FuNGI

A0A5N5QR66

Protein Details

Accession

A0A5N5QR66

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
481-503	VLLFFYRRRKHHRNSGTRPMKPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 21, E.R. 3, mito 1, pero 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037685 RBP11 IPR036603 RBP11-like IPR009025 RBP11-like_dimer
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005665 C:RNA polymerase II, core complex GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0001055 F:RNA polymerase II activity
Pfam	View protein in Pfam PF13656 RNA_pol_L_2
CDD	cd06926 RNAP_II_RPB11

Amino Acid Sequences

MNAPNRFEMFTMADGERLIEVIEDTKIPNAATFKIYHPLLFYPTLSVRAPTHCARTNSQLLANDAVIFAGYKVPHPLEPYFILKVQTNGAFTPSQVLLDACNALIRMITDLKTQFTTKFDLRALETDATDEVSGPYGTTSRYGGYSGETSRPGHDYMDINEESWDLSSASNKKFSGRDGPNSTSTAAQPKQTEAEDGYNKIMNVRGALLAVALHVLASFDVVRAFNFTFLTIPAQCEELSIGISGGVPPYRLLIVPIGELLTPPEIRTIIDRNITGTSDSFIFNYPAASRFVAMMSDSTGIGTGGTSAIIAVGGSGTKSDCLQSSVSAPKFYLYLDPSTPSQCQSTNVSWSSGYQGQVSVYNMVIGGQSSALTIPSGATSVNWTANIRTNTTILFVAGDERGAGTGGSSTLLTIGPGDDSCINSSSPSSTQQPPAGGINTAGGSTSPTSTPSPSSGGSGNTGAIIGGVVGGIAGLVMFLLVLLFFYRRRKHHRNSGTRPMKPDLIDTSEDRPAGDERGGFYEPEPFIIPEAVTNPETGSRPSLHSTHDGAQPRPSMTTISGAPGANVRAPSRLSITTASELGGVPPSSLGTRKSGMPPTSFRPVNFIQHDDAGGLDPSTQEPETIELPPAYTDFRGQTPEPSGSGAGPSAAASASGGASEATAPTPPTEPTASGATITPTVPTTSATTTTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.16
4	0.13
5	0.11
6	0.07
7	0.07
8	0.08
9	0.09
10	0.1
11	0.1
12	0.12
13	0.13
14	0.13
15	0.16
16	0.17
17	0.18
18	0.2
19	0.21
20	0.22
21	0.28
22	0.29
23	0.27
24	0.27
25	0.27
26	0.28
27	0.28
28	0.26
29	0.23
30	0.24
31	0.27
32	0.25
33	0.26
34	0.24
35	0.26
36	0.32
37	0.31
38	0.37
39	0.4
40	0.44
41	0.46
42	0.51
43	0.53
44	0.51
45	0.52
46	0.47
47	0.43
48	0.41
49	0.37
50	0.29
51	0.22
52	0.18
53	0.14
54	0.11
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.1
59	0.14
60	0.16
61	0.18
62	0.23
63	0.23
64	0.24
65	0.28
66	0.31
67	0.3
68	0.3
69	0.3
70	0.27
71	0.28
72	0.28
73	0.26
74	0.24
75	0.21
76	0.22
77	0.2
78	0.19
79	0.22
80	0.17
81	0.15
82	0.14
83	0.14
84	0.11
85	0.13
86	0.14
87	0.09
88	0.1
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.09
94	0.11
95	0.12
96	0.16
97	0.17
98	0.19
99	0.22
100	0.23
101	0.22
102	0.22
103	0.27
104	0.25
105	0.28
106	0.27
107	0.28
108	0.29
109	0.29
110	0.31
111	0.27
112	0.25
113	0.21
114	0.2
115	0.18
116	0.16
117	0.13
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.1
127	0.09
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.13
132	0.16
133	0.17
134	0.19
135	0.21
136	0.21
137	0.22
138	0.24
139	0.23
140	0.2
141	0.21
142	0.2
143	0.19
144	0.25
145	0.23
146	0.21
147	0.21
148	0.2
149	0.16
150	0.15
151	0.13
152	0.07
153	0.07
154	0.13
155	0.18
156	0.21
157	0.25
158	0.25
159	0.28
160	0.29
161	0.32
162	0.36
163	0.36
164	0.43
165	0.45
166	0.49
167	0.48
168	0.48
169	0.46
170	0.37
171	0.33
172	0.32
173	0.27
174	0.27
175	0.25
176	0.25
177	0.27
178	0.26
179	0.26
180	0.2
181	0.25
182	0.24
183	0.25
184	0.25
185	0.24
186	0.23
187	0.22
188	0.21
189	0.15
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.1
217	0.13
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.11
255	0.14
256	0.15
257	0.17
258	0.17
259	0.18
260	0.19
261	0.19
262	0.17
263	0.13
264	0.11
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.11
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.04
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.02
297	0.02
298	0.02
299	0.02
300	0.02
301	0.02
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.11
312	0.17
313	0.18
314	0.18
315	0.17
316	0.16
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.14
324	0.14
325	0.16
326	0.17
327	0.15
328	0.14
329	0.13
330	0.15
331	0.17
332	0.18
333	0.2
334	0.2
335	0.2
336	0.18
337	0.18
338	0.19
339	0.17
340	0.16
341	0.12
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.13
346	0.1
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.05
353	0.04
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.16
373	0.17
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.17
379	0.16
380	0.1
381	0.09
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.13
415	0.17
416	0.18
417	0.22
418	0.23
419	0.23
420	0.23
421	0.23
422	0.21
423	0.17
424	0.14
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.08
433	0.07
434	0.09
435	0.1
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.16
440	0.15
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.16
445	0.15
446	0.13
447	0.11
448	0.1
449	0.08
450	0.07
451	0.05
452	0.03
453	0.03
454	0.02
455	0.02
456	0.02
457	0.02
458	0.02
459	0.01
460	0.01
461	0.01
462	0.01
463	0.01
464	0.01
465	0.01
466	0.01
467	0.01
468	0.02
469	0.03
470	0.04
471	0.07
472	0.14
473	0.2
474	0.27
475	0.37
476	0.47
477	0.56
478	0.66
479	0.74
480	0.79
481	0.82
482	0.87
483	0.87
484	0.81
485	0.77
486	0.7
487	0.64
488	0.53
489	0.47
490	0.4
491	0.34
492	0.33
493	0.3
494	0.3
495	0.29
496	0.28
497	0.25
498	0.22
499	0.19
500	0.19
501	0.17
502	0.14
503	0.13
504	0.18
505	0.18
506	0.17
507	0.16
508	0.21
509	0.19
510	0.2
511	0.2
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.16
516	0.1
517	0.12
518	0.13
519	0.12
520	0.12
521	0.12
522	0.14
523	0.15
524	0.16
525	0.17
526	0.16
527	0.19
528	0.22
529	0.23
530	0.23
531	0.26
532	0.29
533	0.3
534	0.35
535	0.37
536	0.35
537	0.38
538	0.38
539	0.35
540	0.32
541	0.28
542	0.24
543	0.2
544	0.22
545	0.18
546	0.17
547	0.19
548	0.18
549	0.18
550	0.18
551	0.18
552	0.17
553	0.18
554	0.16
555	0.16
556	0.17
557	0.18
558	0.2
559	0.2
560	0.2
561	0.21
562	0.24
563	0.23
564	0.23
565	0.21
566	0.18
567	0.17
568	0.15
569	0.16
570	0.12
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.13
576	0.14
577	0.15
578	0.17
579	0.21
580	0.27
581	0.34
582	0.36
583	0.39
584	0.42
585	0.44
586	0.51
587	0.5
588	0.44
589	0.43
590	0.43
591	0.47
592	0.46
593	0.43
594	0.37
595	0.36
596	0.36
597	0.29
598	0.26
599	0.19
600	0.15
601	0.12
602	0.09
603	0.08
604	0.09
605	0.13
606	0.12
607	0.11
608	0.11
609	0.14
610	0.16
611	0.16
612	0.18
613	0.15
614	0.15
615	0.16
616	0.16
617	0.16
618	0.15
619	0.16
620	0.16
621	0.18
622	0.23
623	0.23
624	0.27
625	0.29
626	0.31
627	0.29
628	0.28
629	0.27
630	0.22
631	0.23
632	0.18
633	0.13
634	0.11
635	0.1
636	0.09
637	0.08
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.07
648	0.07
649	0.08
650	0.09
651	0.1
652	0.12
653	0.13
654	0.17
655	0.19
656	0.19
657	0.21
658	0.24
659	0.23
660	0.22
661	0.22
662	0.2
663	0.19
664	0.18
665	0.17
666	0.14
667	0.15
668	0.14
669	0.16
670	0.17
671	0.18

A0A5N5QR66

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer