FuNGI

A0A5N5QN88

Protein Details

Accession

A0A5N5QN88

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSAPTLNKSRKEKRRRLKEQVSIPLGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-17	KSRKEKRRRL

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024977 Apc4-like_WD40_dom IPR045161 Utp18 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12894 ANAPC4_WD40

Amino Acid Sequences

MSAPTLNKSRKEKRRRLKEQVSIPLGDNQATHEYQYKGEEELRLESVLFGTSRAGGSSDTAGSKGKKPVNTSMSHLLDDELFFNDSTPITGVFQAEQQAEEESRAAQSPVILPSPEVLSRKKAAWVDPDDSQLDVSIASDRRLRKLRNSTVEDVISGREYESRLRRQFEKINPIPEWAVSRSKRTRGSSQSSASGLDIDQDSVEEPTTGPIGISSTPLDALPPTELAITRLRDANQAARTDGAVTAIQFHPSARVPVLMVAGVDKRVRLFNVDGLTNPLLQTLHTPALPPNSATFHPSGTSILLSGPRPFVCVYDLQSAHVATHHVSGRAQPGAKIDTQDRACDVNAFSPDGRTLAIAARQGRVRLLDWATVSVVGEIKASAPVKCVWWGQNDVVSEMFTLDANAEICAWDARMRRCLRKWQDSGGFGTTIATEGASKYTAVGSKSGIVNVYDTPSTLLNSAPVPLKALPHLTTTVTSLRFNHDAQILASASKTKKDQFKLIHTKTLTTFANWPTSGTPLGHVTAMDFSVGSEYLAVGNTRGNVLLYNLRHYAVVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.93
3	0.94
4	0.94
5	0.93
6	0.92
7	0.91
8	0.85
9	0.76
10	0.67
11	0.62
12	0.52
13	0.43
14	0.33
15	0.27
16	0.27
17	0.25
18	0.24
19	0.24
20	0.24
21	0.25
22	0.28
23	0.26
24	0.24
25	0.27
26	0.28
27	0.25
28	0.27
29	0.27
30	0.24
31	0.22
32	0.2
33	0.17
34	0.16
35	0.13
36	0.1
37	0.09
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.09
43	0.11
44	0.13
45	0.14
46	0.13
47	0.14
48	0.18
49	0.2
50	0.25
51	0.32
52	0.35
53	0.38
54	0.42
55	0.51
56	0.54
57	0.54
58	0.54
59	0.55
60	0.52
61	0.49
62	0.44
63	0.35
64	0.29
65	0.26
66	0.21
67	0.14
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.12
72	0.11
73	0.11
74	0.1
75	0.1
76	0.1
77	0.11
78	0.12
79	0.11
80	0.13
81	0.15
82	0.15
83	0.14
84	0.14
85	0.15
86	0.14
87	0.15
88	0.13
89	0.11
90	0.11
91	0.12
92	0.11
93	0.09
94	0.1
95	0.12
96	0.14
97	0.15
98	0.14
99	0.13
100	0.14
101	0.17
102	0.19
103	0.19
104	0.19
105	0.22
106	0.25
107	0.26
108	0.3
109	0.31
110	0.31
111	0.36
112	0.4
113	0.38
114	0.38
115	0.4
116	0.35
117	0.32
118	0.28
119	0.2
120	0.14
121	0.11
122	0.09
123	0.11
124	0.11
125	0.12
126	0.17
127	0.18
128	0.26
129	0.33
130	0.36
131	0.41
132	0.51
133	0.59
134	0.63
135	0.69
136	0.66
137	0.63
138	0.6
139	0.51
140	0.41
141	0.32
142	0.24
143	0.17
144	0.13
145	0.1
146	0.11
147	0.17
148	0.24
149	0.32
150	0.36
151	0.4
152	0.43
153	0.48
154	0.55
155	0.57
156	0.6
157	0.56
158	0.57
159	0.54
160	0.53
161	0.47
162	0.39
163	0.34
164	0.27
165	0.3
166	0.25
167	0.33
168	0.37
169	0.43
170	0.49
171	0.5
172	0.56
173	0.56
174	0.62
175	0.6
176	0.57
177	0.54
178	0.48
179	0.43
180	0.35
181	0.27
182	0.19
183	0.14
184	0.11
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.07
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.09
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.15
218	0.16
219	0.17
220	0.19
221	0.22
222	0.22
223	0.22
224	0.21
225	0.19
226	0.19
227	0.17
228	0.16
229	0.11
230	0.08
231	0.07
232	0.1
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.12
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.1
256	0.11
257	0.12
258	0.14
259	0.14
260	0.13
261	0.16
262	0.16
263	0.14
264	0.13
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.1
274	0.13
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.13
279	0.13
280	0.15
281	0.14
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.09
288	0.07
289	0.07
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.1
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.14
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.17
307	0.16
308	0.13
309	0.08
310	0.11
311	0.12
312	0.11
313	0.12
314	0.13
315	0.16
316	0.18
317	0.17
318	0.14
319	0.16
320	0.17
321	0.18
322	0.18
323	0.16
324	0.2
325	0.21
326	0.21
327	0.2
328	0.19
329	0.19
330	0.18
331	0.18
332	0.14
333	0.15
334	0.16
335	0.14
336	0.13
337	0.14
338	0.12
339	0.12
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.1
344	0.13
345	0.14
346	0.16
347	0.17
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.16
352	0.18
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.15
360	0.1
361	0.09
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.12
370	0.12
371	0.14
372	0.16
373	0.19
374	0.17
375	0.2
376	0.24
377	0.23
378	0.26
379	0.25
380	0.23
381	0.21
382	0.18
383	0.14
384	0.11
385	0.1
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.1
398	0.15
399	0.18
400	0.27
401	0.32
402	0.4
403	0.45
404	0.55
405	0.6
406	0.66
407	0.67
408	0.67
409	0.69
410	0.63
411	0.62
412	0.53
413	0.44
414	0.34
415	0.3
416	0.21
417	0.14
418	0.12
419	0.08
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.09
427	0.12
428	0.13
429	0.13
430	0.13
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.17
435	0.15
436	0.15
437	0.15
438	0.17
439	0.13
440	0.12
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.12
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.15
452	0.16
453	0.17
454	0.18
455	0.22
456	0.21
457	0.21
458	0.23
459	0.21
460	0.21
461	0.23
462	0.26
463	0.24
464	0.24
465	0.23
466	0.27
467	0.29
468	0.29
469	0.3
470	0.27
471	0.26
472	0.24
473	0.26
474	0.21
475	0.18
476	0.18
477	0.2
478	0.19
479	0.22
480	0.26
481	0.29
482	0.37
483	0.42
484	0.51
485	0.53
486	0.63
487	0.7
488	0.7
489	0.72
490	0.65
491	0.63
492	0.56
493	0.55
494	0.45
495	0.37
496	0.38
497	0.33
498	0.39
499	0.35
500	0.34
501	0.29
502	0.31
503	0.3
504	0.25
505	0.24
506	0.19
507	0.2
508	0.19
509	0.17
510	0.16
511	0.15
512	0.15
513	0.12
514	0.09
515	0.08
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.07
520	0.07
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.1
526	0.11
527	0.11
528	0.12
529	0.11
530	0.11
531	0.14
532	0.21
533	0.21
534	0.25
535	0.26
536	0.26

A0A5N5QN88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer