Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5QUC1

Protein Details
Accession A0A5N5QUC1    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33SQTLPSPPKSLPRKPRAPRRPRRAVASSDDHydrophilic
70-95DHSASPPSTRRAKKRSPAKADPSVIPHydrophilic
146-167VPVSGRGKSRPRGKTQRQAYLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-26PKSLPRKPRAPRRPRR
79-86RRAKKRSP
206-215SGRGRGRGRA
253-268PTRGKGRARARGRGGS
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 7, cyto_nucl 6.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MSMSQTLPSPPKSLPRKPRAPRRPRRAVASSDDELDRIRSSDSETEESDSDTCSSSEALDTPAPPATATDHSASPPSTRRAKKRSPAKADPSVIPPQSNWDDLVGHDEALDSSGPPIIDFADFVSGALDAAGPSHTEPDQEGGEPVPVSGRGKSRPRGKTQRQAYLERLSEDPSYTPRVGAFWGHDERLLAPELRGMSDWWRGRWSGRGRGRGRANRIPSERPSDQDTPEAAPIERTWAHDGFERLNERDYRPTRGKGRARARGRGGSAREPEQLWTKAPDTHLHIDPSTRPEFPGQGRGITVNLPGQWRPSMVRVSRNPRPAPAQPTPKAPIDVPTEIVVKLPGKDAKVVSVSHPAPAPPVRSTLPEDPETVQPLQDVPPKVVARIPRGSADTASTKSPAASSPVQAVAPKPDTLSRPAPTSAFPVQVLNQTPASVPPKPAPPVHGRTRSQLGAVAFARPPAVPLTDTAVPLAFGSFEPPVAPVPAPPPVTSNTSPSINPPAAVPPPIKDAPPAPPPLNIPSPVSIRPPPPPMASYTPPPTNPYYNPYAYNPLDGATYYSTATPPPPHHPGMYYPANGFFVPPRPSGPVAIRAPGESANPNGVVNGEDSAARPPVPPMWNYYHPHPISHHSHSHSHSHSHGHNSYYSPSATPYPPPPPGPHQPGYYPGVGEYGNVYDYSGGGVYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.66
3 0.74
4 0.81
5 0.9
6 0.91
7 0.93
8 0.94
9 0.94
10 0.94
11 0.9
12 0.89
13 0.85
14 0.8
15 0.77
16 0.74
17 0.65
18 0.58
19 0.51
20 0.43
21 0.36
22 0.32
23 0.25
24 0.17
25 0.17
26 0.13
27 0.18
28 0.22
29 0.26
30 0.28
31 0.28
32 0.31
33 0.3
34 0.31
35 0.27
36 0.23
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.27
63 0.31
64 0.38
65 0.46
66 0.55
67 0.62
68 0.71
69 0.77
70 0.81
71 0.86
72 0.86
73 0.87
74 0.86
75 0.86
76 0.8
77 0.74
78 0.69
79 0.66
80 0.58
81 0.49
82 0.4
83 0.38
84 0.36
85 0.34
86 0.28
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.25
91 0.18
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.14
137 0.18
138 0.24
139 0.32
140 0.4
141 0.49
142 0.55
143 0.65
144 0.72
145 0.78
146 0.8
147 0.81
148 0.83
149 0.79
150 0.76
151 0.72
152 0.68
153 0.6
154 0.52
155 0.45
156 0.37
157 0.32
158 0.28
159 0.23
160 0.19
161 0.22
162 0.2
163 0.19
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.19
177 0.13
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.21
186 0.23
187 0.21
188 0.23
189 0.23
190 0.24
191 0.32
192 0.35
193 0.38
194 0.43
195 0.52
196 0.52
197 0.6
198 0.68
199 0.68
200 0.69
201 0.67
202 0.66
203 0.64
204 0.66
205 0.64
206 0.58
207 0.58
208 0.52
209 0.46
210 0.47
211 0.42
212 0.38
213 0.36
214 0.34
215 0.27
216 0.27
217 0.26
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.22
229 0.2
230 0.24
231 0.24
232 0.21
233 0.25
234 0.26
235 0.25
236 0.33
237 0.34
238 0.36
239 0.38
240 0.44
241 0.46
242 0.54
243 0.59
244 0.59
245 0.66
246 0.69
247 0.69
248 0.7
249 0.69
250 0.64
251 0.6
252 0.57
253 0.51
254 0.48
255 0.46
256 0.41
257 0.38
258 0.33
259 0.31
260 0.3
261 0.27
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.23
269 0.26
270 0.27
271 0.26
272 0.25
273 0.24
274 0.24
275 0.26
276 0.23
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.21
281 0.21
282 0.27
283 0.22
284 0.21
285 0.21
286 0.2
287 0.2
288 0.17
289 0.16
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.19
300 0.2
301 0.27
302 0.33
303 0.4
304 0.45
305 0.52
306 0.5
307 0.46
308 0.49
309 0.45
310 0.46
311 0.46
312 0.49
313 0.42
314 0.47
315 0.47
316 0.43
317 0.4
318 0.32
319 0.3
320 0.26
321 0.25
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.17
326 0.17
327 0.14
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.19
340 0.19
341 0.18
342 0.18
343 0.16
344 0.17
345 0.18
346 0.19
347 0.13
348 0.15
349 0.15
350 0.17
351 0.22
352 0.24
353 0.26
354 0.24
355 0.25
356 0.24
357 0.25
358 0.25
359 0.21
360 0.17
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.16
365 0.16
366 0.13
367 0.2
368 0.2
369 0.2
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.26
374 0.27
375 0.22
376 0.24
377 0.24
378 0.22
379 0.21
380 0.18
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.16
401 0.17
402 0.22
403 0.26
404 0.23
405 0.24
406 0.25
407 0.25
408 0.23
409 0.26
410 0.23
411 0.2
412 0.19
413 0.17
414 0.17
415 0.2
416 0.21
417 0.18
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.17
422 0.2
423 0.18
424 0.18
425 0.19
426 0.24
427 0.26
428 0.27
429 0.28
430 0.32
431 0.37
432 0.44
433 0.5
434 0.47
435 0.49
436 0.52
437 0.48
438 0.41
439 0.37
440 0.29
441 0.25
442 0.23
443 0.22
444 0.17
445 0.17
446 0.17
447 0.13
448 0.14
449 0.1
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.07
462 0.05
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.11
473 0.16
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.19
478 0.26
479 0.26
480 0.27
481 0.25
482 0.26
483 0.26
484 0.27
485 0.3
486 0.24
487 0.23
488 0.2
489 0.21
490 0.21
491 0.24
492 0.22
493 0.17
494 0.23
495 0.24
496 0.23
497 0.21
498 0.22
499 0.25
500 0.3
501 0.34
502 0.29
503 0.3
504 0.32
505 0.35
506 0.36
507 0.32
508 0.28
509 0.26
510 0.29
511 0.29
512 0.31
513 0.3
514 0.3
515 0.33
516 0.36
517 0.36
518 0.35
519 0.35
520 0.35
521 0.38
522 0.38
523 0.39
524 0.4
525 0.41
526 0.4
527 0.42
528 0.41
529 0.39
530 0.39
531 0.38
532 0.38
533 0.36
534 0.38
535 0.37
536 0.4
537 0.36
538 0.35
539 0.3
540 0.24
541 0.22
542 0.19
543 0.18
544 0.12
545 0.13
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.15
551 0.18
552 0.21
553 0.27
554 0.32
555 0.34
556 0.35
557 0.36
558 0.37
559 0.39
560 0.41
561 0.36
562 0.31
563 0.31
564 0.32
565 0.29
566 0.26
567 0.22
568 0.23
569 0.25
570 0.25
571 0.25
572 0.28
573 0.29
574 0.32
575 0.33
576 0.35
577 0.33
578 0.35
579 0.34
580 0.3
581 0.3
582 0.27
583 0.26
584 0.2
585 0.19
586 0.18
587 0.18
588 0.18
589 0.16
590 0.15
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.09
595 0.08
596 0.09
597 0.12
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.14
602 0.2
603 0.23
604 0.23
605 0.27
606 0.34
607 0.41
608 0.45
609 0.49
610 0.52
611 0.49
612 0.51
613 0.48
614 0.48
615 0.48
616 0.5
617 0.52
618 0.47
619 0.53
620 0.54
621 0.59
622 0.54
623 0.51
624 0.48
625 0.47
626 0.47
627 0.49
628 0.49
629 0.43
630 0.43
631 0.41
632 0.41
633 0.37
634 0.34
635 0.26
636 0.25
637 0.27
638 0.26
639 0.29
640 0.33
641 0.37
642 0.41
643 0.44
644 0.47
645 0.5
646 0.58
647 0.61
648 0.6
649 0.56
650 0.54
651 0.55
652 0.54
653 0.48
654 0.38
655 0.3
656 0.28
657 0.23
658 0.21
659 0.17
660 0.14
661 0.13
662 0.12
663 0.12
664 0.1
665 0.1
666 0.11