Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QHQ6

Protein Details
Accession A0A5N5QHQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47CRHGDRCSRKHIRPPFSQTILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-192K
198-217GGWEPPSSRRSASPPRRRDG
Subcellular Location(s) nucl 12, pero 6, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007192  APC8  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005680  C:anaphase-promoting complex  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0030071  P:regulation of mitotic metaphase/anaphase transition  
Pfam View protein in Pfam  
PF04049  ANAPC8  
PF13414  TPR_11  
PF13181  TPR_8  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MASHLANIFGTEQDRVNCSFYYKIGACRHGDRCSRKHIRPPFSQTILLPNVYHNPAHNPNESYTEDQLQQNFDTTYEDLYCELAKYGHLLELHVCDNVGDHLIGNVYARYEWETEAQAAVDALNNRWYAGRPLYAELSPVTDFREACCRQNENGECNRGGFCNFMHLRLASKKLVSELKAGQRLERRLNPPKSLGGAGGWEPPSSRRSASPPRRRDGRDDDRQKAPVRELRQAIKDCTDRGLLAAAKWAGELLVAIPAEERRRGSSFMHSTPAKGSHASRPSISFSDAEGEGAGSLADAEADEEEADLLEVAKTYYAMKELDRASHLLRNCKGPKARFLSIYCRYLASDRQAQDAWESKAGTREQENVAVNAELVGLLALLKNDTEPFLLFLKGVILARMNRRPEATEALIKSAKAYPWNWSCWKQLGRVVQDNDEFAGIRPHIGDHPAAILFSVTIMIDLHAHAEGALDLLQRVQRIFPQSLYLQALRAQIFYHLRDFDEAEQIFEHVLAEDPYRVDEIDVYSNILYVMKKRARLSDIAHQFVKVAKDRPEVCCLVGNYHSLRTQHEQAIRYFQRAVLLDRTYLAAWTLMGHEFVELKNSQAAIEAYRRAIDVNRKDYRAWYGLGQTYEMIDMPQYALHYFQRATALRPYDIRMWQALASCYQTLQKYKDAIQCYRRALFGVDQLSREAAALIHKLATLYAQINDHEQAAACHTRVVEIAIHSHSDVPVVEYAKSAMHVALWEISKGAAGDLTKARALLSRVAGSAAEESGDAAAKLRGLDAAAGGEMLQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.22
8 0.28
9 0.27
10 0.34
11 0.38
12 0.43
13 0.45
14 0.51
15 0.56
16 0.56
17 0.63
18 0.64
19 0.63
20 0.68
21 0.74
22 0.74
23 0.78
24 0.8
25 0.79
26 0.8
27 0.84
28 0.82
29 0.77
30 0.73
31 0.63
32 0.61
33 0.56
34 0.48
35 0.39
36 0.32
37 0.33
38 0.32
39 0.32
40 0.26
41 0.3
42 0.36
43 0.41
44 0.43
45 0.4
46 0.4
47 0.44
48 0.46
49 0.43
50 0.38
51 0.36
52 0.35
53 0.36
54 0.36
55 0.33
56 0.3
57 0.28
58 0.25
59 0.21
60 0.21
61 0.18
62 0.19
63 0.16
64 0.16
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.12
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.18
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.19
116 0.21
117 0.23
118 0.21
119 0.24
120 0.27
121 0.26
122 0.26
123 0.21
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.26
132 0.25
133 0.29
134 0.35
135 0.36
136 0.35
137 0.45
138 0.48
139 0.46
140 0.51
141 0.51
142 0.45
143 0.43
144 0.42
145 0.33
146 0.29
147 0.23
148 0.16
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.22
153 0.21
154 0.26
155 0.29
156 0.33
157 0.26
158 0.26
159 0.26
160 0.28
161 0.33
162 0.3
163 0.3
164 0.32
165 0.38
166 0.43
167 0.43
168 0.43
169 0.45
170 0.49
171 0.52
172 0.53
173 0.54
174 0.58
175 0.63
176 0.62
177 0.58
178 0.56
179 0.51
180 0.43
181 0.36
182 0.26
183 0.22
184 0.19
185 0.2
186 0.18
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.16
194 0.24
195 0.35
196 0.46
197 0.54
198 0.6
199 0.66
200 0.74
201 0.74
202 0.74
203 0.74
204 0.73
205 0.73
206 0.74
207 0.72
208 0.68
209 0.7
210 0.66
211 0.58
212 0.54
213 0.5
214 0.45
215 0.47
216 0.47
217 0.47
218 0.5
219 0.5
220 0.46
221 0.45
222 0.43
223 0.37
224 0.34
225 0.3
226 0.22
227 0.2
228 0.21
229 0.15
230 0.13
231 0.16
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.03
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.09
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.19
251 0.21
252 0.28
253 0.32
254 0.32
255 0.37
256 0.34
257 0.32
258 0.33
259 0.33
260 0.26
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.29
265 0.3
266 0.29
267 0.28
268 0.3
269 0.3
270 0.29
271 0.21
272 0.17
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.03
282 0.03
283 0.02
284 0.02
285 0.02
286 0.02
287 0.02
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.21
313 0.23
314 0.24
315 0.25
316 0.32
317 0.33
318 0.38
319 0.42
320 0.4
321 0.46
322 0.46
323 0.47
324 0.44
325 0.45
326 0.47
327 0.46
328 0.46
329 0.38
330 0.32
331 0.3
332 0.26
333 0.26
334 0.22
335 0.23
336 0.21
337 0.23
338 0.23
339 0.22
340 0.23
341 0.25
342 0.22
343 0.18
344 0.17
345 0.15
346 0.2
347 0.2
348 0.19
349 0.16
350 0.18
351 0.17
352 0.22
353 0.22
354 0.17
355 0.18
356 0.16
357 0.14
358 0.11
359 0.1
360 0.05
361 0.04
362 0.03
363 0.02
364 0.02
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.05
373 0.04
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.07
384 0.09
385 0.14
386 0.19
387 0.2
388 0.2
389 0.2
390 0.22
391 0.23
392 0.25
393 0.22
394 0.22
395 0.2
396 0.23
397 0.23
398 0.21
399 0.2
400 0.17
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.19
405 0.22
406 0.27
407 0.29
408 0.31
409 0.32
410 0.35
411 0.37
412 0.32
413 0.34
414 0.36
415 0.37
416 0.4
417 0.39
418 0.36
419 0.34
420 0.32
421 0.27
422 0.21
423 0.16
424 0.1
425 0.11
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.06
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.1
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.2
470 0.22
471 0.2
472 0.16
473 0.18
474 0.21
475 0.18
476 0.18
477 0.15
478 0.16
479 0.18
480 0.19
481 0.19
482 0.16
483 0.16
484 0.17
485 0.19
486 0.16
487 0.2
488 0.19
489 0.16
490 0.16
491 0.15
492 0.14
493 0.13
494 0.11
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.09
515 0.09
516 0.18
517 0.2
518 0.25
519 0.27
520 0.31
521 0.33
522 0.37
523 0.39
524 0.4
525 0.43
526 0.43
527 0.41
528 0.36
529 0.34
530 0.33
531 0.32
532 0.26
533 0.25
534 0.25
535 0.32
536 0.35
537 0.38
538 0.41
539 0.38
540 0.35
541 0.35
542 0.31
543 0.27
544 0.25
545 0.25
546 0.21
547 0.23
548 0.24
549 0.21
550 0.24
551 0.26
552 0.29
553 0.32
554 0.36
555 0.36
556 0.35
557 0.44
558 0.41
559 0.38
560 0.34
561 0.29
562 0.28
563 0.27
564 0.29
565 0.24
566 0.24
567 0.22
568 0.22
569 0.23
570 0.18
571 0.16
572 0.13
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.08
583 0.12
584 0.1
585 0.11
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.13
590 0.14
591 0.13
592 0.16
593 0.17
594 0.16
595 0.16
596 0.16
597 0.15
598 0.19
599 0.26
600 0.31
601 0.38
602 0.43
603 0.45
604 0.45
605 0.47
606 0.49
607 0.42
608 0.35
609 0.28
610 0.28
611 0.3
612 0.3
613 0.28
614 0.22
615 0.19
616 0.18
617 0.16
618 0.11
619 0.07
620 0.07
621 0.06
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.1
626 0.11
627 0.14
628 0.14
629 0.15
630 0.22
631 0.22
632 0.25
633 0.29
634 0.31
635 0.3
636 0.32
637 0.34
638 0.33
639 0.34
640 0.33
641 0.28
642 0.26
643 0.26
644 0.27
645 0.24
646 0.2
647 0.21
648 0.19
649 0.18
650 0.2
651 0.23
652 0.25
653 0.28
654 0.31
655 0.31
656 0.38
657 0.44
658 0.46
659 0.5
660 0.53
661 0.57
662 0.57
663 0.55
664 0.49
665 0.44
666 0.4
667 0.35
668 0.34
669 0.33
670 0.3
671 0.28
672 0.29
673 0.28
674 0.25
675 0.22
676 0.16
677 0.1
678 0.11
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.11
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.14
690 0.15
691 0.18
692 0.18
693 0.18
694 0.16
695 0.14
696 0.13
697 0.16
698 0.19
699 0.16
700 0.17
701 0.16
702 0.16
703 0.17
704 0.18
705 0.15
706 0.14
707 0.17
708 0.17
709 0.18
710 0.18
711 0.19
712 0.17
713 0.15
714 0.14
715 0.13
716 0.15
717 0.16
718 0.15
719 0.15
720 0.16
721 0.15
722 0.16
723 0.14
724 0.1
725 0.09
726 0.1
727 0.1
728 0.14
729 0.14
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.13
734 0.13
735 0.11
736 0.09
737 0.09
738 0.14
739 0.16
740 0.19
741 0.19
742 0.19
743 0.19
744 0.21
745 0.23
746 0.24
747 0.25
748 0.25
749 0.25
750 0.26
751 0.25
752 0.22
753 0.21
754 0.16
755 0.11
756 0.09
757 0.09
758 0.09
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.09
768 0.1
769 0.09
770 0.1
771 0.09
772 0.08