FuNGI

C5JR12

Protein Details

Accession

C5JR12

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-157	LIVSPKTRKKKAATAKRTRKQDGV	Hydrophilic
618-641	ENQSKSSKLEPKPNQRNHKSQGDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
139-161	KTRKKKAATAKRTRKQDGVAERR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
KEGG	bgh:BDBG_04672 -
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MDNAAIASQSNTPPSNGRSSARFVTPISVHSSPISAEVIEPSSPFSPPSPSTLLTSLSKSPSHKISNLQMDGAKTTCLEVIQNSSLVVDSPKRQDKSITGSKAKPASTMRHGQRTASHKMATQTEIQTVDGDRLIVSPKTRKKKAATAKRTRKQDGVAERRLHGHVSKVKSPGDLKLDAKIPPSKPCDNKAPSVGDNTDNELERQTGGLQLEKATKRRLDWTPTKEGPIPMVDLAEVHSSSCGKSVIRTHSAGTLLSNYGFSGVVNTSLAPMPETCDNGPTTKRLMELQNFYSASGIQTPTESRPATNDSQSISSKQQRVKVKKPQKAKLTTLTSYVTAKYSVVDQTADLDRIETVNSGKNKKMGVTKRTSGTERANAARGKSDTLKNGNGPPVFKVVPPLEAFKSFDGQELLFGTSSQLEHGHSEDQDEEIQHTADSINKSNVVPRPAVSKGLGSSLFRLSSSKNLWSASSRDLTGAVLQVDEIDLSERSIEVSTPAAKYKRKTGIRDLSGQNVIDVEKDTRTLAANIDTRELDNMNEPSLAEDDLVYRENLESTNAKLNSQTPANISEAMLERPPPDKPIFGGFTTSELAKQVAAYGFKPIKSRDKMISLLEKCWENQSKSSKLEPKPNQRNHKSQGDDLAERQLLGLKPRSDSISFVITRSPKKRLAKTSVKSQEPKSFSLSNEGPRITSKLPMKRFVSPCAILIDDDQSSDSVGEALPLSPSHSSNGNGTLHHPQDCDEIHAPTTQMAIRSAKSSISVSSTTNLPSLSSQITKAVQSQPRIRAFKGLKQPTWYEKILMYDPIQLEDLAAWLNTGGFGLIGEDREVGAGVVREWCESKGICCVWKKQASAKSH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.35
3	0.35
4	0.36
5	0.36
6	0.41
7	0.44
8	0.43
9	0.42
10	0.35
11	0.38
12	0.36
13	0.34
14	0.35
15	0.31
16	0.3
17	0.27
18	0.27
19	0.21
20	0.22
21	0.2
22	0.13
23	0.13
24	0.14
25	0.15
26	0.15
27	0.14
28	0.16
29	0.16
30	0.16
31	0.17
32	0.16
33	0.2
34	0.21
35	0.27
36	0.28
37	0.28
38	0.31
39	0.32
40	0.34
41	0.31
42	0.33
43	0.32
44	0.31
45	0.34
46	0.33
47	0.36
48	0.4
49	0.43
50	0.43
51	0.46
52	0.51
53	0.57
54	0.55
55	0.53
56	0.48
57	0.43
58	0.42
59	0.36
60	0.27
61	0.18
62	0.17
63	0.15
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.17
68	0.18
69	0.18
70	0.17
71	0.16
72	0.16
73	0.15
74	0.16
75	0.15
76	0.18
77	0.27
78	0.36
79	0.37
80	0.38
81	0.42
82	0.44
83	0.49
84	0.54
85	0.54
86	0.52
87	0.54
88	0.6
89	0.61
90	0.56
91	0.53
92	0.48
93	0.47
94	0.47
95	0.53
96	0.53
97	0.57
98	0.58
99	0.54
100	0.57
101	0.56
102	0.56
103	0.52
104	0.46
105	0.4
106	0.43
107	0.45
108	0.4
109	0.39
110	0.33
111	0.32
112	0.31
113	0.28
114	0.25
115	0.22
116	0.21
117	0.16
118	0.14
119	0.1
120	0.1
121	0.13
122	0.13
123	0.17
124	0.25
125	0.34
126	0.44
127	0.5
128	0.57
129	0.61
130	0.69
131	0.76
132	0.78
133	0.8
134	0.81
135	0.86
136	0.87
137	0.9
138	0.84
139	0.78
140	0.72
141	0.7
142	0.69
143	0.68
144	0.68
145	0.62
146	0.58
147	0.57
148	0.53
149	0.47
150	0.37
151	0.36
152	0.34
153	0.37
154	0.41
155	0.42
156	0.42
157	0.43
158	0.44
159	0.41
160	0.4
161	0.38
162	0.34
163	0.34
164	0.36
165	0.33
166	0.36
167	0.37
168	0.34
169	0.36
170	0.42
171	0.46
172	0.48
173	0.52
174	0.57
175	0.55
176	0.57
177	0.55
178	0.54
179	0.47
180	0.47
181	0.44
182	0.37
183	0.34
184	0.33
185	0.31
186	0.26
187	0.25
188	0.2
189	0.18
190	0.15
191	0.15
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.13
196	0.13
197	0.15
198	0.22
199	0.25
200	0.29
201	0.31
202	0.32
203	0.32
204	0.39
205	0.43
206	0.45
207	0.5
208	0.54
209	0.58
210	0.58
211	0.59
212	0.55
213	0.5
214	0.43
215	0.35
216	0.29
217	0.2
218	0.18
219	0.14
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.08
231	0.12
232	0.18
233	0.24
234	0.28
235	0.29
236	0.29
237	0.3
238	0.31
239	0.28
240	0.22
241	0.17
242	0.14
243	0.13
244	0.12
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.11
261	0.13
262	0.12
263	0.14
264	0.15
265	0.17
266	0.18
267	0.18
268	0.19
269	0.17
270	0.18
271	0.19
272	0.24
273	0.27
274	0.3
275	0.3
276	0.33
277	0.32
278	0.31
279	0.28
280	0.23
281	0.18
282	0.15
283	0.14
284	0.09
285	0.1
286	0.11
287	0.13
288	0.18
289	0.17
290	0.15
291	0.17
292	0.22
293	0.24
294	0.24
295	0.24
296	0.21
297	0.24
298	0.25
299	0.25
300	0.26
301	0.3
302	0.34
303	0.36
304	0.41
305	0.47
306	0.54
307	0.61
308	0.66
309	0.7
310	0.71
311	0.77
312	0.79
313	0.79
314	0.77
315	0.73
316	0.71
317	0.67
318	0.61
319	0.54
320	0.47
321	0.39
322	0.32
323	0.28
324	0.2
325	0.14
326	0.13
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.08
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.07
342	0.07
343	0.11
344	0.16
345	0.18
346	0.19
347	0.22
348	0.22
349	0.24
350	0.32
351	0.34
352	0.38
353	0.42
354	0.44
355	0.45
356	0.48
357	0.47
358	0.43
359	0.4
360	0.37
361	0.34
362	0.32
363	0.33
364	0.31
365	0.29
366	0.28
367	0.25
368	0.22
369	0.23
370	0.24
371	0.24
372	0.27
373	0.28
374	0.27
375	0.29
376	0.31
377	0.28
378	0.26
379	0.23
380	0.22
381	0.21
382	0.18
383	0.2
384	0.16
385	0.17
386	0.18
387	0.19
388	0.17
389	0.18
390	0.19
391	0.15
392	0.17
393	0.14
394	0.14
395	0.12
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.08
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.16
430	0.19
431	0.18
432	0.17
433	0.16
434	0.2
435	0.19
436	0.21
437	0.17
438	0.15
439	0.14
440	0.16
441	0.16
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.15
450	0.16
451	0.17
452	0.17
453	0.18
454	0.19
455	0.2
456	0.21
457	0.2
458	0.19
459	0.17
460	0.15
461	0.15
462	0.14
463	0.12
464	0.11
465	0.08
466	0.06
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.08
483	0.09
484	0.13
485	0.17
486	0.2
487	0.22
488	0.29
489	0.37
490	0.42
491	0.46
492	0.52
493	0.58
494	0.58
495	0.63
496	0.57
497	0.52
498	0.47
499	0.42
500	0.32
501	0.23
502	0.2
503	0.13
504	0.12
505	0.09
506	0.07
507	0.08
508	0.08
509	0.09
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.13
514	0.16
515	0.16
516	0.18
517	0.17
518	0.16
519	0.17
520	0.16
521	0.12
522	0.12
523	0.13
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.08
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.11
543	0.19
544	0.19
545	0.19
546	0.2
547	0.21
548	0.22
549	0.22
550	0.21
551	0.15
552	0.17
553	0.18
554	0.17
555	0.16
556	0.15
557	0.15
558	0.15
559	0.14
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.16
565	0.16
566	0.16
567	0.17
568	0.21
569	0.23
570	0.22
571	0.24
572	0.2
573	0.2
574	0.21
575	0.19
576	0.14
577	0.12
578	0.12
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.17
586	0.19
587	0.21
588	0.24
589	0.26
590	0.34
591	0.36
592	0.41
593	0.38
594	0.41
595	0.42
596	0.44
597	0.49
598	0.42
599	0.39
600	0.38
601	0.35
602	0.3
603	0.35
604	0.37
605	0.29
606	0.34
607	0.4
608	0.43
609	0.45
610	0.53
611	0.54
612	0.53
613	0.61
614	0.64
615	0.68
616	0.73
617	0.79
618	0.82
619	0.8
620	0.85
621	0.81
622	0.81
623	0.73
624	0.65
625	0.64
626	0.58
627	0.53
628	0.45
629	0.43
630	0.34
631	0.3
632	0.27
633	0.23
634	0.19
635	0.21
636	0.26
637	0.22
638	0.23
639	0.25
640	0.29
641	0.25
642	0.26
643	0.24
644	0.26
645	0.25
646	0.24
647	0.28
648	0.29
649	0.36
650	0.39
651	0.42
652	0.43
653	0.51
654	0.6
655	0.64
656	0.68
657	0.71
658	0.72
659	0.77
660	0.78
661	0.77
662	0.74
663	0.71
664	0.7
665	0.63
666	0.6
667	0.55
668	0.49
669	0.42
670	0.45
671	0.42
672	0.39
673	0.4
674	0.38
675	0.33
676	0.31
677	0.35
678	0.28
679	0.31
680	0.34
681	0.38
682	0.43
683	0.49
684	0.51
685	0.56
686	0.59
687	0.57
688	0.56
689	0.49
690	0.45
691	0.4
692	0.37
693	0.28
694	0.26
695	0.23
696	0.16
697	0.15
698	0.14
699	0.11
700	0.11
701	0.1
702	0.09
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.09
711	0.11
712	0.12
713	0.13
714	0.15
715	0.16
716	0.17
717	0.23
718	0.22
719	0.21
720	0.24
721	0.3
722	0.31
723	0.31
724	0.3
725	0.25
726	0.29
727	0.29
728	0.32
729	0.26
730	0.25
731	0.24
732	0.25
733	0.24
734	0.19
735	0.21
736	0.16
737	0.15
738	0.17
739	0.19
740	0.18
741	0.2
742	0.21
743	0.19
744	0.2
745	0.19
746	0.18
747	0.19
748	0.2
749	0.19
750	0.2
751	0.21
752	0.2
753	0.2
754	0.19
755	0.16
756	0.15
757	0.17
758	0.18
759	0.18
760	0.18
761	0.21
762	0.23
763	0.23
764	0.27
765	0.33
766	0.35
767	0.41
768	0.48
769	0.53
770	0.61
771	0.63
772	0.59
773	0.6
774	0.59
775	0.61
776	0.63
777	0.64
778	0.59
779	0.6
780	0.66
781	0.63
782	0.64
783	0.57
784	0.48
785	0.41
786	0.42
787	0.38
788	0.36
789	0.3
790	0.3
791	0.29
792	0.29
793	0.28
794	0.22
795	0.2
796	0.16
797	0.15
798	0.1
799	0.09
800	0.07
801	0.06
802	0.06
803	0.06
804	0.05
805	0.05
806	0.04
807	0.04
808	0.06
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.09
820	0.13
821	0.13
822	0.15
823	0.16
824	0.17
825	0.2
826	0.2
827	0.21
828	0.25
829	0.28
830	0.33
831	0.37
832	0.43
833	0.49
834	0.55
835	0.58
836	0.59

C5JR12

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer