Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QBM7

Protein Details
Accession A0A5N5QBM7    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-114KGMPHHSEKPATKKPKKLPRPKTSSDPDAIBasic
271-296NGRVIGVQKKHKKTRKEREEAARARABasic
812-837DEVTTADKRRKPKFKGQTQKGATKVSHydrophilic
839-858KSGTANITRGRRDKRKMRRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-106PHHSEKPATKKPKKLPRPK
279-303KKHKKTRKEREEAARARAAARLRAI
819-858KRRKPKFKGQTQKGATKVSIKSGTANITRGRRDKRKMRRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.333, cyto 7.5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSEHGSTLFVSNLPYTATSTDIQTLFSEIAPVRSAFVVLDKESKSSKGVAYVSFAIKEDAALALENDKPLELDGRVLRLQWADRKGMPHHSEKPATKKPKKLPRPKTSSDPDAIRTVVVSNLPDGIDSKSLWKKARKIPGASKVVFPAPTAENDPHTALVKFASPAEASAAVSKLHNHIFKGSQLSATIKKRVDKLVAGRKSGAPSYSSRLIVRNLAWHVTEQDLHKEFAPYGPIYSITLPTDESSGRHRGFAFVWMLSRADAERALESVNGRVIGVQKKHKKTRKEREEAARARAAARLRAIKGGQESEEQGESEEEHVDEQLKEGRVVAVDWALSKSKWEEAVSQRQDEEATKVDEEGSDKEGSSEEGLNEEGPDGETESEGDASEDEGSAEESEGETHEHERPQLPTTDVGTTLFVRNVPFEAAEDDLRTLFRSFGPLRYARITLDKETGRSRGTGFVCFWKKEDADAAIDEAEAMARELGTDKLGSGATKVHNPFSMSLLTPDPSASLAKRLVLHGRTLSVARAVTRDEADRLREEGERSREKQDKRNLYLMREGGKYYTNAFDAAAGLSEAELAARQASYDSRRALLRSNPSLYVSRTRLSVRRLPLWVSERVLKRLATHAIQEFEAEVSRGERDPLTRDELQLQDTNESTPNRKRGIQQAKIVRATDRVDGVTGKGRSRGYGFIETSQHADALRVLRWANNRPGVVELMRQWWRDEVKDLIAASSQNQRLKEELGRLDAEVGSESRGLNKTLIMEFAIENVQVVKRRREQAEAARADQIEGGARKRKAEQTVEEPTRQSKKSRNDDEVTTADKRRKPKFKGQTQKGATKVSIKSGTANITRGRRDKRKMRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.16
5 0.15
6 0.17
7 0.22
8 0.2
9 0.21
10 0.19
11 0.2
12 0.18
13 0.17
14 0.19
15 0.14
16 0.16
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.12
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.23
27 0.22
28 0.25
29 0.27
30 0.29
31 0.27
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.28
36 0.27
37 0.29
38 0.32
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.24
43 0.2
44 0.19
45 0.15
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.13
58 0.11
59 0.16
60 0.17
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.29
67 0.31
68 0.33
69 0.33
70 0.35
71 0.4
72 0.42
73 0.49
74 0.49
75 0.5
76 0.54
77 0.57
78 0.63
79 0.65
80 0.7
81 0.71
82 0.77
83 0.77
84 0.79
85 0.81
86 0.83
87 0.88
88 0.89
89 0.9
90 0.9
91 0.91
92 0.88
93 0.87
94 0.84
95 0.8
96 0.76
97 0.69
98 0.61
99 0.55
100 0.48
101 0.38
102 0.31
103 0.24
104 0.19
105 0.17
106 0.14
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.2
116 0.24
117 0.3
118 0.37
119 0.43
120 0.5
121 0.57
122 0.67
123 0.68
124 0.71
125 0.74
126 0.78
127 0.79
128 0.72
129 0.65
130 0.57
131 0.53
132 0.44
133 0.35
134 0.29
135 0.22
136 0.23
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.24
141 0.25
142 0.22
143 0.22
144 0.2
145 0.16
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.15
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.23
166 0.25
167 0.27
168 0.32
169 0.29
170 0.24
171 0.24
172 0.27
173 0.32
174 0.34
175 0.38
176 0.35
177 0.38
178 0.41
179 0.44
180 0.44
181 0.42
182 0.47
183 0.51
184 0.53
185 0.51
186 0.5
187 0.48
188 0.47
189 0.42
190 0.34
191 0.26
192 0.23
193 0.27
194 0.29
195 0.29
196 0.27
197 0.28
198 0.29
199 0.3
200 0.28
201 0.28
202 0.25
203 0.25
204 0.24
205 0.22
206 0.21
207 0.19
208 0.21
209 0.17
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.22
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.15
233 0.21
234 0.21
235 0.23
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.26
240 0.23
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.15
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.18
263 0.23
264 0.31
265 0.4
266 0.49
267 0.59
268 0.65
269 0.72
270 0.77
271 0.84
272 0.85
273 0.85
274 0.84
275 0.84
276 0.88
277 0.82
278 0.76
279 0.67
280 0.57
281 0.49
282 0.43
283 0.34
284 0.26
285 0.25
286 0.25
287 0.23
288 0.26
289 0.25
290 0.24
291 0.25
292 0.24
293 0.22
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.14
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.18
330 0.23
331 0.34
332 0.35
333 0.35
334 0.34
335 0.32
336 0.32
337 0.27
338 0.23
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.12
424 0.12
425 0.14
426 0.19
427 0.19
428 0.21
429 0.22
430 0.23
431 0.19
432 0.23
433 0.23
434 0.2
435 0.25
436 0.23
437 0.23
438 0.24
439 0.26
440 0.21
441 0.2
442 0.19
443 0.2
444 0.21
445 0.21
446 0.2
447 0.26
448 0.28
449 0.28
450 0.28
451 0.25
452 0.24
453 0.22
454 0.23
455 0.16
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.07
463 0.05
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.02
468 0.03
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.09
479 0.1
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.19
485 0.19
486 0.18
487 0.18
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.08
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.13
502 0.15
503 0.19
504 0.19
505 0.21
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.17
510 0.16
511 0.12
512 0.12
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.15
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.17
525 0.18
526 0.19
527 0.23
528 0.29
529 0.33
530 0.34
531 0.4
532 0.46
533 0.48
534 0.55
535 0.59
536 0.61
537 0.59
538 0.65
539 0.61
540 0.56
541 0.58
542 0.52
543 0.46
544 0.37
545 0.33
546 0.26
547 0.25
548 0.22
549 0.18
550 0.17
551 0.14
552 0.13
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.09
557 0.08
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.04
570 0.08
571 0.11
572 0.16
573 0.17
574 0.18
575 0.2
576 0.21
577 0.25
578 0.28
579 0.33
580 0.34
581 0.36
582 0.35
583 0.36
584 0.37
585 0.36
586 0.37
587 0.31
588 0.27
589 0.27
590 0.29
591 0.31
592 0.35
593 0.39
594 0.37
595 0.39
596 0.4
597 0.4
598 0.43
599 0.42
600 0.4
601 0.36
602 0.38
603 0.35
604 0.36
605 0.37
606 0.31
607 0.28
608 0.3
609 0.31
610 0.26
611 0.27
612 0.27
613 0.26
614 0.25
615 0.24
616 0.19
617 0.16
618 0.15
619 0.11
620 0.08
621 0.07
622 0.09
623 0.09
624 0.1
625 0.1
626 0.12
627 0.16
628 0.19
629 0.24
630 0.24
631 0.25
632 0.28
633 0.29
634 0.3
635 0.29
636 0.27
637 0.22
638 0.22
639 0.22
640 0.22
641 0.22
642 0.25
643 0.28
644 0.34
645 0.35
646 0.38
647 0.41
648 0.48
649 0.57
650 0.58
651 0.6
652 0.63
653 0.67
654 0.67
655 0.64
656 0.54
657 0.48
658 0.43
659 0.37
660 0.29
661 0.22
662 0.2
663 0.19
664 0.2
665 0.23
666 0.23
667 0.22
668 0.25
669 0.24
670 0.25
671 0.27
672 0.29
673 0.27
674 0.32
675 0.32
676 0.31
677 0.34
678 0.33
679 0.33
680 0.3
681 0.25
682 0.18
683 0.17
684 0.16
685 0.15
686 0.16
687 0.16
688 0.16
689 0.19
690 0.25
691 0.31
692 0.36
693 0.39
694 0.38
695 0.37
696 0.38
697 0.37
698 0.33
699 0.3
700 0.24
701 0.26
702 0.3
703 0.3
704 0.29
705 0.31
706 0.33
707 0.31
708 0.33
709 0.29
710 0.27
711 0.29
712 0.28
713 0.23
714 0.22
715 0.2
716 0.19
717 0.24
718 0.27
719 0.28
720 0.29
721 0.3
722 0.3
723 0.34
724 0.36
725 0.35
726 0.33
727 0.33
728 0.33
729 0.31
730 0.31
731 0.27
732 0.23
733 0.17
734 0.14
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.14
739 0.16
740 0.17
741 0.16
742 0.17
743 0.19
744 0.19
745 0.2
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.15
750 0.15
751 0.11
752 0.1
753 0.11
754 0.14
755 0.19
756 0.23
757 0.3
758 0.37
759 0.45
760 0.48
761 0.52
762 0.58
763 0.62
764 0.68
765 0.64
766 0.59
767 0.56
768 0.52
769 0.47
770 0.39
771 0.29
772 0.25
773 0.23
774 0.26
775 0.29
776 0.3
777 0.33
778 0.38
779 0.45
780 0.47
781 0.52
782 0.53
783 0.53
784 0.63
785 0.66
786 0.63
787 0.58
788 0.58
789 0.58
790 0.54
791 0.53
792 0.51
793 0.56
794 0.64
795 0.71
796 0.72
797 0.69
798 0.7
799 0.7
800 0.65
801 0.6
802 0.54
803 0.51
804 0.5
805 0.5
806 0.55
807 0.59
808 0.65
809 0.68
810 0.74
811 0.79
812 0.82
813 0.89
814 0.89
815 0.9
816 0.87
817 0.87
818 0.81
819 0.75
820 0.67
821 0.64
822 0.56
823 0.54
824 0.51
825 0.43
826 0.42
827 0.41
828 0.45
829 0.41
830 0.43
831 0.42
832 0.44
833 0.51
834 0.56
835 0.62
836 0.65
837 0.72
838 0.78