Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QDM7

Protein Details
Accession A0A5N5QDM7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-101AEEIKRSLYREQKQKRKRDEFARAKDTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-210VRGWKPRRLGGGLGGRPKP
220-248PQGFRGERGRGFRGGFERGFRGRGRGFER
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034143  snRNP70_RRM  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
PS50102  RRM  
CDD cd00086  homeodomain  
cd12236  RRM_snRNP70  
Amino Acid Sequences MTHLLPPNLLKLFAPRPPLPFVRSVGKDPDKVHAKKVGGIAGLLAQVREENERGIVGAGASMMEEGEEEKYTYAEEIKRSLYREQKQKRKRDEFARAKDTYKPADDPEAIGDPYKTLFISRLHVGEDELRREFGVFGRIERIRLVRDKRGVSRGYAFVVYEREKDMKAYKEGDGISILGKRILVDVERGRTVRGWKPRRLGGGLGGRPKPVVAVEVVRAPQGFRGERGRGFRGGFERGFRGRGRGFERHGNGHGERERYGRYEGMDAGGALGSRATGGTSGGTTRGPSATRSGRATSNCRHDVLTMICTVLSCNNVMDIGKHWPRGWLGSASLHKRRVIEANLAARGIRLCASRGGRGLFACVCGVVWSNGAGERRNYICVPPTRPLLATFQHRRLACLWPGTSWTVSRTVNANICSELAPRRPLVVSTDHAHSTDITLEDDKPESDSPLSPPSASSTPQRTRSATLDDQKPSSIGPQRVRSATVSSPRAIQKRKRSRVTPEQLAHLERVFAQDRSPTAARRKEISEQLGMQERQTQIWFQNRRAKAKLVESKGRSGRPGSPGSGRDTPPDTPPELSPGFEADLQALLHETEPISIIPCTDLTIGSWHRIADRTGRHDLVAYISDHKASLTWFIHSGGHGFKMEISIASVVRTEFAHSAPSHPGQGIASFYLAEKPIFYMEDPANGGVWQVCDDWTEGRQASHVMKHQLVGSSVQLGHAIRVFEARRQATRPMHIPQPPILPVFSFPRVLHGRKRSYSGPPAPTQPGHEIFGPDYAEESRFGSFHSMPAVAGPSHQHQSSISDFTSIPIAQSLSRPYSADPARATFDPPRTYDRRATFDVSAQAHPQVDQRRYSEVLGADLYPDYPDMFAMPAMPPPIYGIPMGYTGLEDVADLMPPGTTPPGSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.4
4 0.46
5 0.5
6 0.47
7 0.46
8 0.45
9 0.47
10 0.47
11 0.48
12 0.51
13 0.53
14 0.55
15 0.52
16 0.57
17 0.58
18 0.56
19 0.58
20 0.55
21 0.51
22 0.5
23 0.52
24 0.47
25 0.37
26 0.35
27 0.29
28 0.23
29 0.24
30 0.19
31 0.15
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.15
61 0.17
62 0.19
63 0.22
64 0.26
65 0.3
66 0.33
67 0.4
68 0.44
69 0.5
70 0.58
71 0.66
72 0.72
73 0.78
74 0.86
75 0.89
76 0.89
77 0.89
78 0.89
79 0.9
80 0.9
81 0.9
82 0.88
83 0.8
84 0.72
85 0.7
86 0.65
87 0.6
88 0.53
89 0.46
90 0.4
91 0.44
92 0.43
93 0.36
94 0.34
95 0.32
96 0.28
97 0.26
98 0.23
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.12
103 0.09
104 0.12
105 0.14
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.23
112 0.26
113 0.29
114 0.29
115 0.27
116 0.27
117 0.25
118 0.26
119 0.25
120 0.19
121 0.22
122 0.18
123 0.18
124 0.25
125 0.26
126 0.26
127 0.28
128 0.29
129 0.28
130 0.36
131 0.41
132 0.42
133 0.48
134 0.54
135 0.57
136 0.62
137 0.58
138 0.54
139 0.52
140 0.46
141 0.41
142 0.36
143 0.3
144 0.24
145 0.28
146 0.26
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.22
151 0.25
152 0.29
153 0.29
154 0.31
155 0.33
156 0.31
157 0.33
158 0.33
159 0.31
160 0.26
161 0.21
162 0.19
163 0.17
164 0.16
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.15
172 0.19
173 0.22
174 0.25
175 0.25
176 0.25
177 0.27
178 0.32
179 0.34
180 0.4
181 0.45
182 0.49
183 0.55
184 0.6
185 0.62
186 0.59
187 0.54
188 0.51
189 0.52
190 0.5
191 0.5
192 0.46
193 0.41
194 0.38
195 0.36
196 0.29
197 0.2
198 0.16
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.25
212 0.28
213 0.33
214 0.38
215 0.38
216 0.37
217 0.36
218 0.37
219 0.35
220 0.36
221 0.33
222 0.3
223 0.32
224 0.3
225 0.33
226 0.29
227 0.31
228 0.28
229 0.32
230 0.37
231 0.38
232 0.4
233 0.45
234 0.48
235 0.46
236 0.47
237 0.46
238 0.4
239 0.41
240 0.41
241 0.35
242 0.33
243 0.31
244 0.3
245 0.27
246 0.29
247 0.23
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.17
252 0.16
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.17
276 0.2
277 0.24
278 0.26
279 0.28
280 0.31
281 0.34
282 0.39
283 0.4
284 0.44
285 0.43
286 0.41
287 0.39
288 0.35
289 0.34
290 0.3
291 0.25
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.15
307 0.18
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.22
312 0.24
313 0.24
314 0.18
315 0.16
316 0.2
317 0.25
318 0.3
319 0.35
320 0.36
321 0.35
322 0.34
323 0.35
324 0.35
325 0.32
326 0.31
327 0.31
328 0.32
329 0.31
330 0.3
331 0.28
332 0.23
333 0.2
334 0.15
335 0.12
336 0.08
337 0.08
338 0.13
339 0.15
340 0.17
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.2
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.13
362 0.14
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.2
367 0.23
368 0.27
369 0.27
370 0.28
371 0.27
372 0.27
373 0.27
374 0.25
375 0.24
376 0.29
377 0.31
378 0.34
379 0.37
380 0.37
381 0.37
382 0.35
383 0.36
384 0.3
385 0.28
386 0.24
387 0.19
388 0.22
389 0.21
390 0.2
391 0.16
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.17
398 0.19
399 0.2
400 0.19
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.16
414 0.16
415 0.17
416 0.19
417 0.18
418 0.18
419 0.18
420 0.15
421 0.12
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.11
436 0.14
437 0.14
438 0.12
439 0.12
440 0.14
441 0.14
442 0.15
443 0.17
444 0.22
445 0.27
446 0.33
447 0.35
448 0.34
449 0.35
450 0.36
451 0.39
452 0.36
453 0.37
454 0.37
455 0.36
456 0.35
457 0.32
458 0.3
459 0.24
460 0.23
461 0.23
462 0.23
463 0.26
464 0.31
465 0.33
466 0.34
467 0.35
468 0.32
469 0.29
470 0.27
471 0.29
472 0.26
473 0.24
474 0.27
475 0.3
476 0.36
477 0.39
478 0.43
479 0.48
480 0.57
481 0.65
482 0.68
483 0.69
484 0.72
485 0.76
486 0.76
487 0.74
488 0.65
489 0.6
490 0.55
491 0.51
492 0.43
493 0.32
494 0.24
495 0.15
496 0.17
497 0.14
498 0.12
499 0.11
500 0.12
501 0.13
502 0.17
503 0.18
504 0.19
505 0.25
506 0.3
507 0.31
508 0.32
509 0.35
510 0.35
511 0.39
512 0.38
513 0.33
514 0.28
515 0.29
516 0.33
517 0.3
518 0.25
519 0.25
520 0.22
521 0.2
522 0.2
523 0.19
524 0.17
525 0.26
526 0.29
527 0.31
528 0.4
529 0.43
530 0.48
531 0.49
532 0.49
533 0.44
534 0.5
535 0.52
536 0.49
537 0.53
538 0.5
539 0.54
540 0.55
541 0.53
542 0.45
543 0.4
544 0.39
545 0.36
546 0.36
547 0.31
548 0.31
549 0.32
550 0.35
551 0.38
552 0.33
553 0.31
554 0.31
555 0.3
556 0.28
557 0.29
558 0.25
559 0.22
560 0.21
561 0.23
562 0.21
563 0.2
564 0.17
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.13
569 0.08
570 0.09
571 0.08
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.07
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.12
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.15
596 0.16
597 0.17
598 0.19
599 0.24
600 0.28
601 0.32
602 0.32
603 0.31
604 0.3
605 0.3
606 0.25
607 0.21
608 0.16
609 0.15
610 0.15
611 0.15
612 0.14
613 0.14
614 0.12
615 0.1
616 0.15
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.15
621 0.16
622 0.16
623 0.17
624 0.12
625 0.14
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.11
630 0.11
631 0.09
632 0.09
633 0.08
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.09
642 0.1
643 0.14
644 0.13
645 0.16
646 0.2
647 0.21
648 0.2
649 0.19
650 0.19
651 0.15
652 0.16
653 0.14
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.11
659 0.11
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.1
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.13
668 0.16
669 0.16
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.14
674 0.1
675 0.1
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.11
682 0.11
683 0.14
684 0.14
685 0.13
686 0.14
687 0.16
688 0.18
689 0.21
690 0.26
691 0.26
692 0.26
693 0.27
694 0.29
695 0.27
696 0.26
697 0.22
698 0.18
699 0.17
700 0.16
701 0.15
702 0.15
703 0.14
704 0.13
705 0.14
706 0.14
707 0.1
708 0.16
709 0.17
710 0.18
711 0.26
712 0.28
713 0.29
714 0.32
715 0.4
716 0.4
717 0.45
718 0.47
719 0.44
720 0.49
721 0.49
722 0.5
723 0.45
724 0.45
725 0.42
726 0.38
727 0.33
728 0.26
729 0.24
730 0.27
731 0.25
732 0.24
733 0.21
734 0.28
735 0.34
736 0.38
737 0.44
738 0.48
739 0.54
740 0.54
741 0.59
742 0.56
743 0.58
744 0.63
745 0.63
746 0.6
747 0.55
748 0.58
749 0.58
750 0.55
751 0.51
752 0.47
753 0.41
754 0.37
755 0.35
756 0.31
757 0.27
758 0.28
759 0.24
760 0.18
761 0.17
762 0.16
763 0.15
764 0.14
765 0.15
766 0.12
767 0.12
768 0.13
769 0.16
770 0.16
771 0.16
772 0.18
773 0.17
774 0.16
775 0.17
776 0.19
777 0.13
778 0.14
779 0.16
780 0.18
781 0.21
782 0.21
783 0.21
784 0.19
785 0.24
786 0.26
787 0.27
788 0.23
789 0.21
790 0.21
791 0.21
792 0.24
793 0.2
794 0.16
795 0.14
796 0.15
797 0.13
798 0.16
799 0.2
800 0.2
801 0.21
802 0.22
803 0.22
804 0.3
805 0.32
806 0.34
807 0.32
808 0.31
809 0.34
810 0.34
811 0.37
812 0.35
813 0.4
814 0.39
815 0.4
816 0.45
817 0.46
818 0.51
819 0.55
820 0.55
821 0.54
822 0.54
823 0.56
824 0.5
825 0.49
826 0.51
827 0.45
828 0.41
829 0.37
830 0.35
831 0.3
832 0.29
833 0.32
834 0.33
835 0.34
836 0.37
837 0.38
838 0.4
839 0.42
840 0.42
841 0.4
842 0.32
843 0.3
844 0.27
845 0.24
846 0.2
847 0.17
848 0.16
849 0.12
850 0.12
851 0.1
852 0.08
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.08
857 0.09
858 0.1
859 0.12
860 0.13
861 0.13
862 0.12
863 0.15
864 0.17
865 0.16
866 0.16
867 0.14
868 0.14
869 0.16
870 0.16
871 0.13
872 0.12
873 0.1
874 0.11
875 0.09
876 0.08
877 0.08
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.09
885 0.1