Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UMV5

Protein Details
Accession A0A179UMV5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-43SVATKLSKRPLKQQRTDKTIPGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
KEGG bgh:BDBG_04313  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MSLVKYSDSESEETNPVSRSNSVATKLSKRPLKQQRTDKTIPGSDDGDGRGGNTIALPPLPSEFLDLYASNSRISVQDDPSLHDGRKRVMPHVPGNWPTHIYLEWYPAAAEIAILAEVIARCGQKLENGLKVHGLLYSDLGAQAPLHISLSRPVVLVKEDRQPFRDLLNDALRESDIRPFHVKTDGLDWVSNFEKTRWFLVLRVMKPANNELNRLLAISNRSLAAFQQPPLYQTPAPAYTRASDRNTEKPPKQRSTTSSVAVADYSDYFHISIAWSLTEPSREDKERVASVELDKVKKIGIPFGSVKLKIGNIVHNLELPTGVLDEGGFCGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.22
4 0.24
5 0.22
6 0.21
7 0.23
8 0.26
9 0.27
10 0.31
11 0.36
12 0.41
13 0.47
14 0.54
15 0.56
16 0.55
17 0.63
18 0.68
19 0.73
20 0.75
21 0.79
22 0.8
23 0.82
24 0.83
25 0.78
26 0.74
27 0.69
28 0.61
29 0.54
30 0.45
31 0.37
32 0.34
33 0.29
34 0.23
35 0.18
36 0.16
37 0.14
38 0.12
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.2
56 0.21
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.19
62 0.19
63 0.17
64 0.22
65 0.23
66 0.26
67 0.3
68 0.31
69 0.28
70 0.28
71 0.27
72 0.25
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.32
77 0.38
78 0.41
79 0.45
80 0.48
81 0.47
82 0.48
83 0.46
84 0.41
85 0.36
86 0.31
87 0.25
88 0.22
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.09
97 0.07
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.14
113 0.17
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.23
118 0.23
119 0.21
120 0.16
121 0.14
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.19
146 0.23
147 0.24
148 0.26
149 0.28
150 0.27
151 0.26
152 0.27
153 0.2
154 0.2
155 0.24
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.12
164 0.14
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.21
169 0.21
170 0.16
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.14
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.24
188 0.31
189 0.28
190 0.33
191 0.33
192 0.31
193 0.32
194 0.37
195 0.36
196 0.3
197 0.31
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.24
202 0.19
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.19
215 0.19
216 0.21
217 0.23
218 0.27
219 0.21
220 0.21
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.24
225 0.23
226 0.21
227 0.26
228 0.3
229 0.29
230 0.31
231 0.34
232 0.41
233 0.48
234 0.55
235 0.57
236 0.61
237 0.67
238 0.69
239 0.7
240 0.68
241 0.65
242 0.63
243 0.62
244 0.54
245 0.48
246 0.41
247 0.37
248 0.3
249 0.25
250 0.18
251 0.13
252 0.12
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.13
266 0.14
267 0.18
268 0.24
269 0.26
270 0.28
271 0.31
272 0.36
273 0.36
274 0.37
275 0.35
276 0.31
277 0.3
278 0.36
279 0.37
280 0.34
281 0.31
282 0.29
283 0.27
284 0.27
285 0.26
286 0.25
287 0.21
288 0.25
289 0.28
290 0.34
291 0.4
292 0.38
293 0.38
294 0.34
295 0.32
296 0.31
297 0.31
298 0.3
299 0.29
300 0.32
301 0.31
302 0.31
303 0.31
304 0.26
305 0.24
306 0.18
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.07
311 0.07
312 0.07