Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QSJ0

Protein Details
Accession A0A5N5QSJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-258SDTDESTRPTKRRRSRGKEKTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-258PTKRRRSRGKEKTP
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MSFTPLFRLAPRPHRELSPATSSRKQHIRFVNDILHVCLQRGDLPRARRAWSILVKCPEVDMESIWQVGLALIPGREDGKGRATRDHVNYLKRVRLQILPSQETLLKETVLALIDMGEYQEALDELDLYIVTMPFDQNPVLHIYAGMLWMYTAWPESPEPMGSVGAMETRNWNASRIAAARRHFRRAVALDPGNLFARGFLDRLGCDVVESQPVVAGDMSAEDEDEEMVDIPSKIESDTDESTRPTKRRRSRGKEKTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.53
4 0.5
5 0.5
6 0.5
7 0.51
8 0.55
9 0.55
10 0.58
11 0.62
12 0.59
13 0.58
14 0.61
15 0.61
16 0.58
17 0.6
18 0.59
19 0.54
20 0.52
21 0.46
22 0.42
23 0.35
24 0.3
25 0.26
26 0.21
27 0.22
28 0.26
29 0.29
30 0.3
31 0.35
32 0.41
33 0.44
34 0.46
35 0.42
36 0.4
37 0.42
38 0.45
39 0.46
40 0.47
41 0.48
42 0.46
43 0.44
44 0.41
45 0.34
46 0.26
47 0.21
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.05
58 0.05
59 0.04
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.16
67 0.21
68 0.23
69 0.27
70 0.3
71 0.36
72 0.39
73 0.46
74 0.43
75 0.42
76 0.46
77 0.46
78 0.47
79 0.43
80 0.41
81 0.35
82 0.34
83 0.34
84 0.33
85 0.36
86 0.33
87 0.31
88 0.31
89 0.3
90 0.26
91 0.25
92 0.2
93 0.13
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.07
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.03
108 0.02
109 0.03
110 0.02
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.04
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.05
142 0.05
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.16
163 0.18
164 0.22
165 0.25
166 0.28
167 0.36
168 0.4
169 0.46
170 0.44
171 0.42
172 0.44
173 0.41
174 0.41
175 0.4
176 0.38
177 0.34
178 0.33
179 0.34
180 0.28
181 0.24
182 0.2
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.12
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.14
225 0.18
226 0.21
227 0.23
228 0.25
229 0.3
230 0.38
231 0.42
232 0.46
233 0.53
234 0.61
235 0.69
236 0.78
237 0.84
238 0.88