Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QMT4

Protein Details
Accession A0A5N5QMT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-155KPKSGGTRNKARSKRSKQRKATKWADKCMYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-147KPKSGGTRNKARSKRSKQRKAT
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Amino Acid Sequences MSHRARIKTPPILRPGASQEARRQRALEEQHITHYLAEQNRALRIDAARNIDLFAGLSLNERNADGDDSDSEDDNNALPQSAMGVARFLTQMDLPDSPPQTKVSDAMISSGPNETINSSTQVKQLKPKSGGTRNKARSKRSKQRKATKWADKCMYAELLEMNDAPDSWDSGNDDGLPKDLEREWVALAPVPKGKRCIAVSFAPSLSGPDEPTSVLQANTALHSRVKGLAFMRFPAPLPPDTILDCILDEDVTRTGVLHVLDVIRWRGTDVAQCEVDFRFWFRDARLAELAPQPEPTRTVAGSRPYPHRFLGVPYYLPPLTSALFLQTIIPVAQISAPPARSSTEMEMEMDTNEGQATCVKSDGILLYVREAAYTPGETPLSCWIPSAPLDNAMNQEPPLQLFQRWVNLTQHYRNMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.58
4 0.54
5 0.51
6 0.54
7 0.59
8 0.62
9 0.6
10 0.53
11 0.46
12 0.51
13 0.53
14 0.52
15 0.49
16 0.46
17 0.48
18 0.49
19 0.48
20 0.39
21 0.34
22 0.31
23 0.27
24 0.29
25 0.28
26 0.28
27 0.3
28 0.31
29 0.29
30 0.27
31 0.27
32 0.3
33 0.32
34 0.35
35 0.33
36 0.32
37 0.32
38 0.28
39 0.25
40 0.18
41 0.13
42 0.08
43 0.07
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.19
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.21
88 0.21
89 0.21
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.14
105 0.16
106 0.17
107 0.21
108 0.26
109 0.27
110 0.34
111 0.39
112 0.44
113 0.45
114 0.5
115 0.55
116 0.6
117 0.67
118 0.65
119 0.7
120 0.71
121 0.77
122 0.76
123 0.76
124 0.77
125 0.79
126 0.83
127 0.84
128 0.86
129 0.86
130 0.91
131 0.91
132 0.9
133 0.9
134 0.9
135 0.86
136 0.84
137 0.77
138 0.68
139 0.59
140 0.51
141 0.42
142 0.31
143 0.24
144 0.16
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.18
180 0.19
181 0.22
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.25
186 0.25
187 0.24
188 0.23
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.13
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.14
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.18
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.21
270 0.2
271 0.25
272 0.25
273 0.22
274 0.24
275 0.26
276 0.27
277 0.21
278 0.22
279 0.19
280 0.17
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.15
285 0.18
286 0.2
287 0.25
288 0.3
289 0.33
290 0.4
291 0.41
292 0.43
293 0.41
294 0.4
295 0.35
296 0.33
297 0.36
298 0.3
299 0.27
300 0.26
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.23
305 0.18
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.17
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.17
337 0.13
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.15
365 0.17
366 0.22
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.19
371 0.21
372 0.23
373 0.26
374 0.2
375 0.22
376 0.24
377 0.25
378 0.28
379 0.27
380 0.27
381 0.23
382 0.25
383 0.2
384 0.21
385 0.23
386 0.22
387 0.21
388 0.24
389 0.28
390 0.33
391 0.35
392 0.37
393 0.37
394 0.44
395 0.5
396 0.52