FuNGI

A0A5N5QV68

Protein Details

Accession

A0A5N5QV68

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
698-718	TAILVYRRYRKSRRLGRAEVG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 23, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001514 DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS IPR011262 DNA-dir_RNA_pol_insert IPR011263 DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3 IPR036603 RBP11-like IPR036643 RNApol_insert_sf
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0055029 C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF01000 RNA_pol_A_bac PF01193 RNA_pol_L
PROSITE	View protein in PROSITE PS00446 RNA_POL_D_30KD
CDD	cd07031 RNAP_II_RPB3

Amino Acid Sequences

MNQENGGAPILTIRDVKKQSVNFVLEGVELAFANSLRRVVMADLPTLAIDLVEIESNTTVLADEFIAHRLGMVPLISTNCDEALRYTRDCTCISRCKYCSVELYLHVVSTSQPVDITSNNLDIVPSGGGEFGDENEGEEGDELQKRPPNFGQPVGKAWLQMIQMFHRFCSAAFEKVKNSNFDGTAKEHAKWSPCSAIGFEYDPHNKLRHTTYWYEVDSRAEWPLSENAKEEEPPHDDESFDYMAKPQKFYFDVETDGKVAPREVVLKGLIELQTKLGNIIHGLTPGNEFESDAGPVAAIPPPQMNGPRSQGNGWGASPAPNANAGGWGSNSPASGASGWGASPRGSGGGGWGSGGGAGAGGGGGGWGSPANSGGGGGGWGSPNRTAGSGGGWNMRQGMVRLFTFDASGGSCGTLGRLSIGVDHPHWSSLCPLAARVGLYDASLANSRHTSTLLEDSTRSLAEPEIFLVLAGALRILVPMPANAARIVYFTFQLFGFVTLPFLTCTFLFCPSVKRHPTMPNNTFLWSRAITLNYVQQSLIPPSCSTIVLGGLFAVCCSPNNLMVPSPHSHCVERRVRSSSVSAEIPRRFQTVLKLPTPAQPPGMSAAALTIIWKVWSLTWSVRTNAIVSKEPLWLSSILLGSPWFLWGGLSGIFAAVQNKSHVYRSSFYCTSDNQTLGVISGVLAAALLILCLLLQFWTAILVYRRYRKSRRLGRAEVGDVSVPFLVRIIAFALFIFVALVLSFVATSTFALDVPDVLISSIGMVIFLIFASQEDVLVAWRIKHPKSHVENYPGNNAEGLDDQSAHEEGPPLSRMSLFRTSHGPSRASSILELPASSGNKRDLANIDQTERSPTSFGDIESVGTTSSPYHSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.29
3	0.33
4	0.39
5	0.41
6	0.46
7	0.5
8	0.51
9	0.43
10	0.4
11	0.37
12	0.29
13	0.26
14	0.2
15	0.12
16	0.09
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.1
25	0.11
26	0.13
27	0.19
28	0.19
29	0.19
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.18
34	0.15
35	0.08
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.06
47	0.05
48	0.07
49	0.06
50	0.07
51	0.08
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.09
61	0.1
62	0.12
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.15
70	0.2
71	0.23
72	0.24
73	0.27
74	0.29
75	0.33
76	0.35
77	0.37
78	0.38
79	0.44
80	0.49
81	0.55
82	0.53
83	0.56
84	0.57
85	0.56
86	0.53
87	0.49
88	0.47
89	0.4
90	0.43
91	0.37
92	0.33
93	0.29
94	0.23
95	0.18
96	0.18
97	0.16
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.13
102	0.13
103	0.17
104	0.16
105	0.17
106	0.17
107	0.17
108	0.15
109	0.14
110	0.14
111	0.1
112	0.08
113	0.07
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.07
118	0.06
119	0.08
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.1
128	0.14
129	0.13
130	0.17
131	0.22
132	0.22
133	0.27
134	0.3
135	0.36
136	0.37
137	0.44
138	0.48
139	0.46
140	0.5
141	0.49
142	0.45
143	0.37
144	0.33
145	0.3
146	0.23
147	0.22
148	0.21
149	0.21
150	0.27
151	0.27
152	0.26
153	0.24
154	0.23
155	0.2
156	0.26
157	0.24
158	0.25
159	0.29
160	0.32
161	0.34
162	0.42
163	0.46
164	0.41
165	0.41
166	0.38
167	0.35
168	0.35
169	0.33
170	0.29
171	0.33
172	0.32
173	0.3
174	0.29
175	0.3
176	0.33
177	0.33
178	0.33
179	0.3
180	0.29
181	0.29
182	0.27
183	0.26
184	0.23
185	0.22
186	0.19
187	0.21
188	0.23
189	0.24
190	0.25
191	0.26
192	0.24
193	0.26
194	0.3
195	0.29
196	0.32
197	0.34
198	0.36
199	0.4
200	0.42
201	0.41
202	0.37
203	0.34
204	0.29
205	0.26
206	0.23
207	0.18
208	0.16
209	0.15
210	0.2
211	0.21
212	0.2
213	0.21
214	0.21
215	0.22
216	0.23
217	0.22
218	0.2
219	0.21
220	0.24
221	0.25
222	0.24
223	0.22
224	0.22
225	0.25
226	0.22
227	0.19
228	0.15
229	0.15
230	0.22
231	0.23
232	0.25
233	0.21
234	0.23
235	0.25
236	0.27
237	0.29
238	0.24
239	0.27
240	0.27
241	0.28
242	0.25
243	0.24
244	0.22
245	0.17
246	0.16
247	0.12
248	0.11
249	0.12
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.15
256	0.15
257	0.14
258	0.14
259	0.13
260	0.14
261	0.13
262	0.14
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.1
290	0.14
291	0.14
292	0.16
293	0.2
294	0.23
295	0.24
296	0.24
297	0.26
298	0.25
299	0.25
300	0.21
301	0.19
302	0.16
303	0.15
304	0.15
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.03
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.01
349	0.01
350	0.01
351	0.01
352	0.02
353	0.02
354	0.02
355	0.02
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.09
375	0.1
376	0.11
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.1
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.04
456	0.04
457	0.03
458	0.03
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.05
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.08
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.08
485	0.07
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.08
492	0.09
493	0.11
494	0.12
495	0.12
496	0.17
497	0.2
498	0.29
499	0.3
500	0.31
501	0.35
502	0.43
503	0.51
504	0.56
505	0.55
506	0.51
507	0.5
508	0.49
509	0.44
510	0.36
511	0.31
512	0.21
513	0.2
514	0.16
515	0.16
516	0.15
517	0.15
518	0.19
519	0.16
520	0.16
521	0.15
522	0.14
523	0.14
524	0.17
525	0.16
526	0.13
527	0.12
528	0.13
529	0.14
530	0.13
531	0.12
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.06
544	0.07
545	0.09
546	0.1
547	0.11
548	0.12
549	0.13
550	0.17
551	0.18
552	0.2
553	0.21
554	0.22
555	0.23
556	0.24
557	0.33
558	0.37
559	0.39
560	0.41
561	0.42
562	0.42
563	0.42
564	0.42
565	0.36
566	0.31
567	0.29
568	0.28
569	0.3
570	0.3
571	0.31
572	0.3
573	0.29
574	0.26
575	0.25
576	0.29
577	0.31
578	0.35
579	0.34
580	0.35
581	0.34
582	0.39
583	0.42
584	0.36
585	0.29
586	0.23
587	0.23
588	0.23
589	0.22
590	0.16
591	0.12
592	0.11
593	0.09
594	0.09
595	0.08
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.09
604	0.12
605	0.18
606	0.2
607	0.22
608	0.23
609	0.23
610	0.24
611	0.25
612	0.25
613	0.22
614	0.21
615	0.22
616	0.23
617	0.23
618	0.21
619	0.2
620	0.17
621	0.14
622	0.15
623	0.14
624	0.1
625	0.11
626	0.1
627	0.09
628	0.09
629	0.08
630	0.06
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.08
642	0.07
643	0.08
644	0.09
645	0.12
646	0.13
647	0.16
648	0.19
649	0.22
650	0.25
651	0.29
652	0.36
653	0.35
654	0.36
655	0.36
656	0.35
657	0.37
658	0.37
659	0.32
660	0.25
661	0.24
662	0.21
663	0.18
664	0.16
665	0.1
666	0.06
667	0.05
668	0.05
669	0.04
670	0.04
671	0.03
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.02
676	0.02
677	0.02
678	0.02
679	0.02
680	0.02
681	0.03
682	0.03
683	0.03
684	0.04
685	0.05
686	0.08
687	0.1
688	0.16
689	0.21
690	0.3
691	0.38
692	0.46
693	0.54
694	0.6
695	0.69
696	0.74
697	0.79
698	0.8
699	0.8
700	0.79
701	0.77
702	0.71
703	0.62
704	0.52
705	0.43
706	0.33
707	0.27
708	0.2
709	0.13
710	0.1
711	0.09
712	0.08
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.06
723	0.05
724	0.05
725	0.04
726	0.05
727	0.03
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.04
733	0.05
734	0.06
735	0.06
736	0.06
737	0.07
738	0.07
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.05
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.03
756	0.04
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.06
762	0.07
763	0.1
764	0.11
765	0.11
766	0.17
767	0.24
768	0.26
769	0.33
770	0.37
771	0.45
772	0.53
773	0.59
774	0.61
775	0.63
776	0.69
777	0.66
778	0.69
779	0.6
780	0.52
781	0.44
782	0.36
783	0.29
784	0.24
785	0.22
786	0.15
787	0.13
788	0.13
789	0.15
790	0.15
791	0.14
792	0.13
793	0.13
794	0.13
795	0.16
796	0.17
797	0.16
798	0.16
799	0.19
800	0.2
801	0.24
802	0.32
803	0.3
804	0.3
805	0.35
806	0.39
807	0.44
808	0.48
809	0.43
810	0.34
811	0.39
812	0.39
813	0.35
814	0.32
815	0.27
816	0.26
817	0.25
818	0.24
819	0.19
820	0.23
821	0.23
822	0.23
823	0.24
824	0.23
825	0.26
826	0.27
827	0.3
828	0.29
829	0.32
830	0.4
831	0.4
832	0.41
833	0.4
834	0.4
835	0.42
836	0.39
837	0.35
838	0.27
839	0.23
840	0.25
841	0.24
842	0.24
843	0.21
844	0.2
845	0.2
846	0.19
847	0.19
848	0.14
849	0.12
850	0.12
851	0.1

A0A5N5QV68

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer