
26	0.21
27	0.15
28	0.14
29	0.11
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.09
35	0.1
36	0.13
37	0.21
38	0.23
39	0.24
40	0.32
41	0.41
42	0.47
43	0.47
44	0.46
45	0.41
46	0.43
47	0.42
48	0.36
49	0.31
50	0.27
51	0.28
52	0.33
53	0.3
54	0.26
55	0.26
56	0.28
57	0.3
58	0.29
59	0.26
60	0.22
61	0.22
62	0.2
63	0.18
64	0.15
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.13
75	0.21
76	0.26
77	0.31
78	0.36
79	0.4
80	0.46
81	0.49
82	0.45
83	0.38
84	0.38
85	0.39
86	0.36
87	0.34
88	0.3
89	0.28
90	0.29
91	0.34
92	0.41
93	0.37
94	0.34
95	0.32
96	0.33
97	0.32
98	0.38
99	0.33
100	0.23
101	0.21
102	0.23
103	0.27
104	0.29
105	0.35
106	0.34
107	0.36
108	0.38
109	0.41
110	0.47
111	0.45
112	0.44
113	0.43
114	0.46
115	0.51
116	0.55
117	0.58
118	0.57
119	0.62
120	0.63
121	0.6
122	0.57
123	0.5
124	0.5
125	0.5
126	0.47
127	0.43
128	0.39
129	0.36
130	0.3
131	0.27
132	0.22
133	0.15
134	0.1
135	0.07
136	0.11
137	0.12
138	0.12
139	0.12
140	0.14
141	0.14
142	0.16
143	0.17
144	0.14
145	0.13
146	0.14
147	0.16
148	0.13
149	0.13
150	0.12
151	0.11
152	0.09
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.11
159	0.15
160	0.18
161	0.2
162	0.23
163	0.23
164	0.28
165	0.32
166	0.38
167	0.39
168	0.44
169	0.51
170	0.54
171	0.57
172	0.6
173	0.62
174	0.58
175	0.56
176	0.52
177	0.48
178	0.43
179	0.44
180	0.37
181	0.31
182	0.29
183	0.35
184	0.33
185	0.31
186	0.3
187	0.29
188	0.3
189	0.3
190	0.29
191	0.19
192	0.2
193	0.19
194	0.18
195	0.17
196	0.15
197	0.16
198	0.15
199	0.15
200	0.13
201	0.11
202	0.12
203	0.14
204	0.15
205	0.14
206	0.14
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.06
217	0.07
218	0.06
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.11
258	0.14
259	0.17
260	0.21
261	0.29
262	0.38
263	0.49
264	0.57
265	0.66
266	0.75
267	0.82
268	0.89
269	0.92
270	0.94
271	0.94
272	0.95
273	0.93
274	0.9
275	0.88
276	0.81
277	0.71
278	0.61
279	0.53
280	0.43
281	0.4
282	0.36
283	0.36
284	0.39
285	0.48
286	0.52
287	0.58
288	0.67
289	0.73
290	0.78
291	0.77
292	0.77
293	0.75
294	0.75
295	0.68
296	0.58
297	0.48
298	0.38
299	0.31
300	0.24
301	0.18
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.16
311	0.24
312	0.33
313	0.43
314	0.52
315	0.62
316	0.72
317	0.82
318	0.86
319	0.89
320	0.9
321	0.9
322	0.86
323	0.79
324	0.7
325	0.6
326	0.5
327	0.39
328	0.28
329	0.18
330	0.12
331	0.09
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.09
347	0.1
348	0.17
349	0.22
350	0.3
351	0.39
352	0.45
353	0.54
354	0.62
355	0.71
356	0.74
357	0.81
358	0.84
359	0.86
360	0.89
361	0.88
362	0.88
363	0.89
364	0.85
365	0.82
366	0.8
367	0.78
368	0.78
369	0.8
370	0.8
371	0.79
372	0.81
373	0.83
374	0.84
375	0.84
376	0.83
377	0.81
378	0.78
379	0.71
380	0.65
381	0.58
382	0.49
383	0.42
384	0.33
385	0.25
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.15
390	0.13
391	0.14
392	0.16
393	0.17
394	0.18
395	0.17
396	0.15
397	0.15
398	0.16
399	0.17
400	0.22
401	0.26
402	0.29
403	0.36
404	0.44
405	0.54
406	0.64
407	0.71
408	0.74
409	0.78
410	0.82
411	0.84
412	0.86
413	0.86
414	0.86
415	0.84
416	0.83
417	0.85
418	0.85
419	0.85
420	0.82
421	0.82
422	0.82
423	0.81
424	0.82
425	0.83
426	0.83
427	0.82
428	0.81
429	0.73
430	0.69
431	0.66
432	0.6
433	0.56
434	0.54
435	0.49
436	0.44
437	0.42
438	0.35
439	0.3
440	0.28
441	0.21
442	0.15
443	0.14
444	0.11
445	0.12
446	0.13
447	0.16
448	0.2
449	0.28
450	0.32
451	0.35
452	0.39
453	0.45
454	0.5
455	0.5
456	0.47
457	0.4
458	0.41
459	0.43
460	0.41
461	0.38
462	0.33
463	0.31
464	0.32
465	0.38
466	0.34
467	0.29
468	0.31
469	0.33
470	0.33
471	0.37
472	0.42
473	0.34
474	0.37
475	0.36
476	0.34
477	0.29
478	0.32
479	0.31
480	0.27
481	0.28
482	0.21
483	0.22
484	0.22
485	0.24
486	0.2
487	0.2
488	0.19
489	0.2
490	0.21
491	0.21
492	0.2
493	0.17

A0A5N5QQB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer