Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QV65

Protein Details
Accession A0A5N5QV65    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-226SDESTKRQISQRKKRKHEKILVPVSRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-216RKKRKH
Subcellular Location(s) plas 9, mito 8, nucl 7, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSTPQIARTQAAYNLARQSAYQPQRGTPVASARPAVAKPADGSEAWYLENDVSNRMVLALRCGIPGEVGWALTRLGTLAYQWGNRFSLQNMPGSLDALFTVANWYIEHNSTSSGEENIFATDKENWTRRAHALEALLIIRNSALEETNLRSIAQHPHTVVFIRDALCKLQPAESHAEYVTYILELLHALGPHIVLPPLPSDESTKRQISQRKKRKHEKILVPVSRIAEVAATSDDRALIIASLNALTSLFAVPENAPHTESCSQALDAALRYLPLTQDKPLLNTSLDYLFAHLSYAPVSKAFLMSPKMPEALKLLVAVLQLEQREEYRSQELPPAPVPANPAPPTHKDYELSLEELQKLIPIPEPGRSIQWMQTVFVAAPEDEQTQVTLWSLYRDTFTPYSHQYLPLNASDVIRNVTIAFPTAQPMVFPGPPQRFVIRGIGRRQQPVQDRFKCRWSRSTCTAEIFKNPEELHRHLEEHLNAAGVVPPAQCLWATCAHTDEPARLGTHVLTHVPSSQSSETNSHSASHLNVVTYRAAAAHSPETTSLLLTALLVLRLIWRAAIPATLHAGASVPKADEDHFGFPAPPGLLDRDTEEDEMGGEALEGEKRGVRAFKAMVERLQGVKMADDVLMSWVTEMVESVGGSGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.33
4 0.3
5 0.31
6 0.34
7 0.39
8 0.41
9 0.38
10 0.39
11 0.45
12 0.47
13 0.45
14 0.39
15 0.41
16 0.39
17 0.4
18 0.38
19 0.34
20 0.37
21 0.34
22 0.35
23 0.27
24 0.24
25 0.23
26 0.25
27 0.25
28 0.21
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.15
36 0.2
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.17
44 0.13
45 0.16
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.11
66 0.14
67 0.18
68 0.19
69 0.22
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.21
74 0.27
75 0.26
76 0.28
77 0.26
78 0.27
79 0.26
80 0.25
81 0.23
82 0.15
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.06
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.17
110 0.24
111 0.27
112 0.3
113 0.33
114 0.37
115 0.38
116 0.39
117 0.37
118 0.34
119 0.31
120 0.28
121 0.26
122 0.23
123 0.21
124 0.17
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.12
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.17
139 0.25
140 0.26
141 0.26
142 0.25
143 0.25
144 0.27
145 0.27
146 0.25
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.2
159 0.25
160 0.24
161 0.25
162 0.23
163 0.23
164 0.19
165 0.18
166 0.14
167 0.07
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.15
188 0.19
189 0.24
190 0.29
191 0.3
192 0.3
193 0.37
194 0.44
195 0.5
196 0.57
197 0.63
198 0.69
199 0.77
200 0.85
201 0.89
202 0.91
203 0.91
204 0.89
205 0.89
206 0.89
207 0.83
208 0.75
209 0.67
210 0.57
211 0.47
212 0.37
213 0.26
214 0.16
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.05
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.15
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.11
273 0.12
274 0.09
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.2
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.21
322 0.18
323 0.18
324 0.22
325 0.18
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.26
331 0.29
332 0.27
333 0.27
334 0.23
335 0.22
336 0.25
337 0.23
338 0.22
339 0.19
340 0.18
341 0.17
342 0.17
343 0.15
344 0.11
345 0.1
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.21
358 0.19
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.17
386 0.19
387 0.24
388 0.23
389 0.26
390 0.22
391 0.23
392 0.24
393 0.21
394 0.21
395 0.17
396 0.17
397 0.15
398 0.15
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.07
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.1
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.18
417 0.21
418 0.23
419 0.25
420 0.25
421 0.23
422 0.25
423 0.33
424 0.32
425 0.35
426 0.39
427 0.43
428 0.46
429 0.48
430 0.48
431 0.46
432 0.49
433 0.52
434 0.57
435 0.59
436 0.62
437 0.62
438 0.69
439 0.7
440 0.64
441 0.66
442 0.62
443 0.61
444 0.62
445 0.66
446 0.59
447 0.56
448 0.57
449 0.49
450 0.47
451 0.44
452 0.37
453 0.35
454 0.32
455 0.33
456 0.34
457 0.35
458 0.35
459 0.33
460 0.34
461 0.3
462 0.35
463 0.3
464 0.27
465 0.25
466 0.19
467 0.16
468 0.15
469 0.16
470 0.11
471 0.11
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.07
478 0.1
479 0.14
480 0.16
481 0.16
482 0.19
483 0.19
484 0.22
485 0.22
486 0.21
487 0.17
488 0.17
489 0.17
490 0.15
491 0.16
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.13
498 0.15
499 0.16
500 0.16
501 0.19
502 0.19
503 0.19
504 0.22
505 0.24
506 0.25
507 0.26
508 0.27
509 0.23
510 0.21
511 0.21
512 0.19
513 0.2
514 0.18
515 0.16
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.16
520 0.15
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.15
528 0.15
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.13
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.09
537 0.07
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.12
549 0.11
550 0.12
551 0.16
552 0.16
553 0.15
554 0.14
555 0.15
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.17
564 0.2
565 0.22
566 0.21
567 0.21
568 0.21
569 0.2
570 0.23
571 0.19
572 0.16
573 0.15
574 0.17
575 0.18
576 0.18
577 0.21
578 0.22
579 0.24
580 0.24
581 0.22
582 0.18
583 0.17
584 0.16
585 0.13
586 0.09
587 0.06
588 0.05
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.1
594 0.11
595 0.14
596 0.17
597 0.18
598 0.23
599 0.24
600 0.3
601 0.36
602 0.38
603 0.38
604 0.39
605 0.41
606 0.37
607 0.37
608 0.32
609 0.25
610 0.22
611 0.2
612 0.17
613 0.14
614 0.12
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.07
625 0.08
626 0.08
627 0.08