FuNGI

A0A5N5QY39

Protein Details

Accession

A0A5N5QY39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	ATPLNRKRKPSPPSLSNPPSP	Hydrophilic
34-65	GNHPKNGGSKAEKRKNKKLKKIEAKTQGEKAP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-59	HPKNGGSKAEKRKNKKLKKIEAKT

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001514 DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS IPR011262 DNA-dir_RNA_pol_insert IPR011263 DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3 IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR036603 RBP11-like IPR034922 REX1-like_exo IPR022842 RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1 IPR033901 RNAPI/III_AC40 IPR036643 RNApol_insert_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0055029 C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0001054 F:RNA polymerase I activity GO:0001056 F:RNA polymerase III activity
Pfam	View protein in Pfam PF01000 RNA_pol_A_bac PF01193 RNA_pol_L
PROSITE	View protein in PROSITE PS00446 RNA_POL_D_30KD
CDD	cd06145 REX1_like cd07032 RNAP_I_II_AC40

Amino Acid Sequences

MATPLNRKRKPSPPSLSNPPSPSPPSSPVDTRTGNHPKNGGSKAEKRKNKKLKKIEAKTQGEKAPSLSFAGTELRKRKLPISVEEVRDVFLYLFADGAPTKFLVIENHRSILRAVLLLVPGINPEAIGTSEPQISSAYPVAIGARETSKIPVINSCYSHACPTRATGEPTKMHSVLTTLLQSPISGEQKRKRLLERQQQRFSNDNPSIYVLDVPAMLDNGYPIPSYLGEGLSVDPESIRSTSSWPAAAPTSQTRENGWVETPQNPSASKGKALRMIAIDCEMCETEDGKVLARVCVVDFDSDKVVYDQLVQPEKPVIDYLTQFSGITAEQLAPVTLKLADAQVGLLNLVDANTIIVGHSLENDLRALKLAHPRCIDTSIIYKHPRGAPYKPGLKWLAQKWLNLDIQVKQGGHDPEEDSRACIALLRKKLNEGPDFGVFKQDIESIFERLSKSNGRHGKGATSAVIDHGNPRAWHGAKATSAMACQTDDEVAAKVIEAAQNHDFVFGRLLELSQALGWTTQRTQPNGTEATSVTVTPIEPDPAAVDAAYAALNTRITTIHKGLPPGTVLCIMSGNGDPRLMSSLNVKKSRWDGMMRERKRPEDIPQSEWWTMEEGRLLEDATERAKRGLAFFCLIRLEISSCQSREVHLTHSNWQSKVCFLTFDMADNLDDPRRHVQIHAERVSNVTSTEFPGVYPGEDHSWNFNKFTEKLHVEVRDVSDEAVDFDLVGVDASIANAFRRILIAEVPTIAVENVYIWNNTSVIQDEVLAHRLGLVPIRADPALLDPPDKNHPEEVGTTDRNTLVFHLSVACTRNPNAPKGETDPAILYNNANVLSGHMQWNAVGEQVSDFGNNPPRPHNPKILIAKLRPGQKELGMELHCVKGIGQDHAKFSPVATASYRLLPHIIFRQPIPSELCDKFVQCFPLGVLAVELDAQGQKQVVVKDMRKDTVSREVLRYKEFDDLVELTRIRDFFIFRVESSGSIPAPNLMPMAVSVMREKIATLKVAAENLYMNRDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.82
3	0.81
4	0.79
5	0.77
6	0.7
7	0.66
8	0.61
9	0.58
10	0.53
11	0.52
12	0.48
13	0.49
14	0.5
15	0.47
16	0.5
17	0.48
18	0.43
19	0.48
20	0.54
21	0.52
22	0.52
23	0.51
24	0.49
25	0.54
26	0.56
27	0.54
28	0.52
29	0.58
30	0.65
31	0.72
32	0.76
33	0.77
34	0.84
35	0.87
36	0.9
37	0.91
38	0.9
39	0.91
40	0.93
41	0.94
42	0.93
43	0.93
44	0.91
45	0.87
46	0.83
47	0.77
48	0.68
49	0.59
50	0.52
51	0.44
52	0.36
53	0.31
54	0.24
55	0.19
56	0.18
57	0.23
58	0.24
59	0.29
60	0.34
61	0.37
62	0.41
63	0.43
64	0.46
65	0.48
66	0.5
67	0.48
68	0.51
69	0.54
70	0.53
71	0.55
72	0.51
73	0.43
74	0.38
75	0.32
76	0.24
77	0.17
78	0.14
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.09
89	0.11
90	0.16
91	0.22
92	0.31
93	0.33
94	0.36
95	0.35
96	0.36
97	0.35
98	0.31
99	0.26
100	0.17
101	0.15
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.1
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.08
115	0.09
116	0.11
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.13
121	0.13
122	0.15
123	0.15
124	0.13
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.15
135	0.17
136	0.18
137	0.19
138	0.23
139	0.27
140	0.3
141	0.31
142	0.33
143	0.33
144	0.33
145	0.38
146	0.36
147	0.33
148	0.29
149	0.3
150	0.32
151	0.31
152	0.36
153	0.35
154	0.39
155	0.41
156	0.45
157	0.47
158	0.43
159	0.39
160	0.33
161	0.29
162	0.23
163	0.22
164	0.19
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.15
169	0.15
170	0.19
171	0.24
172	0.25
173	0.32
174	0.38
175	0.47
176	0.53
177	0.57
178	0.57
179	0.6
180	0.68
181	0.7
182	0.74
183	0.76
184	0.79
185	0.78
186	0.77
187	0.72
188	0.65
189	0.64
190	0.57
191	0.47
192	0.39
193	0.37
194	0.33
195	0.28
196	0.26
197	0.15
198	0.12
199	0.11
200	0.1
201	0.08
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.12
228	0.15
229	0.17
230	0.17
231	0.15
232	0.17
233	0.17
234	0.17
235	0.18
236	0.19
237	0.22
238	0.24
239	0.25
240	0.25
241	0.28
242	0.29
243	0.28
244	0.24
245	0.24
246	0.24
247	0.27
248	0.3
249	0.27
250	0.27
251	0.26
252	0.28
253	0.28
254	0.28
255	0.29
256	0.29
257	0.31
258	0.35
259	0.35
260	0.35
261	0.32
262	0.31
263	0.27
264	0.25
265	0.21
266	0.14
267	0.16
268	0.13
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.13
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.13
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.09
293	0.11
294	0.12
295	0.17
296	0.21
297	0.2
298	0.2
299	0.22
300	0.22
301	0.2
302	0.18
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.15
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.13
311	0.12
312	0.1
313	0.09
314	0.08
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.08
353	0.08
354	0.11
355	0.2
356	0.22
357	0.28
358	0.29
359	0.3
360	0.31
361	0.32
362	0.29
363	0.22
364	0.26
365	0.23
366	0.28
367	0.29
368	0.28
369	0.3
370	0.33
371	0.36
372	0.34
373	0.34
374	0.36
375	0.41
376	0.48
377	0.44
378	0.46
379	0.43
380	0.43
381	0.45
382	0.41
383	0.43
384	0.38
385	0.38
386	0.35
387	0.39
388	0.36
389	0.31
390	0.3
391	0.22
392	0.22
393	0.24
394	0.21
395	0.15
396	0.2
397	0.19
398	0.18
399	0.18
400	0.17
401	0.15
402	0.19
403	0.18
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.11
408	0.12
409	0.15
410	0.18
411	0.24
412	0.26
413	0.26
414	0.29
415	0.32
416	0.36
417	0.34
418	0.31
419	0.28
420	0.29
421	0.31
422	0.28
423	0.28
424	0.21
425	0.19
426	0.17
427	0.16
428	0.11
429	0.13
430	0.15
431	0.13
432	0.13
433	0.15
434	0.15
435	0.14
436	0.17
437	0.17
438	0.18
439	0.25
440	0.31
441	0.31
442	0.33
443	0.33
444	0.33
445	0.3
446	0.3
447	0.22
448	0.16
449	0.14
450	0.12
451	0.13
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.16
459	0.16
460	0.17
461	0.17
462	0.18
463	0.16
464	0.18
465	0.17
466	0.12
467	0.12
468	0.11
469	0.1
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.1
491	0.11
492	0.08
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.07
506	0.12
507	0.15
508	0.16
509	0.18
510	0.19
511	0.22
512	0.23
513	0.22
514	0.18
515	0.15
516	0.16
517	0.14
518	0.13
519	0.09
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.03
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.07
543	0.1
544	0.13
545	0.16
546	0.18
547	0.19
548	0.19
549	0.19
550	0.19
551	0.16
552	0.15
553	0.12
554	0.11
555	0.09
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.15
569	0.21
570	0.28
571	0.32
572	0.31
573	0.32
574	0.35
575	0.38
576	0.34
577	0.32
578	0.3
579	0.37
580	0.48
581	0.48
582	0.54
583	0.53
584	0.52
585	0.53
586	0.5
587	0.47
588	0.47
589	0.47
590	0.44
591	0.44
592	0.47
593	0.43
594	0.41
595	0.34
596	0.25
597	0.22
598	0.17
599	0.16
600	0.1
601	0.1
602	0.11
603	0.1
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.1
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.12
612	0.13
613	0.15
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.16
618	0.17
619	0.16
620	0.15
621	0.13
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.13
626	0.16
627	0.15
628	0.17
629	0.17
630	0.17
631	0.19
632	0.19
633	0.21
634	0.24
635	0.25
636	0.3
637	0.38
638	0.41
639	0.38
640	0.39
641	0.34
642	0.3
643	0.3
644	0.24
645	0.17
646	0.13
647	0.16
648	0.15
649	0.15
650	0.15
651	0.13
652	0.13
653	0.12
654	0.13
655	0.12
656	0.12
657	0.13
658	0.16
659	0.18
660	0.18
661	0.18
662	0.26
663	0.31
664	0.41
665	0.42
666	0.39
667	0.38
668	0.39
669	0.39
670	0.3
671	0.22
672	0.14
673	0.11
674	0.11
675	0.13
676	0.11
677	0.1
678	0.12
679	0.12
680	0.11
681	0.11
682	0.1
683	0.11
684	0.12
685	0.13
686	0.17
687	0.23
688	0.24
689	0.24
690	0.24
691	0.26
692	0.26
693	0.29
694	0.31
695	0.28
696	0.29
697	0.33
698	0.33
699	0.31
700	0.32
701	0.3
702	0.25
703	0.23
704	0.21
705	0.15
706	0.13
707	0.13
708	0.1
709	0.08
710	0.06
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.07
727	0.07
728	0.09
729	0.1
730	0.1
731	0.1
732	0.1
733	0.09
734	0.09
735	0.08
736	0.06
737	0.05
738	0.05
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.12
753	0.13
754	0.12
755	0.1
756	0.1
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.09
762	0.1
763	0.13
764	0.12
765	0.11
766	0.11
767	0.12
768	0.16
769	0.16
770	0.17
771	0.15
772	0.19
773	0.27
774	0.29
775	0.27
776	0.24
777	0.25
778	0.25
779	0.26
780	0.27
781	0.26
782	0.26
783	0.25
784	0.25
785	0.24
786	0.22
787	0.21
788	0.18
789	0.15
790	0.13
791	0.12
792	0.13
793	0.13
794	0.16
795	0.18
796	0.18
797	0.18
798	0.19
799	0.27
800	0.28
801	0.32
802	0.34
803	0.34
804	0.36
805	0.39
806	0.42
807	0.35
808	0.33
809	0.3
810	0.28
811	0.28
812	0.24
813	0.19
814	0.15
815	0.16
816	0.14
817	0.13
818	0.1
819	0.11
820	0.13
821	0.14
822	0.16
823	0.15
824	0.15
825	0.14
826	0.16
827	0.14
828	0.12
829	0.11
830	0.08
831	0.08
832	0.09
833	0.1
834	0.08
835	0.09
836	0.13
837	0.22
838	0.24
839	0.26
840	0.3
841	0.39
842	0.47
843	0.51
844	0.56
845	0.51
846	0.58
847	0.64
848	0.68
849	0.67
850	0.61
851	0.64
852	0.6
853	0.63
854	0.56
855	0.51
856	0.45
857	0.41
858	0.42
859	0.36
860	0.37
861	0.31
862	0.31
863	0.3
864	0.28
865	0.25
866	0.21
867	0.19
868	0.17
869	0.18
870	0.22
871	0.26
872	0.28
873	0.32
874	0.33
875	0.34
876	0.29
877	0.27
878	0.27
879	0.21
880	0.21
881	0.19
882	0.22
883	0.23
884	0.27
885	0.28
886	0.22
887	0.23
888	0.21
889	0.23
890	0.26
891	0.29
892	0.26
893	0.26
894	0.33
895	0.32
896	0.36
897	0.36
898	0.32
899	0.34
900	0.33
901	0.37
902	0.31
903	0.32
904	0.31
905	0.3
906	0.3
907	0.24
908	0.24
909	0.2
910	0.23
911	0.22
912	0.19
913	0.16
914	0.12
915	0.12
916	0.11
917	0.1
918	0.06
919	0.07
920	0.07
921	0.07
922	0.07
923	0.09
924	0.12
925	0.14
926	0.19
927	0.27
928	0.31
929	0.39
930	0.45
931	0.47
932	0.45
933	0.46
934	0.45
935	0.47
936	0.5
937	0.45
938	0.47
939	0.5
940	0.51
941	0.53
942	0.51
943	0.42
944	0.42
945	0.38
946	0.31
947	0.29
948	0.28
949	0.27
950	0.3
951	0.28
952	0.23
953	0.26
954	0.25
955	0.22
956	0.22
957	0.22
958	0.18
959	0.25
960	0.27
961	0.23
962	0.28
963	0.27
964	0.25
965	0.25
966	0.28
967	0.21
968	0.19
969	0.19
970	0.17
971	0.17
972	0.17
973	0.15
974	0.11
975	0.1
976	0.1
977	0.14
978	0.13
979	0.14
980	0.15
981	0.16
982	0.17
983	0.17
984	0.17
985	0.18
986	0.2
987	0.2
988	0.2
989	0.23
990	0.25
991	0.27
992	0.27
993	0.23
994	0.23
995	0.23

A0A5N5QY39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer