Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QVA7

Protein Details
Accession A0A5N5QVA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31SREDEEKQKRLKRAELKKLNENPPAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MSIRESREDEEKQKRLKRAELKKLNENPPAVPNKSLDSSLKRHTGLIKRLRLSLGADNRDQILKDIDSLALEKYVDEIVQASVEGMSRCKAEKDIWCAAEIVSAFHRRFPEAYTPPLVAILSKELAAPSRAALNALPLEQREKEESTRVMRQRPLLRIACELAMIGVLSDGQGRSGGEWIMKVIRELLANDPALGSLPLFTTFLKGYSRPFLGLTPLSPAKPIGADVEAGNLASTVAHASANEKQNGATLVDERDELIEKDIRDKFKRMCEVYYDSVSKKLVKEHNRLQDQDRRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLSSCQSLSELLYLPMPSLPSASQKNDSILLLDGGSSLRATGGEDLPANSKWEDEEDRRFYEDLPDLKDFVPKSVLSVEAIASKEERENSAKERSSDPDAGKAKEEQERQDMARLEAKMQNVDMEESKSIGEDDPENQLVSRSPSPTQGAATGASQVLTALLARLSDANNRTVIDEIAVEFAFLNSKASRKRLVKFLSQPPKNRTDILPYFARLVAILNPYMPDVGMELVGLLEEEFRYLQKRKKLVKELASNRMKNVLYLSALAKFKIVPSHLILHVFKVYLDDLTGVNVDNAAMLLEGCGRFLLRSEETGARMATMLELMRRKQSVQHFDQRQVLMLENAYYQCNPPERAPRVEKTRSTMEMFIRHLIYDVLAKKTIDKVLKLLRKVDWNDPAPWKVKYSNISLLAMLAYDLQRYHPEFSIRVVDQVIEDIRLGMEQNIYKNNQRRVSSVKYLGELYMYRLISSTLIFDTLWSLVTFGHPDGRPLPGQVSPIDAPDDFFRIRLACVLLDTCGMCFDQGSQKKKLENYLTFLQLYVHCKAPLSMEVDFMFNDTLEALRPKLTFFKTFEEAAIAVDAMLDIANMGVEGMSLYVSEVGILENSLSDGGDGDESDHGGDESADEDDMDRRKGQRGDTSDMEMSEDANRPGSPEALLIVNHGEHAGPSEEAEAEFAKELAKMFVDAPGERRVERKGIWEGPSLPTGVRKKRGEDEIEQQSGIMKFTIATRKGNKIQTRQLPVPVDTELVKQTREMQLQDKAEQQQLKRIVLDYEQREEIEEQKAFEETMPPFLGGASSWSRLLHASHPDDGLVRRKVKIAPFADN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.77
4 0.78
5 0.79
6 0.82
7 0.82
8 0.82
9 0.84
10 0.87
11 0.86
12 0.82
13 0.74
14 0.66
15 0.65
16 0.65
17 0.57
18 0.5
19 0.43
20 0.41
21 0.41
22 0.41
23 0.38
24 0.37
25 0.41
26 0.45
27 0.5
28 0.46
29 0.47
30 0.52
31 0.55
32 0.58
33 0.62
34 0.64
35 0.6
36 0.63
37 0.61
38 0.54
39 0.49
40 0.48
41 0.48
42 0.44
43 0.43
44 0.41
45 0.41
46 0.41
47 0.37
48 0.29
49 0.25
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.23
79 0.3
80 0.36
81 0.43
82 0.42
83 0.42
84 0.4
85 0.37
86 0.34
87 0.27
88 0.21
89 0.18
90 0.24
91 0.23
92 0.26
93 0.28
94 0.27
95 0.28
96 0.31
97 0.36
98 0.34
99 0.39
100 0.38
101 0.37
102 0.35
103 0.35
104 0.3
105 0.21
106 0.18
107 0.16
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.2
126 0.21
127 0.24
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.31
132 0.35
133 0.37
134 0.46
135 0.48
136 0.51
137 0.52
138 0.57
139 0.6
140 0.61
141 0.63
142 0.59
143 0.56
144 0.52
145 0.5
146 0.42
147 0.34
148 0.28
149 0.19
150 0.14
151 0.11
152 0.07
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.18
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.1
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.18
194 0.23
195 0.24
196 0.22
197 0.23
198 0.22
199 0.24
200 0.24
201 0.21
202 0.22
203 0.23
204 0.22
205 0.22
206 0.21
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.13
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.06
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.08
227 0.15
228 0.21
229 0.23
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.25
234 0.23
235 0.17
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.22
248 0.27
249 0.32
250 0.35
251 0.4
252 0.42
253 0.48
254 0.56
255 0.51
256 0.49
257 0.48
258 0.51
259 0.49
260 0.49
261 0.43
262 0.36
263 0.36
264 0.35
265 0.32
266 0.27
267 0.31
268 0.35
269 0.41
270 0.49
271 0.55
272 0.63
273 0.66
274 0.68
275 0.66
276 0.67
277 0.65
278 0.65
279 0.63
280 0.61
281 0.56
282 0.56
283 0.53
284 0.49
285 0.45
286 0.42
287 0.37
288 0.3
289 0.28
290 0.26
291 0.25
292 0.22
293 0.21
294 0.21
295 0.19
296 0.2
297 0.22
298 0.23
299 0.24
300 0.28
301 0.26
302 0.23
303 0.26
304 0.27
305 0.27
306 0.33
307 0.34
308 0.31
309 0.31
310 0.33
311 0.32
312 0.33
313 0.31
314 0.24
315 0.21
316 0.19
317 0.18
318 0.14
319 0.12
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.13
330 0.17
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.25
335 0.25
336 0.24
337 0.2
338 0.16
339 0.14
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.14
362 0.18
363 0.2
364 0.27
365 0.29
366 0.31
367 0.33
368 0.33
369 0.3
370 0.3
371 0.31
372 0.26
373 0.26
374 0.25
375 0.25
376 0.25
377 0.29
378 0.24
379 0.2
380 0.2
381 0.15
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.12
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.17
398 0.2
399 0.28
400 0.29
401 0.29
402 0.31
403 0.32
404 0.34
405 0.37
406 0.34
407 0.35
408 0.36
409 0.35
410 0.34
411 0.32
412 0.3
413 0.31
414 0.33
415 0.27
416 0.29
417 0.31
418 0.3
419 0.34
420 0.31
421 0.26
422 0.28
423 0.26
424 0.24
425 0.24
426 0.24
427 0.19
428 0.18
429 0.18
430 0.13
431 0.14
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.08
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.14
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.17
454 0.19
455 0.19
456 0.19
457 0.16
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.11
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.05
474 0.05
475 0.09
476 0.11
477 0.12
478 0.13
479 0.13
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.1
496 0.13
497 0.15
498 0.23
499 0.28
500 0.31
501 0.37
502 0.41
503 0.45
504 0.5
505 0.58
506 0.61
507 0.62
508 0.65
509 0.62
510 0.64
511 0.57
512 0.51
513 0.42
514 0.41
515 0.37
516 0.34
517 0.31
518 0.26
519 0.25
520 0.24
521 0.22
522 0.14
523 0.12
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.07
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.02
542 0.02
543 0.02
544 0.03
545 0.03
546 0.04
547 0.08
548 0.12
549 0.16
550 0.22
551 0.31
552 0.38
553 0.46
554 0.55
555 0.58
556 0.63
557 0.68
558 0.68
559 0.7
560 0.7
561 0.62
562 0.54
563 0.52
564 0.44
565 0.34
566 0.29
567 0.2
568 0.13
569 0.14
570 0.14
571 0.13
572 0.14
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.13
578 0.13
579 0.1
580 0.12
581 0.15
582 0.16
583 0.19
584 0.18
585 0.17
586 0.17
587 0.15
588 0.12
589 0.1
590 0.1
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.02
606 0.03
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.05
614 0.09
615 0.08
616 0.09
617 0.13
618 0.14
619 0.16
620 0.17
621 0.16
622 0.12
623 0.12
624 0.11
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.08
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.14
634 0.2
635 0.27
636 0.32
637 0.36
638 0.45
639 0.46
640 0.49
641 0.53
642 0.47
643 0.41
644 0.34
645 0.28
646 0.19
647 0.16
648 0.13
649 0.09
650 0.1
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.1
655 0.13
656 0.14
657 0.17
658 0.25
659 0.29
660 0.35
661 0.4
662 0.43
663 0.48
664 0.53
665 0.51
666 0.47
667 0.48
668 0.44
669 0.42
670 0.4
671 0.34
672 0.33
673 0.32
674 0.3
675 0.25
676 0.22
677 0.2
678 0.16
679 0.13
680 0.13
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.15
685 0.15
686 0.18
687 0.23
688 0.2
689 0.19
690 0.22
691 0.29
692 0.35
693 0.35
694 0.36
695 0.33
696 0.39
697 0.41
698 0.43
699 0.41
700 0.39
701 0.42
702 0.42
703 0.43
704 0.38
705 0.36
706 0.32
707 0.27
708 0.29
709 0.28
710 0.29
711 0.32
712 0.31
713 0.31
714 0.28
715 0.27
716 0.22
717 0.18
718 0.13
719 0.08
720 0.06
721 0.05
722 0.06
723 0.06
724 0.09
725 0.11
726 0.14
727 0.15
728 0.17
729 0.17
730 0.19
731 0.24
732 0.21
733 0.2
734 0.18
735 0.16
736 0.14
737 0.15
738 0.14
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.06
743 0.06
744 0.07
745 0.06
746 0.08
747 0.09
748 0.11
749 0.15
750 0.17
751 0.24
752 0.3
753 0.37
754 0.41
755 0.41
756 0.43
757 0.46
758 0.51
759 0.51
760 0.5
761 0.44
762 0.39
763 0.38
764 0.35
765 0.3
766 0.23
767 0.19
768 0.19
769 0.17
770 0.16
771 0.15
772 0.16
773 0.14
774 0.14
775 0.12
776 0.07
777 0.08
778 0.08
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.09
783 0.07
784 0.07
785 0.06
786 0.07
787 0.09
788 0.08
789 0.14
790 0.13
791 0.15
792 0.16
793 0.18
794 0.18
795 0.18
796 0.2
797 0.15
798 0.17
799 0.16
800 0.19
801 0.17
802 0.17
803 0.18
804 0.16
805 0.15
806 0.14
807 0.18
808 0.13
809 0.13
810 0.13
811 0.12
812 0.12
813 0.13
814 0.13
815 0.09
816 0.1
817 0.11
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.08
822 0.08
823 0.08
824 0.07
825 0.06
826 0.08
827 0.17
828 0.24
829 0.29
830 0.33
831 0.37
832 0.41
833 0.44
834 0.5
835 0.49
836 0.45
837 0.46
838 0.45
839 0.45
840 0.41
841 0.38
842 0.32
843 0.27
844 0.28
845 0.24
846 0.22
847 0.19
848 0.19
849 0.19
850 0.2
851 0.2
852 0.2
853 0.18
854 0.18
855 0.18
856 0.19
857 0.18
858 0.17
859 0.13
860 0.09
861 0.09
862 0.06
863 0.06
864 0.07
865 0.09
866 0.08
867 0.11
868 0.12
869 0.13
870 0.2
871 0.23
872 0.26
873 0.28
874 0.33
875 0.33
876 0.34
877 0.33
878 0.28
879 0.25
880 0.2
881 0.17
882 0.11
883 0.08
884 0.07
885 0.06
886 0.04
887 0.04
888 0.03
889 0.02
890 0.02
891 0.02
892 0.02
893 0.02
894 0.02
895 0.02
896 0.02
897 0.03
898 0.03
899 0.03
900 0.03
901 0.04
902 0.04
903 0.04
904 0.04
905 0.04
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.04
913 0.04
914 0.04
915 0.05
916 0.05
917 0.05
918 0.06
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.05
927 0.06
928 0.06
929 0.06
930 0.06
931 0.07
932 0.11
933 0.13
934 0.15
935 0.17
936 0.19
937 0.26
938 0.3
939 0.34
940 0.38
941 0.42
942 0.47
943 0.47
944 0.5
945 0.44
946 0.41
947 0.38
948 0.29
949 0.24
950 0.21
951 0.2
952 0.16
953 0.16
954 0.16
955 0.15
956 0.16
957 0.16
958 0.13
959 0.11
960 0.12
961 0.12
962 0.12
963 0.11
964 0.12
965 0.11
966 0.1
967 0.1
968 0.09
969 0.07
970 0.09
971 0.1
972 0.09
973 0.09
974 0.1
975 0.1
976 0.1
977 0.12
978 0.1
979 0.09
980 0.1
981 0.09
982 0.09
983 0.09
984 0.1
985 0.1
986 0.1
987 0.1
988 0.1
989 0.13
990 0.16
991 0.16
992 0.18
993 0.24
994 0.25
995 0.25
996 0.27
997 0.27
998 0.3
999 0.3
1000 0.34
1001 0.36
1002 0.41
1003 0.43
1004 0.45
1005 0.44
1006 0.42
1007 0.42
1008 0.36
1009 0.28
1010 0.3
1011 0.35
1012 0.39
1013 0.46
1014 0.46
1015 0.51
1016 0.58
1017 0.65
1018 0.63
1019 0.61
1020 0.61
1021 0.61
1022 0.59
1023 0.53
1024 0.45
1025 0.41
1026 0.35
1027 0.3
1028 0.21
1029 0.12
1030 0.11
1031 0.17
1032 0.26
1033 0.25
1034 0.32
1035 0.37
1036 0.45
1037 0.53
1038 0.62
1039 0.64
1040 0.64
1041 0.71
1042 0.73
1043 0.76
1044 0.71
1045 0.71
1046 0.67
1047 0.6
1048 0.53
1049 0.44
1050 0.37
1051 0.3
1052 0.28
1053 0.26
1054 0.24
1055 0.23
1056 0.21
1057 0.26
1058 0.32
1059 0.34
1060 0.35
1061 0.36
1062 0.42
1063 0.46
1064 0.48
1065 0.48
1066 0.45
1067 0.47
1068 0.5
1069 0.45
1070 0.46
1071 0.47
1072 0.47
1073 0.42
1074 0.4
1075 0.35
1076 0.35
1077 0.42
1078 0.39
1079 0.38
1080 0.37
1081 0.36
1082 0.37
1083 0.36
1084 0.34
1085 0.33
1086 0.29
1087 0.25
1088 0.24
1089 0.25
1090 0.22
1091 0.22
1092 0.24
1093 0.18
1094 0.22
1095 0.22
1096 0.21
1097 0.2
1098 0.2
1099 0.19
1100 0.13
1101 0.17
1102 0.15
1103 0.16
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.18
1107 0.2
1108 0.22
1109 0.23
1110 0.29
1111 0.31
1112 0.33
1113 0.34
1114 0.33
1115 0.35
1116 0.37
1117 0.39
1118 0.38
1119 0.37
1120 0.36
1121 0.4
1122 0.45
1123 0.49
1124 0.54