FuNGI

A0A5N5QEV8

Protein Details

Accession

A0A5N5QEV8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
901-922	TYFVNPAKRKRRFEHKWEQMVK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
830-841	GARMGTKGRRRR
979-998	RRRERTEALRRARQERQRKK

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 7, cyto 6, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04329 RNAP_II_Rpb7_N

Amino Acid Sequences

MRIEGPREPHGQKRVGGLVTGTFEVRVLVGDFAADHRMMSMLRPPFSRFLYNTQTTPSSNTYVFVQPANALGLERSNSPEIKIEKEGSEPTTPTGRKDKGKMESGDFQVPFPPVQAKREYAREYKDCAEVSQTRWVRANHTTSRLDRLGAGASPAVADAVGALEYVWIAHDGADDVYGDEHGDHDSGGIRQRERVGGERGGRDADTRDGQGQAGKRGVHKWREQPRLAAGLLPAAAAEPIAIPRHAAAQLAAETGGISLAAPPDIHGPPDAARLAAPHAGPPHPHADLMQAQTVPISPVHPRPMNRTQAGVLGPTKMAESWTAAPPPEDLNDEVQERKAHLTSARDGAAQRGHRPTGSLEIKDAWQNGQHDRQNERQSSVRRPKLVTQPAPRVPIATRYETMSPPPMRDPHPHGLHLDLHEKAPDKPPIRVQTGRAPSPNHARGRAATAMTPPHTYDDPYRGRSSSHASYTQPKAPPPPAPQAQWGTRAPGTGIVPFNEDLDHDEHEHEPVPPPVQQGKPADQTIVDWANHTQSQHPLSHPNQPPPPAMPNQPGERTRGRSRSRGRADTQPPLMDPATMYSQQHANGSGRPGGRSPLPAPAAHGSGSGSSEAEDLKTPRSPSVPLPGESYAQRFGGYAGQFSVGPPTVNHIYTQDVHNGHMYSSMGFAQSQYALHQMGAGTPGMAMQMQGHPMNGRQVNGYGYPQDLSSSASGSFLDGWANQGYPNARPSAPVPPTPSTGTAPTGDMRNGHAHAQLARAQAIVYPQAMPYPAYSYAMDPYRAPSVVSSFMASPFSHNPFLPPVEPQSTQSSPSHQPIGLPYAGMGKRFPGARMGTKGRRRRMMEEFRPESTVPNDTASEAETEGKRAPDGAETEFETETEMEEVWLEESEDDELENEFHPTYFVNPAKRKRRFEHKWEQMVKLFREIDRETDATMILAAAPPDQHQTHLLLSRSILRDTSYSHIAQEARSIFSDISIARRRERTEALRRARQERQRKKAADDRMATMAHLALTAENHVGSGSDETSVPASQPSQEQDLRMALDAARASLQEMRRVYDEMETRHREESNRRKEESLSLEKLLTSLLGMQRPCSLSWVRRQDPNTADNAQKELTHRILLHPSYFGPRMTKFLESKLYADVEGTCSGRFGYIIAVLGIVDIGKGMVMSGTGQAEFVTKYRAIVFKPFKGEVVDGVVTNVNKVNGIILPQLLLTFADGLFRRGGPAAGVCVEPYMRFDPNSNPPSFASDEQIIDKGTHVRLKIVGTRVDATEIVGPSTTHNSADSLQFAIGTIKEDSLGVID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.47
3	0.44
4	0.36
5	0.31
6	0.29
7	0.27
8	0.21
9	0.15
10	0.14
11	0.13
12	0.12
13	0.1
14	0.09
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.08
19	0.09
20	0.12
21	0.11
22	0.09
23	0.09
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.19
28	0.22
29	0.25
30	0.28
31	0.31
32	0.35
33	0.39
34	0.44
35	0.4
36	0.42
37	0.48
38	0.49
39	0.47
40	0.47
41	0.46
42	0.4
43	0.42
44	0.38
45	0.33
46	0.29
47	0.29
48	0.28
49	0.29
50	0.29
51	0.25
52	0.23
53	0.19
54	0.2
55	0.2
56	0.16
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.17
63	0.2
64	0.2
65	0.21
66	0.28
67	0.28
68	0.31
69	0.35
70	0.34
71	0.32
72	0.35
73	0.37
74	0.34
75	0.36
76	0.32
77	0.3
78	0.36
79	0.35
80	0.36
81	0.42
82	0.45
83	0.48
84	0.55
85	0.6
86	0.59
87	0.67
88	0.66
89	0.63
90	0.64
91	0.61
92	0.62
93	0.53
94	0.46
95	0.41
96	0.38
97	0.31
98	0.26
99	0.29
100	0.24
101	0.29
102	0.33
103	0.34
104	0.38
105	0.47
106	0.51
107	0.5
108	0.56
109	0.55
110	0.56
111	0.55
112	0.55
113	0.47
114	0.41
115	0.42
116	0.37
117	0.36
118	0.41
119	0.4
120	0.37
121	0.42
122	0.42
123	0.4
124	0.44
125	0.49
126	0.46
127	0.51
128	0.54
129	0.51
130	0.58
131	0.53
132	0.46
133	0.38
134	0.33
135	0.28
136	0.22
137	0.21
138	0.13
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.08
143	0.06
144	0.05
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.08
173	0.1
174	0.17
175	0.21
176	0.21
177	0.24
178	0.27
179	0.3
180	0.31
181	0.35
182	0.34
183	0.36
184	0.41
185	0.4
186	0.39
187	0.37
188	0.34
189	0.3
190	0.27
191	0.25
192	0.22
193	0.22
194	0.22
195	0.21
196	0.21
197	0.24
198	0.25
199	0.25
200	0.26
201	0.26
202	0.27
203	0.34
204	0.41
205	0.45
206	0.5
207	0.55
208	0.62
209	0.69
210	0.69
211	0.66
212	0.63
213	0.59
214	0.52
215	0.43
216	0.33
217	0.25
218	0.23
219	0.18
220	0.13
221	0.08
222	0.07
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.1
251	0.11
252	0.12
253	0.11
254	0.13
255	0.13
256	0.17
257	0.17
258	0.13
259	0.12
260	0.13
261	0.15
262	0.16
263	0.15
264	0.14
265	0.17
266	0.18
267	0.19
268	0.21
269	0.24
270	0.21
271	0.21
272	0.19
273	0.21
274	0.24
275	0.25
276	0.25
277	0.2
278	0.19
279	0.19
280	0.19
281	0.16
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.16
286	0.24
287	0.28
288	0.3
289	0.37
290	0.46
291	0.52
292	0.5
293	0.47
294	0.41
295	0.41
296	0.39
297	0.34
298	0.26
299	0.2
300	0.18
301	0.16
302	0.15
303	0.11
304	0.11
305	0.09
306	0.11
307	0.13
308	0.16
309	0.17
310	0.17
311	0.18
312	0.18
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.14
317	0.16
318	0.18
319	0.2
320	0.2
321	0.2
322	0.2
323	0.19
324	0.2
325	0.17
326	0.17
327	0.19
328	0.22
329	0.23
330	0.26
331	0.25
332	0.24
333	0.24
334	0.25
335	0.28
336	0.26
337	0.28
338	0.29
339	0.29
340	0.28
341	0.29
342	0.27
343	0.31
344	0.33
345	0.28
346	0.25
347	0.25
348	0.27
349	0.28
350	0.27
351	0.19
352	0.18
353	0.2
354	0.23
355	0.3
356	0.32
357	0.34
358	0.38
359	0.45
360	0.5
361	0.49
362	0.47
363	0.46
364	0.48
365	0.54
366	0.6
367	0.58
368	0.54
369	0.55
370	0.59
371	0.63
372	0.68
373	0.65
374	0.63
375	0.66
376	0.66
377	0.67
378	0.6
379	0.51
380	0.42
381	0.42
382	0.38
383	0.32
384	0.28
385	0.27
386	0.3
387	0.29
388	0.3
389	0.3
390	0.27
391	0.25
392	0.29
393	0.3
394	0.31
395	0.36
396	0.41
397	0.42
398	0.45
399	0.44
400	0.41
401	0.4
402	0.39
403	0.36
404	0.32
405	0.23
406	0.2
407	0.21
408	0.21
409	0.21
410	0.24
411	0.29
412	0.27
413	0.3
414	0.37
415	0.4
416	0.45
417	0.46
418	0.44
419	0.46
420	0.5
421	0.5
422	0.46
423	0.43
424	0.41
425	0.47
426	0.51
427	0.45
428	0.41
429	0.39
430	0.36
431	0.39
432	0.37
433	0.28
434	0.22
435	0.21
436	0.22
437	0.22
438	0.22
439	0.18
440	0.18
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.23
445	0.27
446	0.29
447	0.31
448	0.29
449	0.29
450	0.3
451	0.34
452	0.29
453	0.29
454	0.28
455	0.28
456	0.35
457	0.38
458	0.42
459	0.38
460	0.35
461	0.36
462	0.37
463	0.41
464	0.39
465	0.43
466	0.4
467	0.4
468	0.43
469	0.43
470	0.42
471	0.41
472	0.36
473	0.32
474	0.29
475	0.27
476	0.22
477	0.2
478	0.19
479	0.17
480	0.17
481	0.14
482	0.16
483	0.15
484	0.16
485	0.12
486	0.12
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.11
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.14
495	0.12
496	0.12
497	0.12
498	0.13
499	0.13
500	0.15
501	0.2
502	0.2
503	0.25
504	0.26
505	0.3
506	0.32
507	0.31
508	0.29
509	0.24
510	0.23
511	0.22
512	0.21
513	0.16
514	0.13
515	0.13
516	0.15
517	0.16
518	0.16
519	0.14
520	0.15
521	0.18
522	0.19
523	0.2
524	0.24
525	0.25
526	0.35
527	0.37
528	0.39
529	0.4
530	0.4
531	0.4
532	0.37
533	0.39
534	0.32
535	0.31
536	0.29
537	0.3
538	0.31
539	0.35
540	0.33
541	0.34
542	0.35
543	0.38
544	0.4
545	0.45
546	0.46
547	0.5
548	0.55
549	0.61
550	0.64
551	0.64
552	0.61
553	0.61
554	0.62
555	0.59
556	0.55
557	0.45
558	0.38
559	0.35
560	0.31
561	0.22
562	0.17
563	0.12
564	0.13
565	0.13
566	0.13
567	0.11
568	0.13
569	0.14
570	0.14
571	0.14
572	0.12
573	0.12
574	0.14
575	0.17
576	0.16
577	0.16
578	0.16
579	0.15
580	0.15
581	0.16
582	0.16
583	0.18
584	0.19
585	0.18
586	0.2
587	0.2
588	0.2
589	0.17
590	0.16
591	0.11
592	0.1
593	0.1
594	0.08
595	0.06
596	0.05
597	0.06
598	0.05
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.09
603	0.11
604	0.11
605	0.12
606	0.14
607	0.15
608	0.15
609	0.24
610	0.24
611	0.23
612	0.25
613	0.25
614	0.25
615	0.24
616	0.24
617	0.17
618	0.14
619	0.13
620	0.1
621	0.1
622	0.13
623	0.12
624	0.11
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.1
629	0.11
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.1
634	0.11
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.13
639	0.14
640	0.15
641	0.16
642	0.15
643	0.15
644	0.16
645	0.15
646	0.13
647	0.13
648	0.12
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.06
665	0.07
666	0.06
667	0.05
668	0.04
669	0.05
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.05
675	0.07
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.08
680	0.13
681	0.14
682	0.13
683	0.12
684	0.13
685	0.14
686	0.15
687	0.15
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.09
692	0.09
693	0.07
694	0.08
695	0.07
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.06
703	0.06
704	0.05
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.06
709	0.08
710	0.09
711	0.1
712	0.11
713	0.12
714	0.11
715	0.12
716	0.14
717	0.21
718	0.23
719	0.24
720	0.28
721	0.28
722	0.3
723	0.31
724	0.31
725	0.24
726	0.23
727	0.22
728	0.18
729	0.17
730	0.15
731	0.15
732	0.13
733	0.12
734	0.13
735	0.14
736	0.15
737	0.14
738	0.15
739	0.14
740	0.15
741	0.16
742	0.17
743	0.16
744	0.15
745	0.14
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.11
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.09
758	0.09
759	0.11
760	0.11
761	0.12
762	0.14
763	0.16
764	0.16
765	0.13
766	0.14
767	0.14
768	0.14
769	0.13
770	0.11
771	0.12
772	0.13
773	0.13
774	0.12
775	0.11
776	0.11
777	0.13
778	0.12
779	0.13
780	0.14
781	0.18
782	0.18
783	0.18
784	0.19
785	0.19
786	0.21
787	0.19
788	0.17
789	0.17
790	0.19
791	0.2
792	0.21
793	0.25
794	0.24
795	0.27
796	0.26
797	0.28
798	0.27
799	0.29
800	0.29
801	0.23
802	0.23
803	0.21
804	0.24
805	0.19
806	0.15
807	0.13
808	0.18
809	0.18
810	0.18
811	0.17
812	0.13
813	0.16
814	0.17
815	0.17
816	0.15
817	0.18
818	0.21
819	0.27
820	0.34
821	0.41
822	0.49
823	0.57
824	0.58
825	0.64
826	0.64
827	0.64
828	0.67
829	0.69
830	0.69
831	0.71
832	0.67
833	0.6
834	0.59
835	0.53
836	0.45
837	0.36
838	0.3
839	0.2
840	0.19
841	0.17
842	0.15
843	0.15
844	0.13
845	0.12
846	0.1
847	0.12
848	0.1
849	0.12
850	0.13
851	0.13
852	0.12
853	0.12
854	0.12
855	0.12
856	0.14
857	0.14
858	0.14
859	0.15
860	0.17
861	0.16
862	0.16
863	0.14
864	0.11
865	0.1
866	0.09
867	0.08
868	0.06
869	0.06
870	0.06
871	0.05
872	0.05
873	0.05
874	0.04
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.05
881	0.06
882	0.06
883	0.07
884	0.07
885	0.07
886	0.07
887	0.07
888	0.08
889	0.15
890	0.19
891	0.26
892	0.34
893	0.44
894	0.54
895	0.63
896	0.69
897	0.69
898	0.76
899	0.77
900	0.8
901	0.81
902	0.81
903	0.83
904	0.8
905	0.77
906	0.71
907	0.68
908	0.59
909	0.54
910	0.46
911	0.36
912	0.37
913	0.34
914	0.31
915	0.29
916	0.28
917	0.23
918	0.21
919	0.2
920	0.14
921	0.13
922	0.1
923	0.05
924	0.05
925	0.05
926	0.05
927	0.05
928	0.06
929	0.1
930	0.11
931	0.12
932	0.12
933	0.14
934	0.17
935	0.21
936	0.21
937	0.18
938	0.19
939	0.24
940	0.24
941	0.23
942	0.2
943	0.17
944	0.17
945	0.19
946	0.23
947	0.2
948	0.19
949	0.18
950	0.22
951	0.21
952	0.2
953	0.23
954	0.2
955	0.18
956	0.18
957	0.19
958	0.16
959	0.15
960	0.17
961	0.12
962	0.18
963	0.24
964	0.26
965	0.29
966	0.33
967	0.36
968	0.38
969	0.45
970	0.47
971	0.51
972	0.59
973	0.63
974	0.66
975	0.69
976	0.71
977	0.73
978	0.73
979	0.74
980	0.74
981	0.75
982	0.78
983	0.76
984	0.77
985	0.76
986	0.76
987	0.74
988	0.66
989	0.6
990	0.53
991	0.5
992	0.42
993	0.34
994	0.25
995	0.16
996	0.13
997	0.09
998	0.06
999	0.06
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.08
1008	0.07
1009	0.07
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.13
1019	0.15
1020	0.2
1021	0.21
1022	0.22
1023	0.23
1024	0.24
1025	0.23
1026	0.21
1027	0.19
1028	0.13
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.12
1032	0.11
1033	0.1
1034	0.11
1035	0.15
1036	0.17
1037	0.2
1038	0.21
1039	0.23
1040	0.24
1041	0.25
1042	0.25
1043	0.26
1044	0.29
1045	0.28
1046	0.36
1047	0.39
1048	0.39
1049	0.41
1050	0.43
1051	0.41
1052	0.47
1053	0.53
1054	0.56
1055	0.58
1056	0.58
1057	0.57
1058	0.57
1059	0.6
1060	0.58
1061	0.56
1062	0.49
1063	0.43
1064	0.41
1065	0.39
1066	0.36
1067	0.29
1068	0.2
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.13
1072	0.17
1073	0.17
1074	0.18
1075	0.22
1076	0.24
1077	0.24
1078	0.24
1079	0.26
1080	0.27
1081	0.37
1082	0.46
1083	0.46
1084	0.51
1085	0.54
1086	0.57
1087	0.57
1088	0.56
1089	0.51
1090	0.45
1091	0.45
1092	0.39
1093	0.4
1094	0.33
1095	0.29
1096	0.28
1097	0.29
1098	0.27
1099	0.27
1100	0.26
1101	0.28
1102	0.34
1103	0.34
1104	0.33
1105	0.29
1106	0.28
1107	0.3
1108	0.31
1109	0.29
1110	0.26
1111	0.25
1112	0.28
1113	0.3
1114	0.34
1115	0.31
1116	0.34
1117	0.39
1118	0.37
1119	0.37
1120	0.36
1121	0.34
1122	0.28
1123	0.27
1124	0.23
1125	0.18
1126	0.19
1127	0.18
1128	0.14
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.13
1132	0.12
1133	0.09
1134	0.08
1135	0.09
1136	0.09
1137	0.09
1138	0.09
1139	0.08
1140	0.08
1141	0.08
1142	0.06
1143	0.04
1144	0.03
1145	0.03
1146	0.03
1147	0.03
1148	0.03
1149	0.03
1150	0.03
1151	0.04
1152	0.06
1153	0.08
1154	0.08
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.1
1158	0.11
1159	0.11
1160	0.13
1161	0.12
1162	0.14
1163	0.18
1164	0.22
1165	0.23
1166	0.32
1167	0.38
1168	0.4
1169	0.46
1170	0.46
1171	0.43
1172	0.43
1173	0.42
1174	0.33
1175	0.32
1176	0.27
1177	0.2
1178	0.21
1179	0.22
1180	0.19
1181	0.2
1182	0.2
1183	0.14
1184	0.13
1185	0.13
1186	0.14
1187	0.11
1188	0.14
1189	0.14
1190	0.12
1191	0.12
1192	0.12
1193	0.12
1194	0.11
1195	0.1
1196	0.08
1197	0.07
1198	0.07
1199	0.12
1200	0.12
1201	0.14
1202	0.16
1203	0.16
1204	0.17
1205	0.16
1206	0.17
1207	0.13
1208	0.14
1209	0.15
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.14
1213	0.14
1214	0.15
1215	0.13
1216	0.16
1217	0.17
1218	0.18
1219	0.19
1220	0.22
1221	0.28
1222	0.38
1223	0.45
1224	0.41
1225	0.4
1226	0.39
1227	0.43
1228	0.45
1229	0.39
1230	0.34
1231	0.3
1232	0.31
1233	0.3
1234	0.31
1235	0.27
1236	0.22
1237	0.23
1238	0.22
1239	0.24
1240	0.26
1241	0.24
1242	0.25
1243	0.27
1244	0.32
1245	0.37
1246	0.37
1247	0.37
1248	0.37
1249	0.39
1250	0.37
1251	0.36
1252	0.32
1253	0.27
1254	0.26
1255	0.22
1256	0.19
1257	0.17
1258	0.17
1259	0.17
1260	0.22
1261	0.22
1262	0.17
1263	0.18
1264	0.19
1265	0.21
1266	0.23
1267	0.22
1268	0.18
1269	0.17
1270	0.16
1271	0.15
1272	0.15
1273	0.14
1274	0.14
1275	0.13
1276	0.12
1277	0.13
1278	0.13

A0A5N5QEV8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer