FuNGI

A0A5N5QY41

Protein Details

Accession

A0A5N5QY41

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
821-843	KATTHDKDTKRRKVEKLVSFQKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
549-587	TKKGAGKPKKIVDAETAAKEKEKQDKRMAKAEKEKKVAE
817-833	KRKAKATTHDKDTKRRK

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 9, cyto_nucl 7.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022043 CAF1A IPR000814 TBP IPR012295 TBP_dom_sf IPR033710 TBP_eukaryotic
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF12253 CAF1A PF00352 TBP
CDD	cd04516 TBP_eukaryotes

Amino Acid Sequences

MPTASRLTFPPPAAPNANRNVRLPTATVPTPAPPPAVQQQTFAMPAVSAPTPAEKPALTLEQQHITAVDGIVPTLQNIVATVNLDCRLDLKTIALHARNAEYNPKVCMLTAFTRIELTDRIKRFAAVIMRIRDPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSRLASRKYARIVQKLGFDAKFSEFKIQNIVGSCDVKFPIRLEGLAYSHGQFSSYEPELFPGLIYRMLKPKVVLLIFVSGKIVLTGAKLVQLVFKNLGSVDDTSFSLVYYHYASSFAFRGSHITVLNTIPMKALLQHHLLIGYNLGGSIEVRVNNQVQHKSDASLAILPEVVALLHAPWSLFGIPVAGTASSQPVASLKNKKSVFKQQSLGLDQAVSTISERLNFHSYLQAVSEPLKEFPVAHLPLIAKLVHESEETYGHAATRIHKLLTAQAPATIVSDGAETPILPRSVVETAIKRVADRINWGVENGVAGATLWRLEVKDRGMLPPEFQQICEERWKERNQAKLDIQAALADLSEVDRAQYLKSTGSSTQVDKDVVMKSPSKADKAEESSTKKGAGKPKKIVDAETAAKEKEKQDKRMAKAEKEKKVAENTKKSAAAFASFFTPARPAAARIKAEDVELSDYDRTFHPFTVKKNTVCSPVNRFVKSRAQSLAVEEPTSSDNLLQQFIGSRKSQPSTRSYRLWQNLEVRAIMNELNDAEVLGDSKTVRRLTLLLKNRRALPAKLFHFHENKRPAYYGTWTKSSSNILPRRPLGRDESLDYDYDSGEDWEEEGDGEVIVSDGSDEEDSGSDEEEEGWLVEDEEVEEVVDEAAGEPSESPAKRKAKATTHDKDTKRRKVEKLVSFQKGPCWEVEIGQCTYDAFNMYRIQLLNDCPYPVDPFTFIPEPFDQAATTKSTESATAPVAGASFAIPIPSTTNSDPNAPATLGTSNRVVSIAKKQVDAANLKNPFPDAHLAELYGLIEGSEKTLKGLVEDLYLALKKYPGVKKYAIEAKLREVADKSRSVDASTKRWRVSDEAWVRISKVMTIVRAPYPLYIGRCGRHSPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.49
3	0.52
4	0.6
5	0.55
6	0.54
7	0.54
8	0.5
9	0.48
10	0.43
11	0.38
12	0.36
13	0.35
14	0.35
15	0.31
16	0.31
17	0.32
18	0.31
19	0.3
20	0.24
21	0.28
22	0.34
23	0.41
24	0.39
25	0.37
26	0.38
27	0.38
28	0.38
29	0.33
30	0.25
31	0.16
32	0.15
33	0.16
34	0.14
35	0.12
36	0.11
37	0.16
38	0.17
39	0.18
40	0.2
41	0.16
42	0.18
43	0.22
44	0.26
45	0.23
46	0.27
47	0.3
48	0.32
49	0.32
50	0.3
51	0.26
52	0.23
53	0.22
54	0.17
55	0.15
56	0.1
57	0.1
58	0.11
59	0.11
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.08
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.13
71	0.14
72	0.13
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.13
78	0.14
79	0.18
80	0.25
81	0.26
82	0.26
83	0.27
84	0.3
85	0.32
86	0.31
87	0.34
88	0.32
89	0.32
90	0.32
91	0.32
92	0.29
93	0.26
94	0.26
95	0.24
96	0.24
97	0.29
98	0.28
99	0.26
100	0.27
101	0.27
102	0.27
103	0.26
104	0.28
105	0.3
106	0.31
107	0.34
108	0.33
109	0.34
110	0.32
111	0.33
112	0.33
113	0.32
114	0.37
115	0.38
116	0.43
117	0.48
118	0.48
119	0.45
120	0.41
121	0.37
122	0.35
123	0.31
124	0.27
125	0.24
126	0.27
127	0.24
128	0.23
129	0.22
130	0.16
131	0.15
132	0.13
133	0.12
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.09
138	0.1
139	0.12
140	0.14
141	0.15
142	0.17
143	0.18
144	0.2
145	0.25
146	0.25
147	0.28
148	0.32
149	0.35
150	0.38
151	0.44
152	0.49
153	0.5
154	0.54
155	0.53
156	0.53
157	0.52
158	0.53
159	0.45
160	0.38
161	0.33
162	0.31
163	0.31
164	0.27
165	0.31
166	0.26
167	0.27
168	0.32
169	0.3
170	0.29
171	0.28
172	0.29
173	0.24
174	0.25
175	0.24
176	0.21
177	0.21
178	0.2
179	0.2
180	0.18
181	0.2
182	0.19
183	0.19
184	0.18
185	0.2
186	0.2
187	0.21
188	0.21
189	0.16
190	0.16
191	0.16
192	0.15
193	0.12
194	0.13
195	0.17
196	0.18
197	0.18
198	0.17
199	0.18
200	0.18
201	0.18
202	0.16
203	0.11
204	0.1
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.22
209	0.24
210	0.25
211	0.24
212	0.25
213	0.28
214	0.27
215	0.25
216	0.19
217	0.24
218	0.23
219	0.22
220	0.2
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.06
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.13
233	0.14
234	0.16
235	0.17
236	0.16
237	0.15
238	0.15
239	0.16
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.11
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.14
262	0.14
263	0.17
264	0.15
265	0.15
266	0.16
267	0.16
268	0.19
269	0.16
270	0.15
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.13
275	0.15
276	0.15
277	0.17
278	0.17
279	0.17
280	0.18
281	0.18
282	0.15
283	0.12
284	0.09
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.06
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.12
295	0.13
296	0.16
297	0.22
298	0.25
299	0.25
300	0.28
301	0.28
302	0.27
303	0.27
304	0.24
305	0.2
306	0.17
307	0.15
308	0.11
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.05
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.1
338	0.16
339	0.25
340	0.26
341	0.34
342	0.37
343	0.4
344	0.45
345	0.54
346	0.56
347	0.53
348	0.53
349	0.49
350	0.52
351	0.52
352	0.46
353	0.35
354	0.27
355	0.21
356	0.18
357	0.14
358	0.08
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.1
363	0.11
364	0.14
365	0.16
366	0.17
367	0.17
368	0.19
369	0.19
370	0.16
371	0.16
372	0.13
373	0.11
374	0.12
375	0.14
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.18
383	0.16
384	0.15
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.19
389	0.17
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.09
401	0.08
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.15
406	0.16
407	0.15
408	0.16
409	0.17
410	0.21
411	0.23
412	0.22
413	0.17
414	0.16
415	0.17
416	0.16
417	0.16
418	0.11
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.05
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.12
436	0.15
437	0.18
438	0.18
439	0.15
440	0.17
441	0.18
442	0.16
443	0.18
444	0.18
445	0.18
446	0.18
447	0.18
448	0.15
449	0.13
450	0.12
451	0.09
452	0.06
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.04
461	0.05
462	0.08
463	0.09
464	0.13
465	0.13
466	0.14
467	0.18
468	0.18
469	0.18
470	0.2
471	0.24
472	0.21
473	0.2
474	0.21
475	0.19
476	0.21
477	0.26
478	0.24
479	0.21
480	0.27
481	0.3
482	0.36
483	0.38
484	0.44
485	0.41
486	0.46
487	0.44
488	0.43
489	0.41
490	0.34
491	0.3
492	0.22
493	0.18
494	0.12
495	0.1
496	0.05
497	0.04
498	0.03
499	0.04
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.1
510	0.1
511	0.13
512	0.15
513	0.15
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.14
518	0.16
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.19
525	0.21
526	0.2
527	0.2
528	0.2
529	0.23
530	0.26
531	0.29
532	0.28
533	0.32
534	0.32
535	0.32
536	0.33
537	0.31
538	0.3
539	0.36
540	0.4
541	0.43
542	0.48
543	0.51
544	0.56
545	0.54
546	0.51
547	0.45
548	0.4
549	0.35
550	0.31
551	0.28
552	0.21
553	0.21
554	0.22
555	0.23
556	0.27
557	0.31
558	0.34
559	0.43
560	0.51
561	0.54
562	0.61
563	0.62
564	0.59
565	0.64
566	0.67
567	0.64
568	0.61
569	0.59
570	0.53
571	0.58
572	0.59
573	0.58
574	0.57
575	0.53
576	0.53
577	0.52
578	0.49
579	0.42
580	0.34
581	0.26
582	0.18
583	0.16
584	0.13
585	0.12
586	0.12
587	0.1
588	0.11
589	0.09
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.17
594	0.22
595	0.23
596	0.23
597	0.25
598	0.24
599	0.24
600	0.21
601	0.16
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.11
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.14
610	0.12
611	0.13
612	0.18
613	0.21
614	0.25
615	0.34
616	0.39
617	0.36
618	0.4
619	0.42
620	0.42
621	0.42
622	0.42
623	0.4
624	0.44
625	0.48
626	0.46
627	0.44
628	0.43
629	0.49
630	0.47
631	0.43
632	0.35
633	0.32
634	0.31
635	0.33
636	0.34
637	0.26
638	0.24
639	0.2
640	0.19
641	0.17
642	0.17
643	0.13
644	0.07
645	0.09
646	0.1
647	0.11
648	0.09
649	0.09
650	0.11
651	0.13
652	0.16
653	0.14
654	0.16
655	0.19
656	0.22
657	0.26
658	0.27
659	0.34
660	0.39
661	0.44
662	0.45
663	0.46
664	0.52
665	0.56
666	0.55
667	0.53
668	0.5
669	0.49
670	0.45
671	0.42
672	0.33
673	0.26
674	0.24
675	0.19
676	0.12
677	0.09
678	0.07
679	0.07
680	0.06
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.06
687	0.05
688	0.07
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.13
693	0.15
694	0.2
695	0.29
696	0.38
697	0.43
698	0.49
699	0.52
700	0.54
701	0.58
702	0.56
703	0.49
704	0.46
705	0.45
706	0.43
707	0.45
708	0.45
709	0.45
710	0.48
711	0.49
712	0.51
713	0.5
714	0.48
715	0.46
716	0.44
717	0.4
718	0.35
719	0.39
720	0.39
721	0.34
722	0.36
723	0.36
724	0.35
725	0.36
726	0.36
727	0.35
728	0.36
729	0.39
730	0.39
731	0.43
732	0.46
733	0.48
734	0.47
735	0.45
736	0.42
737	0.41
738	0.39
739	0.37
740	0.39
741	0.35
742	0.33
743	0.3
744	0.24
745	0.18
746	0.16
747	0.12
748	0.08
749	0.07
750	0.07
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.05
757	0.05
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.05
769	0.05
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.06
774	0.07
775	0.07
776	0.06
777	0.06
778	0.05
779	0.06
780	0.05
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.05
788	0.05
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.05
797	0.04
798	0.06
799	0.12
800	0.13
801	0.15
802	0.24
803	0.3
804	0.34
805	0.4
806	0.46
807	0.5
808	0.59
809	0.67
810	0.66
811	0.7
812	0.75
813	0.75
814	0.78
815	0.79
816	0.8
817	0.8
818	0.8
819	0.77
820	0.79
821	0.83
822	0.82
823	0.82
824	0.82
825	0.77
826	0.73
827	0.67
828	0.62
829	0.56
830	0.48
831	0.38
832	0.33
833	0.27
834	0.26
835	0.29
836	0.28
837	0.24
838	0.23
839	0.22
840	0.18
841	0.18
842	0.16
843	0.14
844	0.1
845	0.12
846	0.14
847	0.15
848	0.18
849	0.17
850	0.19
851	0.2
852	0.22
853	0.24
854	0.23
855	0.23
856	0.21
857	0.22
858	0.23
859	0.21
860	0.2
861	0.17
862	0.16
863	0.22
864	0.24
865	0.23
866	0.25
867	0.24
868	0.27
869	0.25
870	0.25
871	0.2
872	0.17
873	0.2
874	0.18
875	0.18
876	0.15
877	0.15
878	0.15
879	0.16
880	0.16
881	0.17
882	0.15
883	0.15
884	0.14
885	0.13
886	0.13
887	0.11
888	0.1
889	0.08
890	0.07
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.1
896	0.12
897	0.16
898	0.17
899	0.23
900	0.24
901	0.27
902	0.28
903	0.27
904	0.27
905	0.23
906	0.21
907	0.17
908	0.2
909	0.18
910	0.19
911	0.19
912	0.17
913	0.17
914	0.18
915	0.17
916	0.16
917	0.24
918	0.31
919	0.31
920	0.31
921	0.33
922	0.36
923	0.41
924	0.43
925	0.39
926	0.4
927	0.41
928	0.41
929	0.39
930	0.37
931	0.31
932	0.29
933	0.3
934	0.23
935	0.24
936	0.25
937	0.24
938	0.23
939	0.23
940	0.19
941	0.13
942	0.11
943	0.06
944	0.07
945	0.06
946	0.09
947	0.11
948	0.1
949	0.11
950	0.14
951	0.14
952	0.14
953	0.17
954	0.15
955	0.14
956	0.15
957	0.14
958	0.16
959	0.16
960	0.16
961	0.14
962	0.14
963	0.15
964	0.24
965	0.31
966	0.31
967	0.37
968	0.41
969	0.42
970	0.5
971	0.57
972	0.53
973	0.52
974	0.51
975	0.5
976	0.53
977	0.51
978	0.45
979	0.39
980	0.4
981	0.39
982	0.42
983	0.39
984	0.38
985	0.38
986	0.39
987	0.43
988	0.43
989	0.48
990	0.53
991	0.57
992	0.54
993	0.55
994	0.55
995	0.54
996	0.52
997	0.52
998	0.5
999	0.49
1000	0.5
1001	0.49
1002	0.47
1003	0.44
1004	0.4
1005	0.3
1006	0.29
1007	0.25
1008	0.25
1009	0.27
1010	0.3
1011	0.29
1012	0.31
1013	0.31
1014	0.26
1015	0.27
1016	0.29
1017	0.29
1018	0.32
1019	0.34
1020	0.35
1021	0.39

A0A5N5QY41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer