Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QXD4

Protein Details
Accession A0A5N5QXD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-254KLNHDIDKRNKFSRKRNNEEEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-145KRKARKERR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSSPDAQQPPVETEDPATKAGSETSSDDEQVTTNSTPSETKLGDDADTGAKLTIEERAAKLQALRAKMRESTAANRKDLISEHNKTKFSAKQAARLEKQRRLAETLRETVDAEERGEDLERRKNWEYSIEENDEWEKRKARKERRADFQFHDDAHAARRKYKKDLDVIKPDLAAYQAQKEAALNQGSVVQAFSSGSSSNAVTASEHLYRDANTLLYGDNKPTEEAIDRVVSKLNHDIDKRNKFSRKRNNEEEGDITYINERNKVFNKKIARFYDKYTAETRASFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.28
4 0.24
5 0.2
6 0.19
7 0.21
8 0.19
9 0.15
10 0.16
11 0.2
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.17
18 0.19
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.16
25 0.2
26 0.17
27 0.17
28 0.19
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.15
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.2
48 0.21
49 0.23
50 0.26
51 0.28
52 0.28
53 0.3
54 0.31
55 0.32
56 0.31
57 0.31
58 0.35
59 0.41
60 0.43
61 0.41
62 0.41
63 0.39
64 0.36
65 0.33
66 0.31
67 0.31
68 0.31
69 0.37
70 0.42
71 0.43
72 0.42
73 0.46
74 0.43
75 0.41
76 0.46
77 0.4
78 0.42
79 0.49
80 0.57
81 0.56
82 0.62
83 0.63
84 0.59
85 0.66
86 0.6
87 0.55
88 0.52
89 0.51
90 0.49
91 0.47
92 0.44
93 0.37
94 0.34
95 0.33
96 0.27
97 0.27
98 0.2
99 0.15
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.18
107 0.19
108 0.25
109 0.27
110 0.28
111 0.28
112 0.33
113 0.33
114 0.31
115 0.35
116 0.32
117 0.3
118 0.29
119 0.31
120 0.26
121 0.25
122 0.23
123 0.23
124 0.24
125 0.32
126 0.41
127 0.5
128 0.58
129 0.66
130 0.71
131 0.76
132 0.78
133 0.75
134 0.68
135 0.63
136 0.56
137 0.46
138 0.4
139 0.3
140 0.24
141 0.23
142 0.25
143 0.2
144 0.23
145 0.29
146 0.3
147 0.36
148 0.42
149 0.42
150 0.46
151 0.55
152 0.56
153 0.59
154 0.6
155 0.54
156 0.48
157 0.43
158 0.34
159 0.26
160 0.2
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.13
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.11
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.21
217 0.19
218 0.19
219 0.25
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.39
224 0.46
225 0.55
226 0.59
227 0.61
228 0.66
229 0.69
230 0.77
231 0.8
232 0.81
233 0.8
234 0.84
235 0.83
236 0.79
237 0.75
238 0.68
239 0.6
240 0.52
241 0.42
242 0.33
243 0.28
244 0.27
245 0.24
246 0.25
247 0.22
248 0.26
249 0.34
250 0.43
251 0.44
252 0.48
253 0.58
254 0.61
255 0.69
256 0.72
257 0.73
258 0.67
259 0.69
260 0.71
261 0.63
262 0.59
263 0.53
264 0.5
265 0.44
266 0.42
267 0.39
268 0.34
269 0.35
270 0.31