Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QVD6

Protein Details
Accession A0A5N5QVD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-97AEEWKRTGGKQRKTLRPYGSHydrophilic
649-670ASSSVRRKRIRTCAKCEKRIDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037987  FHL2/3/5  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MGVLTSRRNASSVGEWDGRVFGCRSSASANAMEIDLEWASRAYGMREYQATEDGASCSWTEPTIARGDVSGDNEHGAAEEWKRTGGKQRKTLRPYGSGGPCDSPGRAIDNPVMFAASSWLHHSPPMALSLPAAGALRISQVLPMLKCSRCGEETDINFADQHVCKEREKERPVSRSTDRASTVSGISVPSLSSYSSHSRSSTSTKRAPSVRTIQRQSLDDAAARALPRSPSPDSPVPSPGSPVSRAASPAPTVRSAHSHSGPRSPSPAPSQAPSRMTPSPVPVSRTPELPPTAPLVLRKLSRASDASLPPQPPPPTHAPPPPDTSIGGEAGMAGVGRRGFAAAAQAALFTGHLRFGLPSPGLSPTSMYGHAHLGTSPTSPIDGRLSSLSAYLNISTDLGGTPPLSPSHSPASQSSDRLHSPDDAPSPGAQIARANSRSPSPVDVIDGSGSRSLAKGKGKAVGGLSSLANKLRDTSDDQRTSPDPLHRTDRTRSRAPSNARSEAESETMLAYGSWRSESPTELPNQPDENTIAFPRRPSNASDHPPKRSDSQSSGYSSSSSGSSSARRVKQSAGAQALSALREEDEDDVRSAYTSPSSAEIDGAFKVTPISAPAVSTVPVTAIALDALVSDADRLNLPARSKTSASVSSASSSVRRKRIRTCAKCEKRIDDGRWIKVDDGDGGNTVLCEQDWKMLYLPKCRQCGLAIETQAIYASDGQLKGKYHKGCFNCYSCHQPFPDRSFYVYQERPYCKYHYHEANNSLCAAPLCREPIEGPCAVSYSGARYHPEHFTCEYEDMEGRCKMLLKEYWEVNGERICERHAIRTAARSEDDGDRVKAKKRQTRFLDLAPANESGGRDLC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.31
4 0.33
5 0.29
6 0.25
7 0.22
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.2
13 0.22
14 0.23
15 0.24
16 0.24
17 0.21
18 0.21
19 0.19
20 0.15
21 0.15
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.16
31 0.17
32 0.21
33 0.23
34 0.25
35 0.25
36 0.27
37 0.25
38 0.21
39 0.21
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.11
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.16
54 0.19
55 0.2
56 0.23
57 0.22
58 0.18
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.16
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.31
72 0.38
73 0.45
74 0.51
75 0.61
76 0.69
77 0.75
78 0.82
79 0.78
80 0.74
81 0.69
82 0.69
83 0.65
84 0.58
85 0.54
86 0.48
87 0.44
88 0.39
89 0.35
90 0.27
91 0.22
92 0.24
93 0.22
94 0.22
95 0.25
96 0.24
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.1
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.1
128 0.14
129 0.14
130 0.2
131 0.25
132 0.25
133 0.3
134 0.32
135 0.34
136 0.31
137 0.34
138 0.35
139 0.37
140 0.38
141 0.41
142 0.39
143 0.34
144 0.33
145 0.3
146 0.29
147 0.22
148 0.24
149 0.24
150 0.27
151 0.28
152 0.36
153 0.42
154 0.47
155 0.52
156 0.58
157 0.6
158 0.64
159 0.66
160 0.67
161 0.64
162 0.62
163 0.59
164 0.55
165 0.49
166 0.42
167 0.4
168 0.34
169 0.31
170 0.23
171 0.2
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.12
181 0.17
182 0.2
183 0.22
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.34
188 0.38
189 0.4
190 0.44
191 0.46
192 0.51
193 0.54
194 0.54
195 0.54
196 0.56
197 0.57
198 0.6
199 0.61
200 0.6
201 0.59
202 0.57
203 0.52
204 0.45
205 0.37
206 0.29
207 0.25
208 0.2
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.18
216 0.21
217 0.22
218 0.29
219 0.34
220 0.35
221 0.36
222 0.39
223 0.36
224 0.33
225 0.33
226 0.29
227 0.26
228 0.25
229 0.24
230 0.21
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.18
236 0.2
237 0.2
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.26
243 0.3
244 0.31
245 0.35
246 0.34
247 0.4
248 0.41
249 0.37
250 0.38
251 0.34
252 0.33
253 0.32
254 0.37
255 0.32
256 0.32
257 0.36
258 0.37
259 0.39
260 0.37
261 0.36
262 0.31
263 0.32
264 0.31
265 0.3
266 0.32
267 0.31
268 0.34
269 0.32
270 0.38
271 0.36
272 0.36
273 0.33
274 0.32
275 0.31
276 0.27
277 0.25
278 0.22
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.19
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.22
289 0.22
290 0.22
291 0.24
292 0.25
293 0.27
294 0.29
295 0.29
296 0.27
297 0.31
298 0.3
299 0.25
300 0.28
301 0.32
302 0.33
303 0.37
304 0.41
305 0.4
306 0.42
307 0.46
308 0.43
309 0.37
310 0.32
311 0.29
312 0.25
313 0.21
314 0.17
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.05
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.07
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.12
351 0.1
352 0.12
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.15
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.24
399 0.24
400 0.25
401 0.24
402 0.23
403 0.23
404 0.22
405 0.22
406 0.17
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.14
420 0.15
421 0.15
422 0.14
423 0.16
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.14
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.11
441 0.14
442 0.16
443 0.17
444 0.21
445 0.21
446 0.22
447 0.22
448 0.18
449 0.16
450 0.15
451 0.13
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.17
461 0.22
462 0.3
463 0.32
464 0.32
465 0.34
466 0.34
467 0.35
468 0.31
469 0.31
470 0.24
471 0.25
472 0.32
473 0.32
474 0.36
475 0.4
476 0.46
477 0.47
478 0.5
479 0.51
480 0.5
481 0.54
482 0.55
483 0.58
484 0.56
485 0.56
486 0.5
487 0.48
488 0.44
489 0.38
490 0.33
491 0.23
492 0.17
493 0.11
494 0.11
495 0.09
496 0.07
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.12
506 0.15
507 0.18
508 0.2
509 0.21
510 0.22
511 0.23
512 0.22
513 0.21
514 0.19
515 0.17
516 0.16
517 0.16
518 0.17
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.2
523 0.2
524 0.21
525 0.27
526 0.32
527 0.39
528 0.47
529 0.5
530 0.52
531 0.53
532 0.53
533 0.49
534 0.46
535 0.44
536 0.39
537 0.38
538 0.38
539 0.39
540 0.38
541 0.34
542 0.3
543 0.25
544 0.21
545 0.16
546 0.12
547 0.1
548 0.1
549 0.12
550 0.17
551 0.24
552 0.28
553 0.3
554 0.31
555 0.32
556 0.38
557 0.4
558 0.41
559 0.37
560 0.33
561 0.3
562 0.3
563 0.29
564 0.22
565 0.18
566 0.11
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.08
571 0.09
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.09
579 0.08
580 0.07
581 0.08
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.09
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.09
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.05
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.03
615 0.03
616 0.04
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.07
621 0.09
622 0.12
623 0.14
624 0.18
625 0.2
626 0.24
627 0.24
628 0.25
629 0.28
630 0.28
631 0.29
632 0.27
633 0.26
634 0.23
635 0.23
636 0.22
637 0.23
638 0.27
639 0.31
640 0.39
641 0.44
642 0.48
643 0.56
644 0.67
645 0.73
646 0.75
647 0.78
648 0.8
649 0.84
650 0.87
651 0.84
652 0.78
653 0.77
654 0.76
655 0.7
656 0.69
657 0.66
658 0.63
659 0.6
660 0.55
661 0.47
662 0.4
663 0.37
664 0.29
665 0.23
666 0.18
667 0.15
668 0.15
669 0.14
670 0.12
671 0.11
672 0.08
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.12
677 0.13
678 0.15
679 0.17
680 0.22
681 0.27
682 0.35
683 0.43
684 0.45
685 0.48
686 0.47
687 0.47
688 0.43
689 0.46
690 0.41
691 0.39
692 0.33
693 0.31
694 0.3
695 0.27
696 0.26
697 0.19
698 0.16
699 0.09
700 0.1
701 0.11
702 0.12
703 0.13
704 0.17
705 0.19
706 0.22
707 0.29
708 0.34
709 0.36
710 0.43
711 0.46
712 0.5
713 0.55
714 0.56
715 0.54
716 0.51
717 0.56
718 0.52
719 0.53
720 0.48
721 0.49
722 0.52
723 0.53
724 0.57
725 0.49
726 0.5
727 0.48
728 0.49
729 0.51
730 0.47
731 0.47
732 0.48
733 0.51
734 0.51
735 0.51
736 0.51
737 0.47
738 0.48
739 0.51
740 0.52
741 0.56
742 0.59
743 0.64
744 0.63
745 0.6
746 0.56
747 0.47
748 0.37
749 0.3
750 0.24
751 0.18
752 0.17
753 0.2
754 0.19
755 0.2
756 0.2
757 0.24
758 0.27
759 0.26
760 0.23
761 0.2
762 0.21
763 0.2
764 0.19
765 0.15
766 0.15
767 0.19
768 0.2
769 0.23
770 0.24
771 0.28
772 0.35
773 0.36
774 0.37
775 0.35
776 0.36
777 0.37
778 0.36
779 0.33
780 0.28
781 0.3
782 0.26
783 0.29
784 0.26
785 0.22
786 0.22
787 0.24
788 0.22
789 0.25
790 0.29
791 0.3
792 0.36
793 0.37
794 0.4
795 0.4
796 0.4
797 0.37
798 0.35
799 0.31
800 0.27
801 0.26
802 0.24
803 0.27
804 0.28
805 0.32
806 0.35
807 0.38
808 0.39
809 0.46
810 0.47
811 0.46
812 0.45
813 0.39
814 0.37
815 0.37
816 0.39
817 0.35
818 0.34
819 0.35
820 0.38
821 0.44
822 0.46
823 0.51
824 0.55
825 0.6
826 0.68
827 0.7
828 0.76
829 0.74
830 0.75
831 0.75
832 0.67
833 0.62
834 0.55
835 0.47
836 0.38
837 0.33
838 0.28