FuNGI

A0A5N5QCT6

Protein Details

Accession

A0A5N5QCT6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1072-1094	TPANWTGRPIKRKERGRMATSPN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 10, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MRGPETVSGPPHNGEPTELLYYRAAGLSPNTYTEFSKIMEPVETLIDSGSSCNFIDISFARKHKLDLIALPKEREVQGINGKILQNKIHFKVQSSVKIEGREFNLKLYTMPLGGSNVILGMEWLRSAKPIIKWNPFEVCWDDNEILQGKAAQLPREIIDFADVFSEEAFKELPPHQLNDCEIQLREGEQLPKPAKVYPMLLAESKACREYISTELRDNKIQQSTSPVAAPAFFVKKSDGSLRLVVDYRKLNNITISDQFPIPRQDDLLEKLQRAKVFSKLDLRWGFNNVRIKEGDEWKTAFCTKEGLFEYKVMPFGLKNAPATFQRFMNKLFADLLDDYVVVYIDDILIYSNNHEDHTKHVREVLRRLREAHLFCKESKCEFWVNSVMYIGIVISPEGISMEKEKVEAIRQWKTPSSLKELQAFLSFWKKWEWTGEMECAFQNMKEMVCTAPVLRHPCEGELYFLETDASGVAMGAILSQRQEDGYLHPVAFLSKSFNKAQMNYDTHDKELCAIITAFEQWQYLLEGTEEPITVYTNHRNLEYWAKATRFNRWHARWYQTLASYNFHIVFRPGKMSSKPDILSRQSNHVDVGQTDQVMIATERFTGFNSEVLVEIMDLIREEQESDESLSSYKDYDWTNNLLHYKGRVVVPQNQHIHNLILRESHDHPLAGHQGQARTLEMISRQYWWPNMTKEVNQYVETCEQCQRSKGAKQHVALKPLEIPGGPWEWITYDMIVKLPKSRGFDSILVVVNRFSKMAHFLPCNESMSAEEVADIFLREVWKLHGTPKITTSDRGSSFTSRFLRALYQRLNIQPHFSSAYHPETDGQSERMNQWLEGYLRTFGNTRQDDWAHWLPLAEFAYNNHVNRSTKKAPFEIVYGRTLEWKDSGRTTEIIHADEWGTRIRAVQDEARACLEMGWRDPGSVSDLNVGDRVMLLRTNIRSDRPSQKLDSKKLGPFTILRKISSHAFKLDLPPSLCIHPVFHVSLLSKWLEEDKFDRPKPKPRIFVSEEGEEEQEVQEILDWWTDEEGQLWYRVRWVGEGEEGDSWEQAEKMADLRGIMRKFLRTFPEAPTPANWTGRPIKRKERGRMATSPNSSYTPPHPQLRYYPHAESNLFHHANHMETDLHSPARPEGTPAGLERWDQGRILAPDMGPHELGRGQPGEMGQGGPLPPGGVHWEIQEGAVEGKHRVGMGDRPTGDKGEREGVASTEGRGVETGGRPIDGGGYDPSKTLAIQPTRIRRTVEGGRELHLDDRGLGQLPPMAGMVGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.24
3	0.25
4	0.28
5	0.27
6	0.26
7	0.24
8	0.25
9	0.23
10	0.21
11	0.17
12	0.13
13	0.15
14	0.16
15	0.17
16	0.19
17	0.21
18	0.22
19	0.23
20	0.24
21	0.24
22	0.21
23	0.24
24	0.22
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.19
29	0.19
30	0.18
31	0.14
32	0.13
33	0.12
34	0.11
35	0.11
36	0.11
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.1
42	0.14
43	0.14
44	0.19
45	0.24
46	0.26
47	0.29
48	0.3
49	0.33
50	0.35
51	0.4
52	0.38
53	0.39
54	0.46
55	0.51
56	0.54
57	0.54
58	0.48
59	0.47
60	0.43
61	0.38
62	0.31
63	0.28
64	0.34
65	0.37
66	0.37
67	0.37
68	0.39
69	0.4
70	0.41
71	0.39
72	0.38
73	0.41
74	0.44
75	0.47
76	0.46
77	0.46
78	0.51
79	0.53
80	0.55
81	0.52
82	0.54
83	0.5
84	0.54
85	0.52
86	0.49
87	0.47
88	0.46
89	0.42
90	0.38
91	0.37
92	0.32
93	0.31
94	0.28
95	0.24
96	0.17
97	0.17
98	0.15
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.11
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.07
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.07
111	0.07
112	0.09
113	0.11
114	0.17
115	0.21
116	0.31
117	0.39
118	0.48
119	0.52
120	0.56
121	0.59
122	0.55
123	0.53
124	0.49
125	0.42
126	0.35
127	0.36
128	0.31
129	0.25
130	0.28
131	0.25
132	0.2
133	0.19
134	0.17
135	0.13
136	0.18
137	0.2
138	0.19
139	0.19
140	0.21
141	0.21
142	0.22
143	0.22
144	0.16
145	0.17
146	0.15
147	0.14
148	0.13
149	0.12
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.07
157	0.12
158	0.14
159	0.22
160	0.24
161	0.27
162	0.28
163	0.32
164	0.34
165	0.34
166	0.34
167	0.28
168	0.26
169	0.24
170	0.23
171	0.2
172	0.21
173	0.2
174	0.23
175	0.22
176	0.3
177	0.31
178	0.33
179	0.33
180	0.33
181	0.32
182	0.3
183	0.31
184	0.26
185	0.29
186	0.28
187	0.28
188	0.26
189	0.26
190	0.26
191	0.26
192	0.22
193	0.18
194	0.16
195	0.17
196	0.19
197	0.23
198	0.28
199	0.29
200	0.34
201	0.41
202	0.43
203	0.46
204	0.46
205	0.45
206	0.42
207	0.4
208	0.35
209	0.36
210	0.37
211	0.34
212	0.32
213	0.26
214	0.21
215	0.2
216	0.21
217	0.17
218	0.18
219	0.16
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.21
224	0.26
225	0.24
226	0.25
227	0.28
228	0.28
229	0.29
230	0.31
231	0.28
232	0.28
233	0.29
234	0.28
235	0.31
236	0.31
237	0.29
238	0.3
239	0.31
240	0.3
241	0.29
242	0.29
243	0.24
244	0.24
245	0.24
246	0.23
247	0.25
248	0.23
249	0.21
250	0.19
251	0.19
252	0.22
253	0.25
254	0.3
255	0.29
256	0.29
257	0.33
258	0.36
259	0.36
260	0.36
261	0.34
262	0.34
263	0.35
264	0.38
265	0.41
266	0.39
267	0.47
268	0.48
269	0.48
270	0.43
271	0.44
272	0.42
273	0.39
274	0.47
275	0.38
276	0.37
277	0.34
278	0.35
279	0.36
280	0.41
281	0.4
282	0.35
283	0.35
284	0.32
285	0.35
286	0.34
287	0.29
288	0.22
289	0.22
290	0.18
291	0.24
292	0.26
293	0.26
294	0.26
295	0.27
296	0.28
297	0.25
298	0.26
299	0.19
300	0.16
301	0.13
302	0.16
303	0.19
304	0.2
305	0.2
306	0.2
307	0.22
308	0.25
309	0.3
310	0.27
311	0.26
312	0.28
313	0.28
314	0.29
315	0.32
316	0.29
317	0.26
318	0.25
319	0.21
320	0.21
321	0.19
322	0.18
323	0.12
324	0.12
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.11
343	0.18
344	0.27
345	0.28
346	0.26
347	0.31
348	0.35
349	0.39
350	0.48
351	0.51
352	0.5
353	0.5
354	0.53
355	0.51
356	0.53
357	0.52
358	0.49
359	0.47
360	0.42
361	0.41
362	0.44
363	0.43
364	0.39
365	0.37
366	0.33
367	0.3
368	0.28
369	0.3
370	0.29
371	0.28
372	0.25
373	0.23
374	0.2
375	0.15
376	0.15
377	0.1
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.07
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.13
394	0.17
395	0.21
396	0.26
397	0.28
398	0.32
399	0.33
400	0.36
401	0.39
402	0.38
403	0.41
404	0.41
405	0.42
406	0.44
407	0.42
408	0.39
409	0.36
410	0.32
411	0.26
412	0.26
413	0.23
414	0.19
415	0.22
416	0.21
417	0.2
418	0.24
419	0.24
420	0.21
421	0.24
422	0.27
423	0.25
424	0.25
425	0.24
426	0.21
427	0.19
428	0.14
429	0.13
430	0.1
431	0.09
432	0.08
433	0.09
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.08
438	0.1
439	0.14
440	0.18
441	0.18
442	0.2
443	0.2
444	0.2
445	0.23
446	0.21
447	0.19
448	0.15
449	0.17
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.1
454	0.1
455	0.07
456	0.06
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.06
471	0.08
472	0.12
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.13
478	0.12
479	0.1
480	0.12
481	0.12
482	0.17
483	0.17
484	0.23
485	0.24
486	0.26
487	0.29
488	0.32
489	0.33
490	0.31
491	0.36
492	0.32
493	0.31
494	0.29
495	0.25
496	0.18
497	0.17
498	0.14
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.08
505	0.07
506	0.07
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.1
522	0.14
523	0.17
524	0.18
525	0.18
526	0.18
527	0.2
528	0.26
529	0.24
530	0.22
531	0.23
532	0.23
533	0.28
534	0.28
535	0.35
536	0.33
537	0.37
538	0.44
539	0.43
540	0.5
541	0.49
542	0.53
543	0.46
544	0.46
545	0.43
546	0.36
547	0.38
548	0.32
549	0.29
550	0.25
551	0.24
552	0.22
553	0.19
554	0.16
555	0.12
556	0.13
557	0.12
558	0.15
559	0.14
560	0.16
561	0.18
562	0.23
563	0.24
564	0.27
565	0.26
566	0.27
567	0.31
568	0.31
569	0.36
570	0.32
571	0.36
572	0.33
573	0.33
574	0.3
575	0.26
576	0.23
577	0.17
578	0.18
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.05
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.05
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.08
621	0.09
622	0.1
623	0.12
624	0.15
625	0.15
626	0.17
627	0.18
628	0.16
629	0.16
630	0.15
631	0.13
632	0.13
633	0.13
634	0.14
635	0.16
636	0.23
637	0.26
638	0.33
639	0.36
640	0.34
641	0.34
642	0.33
643	0.3
644	0.24
645	0.21
646	0.14
647	0.12
648	0.11
649	0.14
650	0.15
651	0.16
652	0.16
653	0.15
654	0.14
655	0.15
656	0.18
657	0.15
658	0.15
659	0.14
660	0.14
661	0.15
662	0.16
663	0.13
664	0.11
665	0.1
666	0.09
667	0.08
668	0.11
669	0.1
670	0.12
671	0.12
672	0.13
673	0.15
674	0.16
675	0.18
676	0.17
677	0.22
678	0.22
679	0.24
680	0.27
681	0.29
682	0.29
683	0.26
684	0.25
685	0.23
686	0.25
687	0.23
688	0.21
689	0.22
690	0.22
691	0.22
692	0.23
693	0.24
694	0.25
695	0.3
696	0.35
697	0.4
698	0.43
699	0.44
700	0.53
701	0.52
702	0.52
703	0.46
704	0.41
705	0.33
706	0.28
707	0.26
708	0.16
709	0.13
710	0.1
711	0.12
712	0.11
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.09
717	0.09
718	0.08
719	0.07
720	0.07
721	0.09
722	0.1
723	0.09
724	0.12
725	0.15
726	0.18
727	0.22
728	0.23
729	0.24
730	0.27
731	0.28
732	0.26
733	0.26
734	0.26
735	0.22
736	0.21
737	0.18
738	0.16
739	0.15
740	0.13
741	0.1
742	0.08
743	0.12
744	0.15
745	0.18
746	0.18
747	0.19
748	0.23
749	0.26
750	0.27
751	0.22
752	0.19
753	0.16
754	0.18
755	0.16
756	0.12
757	0.1
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.07
762	0.04
763	0.05
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.08
768	0.11
769	0.11
770	0.15
771	0.18
772	0.2
773	0.21
774	0.24
775	0.27
776	0.26
777	0.27
778	0.28
779	0.3
780	0.29
781	0.31
782	0.3
783	0.28
784	0.28
785	0.32
786	0.31
787	0.26
788	0.25
789	0.23
790	0.26
791	0.26
792	0.32
793	0.29
794	0.29
795	0.31
796	0.35
797	0.39
798	0.34
799	0.34
800	0.28
801	0.26
802	0.27
803	0.24
804	0.23
805	0.22
806	0.25
807	0.22
808	0.22
809	0.22
810	0.19
811	0.21
812	0.2
813	0.18
814	0.15
815	0.17
816	0.17
817	0.2
818	0.19
819	0.16
820	0.16
821	0.17
822	0.17
823	0.16
824	0.17
825	0.14
826	0.14
827	0.15
828	0.15
829	0.13
830	0.22
831	0.22
832	0.22
833	0.25
834	0.26
835	0.26
836	0.33
837	0.34
838	0.26
839	0.24
840	0.23
841	0.18
842	0.21
843	0.21
844	0.14
845	0.1
846	0.11
847	0.18
848	0.21
849	0.21
850	0.19
851	0.22
852	0.24
853	0.27
854	0.35
855	0.36
856	0.37
857	0.41
858	0.41
859	0.4
860	0.39
861	0.4
862	0.37
863	0.32
864	0.29
865	0.26
866	0.24
867	0.25
868	0.24
869	0.21
870	0.18
871	0.18
872	0.18
873	0.19
874	0.21
875	0.2
876	0.2
877	0.21
878	0.24
879	0.23
880	0.22
881	0.2
882	0.19
883	0.17
884	0.17
885	0.17
886	0.13
887	0.12
888	0.1
889	0.12
890	0.12
891	0.13
892	0.15
893	0.18
894	0.22
895	0.23
896	0.25
897	0.25
898	0.23
899	0.21
900	0.2
901	0.19
902	0.14
903	0.14
904	0.17
905	0.16
906	0.16
907	0.16
908	0.15
909	0.18
910	0.17
911	0.16
912	0.16
913	0.16
914	0.17
915	0.17
916	0.16
917	0.11
918	0.1
919	0.1
920	0.07
921	0.07
922	0.07
923	0.12
924	0.13
925	0.19
926	0.21
927	0.23
928	0.25
929	0.31
930	0.4
931	0.41
932	0.44
933	0.44
934	0.51
935	0.57
936	0.61
937	0.63
938	0.59
939	0.58
940	0.58
941	0.53
942	0.47
943	0.43
944	0.42
945	0.43
946	0.39
947	0.36
948	0.33
949	0.35
950	0.39
951	0.39
952	0.36
953	0.29
954	0.29
955	0.29
956	0.34
957	0.34
958	0.33
959	0.29
960	0.29
961	0.29
962	0.28
963	0.28
964	0.22
965	0.21
966	0.17
967	0.19
968	0.18
969	0.16
970	0.17
971	0.17
972	0.17
973	0.19
974	0.17
975	0.14
976	0.13
977	0.18
978	0.16
979	0.17
980	0.2
981	0.25
982	0.34
983	0.38
984	0.46
985	0.47
986	0.57
987	0.65
988	0.71
989	0.71
990	0.67
991	0.73
992	0.7
993	0.73
994	0.67
995	0.61
996	0.53
997	0.46
998	0.42
999	0.32
1000	0.26
1001	0.18
1002	0.14
1003	0.09
1004	0.08
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.09
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.14
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.16
1021	0.19
1022	0.18
1023	0.17
1024	0.18
1025	0.17
1026	0.19
1027	0.2
1028	0.18
1029	0.17
1030	0.18
1031	0.17
1032	0.15
1033	0.13
1034	0.1
1035	0.09
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.1
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.14
1044	0.21
1045	0.21
1046	0.23
1047	0.25
1048	0.29
1049	0.31
1050	0.36
1051	0.38
1052	0.36
1053	0.38
1054	0.4
1055	0.48
1056	0.43
1057	0.43
1058	0.39
1059	0.4
1060	0.4
1061	0.41
1062	0.36
1063	0.32
1064	0.4
1065	0.46
1066	0.52
1067	0.54
1068	0.6
1069	0.66
1070	0.75
1071	0.79
1072	0.81
1073	0.81
1074	0.8
1075	0.81
1076	0.79
1077	0.79
1078	0.74
1079	0.67
1080	0.58
1081	0.52
1082	0.46
1083	0.41
1084	0.38
1085	0.38
1086	0.4
1087	0.44
1088	0.44
1089	0.45
1090	0.52
1091	0.57
1092	0.58
1093	0.54
1094	0.53
1095	0.51
1096	0.53
1097	0.51
1098	0.44
1099	0.41
1100	0.44
1101	0.38
1102	0.33
1103	0.31
1104	0.28
1105	0.28
1106	0.28
1107	0.25
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.2
1111	0.2
1112	0.2
1113	0.19
1114	0.19
1115	0.19
1116	0.22
1117	0.21
1118	0.21
1119	0.2
1120	0.21
1121	0.23
1122	0.23
1123	0.25
1124	0.23
1125	0.23
1126	0.23
1127	0.23
1128	0.22
1129	0.2
1130	0.19
1131	0.23
1132	0.23
1133	0.25
1134	0.24
1135	0.22
1136	0.24
1137	0.26
1138	0.27
1139	0.21
1140	0.19
1141	0.18
1142	0.17
1143	0.18
1144	0.19
1145	0.17
1146	0.15
1147	0.17
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.16
1151	0.16
1152	0.12
1153	0.13
1154	0.13
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.09
1158	0.08
1159	0.09
1160	0.14
1161	0.13
1162	0.13
1163	0.14
1164	0.16
1165	0.16
1166	0.16
1167	0.16
1168	0.12
1169	0.12
1170	0.12
1171	0.13
1172	0.12
1173	0.13
1174	0.14
1175	0.13
1176	0.13
1177	0.15
1178	0.2
1179	0.25
1180	0.32
1181	0.32
1182	0.35
1183	0.37
1184	0.39
1185	0.38
1186	0.34
1187	0.32
1188	0.3
1189	0.29
1190	0.27
1191	0.27
1192	0.24
1193	0.27
1194	0.25
1195	0.22
1196	0.19
1197	0.19
1198	0.18
1199	0.17
1200	0.17
1201	0.17
1202	0.19
1203	0.22
1204	0.19
1205	0.19
1206	0.19
1207	0.19
1208	0.2
1209	0.15
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.16
1213	0.16
1214	0.17
1215	0.18
1216	0.17
1217	0.17
1218	0.2
1219	0.25
1220	0.27
1221	0.35
1222	0.43
1223	0.53
1224	0.59
1225	0.62
1226	0.61
1227	0.54
1228	0.57
1229	0.59
1230	0.58
1231	0.56
1232	0.51
1233	0.5
1234	0.49
1235	0.48
1236	0.42
1237	0.35
1238	0.28
1239	0.2
1240	0.21
1241	0.2
1242	0.18
1243	0.17
1244	0.15
1245	0.16
1246	0.15
1247	0.15
1248	0.13

A0A5N5QCT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer