FuNGI

A0A5N5QXZ5

Protein Details

Accession

A0A5N5QXZ5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
173-193	AADVKKQRTWRQYMNRRGGFN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 15, mito 3, E.R. 3, cyto 2, pero 2, vacu 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013957 SNRNP27
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF08648 SNRNP27

Amino Acid Sequences

MAVVMREIGGGETVTTMAAVSAGEVVREAQGAQDAATEIGEMMILEGTIDHEIAMTIGEGPGEMIEIGMPMMTNVAHLAGKMAGPRRTTKMKSPARENLTRMIHPWPSLELSSTPSNAVSSEANAAPPDSKADGEIEEGEDMEEDELQMMAAMGFGGFDSTKGKSVLGNQQGAADVKKQRTWRQYMNRRGGFNRAAFFTPTPFFNRTTIHSRHQAVVRLRSDWRKHWHAFRCSHPDSMGARCLPNSPRPKLHPGHKLFEGSRANHTQLIRAITGHGRHASYLFKCRKVDSPACPCGAPLQDAPHIFVDCPRHAHARWRLRRYSRSIKFSCLFSSVEGLQAVSGFLADGGDVRVIPRPNLSLSLSLSLSRRRALVWVLMVITWVELFVVGVTLVRRIGGRSSSRGGEADSNLVPRTPRSRSGNLTFAQNASTDMEHDDPLENLDKSYEMTYQSQTAPLLSSSASANFGDDVHLRAQRLMDAEPRNRPPAIRRALYRAINHLPLILGVVVSAVLCLLIFVSINWPDALQAMLQTSEPDALGDSSTPSDVSPGGNAPVTNNTAETEMGHNHTGHVLAIDYSAYTSFPLTPKQYLHECQKQQSNHFHGGYWDKPPGKILCYPYRSVELMFSSIEGGVADVPHAETKGNICSSTITFMFDGNRGLMADLALIAQLAGLAREQGKTFLIDDRLWTRGNWTTHFRDIRETQPGPEPGCLPPSPEELVACPRLAKHWVGSWPSYRSYIQPLLITVLQIVTPLTAKFHFGHAFSEAFEDPDKNAGLVRQARSELRRRIQEKTNSTSVAKYMGAHIRRGDRTAMSWEFIKPGSSGYVPIQNYVDAVRKTWDELGPPGPAHVYVASDDPVSLDEFTKLSSDHVYSLRHWGVDGGRVDRALVTDAAEELAELASPSAYVQSEWLNRTEEQRIQLTRGVVVEMALVSELWDDDTNEGDDLELVATACTLTSNVCKMAALGLGWSRSLGSDVKSWVELDNRNNIEPEWEAFEMI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.06
3	0.06
4	0.05
5	0.05
6	0.04
7	0.04
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.09
13	0.09
14	0.1
15	0.09
16	0.07
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.11
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.1
25	0.07
26	0.07
27	0.07
28	0.05
29	0.05
30	0.04
31	0.04
32	0.04
33	0.04
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.05
43	0.05
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.05
50	0.05
51	0.04
52	0.04
53	0.04
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.03
58	0.04
59	0.04
60	0.05
61	0.05
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.09
67	0.1
68	0.15
69	0.21
70	0.24
71	0.27
72	0.32
73	0.37
74	0.46
75	0.49
76	0.54
77	0.58
78	0.64
79	0.69
80	0.74
81	0.76
82	0.75
83	0.78
84	0.71
85	0.69
86	0.66
87	0.59
88	0.51
89	0.48
90	0.43
91	0.37
92	0.36
93	0.3
94	0.27
95	0.26
96	0.26
97	0.21
98	0.22
99	0.24
100	0.24
101	0.21
102	0.19
103	0.18
104	0.16
105	0.17
106	0.13
107	0.12
108	0.15
109	0.15
110	0.15
111	0.15
112	0.16
113	0.14
114	0.14
115	0.16
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.16
123	0.14
124	0.12
125	0.12
126	0.11
127	0.1
128	0.09
129	0.08
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.03
140	0.03
141	0.03
142	0.03
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.07
147	0.09
148	0.12
149	0.12
150	0.13
151	0.14
152	0.2
153	0.29
154	0.34
155	0.35
156	0.32
157	0.33
158	0.34
159	0.34
160	0.29
161	0.25
162	0.25
163	0.26
164	0.31
165	0.36
166	0.43
167	0.51
168	0.57
169	0.62
170	0.67
171	0.74
172	0.8
173	0.84
174	0.81
175	0.77
176	0.71
177	0.68
178	0.63
179	0.57
180	0.49
181	0.41
182	0.37
183	0.35
184	0.33
185	0.3
186	0.25
187	0.24
188	0.26
189	0.25
190	0.26
191	0.26
192	0.27
193	0.29
194	0.35
195	0.38
196	0.39
197	0.44
198	0.44
199	0.47
200	0.48
201	0.51
202	0.49
203	0.52
204	0.48
205	0.45
206	0.48
207	0.52
208	0.53
209	0.53
210	0.55
211	0.55
212	0.59
213	0.65
214	0.69
215	0.69
216	0.69
217	0.7
218	0.71
219	0.65
220	0.62
221	0.53
222	0.49
223	0.43
224	0.41
225	0.38
226	0.3
227	0.28
228	0.26
229	0.3
230	0.28
231	0.34
232	0.39
233	0.39
234	0.44
235	0.49
236	0.57
237	0.6
238	0.65
239	0.66
240	0.64
241	0.64
242	0.6
243	0.6
244	0.52
245	0.53
246	0.5
247	0.42
248	0.42
249	0.4
250	0.39
251	0.38
252	0.37
253	0.32
254	0.29
255	0.3
256	0.24
257	0.21
258	0.21
259	0.21
260	0.22
261	0.22
262	0.21
263	0.18
264	0.18
265	0.19
266	0.22
267	0.22
268	0.3
269	0.33
270	0.36
271	0.37
272	0.39
273	0.44
274	0.48
275	0.52
276	0.51
277	0.54
278	0.53
279	0.53
280	0.51
281	0.45
282	0.4
283	0.34
284	0.28
285	0.2
286	0.2
287	0.22
288	0.23
289	0.24
290	0.22
291	0.21
292	0.18
293	0.2
294	0.22
295	0.2
296	0.23
297	0.23
298	0.26
299	0.26
300	0.36
301	0.42
302	0.47
303	0.55
304	0.6
305	0.66
306	0.69
307	0.75
308	0.75
309	0.76
310	0.74
311	0.74
312	0.68
313	0.67
314	0.62
315	0.56
316	0.49
317	0.4
318	0.33
319	0.24
320	0.24
321	0.17
322	0.17
323	0.15
324	0.13
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.05
329	0.05
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.16
346	0.16
347	0.14
348	0.15
349	0.17
350	0.16
351	0.16
352	0.17
353	0.19
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.15
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.1
367	0.09
368	0.06
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.02
374	0.02
375	0.02
376	0.03
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.08
384	0.12
385	0.14
386	0.17
387	0.2
388	0.2
389	0.21
390	0.21
391	0.2
392	0.18
393	0.16
394	0.15
395	0.14
396	0.14
397	0.13
398	0.13
399	0.12
400	0.12
401	0.16
402	0.16
403	0.23
404	0.28
405	0.33
406	0.38
407	0.42
408	0.46
409	0.42
410	0.42
411	0.35
412	0.29
413	0.25
414	0.2
415	0.16
416	0.12
417	0.11
418	0.08
419	0.09
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.09
426	0.11
427	0.1
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.11
436	0.12
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.12
442	0.1
443	0.09
444	0.08
445	0.06
446	0.07
447	0.06
448	0.07
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.16
466	0.2
467	0.23
468	0.28
469	0.3
470	0.31
471	0.3
472	0.3
473	0.28
474	0.32
475	0.35
476	0.32
477	0.31
478	0.35
479	0.41
480	0.45
481	0.41
482	0.38
483	0.34
484	0.32
485	0.31
486	0.24
487	0.18
488	0.14
489	0.13
490	0.07
491	0.05
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.02
498	0.02
499	0.02
500	0.02
501	0.02
502	0.02
503	0.02
504	0.02
505	0.04
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.11
552	0.12
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.09
558	0.08
559	0.06
560	0.04
561	0.05
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.05
569	0.06
570	0.07
571	0.11
572	0.13
573	0.15
574	0.16
575	0.19
576	0.23
577	0.27
578	0.34
579	0.39
580	0.4
581	0.42
582	0.48
583	0.48
584	0.49
585	0.53
586	0.51
587	0.48
588	0.46
589	0.42
590	0.37
591	0.39
592	0.35
593	0.29
594	0.29
595	0.24
596	0.23
597	0.27
598	0.25
599	0.24
600	0.27
601	0.3
602	0.33
603	0.36
604	0.37
605	0.35
606	0.37
607	0.35
608	0.3
609	0.26
610	0.18
611	0.16
612	0.14
613	0.13
614	0.1
615	0.09
616	0.09
617	0.06
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.07
629	0.11
630	0.12
631	0.11
632	0.11
633	0.13
634	0.13
635	0.16
636	0.15
637	0.12
638	0.12
639	0.13
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.1
644	0.1
645	0.08
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.03
654	0.03
655	0.02
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.04
661	0.05
662	0.06
663	0.07
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.11
668	0.13
669	0.15
670	0.15
671	0.17
672	0.18
673	0.2
674	0.2
675	0.19
676	0.19
677	0.22
678	0.25
679	0.26
680	0.3
681	0.32
682	0.39
683	0.42
684	0.4
685	0.4
686	0.41
687	0.42
688	0.44
689	0.4
690	0.35
691	0.38
692	0.41
693	0.36
694	0.34
695	0.31
696	0.24
697	0.27
698	0.25
699	0.21
700	0.2
701	0.22
702	0.22
703	0.2
704	0.2
705	0.17
706	0.22
707	0.21
708	0.19
709	0.16
710	0.14
711	0.16
712	0.19
713	0.18
714	0.16
715	0.19
716	0.24
717	0.27
718	0.3
719	0.33
720	0.33
721	0.34
722	0.35
723	0.31
724	0.27
725	0.31
726	0.31
727	0.28
728	0.26
729	0.24
730	0.24
731	0.23
732	0.21
733	0.15
734	0.11
735	0.09
736	0.08
737	0.08
738	0.05
739	0.06
740	0.06
741	0.08
742	0.08
743	0.11
744	0.12
745	0.17
746	0.18
747	0.18
748	0.2
749	0.2
750	0.2
751	0.17
752	0.2
753	0.16
754	0.15
755	0.15
756	0.14
757	0.12
758	0.14
759	0.14
760	0.11
761	0.11
762	0.11
763	0.17
764	0.22
765	0.24
766	0.24
767	0.26
768	0.31
769	0.37
770	0.45
771	0.47
772	0.49
773	0.56
774	0.57
775	0.61
776	0.65
777	0.69
778	0.67
779	0.64
780	0.62
781	0.56
782	0.54
783	0.49
784	0.4
785	0.34
786	0.27
787	0.21
788	0.21
789	0.26
790	0.26
791	0.28
792	0.31
793	0.35
794	0.37
795	0.38
796	0.36
797	0.29
798	0.3
799	0.34
800	0.32
801	0.26
802	0.26
803	0.24
804	0.24
805	0.23
806	0.21
807	0.14
808	0.14
809	0.15
810	0.14
811	0.15
812	0.16
813	0.23
814	0.22
815	0.24
816	0.23
817	0.2
818	0.2
819	0.2
820	0.24
821	0.17
822	0.18
823	0.19
824	0.19
825	0.21
826	0.25
827	0.24
828	0.2
829	0.24
830	0.26
831	0.26
832	0.25
833	0.23
834	0.2
835	0.18
836	0.17
837	0.14
838	0.12
839	0.1
840	0.12
841	0.12
842	0.11
843	0.11
844	0.1
845	0.1
846	0.11
847	0.1
848	0.1
849	0.1
850	0.1
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.11
855	0.13
856	0.14
857	0.16
858	0.2
859	0.22
860	0.22
861	0.3
862	0.3
863	0.27
864	0.26
865	0.26
866	0.24
867	0.28
868	0.29
869	0.24
870	0.23
871	0.23
872	0.23
873	0.21
874	0.2
875	0.16
876	0.13
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.11
881	0.1
882	0.09
883	0.07
884	0.06
885	0.05
886	0.05
887	0.05
888	0.04
889	0.04
890	0.05
891	0.06
892	0.07
893	0.07
894	0.09
895	0.15
896	0.2
897	0.22
898	0.24
899	0.26
900	0.27
901	0.31
902	0.36
903	0.34
904	0.34
905	0.39
906	0.39
907	0.39
908	0.42
909	0.38
910	0.34
911	0.3
912	0.26
913	0.19
914	0.17
915	0.14
916	0.1
917	0.09
918	0.07
919	0.06
920	0.06
921	0.06
922	0.06
923	0.07
924	0.08
925	0.09
926	0.09
927	0.12
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.1
932	0.09
933	0.09
934	0.08
935	0.07
936	0.06
937	0.05
938	0.06
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.07
944	0.1
945	0.14
946	0.15
947	0.15
948	0.16
949	0.15
950	0.17
951	0.17
952	0.13
953	0.13
954	0.15
955	0.15
956	0.15
957	0.15
958	0.14
959	0.12
960	0.15
961	0.14
962	0.14
963	0.17
964	0.19
965	0.22
966	0.23
967	0.23
968	0.24
969	0.28
970	0.31
971	0.32
972	0.39
973	0.4
974	0.41
975	0.41
976	0.38
977	0.35
978	0.31
979	0.29
980	0.25

A0A5N5QXZ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer