Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QIF9

Protein Details
Accession A0A5N5QIF9    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-164KPAAEKEKEKNERRARRRATGRRNARAPPBasic
197-223AVGEAVKPKKKKKFNRKKTKKGAAAATHydrophilic
247-271AEAAPKRVKKPRTPRAPRPPRPAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-162PAAEKEKEKNERRARRRATGRRNARA
203-219KPKKKKKFNRKKTKKGA
250-268APKRVKKPRTPRAPRPPRP
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 10.999, nucl 5.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSVAAAPPPANAVPATNGATSEVPAASTNNAGTAGDATTTSDPAGQKNGAPTSPEETGHKVFAGNLAYATTDEGLKEFFSAFTDDIVSSEVIYRGNRQAGYGFVTFKTLEAAQKAVADLNDKELGGRPIIVQLAKPAAEKEKEKNERRARRRATGRRNARAPPGEVTEAEAEGQAEDSKPSVVERAENAAEGAAAAVGEAVKPKKKKKFNRKKTKKGAAAATAEGEQHTAAGEPSAGGEAVNSNGAEAAPKRVKKPRTPRAPRPPRPAGEQPEGQPSKNMLFVANLAFSIDDARLKQIFTDADINVVTARVVTRRWGARRSKGFGFVDVGNEEEQKKALAYFAPVESPDGTTPVVGKEVEGRQIAVKVAVDAHKKDFGEAATDAAANSAEKSEATPDTTVVAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.21
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.13
11 0.12
12 0.12
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.08
24 0.08
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.25
36 0.28
37 0.25
38 0.26
39 0.27
40 0.28
41 0.29
42 0.29
43 0.26
44 0.28
45 0.3
46 0.29
47 0.27
48 0.22
49 0.2
50 0.22
51 0.21
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.14
82 0.17
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.23
89 0.21
90 0.19
91 0.15
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.1
116 0.11
117 0.13
118 0.13
119 0.1
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.16
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.35
130 0.44
131 0.5
132 0.59
133 0.65
134 0.72
135 0.77
136 0.82
137 0.78
138 0.78
139 0.82
140 0.82
141 0.83
142 0.83
143 0.84
144 0.82
145 0.81
146 0.74
147 0.71
148 0.64
149 0.55
150 0.47
151 0.4
152 0.33
153 0.28
154 0.27
155 0.2
156 0.17
157 0.15
158 0.12
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.03
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.04
188 0.06
189 0.1
190 0.15
191 0.23
192 0.32
193 0.42
194 0.53
195 0.63
196 0.73
197 0.8
198 0.88
199 0.92
200 0.94
201 0.95
202 0.94
203 0.9
204 0.84
205 0.78
206 0.72
207 0.63
208 0.52
209 0.42
210 0.32
211 0.25
212 0.19
213 0.14
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.13
237 0.17
238 0.2
239 0.25
240 0.32
241 0.39
242 0.48
243 0.59
244 0.62
245 0.68
246 0.76
247 0.83
248 0.86
249 0.91
250 0.91
251 0.89
252 0.87
253 0.79
254 0.77
255 0.74
256 0.7
257 0.64
258 0.58
259 0.5
260 0.52
261 0.5
262 0.43
263 0.36
264 0.31
265 0.27
266 0.26
267 0.24
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.2
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.17
302 0.24
303 0.3
304 0.38
305 0.45
306 0.54
307 0.62
308 0.65
309 0.62
310 0.63
311 0.6
312 0.53
313 0.49
314 0.4
315 0.34
316 0.29
317 0.26
318 0.19
319 0.19
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.17
333 0.19
334 0.18
335 0.19
336 0.17
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.14
343 0.12
344 0.12
345 0.16
346 0.19
347 0.24
348 0.24
349 0.23
350 0.23
351 0.25
352 0.25
353 0.2
354 0.18
355 0.14
356 0.17
357 0.22
358 0.25
359 0.27
360 0.3
361 0.34
362 0.33
363 0.34
364 0.32
365 0.27
366 0.26
367 0.24
368 0.21
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.1
380 0.13
381 0.15
382 0.18
383 0.18
384 0.17