Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QXE9

Protein Details
Accession A0A5N5QXE9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-174SQINGNSKPKPKPKPKAKDAVKPKVPSHydrophilic
459-485IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGAITWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-175PKPNSQINGNSKPKPKPKPKAKDAVKPKVPSK
465-476GFRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 3, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPRLAAVYAAVHAFLVEQDHPKAAAAVKKAALAVVDLDRVPPPPQGSLVELFARRIPVAEQTSSDASCDVAATVASQGNPLAVNGTNPRATLKRKAPASSSSKPSDEDPSNSGSEQSSSSSSSSSSESDSDSSDDGKQKEKPVPKPNSQINGNSKPKPKPKPKAKDAVKPKVPSKVKSSSSSDSSSSSSDSDSSESSSSSDSDSDSSSSSSESDPETKPVKKSKVNTTAPAVSKTKAGPTEESDSDSDSDSDSSESESESESDSDSEPENQPKATSTVPVANTKASAAEPKSDSESSTSSSESEAENQPPAKKPKVDAAPAAPVTTTKAKVVAAAESESESSSSSDSSSSESESENQPAAKRRKVDDTSAVPITTTKAQKKTVAAAVNSKSVSDSADNTDQTSKHTNGKNKGPRKPIVPFSRIKSDNVVFADPRLKDNRFQSKGGASGDYGERASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGAITWSDPPTPHPASSYTPPHPSYTHPHPPLQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.15
5 0.16
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.2
10 0.21
11 0.24
12 0.24
13 0.27
14 0.27
15 0.28
16 0.28
17 0.27
18 0.23
19 0.18
20 0.17
21 0.14
22 0.15
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.19
30 0.18
31 0.21
32 0.22
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.28
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.25
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.21
45 0.24
46 0.24
47 0.24
48 0.26
49 0.29
50 0.28
51 0.27
52 0.2
53 0.16
54 0.14
55 0.13
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.11
71 0.14
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.21
76 0.25
77 0.29
78 0.36
79 0.41
80 0.45
81 0.49
82 0.52
83 0.53
84 0.57
85 0.61
86 0.59
87 0.58
88 0.54
89 0.51
90 0.49
91 0.47
92 0.45
93 0.4
94 0.36
95 0.32
96 0.31
97 0.31
98 0.3
99 0.28
100 0.21
101 0.19
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.21
122 0.21
123 0.24
124 0.27
125 0.31
126 0.38
127 0.45
128 0.51
129 0.56
130 0.63
131 0.66
132 0.71
133 0.73
134 0.73
135 0.68
136 0.67
137 0.66
138 0.67
139 0.66
140 0.64
141 0.64
142 0.65
143 0.7
144 0.73
145 0.75
146 0.75
147 0.8
148 0.84
149 0.86
150 0.88
151 0.87
152 0.86
153 0.86
154 0.86
155 0.82
156 0.77
157 0.71
158 0.7
159 0.67
160 0.6
161 0.57
162 0.55
163 0.52
164 0.52
165 0.55
166 0.49
167 0.49
168 0.47
169 0.41
170 0.34
171 0.31
172 0.27
173 0.22
174 0.18
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.13
202 0.17
203 0.22
204 0.23
205 0.28
206 0.34
207 0.39
208 0.41
209 0.46
210 0.52
211 0.58
212 0.59
213 0.58
214 0.55
215 0.54
216 0.5
217 0.48
218 0.39
219 0.29
220 0.28
221 0.25
222 0.24
223 0.2
224 0.2
225 0.18
226 0.2
227 0.25
228 0.23
229 0.25
230 0.22
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.14
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.15
265 0.17
266 0.2
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.11
273 0.13
274 0.11
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.19
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.11
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.16
294 0.17
295 0.19
296 0.25
297 0.29
298 0.3
299 0.3
300 0.3
301 0.36
302 0.41
303 0.41
304 0.38
305 0.36
306 0.38
307 0.36
308 0.34
309 0.26
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.18
314 0.12
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.18
345 0.26
346 0.32
347 0.34
348 0.36
349 0.38
350 0.46
351 0.48
352 0.5
353 0.49
354 0.48
355 0.49
356 0.46
357 0.43
358 0.33
359 0.3
360 0.27
361 0.26
362 0.27
363 0.28
364 0.32
365 0.35
366 0.39
367 0.41
368 0.44
369 0.44
370 0.42
371 0.38
372 0.4
373 0.39
374 0.39
375 0.37
376 0.32
377 0.26
378 0.21
379 0.21
380 0.15
381 0.15
382 0.16
383 0.21
384 0.21
385 0.23
386 0.26
387 0.24
388 0.26
389 0.3
390 0.27
391 0.31
392 0.37
393 0.44
394 0.48
395 0.58
396 0.65
397 0.68
398 0.74
399 0.75
400 0.73
401 0.72
402 0.72
403 0.71
404 0.7
405 0.67
406 0.64
407 0.62
408 0.67
409 0.62
410 0.56
411 0.54
412 0.46
413 0.45
414 0.42
415 0.39
416 0.3
417 0.3
418 0.35
419 0.29
420 0.32
421 0.33
422 0.33
423 0.35
424 0.44
425 0.53
426 0.51
427 0.51
428 0.51
429 0.48
430 0.51
431 0.47
432 0.39
433 0.28
434 0.27
435 0.27
436 0.25
437 0.21
438 0.17
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.14
443 0.14
444 0.14
445 0.15
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.22
450 0.22
451 0.26
452 0.28
453 0.35
454 0.44
455 0.54
456 0.62
457 0.68
458 0.77
459 0.81
460 0.88
461 0.91
462 0.9
463 0.9
464 0.88
465 0.86
466 0.84
467 0.76
468 0.66
469 0.58
470 0.5
471 0.44
472 0.39
473 0.31
474 0.23
475 0.25
476 0.32
477 0.33
478 0.31
479 0.29
480 0.29
481 0.34
482 0.42
483 0.47
484 0.45
485 0.48
486 0.5
487 0.51
488 0.49
489 0.48
490 0.49
491 0.5
492 0.55
493 0.52