FuNGI

A0A5N5QVP5

Protein Details

Accession

A0A5N5QVP5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-32	MSRPLKRIPIPEPKRRRPPPPKDISAKRETST	Hydrophilic
132-159	EEEGKGKKKAKEDPKKKAFAKKTRQVHM	Basic
544-566	GGTSGVQKKKKSKHDLVAPNGDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-24	KRIPIPEPKRRRPPPPKDI
130-155	KKEEEGKGKKKAKEDPKKKAFAKKTR
270-289	ARTKPKKEEEDEKPARGIRK
511-522	GKKRKDHPDRGG
552-553	KK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSRPLKRIPIPEPKRRRPPPPKDISAKRETSTTPAPSNTPQGAYVDYKLTSSKHSDKKWDVFKLLSHQDTPIDLNSWPAPVKLNRKDFKSRNEVEESAGPLTPMLGPDGKPVIGPDGKIVMLNADGTRYKKEEEGKGKKKAKEDPKKKAFAKKTRQVHMIPEEVRAFRKEHRKDWLLEDNGGGLAAKQSWSGKYSDANDKQIYAFFAPVPGSDMEFRFIPVHRFYNFTRNNNVSNERVESQVSHISAQTLKRLFTMDSQHARMQAAKNSARTKPKKEEEDEKPARGIRKLKLVNTGRERYADEDHKPHLGGEGQYDEMEYEDEVQDDEELPADALQDEDEKEAAERQKREYLRDKVSARVEPESDEDDEDKGYTEDGRQLKKLMKKMLNESDDEKNPYADSDDEDDEEETKPEQPPAIGVMPNTPTPSGTSTPRPQQSSQQTQSSQPQKPTQNASALNNSISRASSMGGSALLAQRATSPHPIRKSPGVTSSVNRATTPLPSGAATPASGGKKRKDHPDRGGTPTPPQKRPTPTPQSPSPATPGGTSGVQKKKKSKHDLVAPNGDPLPEVIMEEHAIEYLRKMGGAVQTSEVIIYFKRALKHDPENQKRLTDALKKVSTQAQKGYIKLNAPWSNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.87
3	0.9
4	0.9
5	0.91
6	0.91
7	0.91
8	0.9
9	0.89
10	0.91
11	0.88
12	0.86
13	0.8
14	0.7
15	0.64
16	0.56
17	0.53
18	0.5
19	0.48
20	0.43
21	0.41
22	0.43
23	0.42
24	0.48
25	0.43
26	0.37
27	0.32
28	0.29
29	0.31
30	0.3
31	0.28
32	0.25
33	0.22
34	0.22
35	0.23
36	0.22
37	0.23
38	0.28
39	0.36
40	0.42
41	0.47
42	0.56
43	0.62
44	0.7
45	0.75
46	0.73
47	0.68
48	0.61
49	0.59
50	0.58
51	0.58
52	0.52
53	0.44
54	0.39
55	0.36
56	0.36
57	0.34
58	0.26
59	0.2
60	0.17
61	0.19
62	0.18
63	0.19
64	0.18
65	0.16
66	0.2
67	0.26
68	0.36
69	0.42
70	0.51
71	0.54
72	0.61
73	0.71
74	0.72
75	0.74
76	0.75
77	0.7
78	0.66
79	0.68
80	0.62
81	0.55
82	0.51
83	0.45
84	0.36
85	0.31
86	0.25
87	0.17
88	0.17
89	0.14
90	0.11
91	0.1
92	0.11
93	0.11
94	0.14
95	0.16
96	0.16
97	0.15
98	0.15
99	0.19
100	0.18
101	0.18
102	0.17
103	0.17
104	0.17
105	0.17
106	0.16
107	0.11
108	0.1
109	0.11
110	0.1
111	0.1
112	0.13
113	0.15
114	0.18
115	0.19
116	0.21
117	0.24
118	0.3
119	0.37
120	0.46
121	0.55
122	0.6
123	0.69
124	0.75
125	0.75
126	0.76
127	0.76
128	0.76
129	0.77
130	0.79
131	0.79
132	0.81
133	0.86
134	0.85
135	0.86
136	0.85
137	0.85
138	0.85
139	0.83
140	0.82
141	0.8
142	0.8
143	0.71
144	0.69
145	0.63
146	0.6
147	0.51
148	0.46
149	0.43
150	0.38
151	0.38
152	0.32
153	0.29
154	0.28
155	0.38
156	0.4
157	0.42
158	0.5
159	0.52
160	0.53
161	0.58
162	0.61
163	0.53
164	0.48
165	0.42
166	0.34
167	0.29
168	0.25
169	0.18
170	0.08
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.08
176	0.09
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.17
181	0.21
182	0.3
183	0.33
184	0.37
185	0.36
186	0.36
187	0.35
188	0.32
189	0.29
190	0.2
191	0.17
192	0.11
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.17
208	0.2
209	0.2
210	0.23
211	0.24
212	0.33
213	0.39
214	0.38
215	0.42
216	0.41
217	0.44
218	0.44
219	0.46
220	0.38
221	0.33
222	0.33
223	0.27
224	0.25
225	0.22
226	0.18
227	0.18
228	0.19
229	0.18
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.17
234	0.17
235	0.2
236	0.17
237	0.17
238	0.17
239	0.18
240	0.18
241	0.19
242	0.23
243	0.25
244	0.28
245	0.3
246	0.31
247	0.31
248	0.31
249	0.3
250	0.27
251	0.24
252	0.27
253	0.27
254	0.31
255	0.34
256	0.39
257	0.46
258	0.49
259	0.52
260	0.55
261	0.6
262	0.62
263	0.62
264	0.67
265	0.63
266	0.69
267	0.65
268	0.57
269	0.51
270	0.46
271	0.44
272	0.39
273	0.37
274	0.28
275	0.34
276	0.36
277	0.36
278	0.44
279	0.46
280	0.49
281	0.51
282	0.51
283	0.42
284	0.41
285	0.39
286	0.33
287	0.33
288	0.29
289	0.25
290	0.25
291	0.26
292	0.25
293	0.24
294	0.21
295	0.17
296	0.15
297	0.13
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.03
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.09
330	0.13
331	0.17
332	0.18
333	0.21
334	0.28
335	0.3
336	0.35
337	0.41
338	0.44
339	0.45
340	0.51
341	0.49
342	0.48
343	0.51
344	0.47
345	0.4
346	0.35
347	0.3
348	0.24
349	0.24
350	0.21
351	0.18
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.12
363	0.17
364	0.19
365	0.19
366	0.22
367	0.27
368	0.32
369	0.37
370	0.4
371	0.41
372	0.43
373	0.5
374	0.56
375	0.52
376	0.49
377	0.47
378	0.43
379	0.41
380	0.4
381	0.33
382	0.25
383	0.23
384	0.21
385	0.19
386	0.13
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.14
392	0.14
393	0.13
394	0.13
395	0.12
396	0.09
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.13
404	0.15
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.16
409	0.17
410	0.18
411	0.14
412	0.12
413	0.13
414	0.17
415	0.16
416	0.18
417	0.24
418	0.28
419	0.36
420	0.41
421	0.44
422	0.42
423	0.48
424	0.54
425	0.58
426	0.57
427	0.56
428	0.52
429	0.52
430	0.59
431	0.59
432	0.54
433	0.49
434	0.52
435	0.51
436	0.54
437	0.56
438	0.51
439	0.49
440	0.48
441	0.46
442	0.44
443	0.4
444	0.36
445	0.31
446	0.28
447	0.22
448	0.19
449	0.16
450	0.11
451	0.1
452	0.09
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.11
464	0.14
465	0.21
466	0.25
467	0.31
468	0.36
469	0.39
470	0.42
471	0.48
472	0.5
473	0.45
474	0.45
475	0.43
476	0.41
477	0.4
478	0.44
479	0.42
480	0.39
481	0.35
482	0.31
483	0.27
484	0.27
485	0.27
486	0.2
487	0.16
488	0.15
489	0.16
490	0.16
491	0.15
492	0.13
493	0.11
494	0.16
495	0.18
496	0.23
497	0.27
498	0.33
499	0.41
500	0.46
501	0.56
502	0.61
503	0.67
504	0.72
505	0.78
506	0.77
507	0.77
508	0.78
509	0.69
510	0.68
511	0.68
512	0.66
513	0.61
514	0.6
515	0.59
516	0.6
517	0.67
518	0.69
519	0.69
520	0.7
521	0.71
522	0.74
523	0.73
524	0.68
525	0.62
526	0.57
527	0.49
528	0.42
529	0.35
530	0.3
531	0.25
532	0.24
533	0.24
534	0.28
535	0.34
536	0.41
537	0.47
538	0.55
539	0.62
540	0.71
541	0.79
542	0.79
543	0.79
544	0.82
545	0.86
546	0.84
547	0.85
548	0.75
549	0.68
550	0.59
551	0.49
552	0.38
553	0.29
554	0.23
555	0.13
556	0.13
557	0.09
558	0.1
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.09
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.11
567	0.11
568	0.1
569	0.1
570	0.14
571	0.18
572	0.21
573	0.22
574	0.21
575	0.22
576	0.22
577	0.22
578	0.18
579	0.14
580	0.11
581	0.13
582	0.15
583	0.18
584	0.23
585	0.26
586	0.32
587	0.39
588	0.48
589	0.54
590	0.61
591	0.68
592	0.71
593	0.71
594	0.67
595	0.6
596	0.55
597	0.54
598	0.52
599	0.49
600	0.51
601	0.52
602	0.51
603	0.54
604	0.59
605	0.58
606	0.54
607	0.53
608	0.53
609	0.52
610	0.54
611	0.55
612	0.52
613	0.47
614	0.46
615	0.5

A0A5N5QVP5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer