Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QVD5

Protein Details
Accession A0A5N5QVD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
513-544QDGESPAKRPRGRPKGSKNKPKAPPPSEPTADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
519-537AKRPRGRPKGSKNKPKAPP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR018482  Znf-C4H2  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10146  zf-C4H2  
Amino Acid Sequences MSPTTQSSKPPPPKSISYEDYVVRVISLMTKEKGSIDQPSLRRTMGLAPSYLILDTTTLSSSAMGVRAWMSGFHKLVDVMLALHAREELELETVNCASQSCSECWTMTGSFHGLQEARTGVRSIAARLRGILDPNGIEYKGEKTTNPSLDVMRNCPPHKLVTSCRDSKNCLGPQRPLPDHQSNPHGQQYSLQQAHFGPPHQHQPHPQQQSTSVSPQPQYYHAGQDHVNGYANNQPYVDPHQKTFAVPPTAAQQHPQVASARASMVPAQSVTQETYQSPVIAQPGSDWAKDLIRQARTSELKKHSLTLQLHTAQILSAHSSLEQRNKKLEDVKAEKTWLESERARLLECLREVNEDREKVDLSESTLLKEINEFKTKIKTITEGEYETAKKEVDGIRKELGMPPLPSLQATLEEKSARGFIPHTSVFGVADAGSSHNGSTHSKRRLEETNEEVPADGETIPATVPCSVMRPSLYSMAQANGTPVVKRGPGRPRKTPLDVNSDPSVPGPSNSVGQDGESPAKRPRGRPKGSKNKPKAPPPSEPTADS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.72
3 0.65
4 0.59
5 0.56
6 0.5
7 0.46
8 0.39
9 0.32
10 0.23
11 0.19
12 0.15
13 0.14
14 0.17
15 0.2
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.24
20 0.27
21 0.26
22 0.28
23 0.3
24 0.36
25 0.39
26 0.43
27 0.44
28 0.41
29 0.38
30 0.34
31 0.35
32 0.34
33 0.32
34 0.28
35 0.26
36 0.27
37 0.27
38 0.25
39 0.17
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.16
65 0.14
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.19
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.23
93 0.19
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.11
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.21
115 0.24
116 0.22
117 0.24
118 0.22
119 0.18
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.15
127 0.17
128 0.18
129 0.16
130 0.21
131 0.29
132 0.31
133 0.33
134 0.31
135 0.29
136 0.34
137 0.36
138 0.34
139 0.33
140 0.37
141 0.36
142 0.37
143 0.36
144 0.34
145 0.35
146 0.36
147 0.37
148 0.39
149 0.46
150 0.5
151 0.54
152 0.53
153 0.54
154 0.54
155 0.56
156 0.53
157 0.53
158 0.5
159 0.5
160 0.54
161 0.58
162 0.55
163 0.49
164 0.5
165 0.5
166 0.5
167 0.49
168 0.48
169 0.43
170 0.44
171 0.46
172 0.39
173 0.32
174 0.31
175 0.32
176 0.34
177 0.33
178 0.29
179 0.25
180 0.25
181 0.29
182 0.27
183 0.24
184 0.19
185 0.19
186 0.3
187 0.31
188 0.33
189 0.35
190 0.43
191 0.51
192 0.55
193 0.53
194 0.44
195 0.45
196 0.47
197 0.45
198 0.4
199 0.34
200 0.29
201 0.29
202 0.29
203 0.28
204 0.24
205 0.25
206 0.22
207 0.25
208 0.23
209 0.24
210 0.22
211 0.24
212 0.22
213 0.19
214 0.19
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.21
224 0.27
225 0.23
226 0.23
227 0.26
228 0.26
229 0.27
230 0.29
231 0.27
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.22
236 0.25
237 0.24
238 0.22
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.2
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.19
278 0.19
279 0.2
280 0.21
281 0.21
282 0.27
283 0.31
284 0.32
285 0.37
286 0.36
287 0.39
288 0.39
289 0.4
290 0.35
291 0.39
292 0.37
293 0.31
294 0.32
295 0.28
296 0.28
297 0.26
298 0.23
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.1
307 0.12
308 0.21
309 0.25
310 0.25
311 0.3
312 0.32
313 0.34
314 0.38
315 0.39
316 0.39
317 0.41
318 0.44
319 0.41
320 0.41
321 0.38
322 0.33
323 0.33
324 0.25
325 0.23
326 0.2
327 0.21
328 0.24
329 0.25
330 0.24
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.17
337 0.2
338 0.21
339 0.26
340 0.3
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.25
345 0.21
346 0.21
347 0.16
348 0.13
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.18
356 0.2
357 0.2
358 0.24
359 0.25
360 0.25
361 0.33
362 0.34
363 0.33
364 0.3
365 0.29
366 0.27
367 0.31
368 0.31
369 0.26
370 0.25
371 0.27
372 0.26
373 0.23
374 0.21
375 0.16
376 0.13
377 0.16
378 0.21
379 0.25
380 0.28
381 0.31
382 0.31
383 0.32
384 0.33
385 0.32
386 0.31
387 0.27
388 0.24
389 0.23
390 0.24
391 0.23
392 0.22
393 0.2
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.19
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.18
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.17
413 0.16
414 0.15
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.11
424 0.15
425 0.22
426 0.3
427 0.37
428 0.42
429 0.43
430 0.47
431 0.54
432 0.57
433 0.57
434 0.55
435 0.54
436 0.5
437 0.49
438 0.44
439 0.35
440 0.28
441 0.22
442 0.15
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.11
453 0.12
454 0.15
455 0.16
456 0.18
457 0.2
458 0.25
459 0.24
460 0.24
461 0.24
462 0.23
463 0.23
464 0.2
465 0.19
466 0.18
467 0.18
468 0.16
469 0.16
470 0.17
471 0.2
472 0.23
473 0.3
474 0.37
475 0.47
476 0.54
477 0.62
478 0.68
479 0.72
480 0.77
481 0.78
482 0.73
483 0.73
484 0.68
485 0.64
486 0.59
487 0.51
488 0.44
489 0.36
490 0.33
491 0.23
492 0.21
493 0.19
494 0.17
495 0.2
496 0.2
497 0.22
498 0.18
499 0.19
500 0.21
501 0.21
502 0.26
503 0.25
504 0.27
505 0.31
506 0.41
507 0.45
508 0.51
509 0.59
510 0.63
511 0.71
512 0.79
513 0.84
514 0.86
515 0.92
516 0.94
517 0.93
518 0.92
519 0.92
520 0.91
521 0.91
522 0.87
523 0.86
524 0.81
525 0.81