Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QPF8

Protein Details
Accession A0A5N5QPF8    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-331AEMRAMPKPKRSKRQADEDMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-324RKAAEMRAMPKPKRSKR
595-614RKRKAEAPVKRADPEPKKAK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
Amino Acid Sequences MSAMEEDAKDEGAMLEQLSSVLTVLQENPYDLAKHLEHIQLASSIPGMEDQAIAAREMMVETWAAPEDVWLPLIEHKIAGAGVLTTESFNEIVNLFESAETDYFSIEILHKHLGFILNATTQGNDALQSFLTRDTVRELLQAIVVKGSGHITKCHLLWNQWIAWEMEHLAGSSSRTPEDIQRVQATLLSRVHVPHSDLDTAMQEYSTFVSTYLPDANYEELLVAANKAKMDPQKKYGWRERWEMSLQQAGDTPAMYAQYIDYEWRRPDPKFLIPLYERAIAATASHRMEPGGEETLQTFWAGLHKAVRKAAEMRAMPKPKRSKRQADEDMDDEELEDGDIQARVDLVLKRAIRSIPFSSTIWAAQILSAGGSGGNIVETVALVDSLTDRALELLRLKGADSEAYVEVGLASADALRLNLQTEDGAASKEGDRLLQLEQYLYAAYTKLVKGADFGEMAVELWKATEEHYKGSYLACILRATDLVQRDEIAQARDVYKRGASRPLDWPEQVWDSWVLFEHIYGSHTTVEAAKEVIEKQRVIVMKKRQKEAIKAAEAYAAANPVTDTKDAPENAQEESPIREADQNAMDVDEGSPDSRKRKAEAPVKRADPEPKKAKADTTALKRSLGLLAFNVLIDNLCRDRENSTVFVTDMPVGTGQDEIRNLFRDCGEIREIKIMHVDDQPIVTVEFIDRESVPAALTKDKKRINDVEISVHLAWKSTLYITNFLESTDDAEIRKLFSPFGKILDVRWPSKKFKTTRRFCYLQYTSPAAAQAALSLYGKELAPGQPMSVYISNPERKKERTDAGADQREIYIAGLSKLSTRADLEQLFGQFGAIREIRLATDGEGNAKGYAFVEFEQESSASQALSMNNHELKKRRMAVTIADSRVHAKHRNEEHAGLSRKAEIRSRSLRVRKVPPEATDGLLQQAFEKLAPVVSVQVLEGKGEAVVELKHASDVGRLLLLTEPIEFNGAALEIAEESAAKPSSKPGGNAPFVPRTAVSRPRAGLGSKKAGIGAVASASGAQSAPAPQPTTSSTPATGKSQADFRSMLLSGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.2
20 0.18
21 0.2
22 0.23
23 0.26
24 0.25
25 0.24
26 0.25
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.09
58 0.1
59 0.13
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.12
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.12
109 0.13
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.2
126 0.17
127 0.2
128 0.21
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.16
138 0.19
139 0.23
140 0.23
141 0.29
142 0.29
143 0.28
144 0.34
145 0.37
146 0.34
147 0.32
148 0.33
149 0.27
150 0.24
151 0.23
152 0.17
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.21
165 0.29
166 0.3
167 0.32
168 0.33
169 0.33
170 0.32
171 0.34
172 0.3
173 0.26
174 0.24
175 0.21
176 0.19
177 0.2
178 0.22
179 0.22
180 0.22
181 0.21
182 0.23
183 0.23
184 0.22
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.18
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.14
216 0.22
217 0.28
218 0.32
219 0.36
220 0.45
221 0.52
222 0.61
223 0.66
224 0.68
225 0.67
226 0.69
227 0.65
228 0.62
229 0.59
230 0.52
231 0.45
232 0.41
233 0.36
234 0.29
235 0.28
236 0.23
237 0.2
238 0.17
239 0.14
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.1
248 0.12
249 0.16
250 0.18
251 0.23
252 0.27
253 0.27
254 0.34
255 0.36
256 0.41
257 0.43
258 0.42
259 0.44
260 0.41
261 0.44
262 0.41
263 0.38
264 0.31
265 0.25
266 0.25
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.15
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.09
286 0.06
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.16
291 0.19
292 0.22
293 0.25
294 0.26
295 0.26
296 0.28
297 0.3
298 0.32
299 0.29
300 0.31
301 0.38
302 0.45
303 0.44
304 0.5
305 0.57
306 0.59
307 0.68
308 0.73
309 0.75
310 0.73
311 0.82
312 0.83
313 0.79
314 0.74
315 0.65
316 0.58
317 0.47
318 0.4
319 0.29
320 0.19
321 0.12
322 0.08
323 0.06
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.15
335 0.16
336 0.17
337 0.19
338 0.21
339 0.19
340 0.23
341 0.24
342 0.21
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.22
347 0.21
348 0.16
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.08
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.02
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.03
397 0.03
398 0.02
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.06
451 0.11
452 0.11
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.11
468 0.13
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.14
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.24
486 0.23
487 0.25
488 0.32
489 0.35
490 0.36
491 0.33
492 0.32
493 0.27
494 0.27
495 0.24
496 0.17
497 0.13
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.06
517 0.07
518 0.08
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.15
524 0.17
525 0.19
526 0.25
527 0.32
528 0.37
529 0.42
530 0.45
531 0.47
532 0.48
533 0.52
534 0.53
535 0.51
536 0.46
537 0.42
538 0.4
539 0.35
540 0.31
541 0.26
542 0.18
543 0.1
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.12
553 0.12
554 0.13
555 0.15
556 0.14
557 0.15
558 0.15
559 0.14
560 0.11
561 0.13
562 0.13
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.13
568 0.13
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.08
574 0.08
575 0.06
576 0.05
577 0.05
578 0.07
579 0.09
580 0.12
581 0.16
582 0.18
583 0.19
584 0.25
585 0.34
586 0.42
587 0.49
588 0.54
589 0.56
590 0.58
591 0.57
592 0.54
593 0.54
594 0.51
595 0.5
596 0.5
597 0.48
598 0.49
599 0.48
600 0.47
601 0.43
602 0.43
603 0.41
604 0.41
605 0.43
606 0.4
607 0.4
608 0.38
609 0.34
610 0.31
611 0.24
612 0.17
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.08
625 0.09
626 0.11
627 0.14
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.17
632 0.17
633 0.16
634 0.15
635 0.13
636 0.1
637 0.09
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.11
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.15
652 0.15
653 0.17
654 0.19
655 0.17
656 0.18
657 0.22
658 0.22
659 0.2
660 0.23
661 0.2
662 0.2
663 0.2
664 0.2
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.12
669 0.11
670 0.08
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.11
683 0.16
684 0.22
685 0.25
686 0.33
687 0.37
688 0.39
689 0.43
690 0.46
691 0.44
692 0.46
693 0.44
694 0.4
695 0.37
696 0.39
697 0.32
698 0.29
699 0.24
700 0.17
701 0.15
702 0.11
703 0.11
704 0.08
705 0.12
706 0.13
707 0.17
708 0.17
709 0.19
710 0.18
711 0.17
712 0.17
713 0.13
714 0.13
715 0.11
716 0.11
717 0.1
718 0.11
719 0.12
720 0.13
721 0.15
722 0.13
723 0.13
724 0.14
725 0.18
726 0.18
727 0.2
728 0.21
729 0.19
730 0.2
731 0.28
732 0.31
733 0.3
734 0.37
735 0.39
736 0.42
737 0.49
738 0.56
739 0.55
740 0.62
741 0.69
742 0.71
743 0.76
744 0.78
745 0.74
746 0.67
747 0.7
748 0.64
749 0.58
750 0.54
751 0.48
752 0.4
753 0.38
754 0.36
755 0.26
756 0.21
757 0.15
758 0.11
759 0.07
760 0.08
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.08
765 0.08
766 0.07
767 0.09
768 0.09
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.11
773 0.12
774 0.16
775 0.15
776 0.14
777 0.14
778 0.22
779 0.29
780 0.3
781 0.35
782 0.37
783 0.39
784 0.45
785 0.49
786 0.47
787 0.47
788 0.51
789 0.54
790 0.58
791 0.62
792 0.56
793 0.5
794 0.44
795 0.38
796 0.32
797 0.24
798 0.15
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.1
804 0.12
805 0.12
806 0.11
807 0.13
808 0.14
809 0.19
810 0.19
811 0.2
812 0.2
813 0.2
814 0.2
815 0.18
816 0.15
817 0.12
818 0.12
819 0.15
820 0.12
821 0.12
822 0.12
823 0.13
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.09
828 0.13
829 0.13
830 0.15
831 0.15
832 0.16
833 0.15
834 0.14
835 0.13
836 0.09
837 0.1
838 0.09
839 0.08
840 0.11
841 0.11
842 0.11
843 0.12
844 0.12
845 0.11
846 0.12
847 0.12
848 0.08
849 0.08
850 0.11
851 0.11
852 0.13
853 0.15
854 0.19
855 0.24
856 0.26
857 0.31
858 0.34
859 0.38
860 0.44
861 0.49
862 0.46
863 0.46
864 0.46
865 0.48
866 0.51
867 0.55
868 0.48
869 0.42
870 0.4
871 0.39
872 0.4
873 0.38
874 0.37
875 0.33
876 0.4
877 0.47
878 0.54
879 0.55
880 0.54
881 0.54
882 0.55
883 0.55
884 0.48
885 0.41
886 0.39
887 0.38
888 0.39
889 0.4
890 0.35
891 0.39
892 0.45
893 0.5
894 0.55
895 0.6
896 0.65
897 0.68
898 0.74
899 0.73
900 0.74
901 0.74
902 0.66
903 0.65
904 0.59
905 0.53
906 0.45
907 0.38
908 0.32
909 0.27
910 0.23
911 0.17
912 0.17
913 0.15
914 0.12
915 0.13
916 0.09
917 0.09
918 0.1
919 0.09
920 0.09
921 0.09
922 0.1
923 0.09
924 0.12
925 0.12
926 0.12
927 0.11
928 0.1
929 0.09
930 0.09
931 0.09
932 0.06
933 0.06
934 0.08
935 0.09
936 0.09
937 0.09
938 0.1
939 0.1
940 0.11
941 0.12
942 0.11
943 0.11
944 0.1
945 0.11
946 0.12
947 0.13
948 0.11
949 0.12
950 0.11
951 0.11
952 0.13
953 0.11
954 0.1
955 0.09
956 0.09
957 0.07
958 0.06
959 0.07
960 0.05
961 0.05
962 0.05
963 0.05
964 0.05
965 0.09
966 0.11
967 0.11
968 0.11
969 0.16
970 0.24
971 0.27
972 0.28
973 0.34
974 0.41
975 0.45
976 0.49
977 0.51
978 0.49
979 0.46
980 0.47
981 0.39
982 0.35
983 0.39
984 0.43
985 0.42
986 0.43
987 0.43
988 0.44
989 0.47
990 0.44
991 0.45
992 0.44
993 0.48
994 0.44
995 0.43
996 0.4
997 0.37
998 0.34
999 0.26
1000 0.19
1001 0.11
1002 0.09
1003 0.08
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.07
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.09
1011 0.13
1012 0.16
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.22
1016 0.26
1017 0.31
1018 0.32
1019 0.32
1020 0.32
1021 0.34
1022 0.37
1023 0.38
1024 0.4
1025 0.36
1026 0.35
1027 0.39
1028 0.38
1029 0.38
1030 0.36
1031 0.32
1032 0.31
1033 0.29