Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QTX4

Protein Details
Accession A0A5N5QTX4    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-203DQPAETGSPKKKHKKQAEKLEAVKPHydrophilic
259-280ELTQVEKSTKKSKKKRKSESETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-222PKKKHKKQAEKLEAVKPESSAKGKAKVKGKSKDKDK
267-276TKKSKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.166, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MPVEENGKNEGVTDLSYKPPRSMKKVTLVDEGSTLVGFEWDHINSNPDIDLWAVRIPAGFSSADLAGLKVKLPTNNTEDITGILKKGSANFSLKTIGGTDSLGEEMQNLHCLVPKRGDAGALYTGEYSFDHLDPVPTPTVPPPPQPSQRPQPMERLKHTFSPIGAAPLSPPSSTAMEIDQPAETGSPKKKHKKQAEKLEAVKPESSAKGKAKVKGKSKDKDKAANDTQATGEIINTDVVEASHTKQPRKKPSGITVEVELTQVEKSTKKSKKKRKSESET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.22
3 0.29
4 0.29
5 0.33
6 0.41
7 0.47
8 0.52
9 0.58
10 0.58
11 0.62
12 0.68
13 0.67
14 0.67
15 0.61
16 0.54
17 0.46
18 0.4
19 0.3
20 0.22
21 0.17
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.12
29 0.12
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.08
47 0.07
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.15
59 0.18
60 0.22
61 0.25
62 0.29
63 0.29
64 0.27
65 0.25
66 0.23
67 0.23
68 0.19
69 0.15
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.18
77 0.18
78 0.2
79 0.21
80 0.21
81 0.18
82 0.17
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.16
127 0.16
128 0.19
129 0.23
130 0.28
131 0.34
132 0.38
133 0.42
134 0.44
135 0.51
136 0.53
137 0.5
138 0.54
139 0.57
140 0.58
141 0.57
142 0.56
143 0.49
144 0.48
145 0.48
146 0.39
147 0.3
148 0.28
149 0.23
150 0.19
151 0.17
152 0.13
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.12
172 0.18
173 0.25
174 0.34
175 0.45
176 0.53
177 0.63
178 0.74
179 0.8
180 0.84
181 0.87
182 0.89
183 0.86
184 0.84
185 0.8
186 0.73
187 0.64
188 0.54
189 0.44
190 0.36
191 0.32
192 0.28
193 0.28
194 0.28
195 0.34
196 0.38
197 0.44
198 0.49
199 0.54
200 0.61
201 0.65
202 0.71
203 0.71
204 0.76
205 0.79
206 0.78
207 0.79
208 0.74
209 0.73
210 0.69
211 0.68
212 0.59
213 0.51
214 0.44
215 0.36
216 0.33
217 0.23
218 0.17
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.17
230 0.21
231 0.29
232 0.35
233 0.45
234 0.55
235 0.61
236 0.66
237 0.69
238 0.74
239 0.77
240 0.76
241 0.69
242 0.61
243 0.56
244 0.49
245 0.4
246 0.3
247 0.21
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.19
253 0.29
254 0.39
255 0.49
256 0.6
257 0.69
258 0.78
259 0.87
260 0.92