Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QX34

Protein Details
Accession A0A5N5QX34    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70AEKERIKRRFEEEQKAKQRALBasic
252-272WFSTKKDKERERQEREKQESEBasic
278-298ERERERERKAREREREREREKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-67AAAREAKEREAEKERIKRRFEEEQKAKQ
277-312VERERERERKAREREREREREKERERERERTKDRSR
427-441ERARRRARKSAGGGR
504-521RRREEVKRRRKAAAAARS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTSFASLIKLSKTQNNTAAQDLAAAVAKREAAQAAAKAEAAAREAKEREAEKERIKRRFEEEQKAKQRALDSADAAAKRDKELDEKREREARAMLAGKSASSVSRVRATGGSGSNGGEGSRSKTSSGASAYDSVASGAMGLTRQEKRARQNTAWDDSASRSKYAAKKRKAGVILPGGALNVEAGSGSPGHGGSGLSVRARLAASQSGLIKLNTNKRDTRSIDEITRDLQEKRGGVDVKKVLTGAEAEKFGDWFSTKKDKERERQEREKQESERLATVERERERERKAREREREREREKERERERERTKDRSRSGSVTAPSQTQSKRPAVVPAAPPKPAPIVIATKPSTLLSGGSKPSAAPKEYRVTVKTTGTPITNNPLPTPTSSAPTKPRVAAPAPTSKPASAAAKRPRSYDSGSDSYDSEEEERERARRRARKSAGGGRGGSGFDIWSIINPGKSRQEYLGRDVLSDDDEDMEATGRDLEREEKQSARIAKQEDAEAEAEERRREEVKRRRKAAAAARS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.51
4 0.49
5 0.47
6 0.39
7 0.34
8 0.27
9 0.21
10 0.17
11 0.15
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.12
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.16
29 0.15
30 0.2
31 0.21
32 0.23
33 0.28
34 0.29
35 0.34
36 0.38
37 0.44
38 0.48
39 0.57
40 0.64
41 0.66
42 0.69
43 0.68
44 0.68
45 0.71
46 0.71
47 0.73
48 0.73
49 0.76
50 0.81
51 0.8
52 0.74
53 0.66
54 0.59
55 0.52
56 0.48
57 0.42
58 0.33
59 0.32
60 0.36
61 0.33
62 0.32
63 0.32
64 0.27
65 0.24
66 0.26
67 0.24
68 0.28
69 0.36
70 0.44
71 0.51
72 0.53
73 0.58
74 0.62
75 0.61
76 0.55
77 0.49
78 0.41
79 0.38
80 0.39
81 0.33
82 0.29
83 0.28
84 0.24
85 0.22
86 0.21
87 0.13
88 0.14
89 0.15
90 0.15
91 0.2
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.11
105 0.1
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.18
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.11
122 0.09
123 0.07
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.1
129 0.12
130 0.17
131 0.22
132 0.28
133 0.37
134 0.45
135 0.51
136 0.48
137 0.57
138 0.59
139 0.59
140 0.55
141 0.47
142 0.4
143 0.36
144 0.4
145 0.31
146 0.25
147 0.21
148 0.26
149 0.33
150 0.42
151 0.49
152 0.5
153 0.56
154 0.59
155 0.66
156 0.63
157 0.57
158 0.54
159 0.5
160 0.44
161 0.36
162 0.33
163 0.25
164 0.22
165 0.19
166 0.12
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.18
198 0.26
199 0.28
200 0.32
201 0.33
202 0.35
203 0.43
204 0.43
205 0.44
206 0.42
207 0.4
208 0.39
209 0.38
210 0.35
211 0.29
212 0.28
213 0.24
214 0.19
215 0.18
216 0.18
217 0.16
218 0.17
219 0.2
220 0.21
221 0.19
222 0.25
223 0.24
224 0.23
225 0.23
226 0.21
227 0.16
228 0.14
229 0.15
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.11
241 0.2
242 0.21
243 0.27
244 0.35
245 0.42
246 0.5
247 0.61
248 0.67
249 0.67
250 0.76
251 0.79
252 0.81
253 0.8
254 0.78
255 0.69
256 0.65
257 0.58
258 0.5
259 0.42
260 0.33
261 0.28
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.25
267 0.27
268 0.31
269 0.36
270 0.41
271 0.46
272 0.49
273 0.58
274 0.63
275 0.7
276 0.74
277 0.78
278 0.81
279 0.84
280 0.79
281 0.79
282 0.75
283 0.75
284 0.71
285 0.72
286 0.69
287 0.7
288 0.7
289 0.71
290 0.72
291 0.72
292 0.73
293 0.73
294 0.75
295 0.73
296 0.72
297 0.69
298 0.66
299 0.58
300 0.56
301 0.5
302 0.43
303 0.37
304 0.34
305 0.27
306 0.25
307 0.26
308 0.24
309 0.23
310 0.28
311 0.27
312 0.29
313 0.28
314 0.32
315 0.3
316 0.34
317 0.36
318 0.39
319 0.38
320 0.37
321 0.36
322 0.32
323 0.31
324 0.26
325 0.2
326 0.15
327 0.18
328 0.18
329 0.25
330 0.25
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.2
335 0.16
336 0.15
337 0.12
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.2
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.24
348 0.29
349 0.32
350 0.36
351 0.32
352 0.33
353 0.35
354 0.36
355 0.34
356 0.31
357 0.3
358 0.27
359 0.27
360 0.25
361 0.28
362 0.28
363 0.25
364 0.23
365 0.23
366 0.23
367 0.23
368 0.28
369 0.22
370 0.23
371 0.25
372 0.29
373 0.34
374 0.38
375 0.4
376 0.35
377 0.37
378 0.38
379 0.38
380 0.39
381 0.37
382 0.42
383 0.41
384 0.42
385 0.42
386 0.36
387 0.35
388 0.33
389 0.36
390 0.3
391 0.37
392 0.43
393 0.51
394 0.52
395 0.54
396 0.53
397 0.5
398 0.51
399 0.48
400 0.45
401 0.4
402 0.41
403 0.39
404 0.37
405 0.34
406 0.3
407 0.24
408 0.18
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.19
413 0.22
414 0.29
415 0.35
416 0.44
417 0.5
418 0.57
419 0.65
420 0.69
421 0.74
422 0.76
423 0.79
424 0.77
425 0.74
426 0.67
427 0.57
428 0.52
429 0.43
430 0.33
431 0.23
432 0.15
433 0.09
434 0.1
435 0.08
436 0.07
437 0.1
438 0.11
439 0.15
440 0.15
441 0.2
442 0.27
443 0.3
444 0.31
445 0.34
446 0.42
447 0.43
448 0.48
449 0.5
450 0.42
451 0.4
452 0.38
453 0.34
454 0.26
455 0.22
456 0.17
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.15
469 0.2
470 0.25
471 0.29
472 0.29
473 0.31
474 0.38
475 0.43
476 0.43
477 0.44
478 0.42
479 0.43
480 0.43
481 0.44
482 0.38
483 0.35
484 0.32
485 0.26
486 0.25
487 0.25
488 0.25
489 0.23
490 0.23
491 0.23
492 0.27
493 0.31
494 0.4
495 0.46
496 0.54
497 0.63
498 0.68
499 0.71
500 0.73
501 0.77