Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QH47

Protein Details
Accession A0A5N5QH47    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21DSLPKRPNTPPSPPRRGSRHBasic
45-67IWDRERGRPMFRPRSRSRSRSFDHydrophilic
71-106DYQRRRSPPLPHPHSRLPRRAWERSRSRSPPPPSKSHydrophilic
117-160TGCDKGNRCRFRHERPRSRSFSPSRSRSRSPRSRSPPMRYRRGEHydrophilic
210-241EERSPGRRTGRSRGRGRRRPDRNKDKANWDSFBasic
261-281YESHRGRSRSRSPRGRSRTPSBasic
336-355TPPRGRSRARSRSRSPSRQSHydrophilic
608-633HPFPLPPRPRSPPRMRSPPRGPRATRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-63PPSPPRRGSRHVSPPTAQRPGPSSWEPPRPRSPGIWDRERGRPMFRPRSRSRS
75-103RRSPPLPHPHSRLPRRAWERSRSRSPPPP
128-159RHERPRSRSFSPSRSRSRSPRSRSPPMRYRRG
213-234SPGRRTGRSRGRGRRRPDRNKD
258-355KRGYESHRGRSRSRSPRGRSRTPSNSRSRSPHDATAASTRSNSKEKRSRHSVAYPPPSRSHSRSHSTRLRSPTRSRDHTPPRGRSRARSRSRSPSRQS
614-640PRPRSPPRMRSPPRGPRATRLLPDKAK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDSLPKRPNTPPSPPRRGSRHVSPPTAQRPGPSSWEPPRPRSPGIWDRERGRPMFRPRSRSRSRSFDYNYDYQRRRSPPLPHPHSRLPRRAWERSRSRSPPPPSKSPVLCKYFSRPTGCDKGNRCRFRHERPRSRSFSPSRSRSRSPRSRSPPMRYRRGESPMLIPRGGLRSPQPSLLQRLGPVAPMRPVSPMRSRAVSNDPTEPLEEGEERSPGRRTGRSRGRGRRRPDRNKDKANWDSFVADEDELMSEDDGRGSKRGYESHRGRSRSRSPRGRSRTPSNSRSRSPHDATAASTRSNSKEKRSRHSVAYPPPSRSHSRSHSTRLRSPTRSRDHTPPRGRSRARSRSRSPSRQSRSGSQPSHRQSPPDPNQESLPEREKNSTSAPNPSSSLATASSTSPSIPTGPRWRAGANPQTTPASVAPAARAVPVSGRGGPPPTGPRGDREPPRGPRNMVASSMHMAAGVGGTGMGSGPGWERPQLAFQNYLAAVQSKLEEREGKKKEEEPSPEGEPKIVAEAKTAVESDAMDLDDSEERKLVPPHLNTPIPGPSAGGSSVASPAQSNVRRASASLHASPAIGQGVPLPTLTGASQSHTTTPSAIPATLPPTHPFPLPPRPRSPPRMRSPPRGPRATRLLPDKAKGAATETGPERDRGTDPVGRGGDKNHWTDKDRTTGEAERKAHPPATNPARHPRMPPIRATKRESLFPDLERELASLEEQRTKLANEHFPLEIALRQAVDELALSTIDCRAAEDRRVMTETVLEAMMKGGGLAASGDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.81
3 0.79
4 0.79
5 0.76
6 0.76
7 0.76
8 0.75
9 0.76
10 0.72
11 0.73
12 0.75
13 0.74
14 0.64
15 0.57
16 0.53
17 0.5
18 0.52
19 0.47
20 0.47
21 0.48
22 0.57
23 0.6
24 0.63
25 0.68
26 0.67
27 0.66
28 0.63
29 0.64
30 0.63
31 0.66
32 0.67
33 0.65
34 0.63
35 0.68
36 0.7
37 0.63
38 0.6
39 0.61
40 0.62
41 0.67
42 0.69
43 0.71
44 0.73
45 0.81
46 0.84
47 0.84
48 0.81
49 0.8
50 0.78
51 0.78
52 0.76
53 0.74
54 0.71
55 0.71
56 0.71
57 0.71
58 0.69
59 0.64
60 0.67
61 0.64
62 0.64
63 0.63
64 0.64
65 0.64
66 0.71
67 0.75
68 0.75
69 0.77
70 0.8
71 0.83
72 0.82
73 0.82
74 0.77
75 0.78
76 0.79
77 0.82
78 0.8
79 0.8
80 0.81
81 0.81
82 0.85
83 0.8
84 0.8
85 0.79
86 0.81
87 0.81
88 0.78
89 0.78
90 0.74
91 0.76
92 0.75
93 0.74
94 0.74
95 0.69
96 0.65
97 0.59
98 0.61
99 0.61
100 0.61
101 0.57
102 0.51
103 0.52
104 0.59
105 0.59
106 0.59
107 0.57
108 0.62
109 0.66
110 0.72
111 0.67
112 0.68
113 0.73
114 0.75
115 0.79
116 0.8
117 0.8
118 0.81
119 0.88
120 0.84
121 0.81
122 0.8
123 0.77
124 0.76
125 0.75
126 0.75
127 0.75
128 0.76
129 0.79
130 0.78
131 0.81
132 0.81
133 0.8
134 0.81
135 0.8
136 0.84
137 0.86
138 0.86
139 0.85
140 0.83
141 0.85
142 0.79
143 0.76
144 0.73
145 0.7
146 0.64
147 0.57
148 0.56
149 0.54
150 0.52
151 0.46
152 0.38
153 0.34
154 0.34
155 0.32
156 0.26
157 0.21
158 0.24
159 0.26
160 0.29
161 0.31
162 0.3
163 0.36
164 0.37
165 0.34
166 0.29
167 0.31
168 0.28
169 0.26
170 0.24
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.19
175 0.2
176 0.22
177 0.24
178 0.3
179 0.34
180 0.34
181 0.36
182 0.36
183 0.36
184 0.41
185 0.42
186 0.37
187 0.36
188 0.34
189 0.33
190 0.33
191 0.29
192 0.21
193 0.18
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.24
203 0.28
204 0.33
205 0.41
206 0.51
207 0.59
208 0.67
209 0.74
210 0.8
211 0.82
212 0.86
213 0.86
214 0.87
215 0.88
216 0.89
217 0.9
218 0.88
219 0.9
220 0.87
221 0.87
222 0.84
223 0.77
224 0.67
225 0.57
226 0.48
227 0.38
228 0.33
229 0.25
230 0.16
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.11
245 0.14
246 0.19
247 0.24
248 0.34
249 0.39
250 0.49
251 0.56
252 0.58
253 0.58
254 0.62
255 0.66
256 0.66
257 0.7
258 0.7
259 0.7
260 0.76
261 0.82
262 0.82
263 0.79
264 0.78
265 0.79
266 0.77
267 0.79
268 0.78
269 0.76
270 0.71
271 0.7
272 0.68
273 0.65
274 0.6
275 0.55
276 0.48
277 0.43
278 0.41
279 0.4
280 0.35
281 0.27
282 0.24
283 0.22
284 0.23
285 0.29
286 0.3
287 0.33
288 0.4
289 0.45
290 0.52
291 0.58
292 0.59
293 0.57
294 0.63
295 0.62
296 0.63
297 0.67
298 0.62
299 0.57
300 0.56
301 0.54
302 0.51
303 0.47
304 0.44
305 0.41
306 0.45
307 0.46
308 0.52
309 0.55
310 0.57
311 0.59
312 0.61
313 0.62
314 0.61
315 0.63
316 0.65
317 0.65
318 0.65
319 0.63
320 0.65
321 0.67
322 0.71
323 0.73
324 0.72
325 0.72
326 0.75
327 0.73
328 0.72
329 0.73
330 0.73
331 0.73
332 0.72
333 0.7
334 0.72
335 0.79
336 0.8
337 0.77
338 0.77
339 0.75
340 0.74
341 0.71
342 0.66
343 0.65
344 0.65
345 0.62
346 0.55
347 0.57
348 0.53
349 0.58
350 0.52
351 0.47
352 0.41
353 0.47
354 0.51
355 0.51
356 0.48
357 0.41
358 0.42
359 0.43
360 0.41
361 0.34
362 0.31
363 0.25
364 0.25
365 0.27
366 0.26
367 0.25
368 0.26
369 0.28
370 0.24
371 0.28
372 0.28
373 0.26
374 0.27
375 0.25
376 0.22
377 0.17
378 0.17
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.09
389 0.08
390 0.12
391 0.2
392 0.21
393 0.23
394 0.24
395 0.24
396 0.25
397 0.31
398 0.35
399 0.3
400 0.29
401 0.29
402 0.28
403 0.28
404 0.27
405 0.2
406 0.14
407 0.12
408 0.12
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.19
427 0.19
428 0.21
429 0.26
430 0.32
431 0.36
432 0.41
433 0.47
434 0.5
435 0.56
436 0.56
437 0.51
438 0.48
439 0.48
440 0.42
441 0.35
442 0.29
443 0.25
444 0.23
445 0.22
446 0.18
447 0.12
448 0.11
449 0.08
450 0.07
451 0.05
452 0.03
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.02
460 0.03
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.09
465 0.09
466 0.15
467 0.17
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.21
472 0.2
473 0.19
474 0.15
475 0.13
476 0.11
477 0.1
478 0.11
479 0.08
480 0.09
481 0.11
482 0.17
483 0.19
484 0.29
485 0.33
486 0.35
487 0.38
488 0.42
489 0.45
490 0.47
491 0.5
492 0.44
493 0.45
494 0.46
495 0.46
496 0.41
497 0.35
498 0.28
499 0.22
500 0.22
501 0.19
502 0.14
503 0.12
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.09
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.12
523 0.14
524 0.18
525 0.22
526 0.24
527 0.29
528 0.35
529 0.36
530 0.34
531 0.35
532 0.33
533 0.27
534 0.25
535 0.2
536 0.14
537 0.14
538 0.14
539 0.12
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.07
546 0.08
547 0.16
548 0.19
549 0.21
550 0.22
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.27
555 0.25
556 0.27
557 0.25
558 0.25
559 0.23
560 0.23
561 0.23
562 0.2
563 0.15
564 0.1
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.07
572 0.08
573 0.08
574 0.1
575 0.09
576 0.11
577 0.14
578 0.14
579 0.16
580 0.17
581 0.17
582 0.16
583 0.16
584 0.18
585 0.16
586 0.16
587 0.14
588 0.15
589 0.19
590 0.2
591 0.21
592 0.2
593 0.23
594 0.25
595 0.25
596 0.26
597 0.28
598 0.37
599 0.45
600 0.49
601 0.52
602 0.59
603 0.67
604 0.74
605 0.78
606 0.77
607 0.77
608 0.82
609 0.82
610 0.84
611 0.86
612 0.86
613 0.85
614 0.84
615 0.78
616 0.74
617 0.76
618 0.72
619 0.68
620 0.64
621 0.64
622 0.59
623 0.58
624 0.53
625 0.46
626 0.4
627 0.34
628 0.31
629 0.25
630 0.22
631 0.25
632 0.25
633 0.28
634 0.28
635 0.29
636 0.26
637 0.26
638 0.27
639 0.25
640 0.28
641 0.27
642 0.27
643 0.33
644 0.33
645 0.32
646 0.31
647 0.31
648 0.34
649 0.35
650 0.39
651 0.38
652 0.41
653 0.44
654 0.5
655 0.51
656 0.52
657 0.48
658 0.46
659 0.45
660 0.48
661 0.51
662 0.53
663 0.51
664 0.46
665 0.48
666 0.5
667 0.48
668 0.43
669 0.4
670 0.42
671 0.49
672 0.52
673 0.54
674 0.61
675 0.63
676 0.64
677 0.64
678 0.64
679 0.65
680 0.61
681 0.65
682 0.65
683 0.69
684 0.73
685 0.76
686 0.74
687 0.67
688 0.7
689 0.66
690 0.63
691 0.57
692 0.51
693 0.51
694 0.43
695 0.4
696 0.34
697 0.29
698 0.22
699 0.18
700 0.18
701 0.17
702 0.18
703 0.24
704 0.23
705 0.25
706 0.26
707 0.27
708 0.31
709 0.34
710 0.38
711 0.35
712 0.38
713 0.36
714 0.34
715 0.34
716 0.3
717 0.24
718 0.18
719 0.17
720 0.14
721 0.13
722 0.14
723 0.12
724 0.11
725 0.09
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.11
735 0.14
736 0.19
737 0.23
738 0.29
739 0.3
740 0.33
741 0.36
742 0.34
743 0.31
744 0.29
745 0.26
746 0.22
747 0.2
748 0.15
749 0.13
750 0.13
751 0.12
752 0.09
753 0.07
754 0.06
755 0.05
756 0.05