Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QFS1

Protein Details
Accession A0A5N5QFS1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-122VQSIAHKKKYHRFLARRKPFLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-125KKKYHRFLARRKPFLDRIK
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR013249  RNA_pol_sigma70_r4_t2  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016987  F:sigma factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF08281  Sigma70_r4_2  
Amino Acid Sequences MSRRGHKELPETLRTYILALRVEGYTYKEIGEKLSIAPSTAFKTVARALKHGTLKSLPRSGCPPALSETTCRLVVRKLTIYRFEPYSLIAKRIGNVTAQQVQSIAHKKKYHRFLARRKPFLDRIKAVKRLVWARENRMRNWNTVMWTDEVPLETGGKSHRPRVTCRAGEAYLPECIAPTFQSGRKSLMAWGCIAHGYKGPLIRLEVEPCSVTSTGRKRGGGVGARVYVDQVISGPMKDCLAHLEKERGHPMLVVEDGAPSHWGKAAKVAREKYGIQQLAHPPNSPDLNPIEPIWRLLKNRIDSIPESRKDLEHLWATAQSVWDSITVEEVNKHTGKMNARVTAVIKAKGFQTPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.39
3 0.32
4 0.28
5 0.23
6 0.2
7 0.2
8 0.18
9 0.19
10 0.18
11 0.2
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.2
18 0.2
19 0.17
20 0.16
21 0.21
22 0.2
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.16
30 0.2
31 0.26
32 0.3
33 0.3
34 0.29
35 0.32
36 0.38
37 0.44
38 0.41
39 0.39
40 0.39
41 0.43
42 0.46
43 0.5
44 0.43
45 0.4
46 0.44
47 0.44
48 0.43
49 0.38
50 0.34
51 0.31
52 0.34
53 0.33
54 0.31
55 0.31
56 0.29
57 0.3
58 0.28
59 0.25
60 0.24
61 0.27
62 0.29
63 0.32
64 0.35
65 0.38
66 0.44
67 0.45
68 0.45
69 0.43
70 0.38
71 0.31
72 0.27
73 0.31
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.24
78 0.24
79 0.25
80 0.24
81 0.18
82 0.18
83 0.21
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.2
88 0.19
89 0.24
90 0.31
91 0.3
92 0.32
93 0.37
94 0.43
95 0.51
96 0.6
97 0.63
98 0.65
99 0.71
100 0.75
101 0.82
102 0.86
103 0.84
104 0.77
105 0.75
106 0.73
107 0.72
108 0.69
109 0.63
110 0.62
111 0.62
112 0.67
113 0.6
114 0.53
115 0.5
116 0.48
117 0.48
118 0.46
119 0.43
120 0.45
121 0.52
122 0.54
123 0.52
124 0.55
125 0.52
126 0.46
127 0.46
128 0.4
129 0.34
130 0.31
131 0.3
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.15
136 0.13
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.14
144 0.16
145 0.22
146 0.25
147 0.27
148 0.32
149 0.4
150 0.47
151 0.41
152 0.42
153 0.4
154 0.36
155 0.34
156 0.32
157 0.25
158 0.17
159 0.15
160 0.13
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.06
165 0.07
166 0.09
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.16
200 0.21
201 0.28
202 0.31
203 0.31
204 0.3
205 0.33
206 0.38
207 0.36
208 0.32
209 0.28
210 0.25
211 0.25
212 0.24
213 0.22
214 0.16
215 0.11
216 0.09
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.11
227 0.14
228 0.16
229 0.18
230 0.25
231 0.26
232 0.3
233 0.34
234 0.29
235 0.26
236 0.25
237 0.23
238 0.18
239 0.17
240 0.13
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.2
252 0.24
253 0.29
254 0.38
255 0.4
256 0.4
257 0.43
258 0.45
259 0.41
260 0.46
261 0.43
262 0.35
263 0.39
264 0.44
265 0.49
266 0.49
267 0.45
268 0.36
269 0.38
270 0.4
271 0.34
272 0.28
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.24
277 0.23
278 0.21
279 0.23
280 0.24
281 0.26
282 0.26
283 0.32
284 0.39
285 0.39
286 0.44
287 0.44
288 0.45
289 0.43
290 0.5
291 0.52
292 0.47
293 0.48
294 0.44
295 0.43
296 0.41
297 0.4
298 0.37
299 0.31
300 0.3
301 0.28
302 0.27
303 0.28
304 0.25
305 0.24
306 0.18
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.16
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.27
322 0.32
323 0.38
324 0.44
325 0.42
326 0.43
327 0.45
328 0.44
329 0.46
330 0.45
331 0.4
332 0.34
333 0.31
334 0.32