Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QVP4

Protein Details
Accession A0A5N5QVP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-253LEPPRFKHKKIPRGPPSPPPTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-260RFKHKKIPRGPPSPPPTILRSPPR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008914  PEBP  
IPR036610  PEBP-like_sf  
IPR035810  PEBP_euk  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01161  PBP  
PF02731  SKIP_SNW  
CDD cd00866  PEBP_euk  
Amino Acid Sequences MVDDGRGGRRECANTGCDASANDNLNFHHSTMAALASLLPQPVNAPISDDEEEKAPVTALAPAVVIPPYGQRKGWRPAKQADFGDGGAYPECHIAQYPLDLGKKKANPGNTLALQVDSEGNVRYDAIAQQGHRDGRRVQSQFKDLVPLVHRTDLDDEARLMERPSEDEVQATADRTRAALEKLVNGKIKAAQPKNVPDSVGKSSFVRYTPSQQSGNGMNQRIIKITEVVEDPLEPPRFKHKKIPRGPPSPPPTILRSPPRKATAAEQKEWMIPPCISNWKNNKGFTIPLDKRLAADGRGLQDVHINDNFAKFSESLFIADRHAREEVRQRSLMQQKIVEKEKAAKEEQLREMAQRARAERGGLVAPSAGGSTAAAAPKANLSGVAGYGSGSDESSDEEDEDEEAAKLRDQMRREKRHERERELRMNNMGTEQRAKQLARQEHRDISEKVALGLAKPTLSKESMLDSRLFNQQSLSHSFADEDSYNLYDKPLFHGSSAAAAIYKSRGNISTGDDSAFGGGTEEGIRRTLEQDRFNLGVSNFEGAREQEVREGPVMFEKDATASTGADVFGVDQFLDAAKRGEKRGLDTNAGGSRKRQQLEQAEDQDWVDAIAVPKCPTTKLGHPRPSLDEVKASFYKAKIVPELLPVFAPTSLLYLTYKSDSLKDTEVVLPGKKFAKDTTENQPEISIEGPGWPGAYVFFLLDPDAPSHSNPKWAQVRHMFAGNLTVSGLSKHVPNSVVLSNATTAVNEYMPPAPPAGTGHHRYVALLYAQPPDFDFSFLNTTDRYDFNITEFSRRSGLGMPLAGTFMSVKVKKDEDVNWLMPLDHLRENWPQIGFNLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.34
4 0.29
5 0.26
6 0.27
7 0.28
8 0.3
9 0.26
10 0.25
11 0.25
12 0.29
13 0.29
14 0.26
15 0.21
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.13
30 0.15
31 0.13
32 0.15
33 0.16
34 0.22
35 0.24
36 0.24
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.2
41 0.18
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.08
54 0.15
55 0.21
56 0.23
57 0.26
58 0.3
59 0.38
60 0.49
61 0.58
62 0.6
63 0.61
64 0.68
65 0.74
66 0.75
67 0.69
68 0.63
69 0.56
70 0.47
71 0.4
72 0.31
73 0.25
74 0.18
75 0.16
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.19
86 0.23
87 0.25
88 0.27
89 0.34
90 0.38
91 0.43
92 0.45
93 0.46
94 0.45
95 0.48
96 0.54
97 0.46
98 0.45
99 0.38
100 0.34
101 0.28
102 0.25
103 0.2
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.19
117 0.25
118 0.3
119 0.29
120 0.32
121 0.32
122 0.36
123 0.46
124 0.45
125 0.47
126 0.49
127 0.53
128 0.53
129 0.5
130 0.48
131 0.39
132 0.41
133 0.36
134 0.35
135 0.32
136 0.32
137 0.32
138 0.28
139 0.31
140 0.28
141 0.27
142 0.23
143 0.2
144 0.19
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.15
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.18
155 0.18
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.15
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.17
168 0.22
169 0.27
170 0.32
171 0.33
172 0.31
173 0.31
174 0.32
175 0.36
176 0.4
177 0.39
178 0.4
179 0.43
180 0.5
181 0.54
182 0.5
183 0.46
184 0.39
185 0.4
186 0.4
187 0.36
188 0.29
189 0.25
190 0.26
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.23
195 0.28
196 0.34
197 0.38
198 0.37
199 0.35
200 0.37
201 0.36
202 0.41
203 0.39
204 0.33
205 0.32
206 0.33
207 0.33
208 0.31
209 0.28
210 0.21
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.18
220 0.21
221 0.18
222 0.19
223 0.29
224 0.35
225 0.37
226 0.47
227 0.5
228 0.58
229 0.67
230 0.77
231 0.76
232 0.79
233 0.81
234 0.8
235 0.77
236 0.71
237 0.65
238 0.57
239 0.53
240 0.49
241 0.51
242 0.51
243 0.53
244 0.53
245 0.56
246 0.57
247 0.53
248 0.49
249 0.51
250 0.52
251 0.49
252 0.47
253 0.42
254 0.4
255 0.4
256 0.4
257 0.33
258 0.25
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.26
263 0.25
264 0.32
265 0.38
266 0.45
267 0.5
268 0.5
269 0.49
270 0.42
271 0.43
272 0.38
273 0.41
274 0.33
275 0.34
276 0.36
277 0.34
278 0.32
279 0.33
280 0.31
281 0.21
282 0.22
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.15
288 0.18
289 0.17
290 0.18
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.11
297 0.12
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.17
312 0.26
313 0.29
314 0.32
315 0.33
316 0.32
317 0.38
318 0.46
319 0.46
320 0.39
321 0.38
322 0.37
323 0.41
324 0.44
325 0.37
326 0.3
327 0.34
328 0.35
329 0.35
330 0.32
331 0.31
332 0.31
333 0.36
334 0.38
335 0.34
336 0.31
337 0.28
338 0.31
339 0.29
340 0.29
341 0.26
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.19
347 0.18
348 0.15
349 0.12
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.08
394 0.12
395 0.15
396 0.17
397 0.28
398 0.37
399 0.46
400 0.53
401 0.61
402 0.66
403 0.73
404 0.78
405 0.76
406 0.75
407 0.74
408 0.77
409 0.69
410 0.63
411 0.55
412 0.48
413 0.39
414 0.33
415 0.25
416 0.17
417 0.17
418 0.16
419 0.15
420 0.18
421 0.18
422 0.18
423 0.25
424 0.32
425 0.34
426 0.39
427 0.41
428 0.41
429 0.43
430 0.45
431 0.38
432 0.34
433 0.32
434 0.26
435 0.22
436 0.2
437 0.18
438 0.13
439 0.13
440 0.1
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.13
449 0.15
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.17
454 0.23
455 0.22
456 0.18
457 0.17
458 0.18
459 0.2
460 0.23
461 0.24
462 0.19
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.15
468 0.11
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.13
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.16
481 0.16
482 0.16
483 0.15
484 0.11
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.08
492 0.09
493 0.1
494 0.12
495 0.16
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.16
501 0.14
502 0.13
503 0.08
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.08
512 0.07
513 0.1
514 0.17
515 0.22
516 0.24
517 0.26
518 0.29
519 0.3
520 0.3
521 0.3
522 0.23
523 0.19
524 0.17
525 0.16
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.1
530 0.13
531 0.12
532 0.12
533 0.14
534 0.15
535 0.16
536 0.16
537 0.16
538 0.13
539 0.16
540 0.17
541 0.13
542 0.13
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.06
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.06
564 0.1
565 0.12
566 0.14
567 0.18
568 0.19
569 0.23
570 0.31
571 0.33
572 0.32
573 0.31
574 0.34
575 0.36
576 0.36
577 0.33
578 0.27
579 0.31
580 0.35
581 0.35
582 0.32
583 0.35
584 0.42
585 0.49
586 0.55
587 0.52
588 0.46
589 0.46
590 0.44
591 0.36
592 0.27
593 0.19
594 0.11
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.13
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.19
605 0.27
606 0.36
607 0.46
608 0.54
609 0.56
610 0.58
611 0.61
612 0.62
613 0.56
614 0.47
615 0.42
616 0.34
617 0.38
618 0.35
619 0.32
620 0.28
621 0.25
622 0.3
623 0.27
624 0.29
625 0.25
626 0.27
627 0.26
628 0.3
629 0.31
630 0.25
631 0.22
632 0.2
633 0.18
634 0.16
635 0.15
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.11
643 0.12
644 0.14
645 0.13
646 0.16
647 0.16
648 0.19
649 0.2
650 0.19
651 0.2
652 0.21
653 0.24
654 0.24
655 0.24
656 0.22
657 0.23
658 0.26
659 0.24
660 0.24
661 0.22
662 0.28
663 0.31
664 0.36
665 0.43
666 0.48
667 0.47
668 0.46
669 0.45
670 0.37
671 0.32
672 0.28
673 0.18
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.07
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.12
692 0.13
693 0.14
694 0.2
695 0.2
696 0.28
697 0.28
698 0.35
699 0.41
700 0.42
701 0.49
702 0.51
703 0.56
704 0.5
705 0.53
706 0.44
707 0.36
708 0.39
709 0.31
710 0.23
711 0.17
712 0.15
713 0.11
714 0.12
715 0.12
716 0.08
717 0.1
718 0.11
719 0.15
720 0.15
721 0.16
722 0.2
723 0.2
724 0.21
725 0.2
726 0.2
727 0.17
728 0.18
729 0.17
730 0.13
731 0.12
732 0.12
733 0.12
734 0.1
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.15
739 0.15
740 0.13
741 0.14
742 0.16
743 0.2
744 0.25
745 0.28
746 0.31
747 0.34
748 0.34
749 0.33
750 0.32
751 0.29
752 0.24
753 0.22
754 0.21
755 0.23
756 0.23
757 0.23
758 0.23
759 0.23
760 0.21
761 0.21
762 0.19
763 0.17
764 0.2
765 0.21
766 0.22
767 0.18
768 0.21
769 0.22
770 0.22
771 0.23
772 0.24
773 0.23
774 0.24
775 0.31
776 0.3
777 0.34
778 0.35
779 0.33
780 0.32
781 0.31
782 0.31
783 0.28
784 0.3
785 0.26
786 0.25
787 0.24
788 0.22
789 0.22
790 0.2
791 0.16
792 0.13
793 0.11
794 0.18
795 0.2
796 0.22
797 0.26
798 0.29
799 0.3
800 0.36
801 0.38
802 0.37
803 0.43
804 0.42
805 0.39
806 0.37
807 0.35
808 0.31
809 0.3
810 0.27
811 0.23
812 0.22
813 0.25
814 0.31
815 0.35
816 0.37
817 0.36
818 0.32